MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 82576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_008358	TGC	2	6	664667	664672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798474
15003	NC_008358	CATGA	2	10	664713	664722	40 %	20 %	20 %	20 %	114798474
15004	NC_008358	ATG	2	6	664782	664787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798474
15005	NC_008358	CGA	2	6	664855	664860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798474
15006	NC_008358	CGC	2	6	664873	664878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798474
15007	NC_008358	GTGGCT	2	12	664889	664900	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114798474
15008	NC_008358	GCGG	2	8	664922	664929	0 %	0 %	75 %	25 %	114798474
15009	NC_008358	GC	3	6	665059	665064	0 %	0 %	50 %	50 %	114798474
15010	NC_008358	GC	3	6	665172	665177	0 %	0 %	50 %	50 %	114798474
15011	NC_008358	GCG	2	6	665237	665242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798474
15012	NC_008358	GCG	2	6	665247	665252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798474
15013	NC_008358	GGC	2	6	665267	665272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798474
15014	NC_008358	GGGAA	2	10	665327	665336	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_008358	ACT	2	6	665373	665378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_008358	GTC	2	6	665402	665407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15017	NC_008358	TCA	2	6	665426	665431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798026
15018	NC_008358	CGCCTG	2	12	665469	665480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114798026
15019	NC_008358	GCC	2	6	665523	665528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798026
15020	NC_008358	CG	3	6	665681	665686	0 %	0 %	50 %	50 %	114798026
15021	NC_008358	CTT	2	6	665747	665752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114798026
15022	NC_008358	GTCG	2	8	665766	665773	0 %	25 %	50 %	25 %	114798026
15023	NC_008358	GGC	2	6	665793	665798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798026
15024	NC_008358	CAA	2	6	665862	665867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114798026
15025	NC_008358	GGC	2	6	665890	665895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798026
15026	NC_008358	ATC	2	6	665896	665901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798026
15027	NC_008358	CGGG	2	8	665966	665973	0 %	0 %	75 %	25 %	114798026
15028	NC_008358	ATG	2	6	666038	666043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798026
15029	NC_008358	GAG	2	6	666094	666099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114798026
15030	NC_008358	TCC	2	6	666169	666174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114798026
15031	NC_008358	ATT	3	9	666179	666187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114798026
15032	NC_008358	ATCT	2	8	666244	666251	25 %	50 %	0 %	25 %	114798026
15033	NC_008358	TGG	2	6	666265	666270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114798026
15034	NC_008358	GAT	2	6	666271	666276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798026
15035	NC_008358	GGC	2	6	666302	666307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798026
15036	NC_008358	AGGAAG	2	12	666308	666319	50 %	0 %	50 %	0 %	114798026
15037	NC_008358	GGCC	2	8	666352	666359	0 %	0 %	50 %	50 %	114798026
15038	NC_008358	CGAC	2	8	666371	666378	25 %	0 %	25 %	50 %	114798026
15039	NC_008358	CAG	2	6	666394	666399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798026
15040	NC_008358	ACCGTG	2	12	666421	666432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114798026
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15043	NC_008358	GAA	2	6	666802	666807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798026
15044	NC_008358	CTT	2	6	666819	666824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114798026
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15050	NC_008358	ATC	2	6	667015	667020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798026
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15052	NC_008358	ATG	3	9	667121	667129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798026
15053	NC_008358	TGG	4	12	667309	667320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114798026
15054	NC_008358	AGC	2	6	667324	667329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798026
15055	NC_008358	GCT	2	6	667348	667353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798026
15056	NC_008358	CGC	2	6	667399	667404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798026
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15058	NC_008358	CGC	2	6	667583	667588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798026
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15060	NC_008358	CGG	2	6	667621	667626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797087
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15069	NC_008358	GGA	2	6	668312	668317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114797087
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15241	NC_008358	TCA	2	6	676438	676443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797516
15242	NC_008358	AGC	2	6	676444	676449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797516
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15244	NC_008358	CTC	2	6	676496	676501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797516
15245	NC_008358	CCCGCG	2	12	676573	676584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797516
15246	NC_008358	CAT	2	6	676619	676624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797516
15247	NC_008358	CGACAT	2	12	676685	676696	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114797516
15248	NC_008358	GTC	2	6	676725	676730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797516
15249	NC_008358	TGA	3	9	676735	676743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797516
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15251	NC_008358	ATC	2	6	676923	676928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797516
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15253	NC_008358	CAT	2	6	677080	677085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797137
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15255	NC_008358	CGCCGG	2	12	677197	677208	0 %	0 %	50 %	50 %	114797137
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15260	NC_008358	CAAAGC	2	12	677626	677637	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	114797137
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15349	NC_008358	TCT	2	6	681161	681166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114800079
15350	NC_008358	GCCG	2	8	681237	681244	0 %	0 %	50 %	50 %	114800079
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15353	NC_008358	GA	3	6	681394	681399	50 %	0 %	50 %	0 %	114800079
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15356	NC_008358	TTG	2	6	681421	681426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114800079
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15475	NC_008358	GC	3	6	686316	686321	0 %	0 %	50 %	50 %	114798429
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15479	NC_008358	GCG	2	6	686386	686391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798429
15480	NC_008358	TCA	3	9	686431	686439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797664
15481	NC_008358	GC	3	6	686452	686457	0 %	0 %	50 %	50 %	114797664
15482	NC_008358	GCC	2	6	686512	686517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797664
15483	NC_008358	CGG	2	6	686531	686536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797664
15484	NC_008358	GGCG	2	8	686549	686556	0 %	0 %	75 %	25 %	114797664
15485	NC_008358	GC	3	6	686563	686568	0 %	0 %	50 %	50 %	114797664
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15488	NC_008358	GCT	2	6	686720	686725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797664
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15490	NC_008358	CGGCG	2	10	686840	686849	0 %	0 %	60 %	40 %	114797664
15491	NC_008358	TCA	2	6	686860	686865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797664
15492	NC_008358	GCG	2	6	686919	686924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797664
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