MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 82576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008358	A	6	6	600423	600428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_008358	TCA	2	6	600538	600543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798615
13503	NC_008358	CCA	2	6	600643	600648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114798615
13504	NC_008358	CGT	2	6	600701	600706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798615
13505	NC_008358	TTC	2	6	600761	600766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114798615
13506	NC_008358	CGC	2	6	600794	600799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798615
13507	NC_008358	GC	4	8	600798	600805	0 %	0 %	50 %	50 %	114798615
13508	NC_008358	GGC	2	6	600905	600910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798615
13509	NC_008358	CCA	2	6	600940	600945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114798615
13510	NC_008358	CAT	2	6	601000	601005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798615
13511	NC_008358	CCGC	2	8	601048	601055	0 %	0 %	25 %	75 %	114798615
13512	NC_008358	CAG	2	6	601064	601069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798615
13513	NC_008358	AGA	2	6	601119	601124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798615
13514	NC_008358	GCG	3	9	601127	601135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798615
13515	NC_008358	GCTC	2	8	601141	601148	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13516	NC_008358	GCA	2	6	601186	601191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_008358	GCC	2	6	601271	601276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797507
13518	NC_008358	CCTC	2	8	601345	601352	0 %	25 %	0 %	75 %	114797507
13519	NC_008358	GC	3	6	601363	601368	0 %	0 %	50 %	50 %	114797507
13520	NC_008358	C	6	6	601489	601494	0 %	0 %	0 %	100 %	114797507
13521	NC_008358	CGCCAG	2	12	601602	601613	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114797507
13522	NC_008358	CCG	2	6	601623	601628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797507
13523	NC_008358	CTG	2	6	601635	601640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13524	NC_008358	ACG	2	6	601641	601646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13525	NC_008358	CCT	2	6	601661	601666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797507
13526	NC_008358	CTT	2	6	601691	601696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114797507
13527	NC_008358	TCA	2	6	601714	601719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797507
13528	NC_008358	CGA	2	6	601721	601726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13529	NC_008358	CAG	2	6	601931	601936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13530	NC_008358	CAT	2	6	602012	602017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797507
13531	NC_008358	ACC	2	6	602028	602033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114797507
13532	NC_008358	GACATC	2	12	602043	602054	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114797507
13533	NC_008358	CGCGA	2	10	602130	602139	20 %	0 %	40 %	40 %	114797507
13534	NC_008358	GCC	2	6	602202	602207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797507
13535	NC_008358	CAT	2	6	602235	602240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797507
13536	NC_008358	GCTC	2	8	602242	602249	0 %	25 %	25 %	50 %	114797507
13537	NC_008358	CGT	2	6	602306	602311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13538	NC_008358	GC	3	6	602374	602379	0 %	0 %	50 %	50 %	114797507
13539	NC_008358	GCC	2	6	602388	602393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797507
13540	NC_008358	ACC	2	6	602422	602427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114797507
13541	NC_008358	CCT	2	6	602450	602455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797507
13542	NC_008358	GCCGC	2	10	602488	602497	0 %	0 %	40 %	60 %	114797507
13543	NC_008358	GCC	2	6	602502	602507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797507
13544	NC_008358	GA	3	6	602518	602523	50 %	0 %	50 %	0 %	114797507
13545	NC_008358	GC	3	6	602548	602553	0 %	0 %	50 %	50 %	114797507
13546	NC_008358	CAT	2	6	602573	602578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797507
13547	NC_008358	CCG	2	6	602630	602635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797507
13548	NC_008358	CGC	2	6	602648	602653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797507
13549	NC_008358	TCG	2	6	602680	602685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13550	NC_008358	TCG	2	6	602689	602694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13551	NC_008358	CGG	2	6	602699	602704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797507
13552	NC_008358	GCGCC	2	10	602744	602753	0 %	0 %	40 %	60 %	114797507
13553	NC_008358	TCG	2	6	602818	602823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13554	NC_008358	GCGG	2	8	602859	602866	0 %	0 %	75 %	25 %	114797507
13555	NC_008358	GGGGA	2	10	602884	602893	20 %	0 %	80 %	0 %	114797507
13556	NC_008358	GCAG	2	8	602913	602920	25 %	0 %	50 %	25 %	114797507
13557	NC_008358	GAA	2	6	602937	602942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797507
13558	NC_008358	CCT	2	6	602954	602959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797507
13559	NC_008358	TCC	2	6	602995	603000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797507
13560	NC_008358	GAA	2	6	603141	603146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797507
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13562	NC_008358	CCT	2	6	603224	603229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797507
13563	NC_008358	CG	3	6	603244	603249	0 %	0 %	50 %	50 %	114797507
13564	NC_008358	GCC	2	6	603286	603291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797507
13565	NC_008358	CGC	2	6	603324	603329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797507
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13567	NC_008358	TCG	2	6	603361	603366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13568	NC_008358	CGA	2	6	603452	603457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13569	NC_008358	GAA	2	6	603462	603467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797507
13570	NC_008358	CGA	2	6	603473	603478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797507
13571	NC_008358	TGA	2	6	603487	603492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797507
13572	NC_008358	TCC	3	9	603631	603639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797507
13573	NC_008358	CGC	2	6	603656	603661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797507
13574	NC_008358	CCT	2	6	603668	603673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797507
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13577	NC_008358	GAA	2	6	603834	603839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797507
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13580	NC_008358	CG	3	6	603916	603921	0 %	0 %	50 %	50 %	114798456
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13582	NC_008358	CCGC	2	8	604126	604133	0 %	0 %	25 %	75 %	114798456
13583	NC_008358	CAG	2	6	604265	604270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798456
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13585	NC_008358	GCGCCA	2	12	604339	604350	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114798456
13586	NC_008358	CG	3	6	604390	604395	0 %	0 %	50 %	50 %	114798456
13587	NC_008358	AGC	2	6	604410	604415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798456
13588	NC_008358	CAG	2	6	604428	604433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798456
13589	NC_008358	CAG	3	9	604439	604447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798456
13590	NC_008358	GCCGG	2	10	604452	604461	0 %	0 %	60 %	40 %	114798456
13591	NC_008358	CGCCA	2	10	604517	604526	20 %	0 %	20 %	60 %	114798456
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13593	NC_008358	CGAC	2	8	604555	604562	25 %	0 %	25 %	50 %	114798456
13594	NC_008358	CGT	2	6	604610	604615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798456
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13597	NC_008358	TGCC	2	8	604699	604706	0 %	25 %	25 %	50 %	114798456
13598	NC_008358	CAG	2	6	604712	604717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798456
13599	NC_008358	CAGGG	2	10	604730	604739	20 %	0 %	60 %	20 %	114798456
13600	NC_008358	GCC	2	6	604782	604787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798456
13601	NC_008358	CG	6	12	604792	604803	0 %	0 %	50 %	50 %	114798456
13602	NC_008358	ACC	3	9	604848	604856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114798456
13603	NC_008358	ACG	2	6	604938	604943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798456
13604	NC_008358	GGC	2	6	604946	604951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798456
13605	NC_008358	AGCGC	2	10	604957	604966	20 %	0 %	40 %	40 %	114798456
13606	NC_008358	AG	3	6	604975	604980	50 %	0 %	50 %	0 %	114798456
13607	NC_008358	CG	3	6	604987	604992	0 %	0 %	50 %	50 %	114798456
13608	NC_008358	CCG	2	6	605009	605014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799666
13609	NC_008358	CG	3	6	605022	605027	0 %	0 %	50 %	50 %	114799666
13610	NC_008358	ATG	2	6	605215	605220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799666
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13612	NC_008358	TGA	2	6	605262	605267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799666
13613	NC_008358	GGCCG	2	10	605281	605290	0 %	0 %	60 %	40 %	114799666
13614	NC_008358	AATC	2	8	605292	605299	50 %	25 %	0 %	25 %	114799666
13615	NC_008358	GAA	2	6	605338	605343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114799666
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13742	NC_008358	CGG	2	6	610012	610017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799127
13743	NC_008358	CGG	2	6	610081	610086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799127
13744	NC_008358	CG	3	6	610108	610113	0 %	0 %	50 %	50 %	114799127
13745	NC_008358	AACG	2	8	610120	610127	50 %	0 %	25 %	25 %	114799127
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13862	NC_008358	GC	3	6	614907	614912	0 %	0 %	50 %	50 %	114798723
13863	NC_008358	CCA	2	6	614927	614932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114798723
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13866	NC_008358	TGC	3	9	615089	615097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798723
13867	NC_008358	CCGAT	2	10	615116	615125	20 %	20 %	20 %	40 %	114798723
13868	NC_008358	CGC	2	6	615155	615160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798723
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13873	NC_008358	GCT	2	6	615297	615302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798723
13874	NC_008358	CTC	2	6	615315	615320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114798723
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13880	NC_008358	GCT	2	6	615594	615599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798723
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13894	NC_008358	GAA	2	6	616243	616248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798723
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13897	NC_008358	CCG	2	6	616488	616493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798906
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13924	NC_008358	TCT	2	6	617740	617745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13925	NC_008358	CGG	2	6	617823	617828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798362
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13927	NC_008358	TCG	2	6	617873	617878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798362
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13931	NC_008358	ATG	2	6	617999	618004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798362
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13933	NC_008358	GTC	2	6	618019	618024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798362
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13943	NC_008358	GT	3	6	618316	618321	0 %	50 %	50 %	0 %	114798362
13944	NC_008358	CGAC	2	8	618353	618360	25 %	0 %	25 %	50 %	114798362
13945	NC_008358	CGC	2	6	618382	618387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798362
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13948	NC_008358	GCG	2	6	618584	618589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798362
13949	NC_008358	CTC	2	6	618648	618653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114798362
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13953	NC_008358	ACCG	2	8	618757	618764	25 %	0 %	25 %	50 %	114798362
13954	NC_008358	ATC	2	6	618859	618864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798362
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13962	NC_008358	CGA	2	6	619227	619232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798877
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13965	NC_008358	CAA	2	6	619278	619283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114798877
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13967	NC_008358	TCG	2	6	619463	619468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798877
13968	NC_008358	CGA	2	6	619497	619502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798877
13969	NC_008358	AGC	2	6	619609	619614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798877
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13971	NC_008358	GGCCG	2	10	619657	619666	0 %	0 %	60 %	40 %	114798877
13972	NC_008358	TGC	2	6	619667	619672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798877
13973	NC_008358	GGT	2	6	619680	619685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114798877
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13976	NC_008358	GCC	2	6	619705	619710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798877
13977	NC_008358	GAT	2	6	619776	619781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798877
13978	NC_008358	CG	3	6	619814	619819	0 %	0 %	50 %	50 %	114798877
13979	NC_008358	CGCC	2	8	619923	619930	0 %	0 %	25 %	75 %	114798877
13980	NC_008358	CG	4	8	619956	619963	0 %	0 %	50 %	50 %	114798877
13981	NC_008358	GCT	2	6	620013	620018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798877
13982	NC_008358	CGG	2	6	620028	620033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798877
13983	NC_008358	AGC	2	6	620065	620070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798877
13984	NC_008358	CGCC	2	8	620079	620086	0 %	0 %	25 %	75 %	114798877
13985	NC_008358	GGC	2	6	620151	620156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798877
13986	NC_008358	CCT	2	6	620159	620164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114798877
13987	NC_008358	CGC	2	6	620169	620174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798877
13988	NC_008358	GC	5	10	620182	620191	0 %	0 %	50 %	50 %	114798877
13989	NC_008358	CGG	2	6	620208	620213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798877
13990	NC_008358	CAC	2	6	620226	620231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114798877
13991	NC_008358	TCG	2	6	620258	620263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798877
13992	NC_008358	AGTTCC	2	12	620495	620506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114798877
13993	NC_008358	CGC	2	6	620554	620559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798877
13994	NC_008358	GCG	2	6	620572	620577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798877
13995	NC_008358	GCG	2	6	620612	620617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798877
13996	NC_008358	GAA	2	6	620650	620655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798877
13997	NC_008358	CCG	2	6	620712	620717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798877
13998	NC_008358	GC	4	8	620724	620731	0 %	0 %	50 %	50 %	114798877
13999	NC_008358	GGC	2	6	620739	620744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798877
14000	NC_008358	GAC	2	6	620781	620786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798877

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