MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhodospira halophila SL1 chromosome

Total Repeats: 66757

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2252	NC_008789	CAGG	2	8	100882	100889	25 %	0 %	50 %	25 %	121996896
2253	NC_008789	GC	3	6	100895	100900	0 %	0 %	50 %	50 %	121996896
2254	NC_008789	CTT	2	6	100981	100986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121996896
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2256	NC_008789	GTC	2	6	101162	101167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996896
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2259	NC_008789	CTG	2	6	101203	101208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996896
2260	NC_008789	GTTC	2	8	101220	101227	0 %	50 %	25 %	25 %	121996896
2261	NC_008789	CCG	2	6	101250	101255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996896
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2268	NC_008789	GCA	2	6	101408	101413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996897
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2282	NC_008789	CCGGC	2	10	101870	101879	0 %	0 %	40 %	60 %	121996897
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2286	NC_008789	GC	3	6	102228	102233	0 %	0 %	50 %	50 %	121996897
2287	NC_008789	CGG	2	6	102294	102299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996897
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2289	NC_008789	GTCA	2	8	102395	102402	25 %	25 %	25 %	25 %	121996898
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2312	NC_008789	CCTGG	2	10	103558	103567	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2313	NC_008789	TGC	2	6	103584	103589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2356	NC_008789	CAC	2	6	105608	105613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2357	NC_008789	CGC	2	6	105773	105778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996901
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2365	NC_008789	CACAT	2	10	106249	106258	40 %	20 %	0 %	40 %	121996902
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2369	NC_008789	CATC	2	8	106379	106386	25 %	25 %	0 %	50 %	121996902
2370	NC_008789	CGG	2	6	106597	106602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996902
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2372	NC_008789	GCT	2	6	106727	106732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996902
2373	NC_008789	CGA	2	6	106736	106741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121996902
2374	NC_008789	GAA	2	6	106815	106820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121996902
2375	NC_008789	TCG	2	6	106840	106845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996902
2376	NC_008789	TCA	2	6	106847	106852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996902
2377	NC_008789	CGTATC	2	12	106922	106933	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	121996903
2378	NC_008789	CGC	2	6	106988	106993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121996903
2379	NC_008789	CTG	2	6	106994	106999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996903
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2393	NC_008789	GCT	2	6	107669	107674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996903
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2395	NC_008789	GAG	2	6	107760	107765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121996904
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2411	NC_008789	AGAT	2	8	108403	108410	50 %	25 %	25 %	0 %	121996904
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2446	NC_008789	ATC	2	6	110516	110521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996905
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2477	NC_008789	CCG	2	6	111836	111841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2478	NC_008789	GGCC	2	8	111876	111883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2479	NC_008789	GC	3	6	111915	111920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2480	NC_008789	GAA	2	6	111929	111934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2481	NC_008789	CGGC	2	8	111986	111993	0 %	0 %	50 %	50 %	121996906
2482	NC_008789	GACG	2	8	112013	112020	25 %	0 %	50 %	25 %	121996906
2483	NC_008789	CCT	2	6	112031	112036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996906
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2485	NC_008789	ACGTAG	2	12	112102	112113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	121996906
2486	NC_008789	TCG	2	6	112180	112185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121996906
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2490	NC_008789	GAT	2	6	112386	112391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121996906
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2494	NC_008789	CTC	2	6	112731	112736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121996906
2495	NC_008789	TCA	2	6	112748	112753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121996906
2496	NC_008789	GTT	2	6	112755	112760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121996906
2497	NC_008789	GGC	2	6	112857	112862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121996906
2498	NC_008789	CT	3	6	112901	112906	0 %	50 %	0 %	50 %	121996906
2499	NC_008789	CCGG	2	8	112984	112991	0 %	0 %	50 %	50 %	121996907
2500	NC_008789	GC	3	6	113038	113043	0 %	0 %	50 %	50 %	121996907

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