MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 82576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008358	AGGC	2	8	179607	179614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_008358	GCC	2	6	179625	179630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_008358	GCC	2	6	179777	179782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798672
4004	NC_008358	GCT	2	6	179880	179885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798672
4005	NC_008358	CGC	2	6	179939	179944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798672
4006	NC_008358	CGC	2	6	179946	179951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798672
4007	NC_008358	CCAC	2	8	179970	179977	25 %	0 %	0 %	75 %	114798672
4008	NC_008358	CGTCCG	2	12	179985	179996	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114798672
4009	NC_008358	GCC	2	6	180037	180042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798672
4010	NC_008358	GGC	2	6	180100	180105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798672
4011	NC_008358	AAC	2	6	180106	180111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114798672
4012	NC_008358	CTG	2	6	180132	180137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798672
4013	NC_008358	GCCG	2	8	180258	180265	0 %	0 %	50 %	50 %	114798672
4014	NC_008358	GAT	2	6	180349	180354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798672
4015	NC_008358	C	6	6	180377	180382	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4016	NC_008358	TCAAG	2	10	180386	180395	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4017	NC_008358	TCAAG	2	10	180402	180411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4018	NC_008358	CCA	2	6	180495	180500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114799497
4019	NC_008358	CAGG	2	8	180516	180523	25 %	0 %	50 %	25 %	114799497
4020	NC_008358	CTT	2	6	180556	180561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799497
4021	NC_008358	CGCGC	2	10	180583	180592	0 %	0 %	40 %	60 %	114799497
4022	NC_008358	GC	3	6	180626	180631	0 %	0 %	50 %	50 %	114799497
4023	NC_008358	GGT	2	6	180646	180651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799497
4024	NC_008358	CGG	2	6	180660	180665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799497
4025	NC_008358	GGC	2	6	180672	180677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799497
4026	NC_008358	CG	3	6	180684	180689	0 %	0 %	50 %	50 %	114799497
4027	NC_008358	GGC	2	6	180717	180722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799497
4028	NC_008358	TCA	2	6	180798	180803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799497
4029	NC_008358	GGC	2	6	180816	180821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799497
4030	NC_008358	ATG	2	6	180911	180916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799497
4031	NC_008358	GCA	2	6	180921	180926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799497
4032	NC_008358	TTG	2	6	180971	180976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114799497
4033	NC_008358	TGA	2	6	180987	180992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799497
4034	NC_008358	GCG	2	6	181067	181072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799497
4035	NC_008358	GTC	2	6	181078	181083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799497
4036	NC_008358	TCA	2	6	181100	181105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799497
4037	NC_008358	CG	3	6	181118	181123	0 %	0 %	50 %	50 %	114799497
4038	NC_008358	CAG	2	6	181137	181142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799497
4039	NC_008358	GCG	2	6	181152	181157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799497
4040	NC_008358	TCA	2	6	181277	181282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799497
4041	NC_008358	GCC	2	6	181357	181362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799497
4042	NC_008358	GC	3	6	181367	181372	0 %	0 %	50 %	50 %	114799497
4043	NC_008358	GCCA	2	8	181376	181383	25 %	0 %	25 %	50 %	114799497
4044	NC_008358	GCG	2	6	181437	181442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799497
4045	NC_008358	TTC	2	6	181457	181462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799497
4046	NC_008358	GTC	2	6	181638	181643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800272
4047	NC_008358	GC	3	6	181682	181687	0 %	0 %	50 %	50 %	114800272
4048	NC_008358	GGT	2	6	181700	181705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114800272
4049	NC_008358	CGA	2	6	181718	181723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800272
4050	NC_008358	GCC	3	9	181725	181733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800272
4051	NC_008358	GCC	2	6	181743	181748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800272
4052	NC_008358	TTC	2	6	181854	181859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114800272
4053	NC_008358	GGC	2	6	181893	181898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800272
4054	NC_008358	TCG	2	6	181921	181926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800272
4055	NC_008358	GAAT	2	8	181984	181991	50 %	25 %	25 %	0 %	114800272
4056	NC_008358	GCCG	2	8	182007	182014	0 %	0 %	50 %	50 %	114800272
4057	NC_008358	CAT	2	6	182063	182068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114800272
4058	NC_008358	CCA	2	6	182105	182110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114800272
4059	NC_008358	GCG	2	6	182123	182128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800272
4060	NC_008358	GCG	2	6	182140	182145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800272
4061	NC_008358	GGC	2	6	182154	182159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800272
4062	NC_008358	CGC	2	6	182234	182239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800272
4063	NC_008358	TGGCTT	2	12	182306	182317	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	114800272
4064	NC_008358	GGCC	2	8	182348	182355	0 %	0 %	50 %	50 %	114800272
4065	NC_008358	AGC	2	6	182356	182361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800272
4066	NC_008358	GC	3	6	182378	182383	0 %	0 %	50 %	50 %	114800272
4067	NC_008358	GGGGC	2	10	182390	182399	0 %	0 %	80 %	20 %	114800272
4068	NC_008358	CAG	2	6	182583	182588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800272
4069	NC_008358	GAG	2	6	182635	182640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114800272
4070	NC_008358	TCG	2	6	182740	182745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800272
4071	NC_008358	CAG	2	6	182751	182756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800272
4072	NC_008358	CCA	2	6	182788	182793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114800272
4073	NC_008358	GC	3	6	182801	182806	0 %	0 %	50 %	50 %	114800272
4074	NC_008358	GC	3	6	182831	182836	0 %	0 %	50 %	50 %	114800272
4075	NC_008358	TCG	2	6	182895	182900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_008358	GC	3	6	182958	182963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_008358	GC	3	6	182999	183004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_008358	CCT	2	6	183049	183054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114798197
4079	NC_008358	GCG	2	6	183192	183197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798197
4080	NC_008358	GACGAA	2	12	183198	183209	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	114798197
4081	NC_008358	GAC	2	6	183210	183215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798197
4082	NC_008358	GAGGAA	2	12	183219	183230	50 %	0 %	50 %	0 %	114798197
4083	NC_008358	GAC	2	6	183249	183254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798197
4084	NC_008358	GAC	2	6	183258	183263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798197
4085	NC_008358	TGA	2	6	183275	183280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798197
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4087	NC_008358	GAA	2	6	183297	183302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798197
4088	NC_008358	GAC	2	6	183327	183332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798197
4089	NC_008358	GAA	2	6	183360	183365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798197
4090	NC_008358	GAT	4	12	183417	183428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798197
4091	NC_008358	TCA	2	6	183430	183435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798197
4092	NC_008358	GAC	2	6	183444	183449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798197
4093	NC_008358	CGA	3	9	183467	183475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798197
4094	NC_008358	CGA	3	9	183506	183514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798197
4095	NC_008358	GAC	2	6	183516	183521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798197
4096	NC_008358	GCATG	2	10	183614	183623	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4097	NC_008358	CCA	2	6	183655	183660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_008358	GCC	2	6	183701	183706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_008358	GGC	2	6	183714	183719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_008358	CAGA	2	8	183744	183751	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_008358	CCGG	2	8	183843	183850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_008358	ATG	2	6	183880	183885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_008358	TGA	2	6	183999	184004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800391
4104	NC_008358	AAG	2	6	184035	184040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114800391
4105	NC_008358	GATG	2	8	184060	184067	25 %	25 %	50 %	0 %	114800391
4106	NC_008358	CCCG	2	8	184090	184097	0 %	0 %	25 %	75 %	114800391
4107	NC_008358	TGA	2	6	184114	184119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800391
4108	NC_008358	TGA	2	6	184123	184128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800391
4109	NC_008358	GCC	2	6	184196	184201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800391
4110	NC_008358	GGGA	2	8	184331	184338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008358	GC	3	6	184357	184362	0 %	0 %	50 %	50 %	114799624
4112	NC_008358	GCC	2	6	184394	184399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799624
4113	NC_008358	AACCG	2	10	184414	184423	40 %	0 %	20 %	40 %	114799624
4114	NC_008358	C	6	6	184427	184432	0 %	0 %	0 %	100 %	114799624
4115	NC_008358	CGC	2	6	184449	184454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799624
4116	NC_008358	GGC	2	6	184489	184494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799624
4117	NC_008358	CGC	2	6	184501	184506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799624
4118	NC_008358	GCAGG	2	10	184598	184607	20 %	0 %	60 %	20 %	114799624
4119	NC_008358	AGA	2	6	184608	184613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114799624
4120	NC_008358	GAT	2	6	184670	184675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799624
4121	NC_008358	TGC	2	6	184677	184682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799624
4122	NC_008358	GATCA	2	10	184739	184748	40 %	20 %	20 %	20 %	114799624
4123	NC_008358	GGT	2	6	184778	184783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799624
4124	NC_008358	GC	3	6	184858	184863	0 %	0 %	50 %	50 %	114799624
4125	NC_008358	ACA	2	6	184899	184904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799624
4126	NC_008358	ATCGAG	2	12	184946	184957	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114799624
4127	NC_008358	CAA	2	6	184996	185001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799624
4128	NC_008358	GGC	2	6	185048	185053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799624
4129	NC_008358	ATC	2	6	185081	185086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799624
4130	NC_008358	AAC	2	6	185090	185095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799624
4131	NC_008358	GGCA	2	8	185113	185120	25 %	0 %	50 %	25 %	114799624
4132	NC_008358	ACA	2	6	185202	185207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799624
4133	NC_008358	GCGG	2	8	185312	185319	0 %	0 %	75 %	25 %	114799624
4134	NC_008358	GAC	2	6	185321	185326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799624
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4136	NC_008358	GGC	2	6	185363	185368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799624
4137	NC_008358	GGGCGA	2	12	185407	185418	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114799624
4138	NC_008358	GAG	2	6	185444	185449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114799624
4139	NC_008358	GGTT	2	8	185458	185465	0 %	50 %	50 %	0 %	114799624
4140	NC_008358	TCA	2	6	185466	185471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799624
4141	NC_008358	CGG	2	6	185502	185507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799624
4142	NC_008358	AGGC	2	8	185590	185597	25 %	0 %	50 %	25 %	114799624
4143	NC_008358	GCG	2	6	185624	185629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799280
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4147	NC_008358	GGC	2	6	185698	185703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799280
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4153	NC_008358	GGC	2	6	186004	186009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799280
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4155	NC_008358	AACCAG	2	12	186131	186142	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	114799280
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4158	NC_008358	CG	3	6	186313	186318	0 %	0 %	50 %	50 %	114799280
4159	NC_008358	GC	3	6	186345	186350	0 %	0 %	50 %	50 %	114799280
4160	NC_008358	GCCA	2	8	186397	186404	25 %	0 %	25 %	50 %	114799280
4161	NC_008358	CCT	2	6	186430	186435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114799280
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4165	NC_008358	TGG	2	6	186692	186697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114798243
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4174	NC_008358	TCC	2	6	187271	187276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797270
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4177	NC_008358	GC	3	6	187463	187468	0 %	0 %	50 %	50 %	114797270
4178	NC_008358	ACCG	2	8	187475	187482	25 %	0 %	25 %	50 %	114797270
4179	NC_008358	GC	3	6	187502	187507	0 %	0 %	50 %	50 %	114797270
4180	NC_008358	GGCG	2	8	187513	187520	0 %	0 %	75 %	25 %	114797270
4181	NC_008358	GCA	2	6	187537	187542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797270
4182	NC_008358	CCA	2	6	187615	187620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114797270
4183	NC_008358	CGATCT	2	12	187708	187719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114797270
4184	NC_008358	CTG	2	6	187820	187825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4185	NC_008358	AGC	2	6	187866	187871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799884
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4190	NC_008358	TGACC	2	10	188181	188190	20 %	20 %	20 %	40 %	114799884
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4198	NC_008358	TCG	2	6	188600	188605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798835
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4203	NC_008358	GCGG	2	8	188713	188720	0 %	0 %	75 %	25 %	114798835
4204	NC_008358	C	6	6	188742	188747	0 %	0 %	0 %	100 %	114798835
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4211	NC_008358	TGG	2	6	189095	189100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4212	NC_008358	GGC	2	6	189116	189121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4213	NC_008358	TCG	2	6	189177	189182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797827
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4219	NC_008358	TCG	2	6	189771	189776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797827
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4231	NC_008358	GC	3	6	190232	190237	0 %	0 %	50 %	50 %	114800351
4232	NC_008358	CCA	2	6	190248	190253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114800351
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4237	NC_008358	CGA	2	6	190411	190416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800351
4238	NC_008358	GC	4	8	190438	190445	0 %	0 %	50 %	50 %	114800351
4239	NC_008358	CGGC	2	8	190585	190592	0 %	0 %	50 %	50 %	114800351
4240	NC_008358	TGC	2	6	190701	190706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800351
4241	NC_008358	CG	3	6	190842	190847	0 %	0 %	50 %	50 %	114800351
4242	NC_008358	GAGAAG	2	12	190898	190909	50 %	0 %	50 %	0 %	114800351
4243	NC_008358	GCG	2	6	190928	190933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800351
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4491	NC_008358	GC	3	6	199845	199850	0 %	0 %	50 %	50 %	114799824
4492	NC_008358	CGC	2	6	199915	199920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799824
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