MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 82576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008358	CAT	2	6	246640	246645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799934
5502	NC_008358	TGC	2	6	246688	246693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799934
5503	NC_008358	GGC	2	6	246698	246703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799934
5504	NC_008358	GC	3	6	246738	246743	0 %	0 %	50 %	50 %	114799934
5505	NC_008358	GAT	2	6	246784	246789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799934
5506	NC_008358	GC	3	6	246799	246804	0 %	0 %	50 %	50 %	114799934
5507	NC_008358	CTT	2	6	246824	246829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799934
5508	NC_008358	AGG	2	6	246834	246839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114799934
5509	NC_008358	CAGC	2	8	246850	246857	25 %	0 %	25 %	50 %	114799934
5510	NC_008358	AAC	2	6	246978	246983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799186
5511	NC_008358	GGT	2	6	247091	247096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799186
5512	NC_008358	CA	3	6	247154	247159	50 %	0 %	0 %	50 %	114799186
5513	NC_008358	CAG	2	6	247364	247369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799186
5514	NC_008358	AGGCC	2	10	247409	247418	20 %	0 %	40 %	40 %	114799186
5515	NC_008358	GCA	2	6	247423	247428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799186
5516	NC_008358	TC	4	8	247429	247436	0 %	50 %	0 %	50 %	114799186
5517	NC_008358	ACA	2	6	247477	247482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799186
5518	NC_008358	TTC	2	6	247549	247554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799186
5519	NC_008358	GTC	2	6	247587	247592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799186
5520	NC_008358	CAC	2	6	247679	247684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114799186
5521	NC_008358	TCG	2	6	247736	247741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797541
5522	NC_008358	CGG	2	6	247817	247822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797541
5523	NC_008358	GGA	2	6	247845	247850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114797541
5524	NC_008358	CGG	2	6	247971	247976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797541
5525	NC_008358	CCA	2	6	247988	247993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114797541
5526	NC_008358	CT	3	6	248016	248021	0 %	50 %	0 %	50 %	114797541
5527	NC_008358	CTT	2	6	248114	248119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114800335
5528	NC_008358	TCG	2	6	248131	248136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800335
5529	NC_008358	CGCT	2	8	248137	248144	0 %	25 %	25 %	50 %	114800335
5530	NC_008358	TTC	2	6	248162	248167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114800335
5531	NC_008358	CTC	2	6	248286	248291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114800335
5532	NC_008358	GCG	2	6	248297	248302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800335
5533	NC_008358	AGG	2	6	248308	248313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114800335
5534	NC_008358	CTG	2	6	248322	248327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800335
5535	NC_008358	GTG	2	6	248331	248336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114800335
5536	NC_008358	GCTC	2	8	248368	248375	0 %	25 %	25 %	50 %	114800335
5537	NC_008358	GAT	2	6	248397	248402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800335
5538	NC_008358	GTT	2	6	248417	248422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114800335
5539	NC_008358	GCG	2	6	248458	248463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800335
5540	NC_008358	CGCT	2	8	248551	248558	0 %	25 %	25 %	50 %	114800335
5541	NC_008358	GC	3	6	248559	248564	0 %	0 %	50 %	50 %	114800335
5542	NC_008358	ATT	2	6	248595	248600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114800335
5543	NC_008358	CAG	2	6	248610	248615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800335
5544	NC_008358	ACCG	2	8	248760	248767	25 %	0 %	25 %	50 %	114800335
5545	NC_008358	ATT	2	6	248784	248789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114800335
5546	NC_008358	ATG	2	6	248820	248825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_008358	CGT	2	6	248861	248866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_008358	GGC	2	6	248871	248876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_008358	CGG	2	6	248963	248968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800308
5550	NC_008358	AAAGAC	2	12	248988	248999	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	114800308
5551	NC_008358	A	7	7	249013	249019	100 %	0 %	0 %	0 %	114800308
5552	NC_008358	AAG	2	6	249024	249029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114800308
5553	NC_008358	GAT	2	6	249030	249035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800308
5554	NC_008358	CAG	3	9	249047	249055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800308
5555	NC_008358	TGT	2	6	249092	249097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114800308
5556	NC_008358	CAT	2	6	249101	249106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114800308
5557	NC_008358	TCAATA	2	12	249139	249150	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	114800308
5558	NC_008358	TGA	2	6	249214	249219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114800308
5559	NC_008358	GCG	2	6	249238	249243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800308
5560	NC_008358	GC	3	6	249310	249315	0 %	0 %	50 %	50 %	114800308
5561	NC_008358	AAG	2	6	249321	249326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114800308
5562	NC_008358	TGCCG	2	10	249467	249476	0 %	20 %	40 %	40 %	114799290
5563	NC_008358	TGA	2	6	249520	249525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799290
5564	NC_008358	TGG	2	6	249715	249720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799290
5565	NC_008358	GAAG	2	8	249773	249780	50 %	0 %	50 %	0 %	114799290
5566	NC_008358	CTGG	2	8	249809	249816	0 %	25 %	50 %	25 %	114799290
5567	NC_008358	ATC	2	6	249840	249845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799290
5568	NC_008358	CGA	2	6	249916	249921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799290
5569	NC_008358	TGA	2	6	249982	249987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799290
5570	NC_008358	TGG	2	6	250018	250023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799290
5571	NC_008358	GTC	2	6	250032	250037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799290
5572	NC_008358	TAT	2	6	250054	250059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114799290
5573	NC_008358	TCA	2	6	250072	250077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799290
5574	NC_008358	GCC	3	9	250157	250165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799132
5575	NC_008358	CAGGG	2	10	250169	250178	20 %	0 %	60 %	20 %	114799132
5576	NC_008358	CTG	2	6	250208	250213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799132
5577	NC_008358	CTG	2	6	250229	250234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799132
5578	NC_008358	CCG	2	6	250345	250350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799132
5579	NC_008358	AAC	3	9	250430	250438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799132
5580	NC_008358	GTC	2	6	250442	250447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799132
5581	NC_008358	CG	3	6	250467	250472	0 %	0 %	50 %	50 %	114799132
5582	NC_008358	GTGG	2	8	250514	250521	0 %	25 %	75 %	0 %	114799132
5583	NC_008358	GCG	3	9	250533	250541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799132
5584	NC_008358	TCG	2	6	250609	250614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799132
5585	NC_008358	CCG	2	6	250641	250646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799132
5586	NC_008358	CAG	2	6	250715	250720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799132
5587	NC_008358	CTG	2	6	250723	250728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799132
5588	NC_008358	TGTC	2	8	250732	250739	0 %	50 %	25 %	25 %	114799132
5589	NC_008358	CG	3	6	250769	250774	0 %	0 %	50 %	50 %	114799132
5590	NC_008358	GCG	2	6	250785	250790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799132
5591	NC_008358	TGGGC	2	10	250825	250834	0 %	20 %	60 %	20 %	114799132
5592	NC_008358	AGG	2	6	250854	250859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114799132
5593	NC_008358	GCA	2	6	250890	250895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799132
5594	NC_008358	CGG	2	6	250898	250903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799132
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5597	NC_008358	CGG	2	6	250966	250971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799132
5598	NC_008358	TCG	2	6	250974	250979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799132
5599	NC_008358	GGCT	2	8	251036	251043	0 %	25 %	50 %	25 %	114799132
5600	NC_008358	TCT	2	6	251061	251066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799132
5601	NC_008358	GGC	2	6	251072	251077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799132
5602	NC_008358	GCG	2	6	251208	251213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799132
5603	NC_008358	GCA	2	6	251218	251223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799132
5604	NC_008358	GCGAG	2	10	251230	251239	20 %	0 %	60 %	20 %	114799132
5605	NC_008358	GCTG	2	8	251276	251283	0 %	25 %	50 %	25 %	114799132
5606	NC_008358	GCT	2	6	251309	251314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799132
5607	NC_008358	CAAC	2	8	251456	251463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_008358	CCGG	2	8	251579	251586	0 %	0 %	50 %	50 %	114799762
5609	NC_008358	GGAAG	2	10	251587	251596	40 %	0 %	60 %	0 %	114799762
5610	NC_008358	GGC	2	6	251716	251721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799762
5611	NC_008358	TGG	2	6	251742	251747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799762
5612	NC_008358	GC	3	6	251792	251797	0 %	0 %	50 %	50 %	114799762
5613	NC_008358	GCG	2	6	251813	251818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799762
5614	NC_008358	AGCC	2	8	251819	251826	25 %	0 %	25 %	50 %	114799762
5615	NC_008358	GCC	2	6	251837	251842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799762
5616	NC_008358	GCG	2	6	251966	251971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800152
5617	NC_008358	GC	3	6	252011	252016	0 %	0 %	50 %	50 %	114800152
5618	NC_008358	CTG	2	6	252094	252099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114800152
5619	NC_008358	CGG	2	6	252149	252154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800152
5620	NC_008358	TGAG	2	8	252274	252281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_008358	GAC	2	6	252324	252329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_008358	CAA	2	6	252336	252341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_008358	GCG	2	6	252361	252366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_008358	GATA	2	8	252378	252385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_008358	AAC	2	6	252405	252410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114799536
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5984	NC_008358	T	7	7	268589	268595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5985	NC_008358	TTG	2	6	268612	268617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5986	NC_008358	GCAG	2	8	268621	268628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5987	NC_008358	CGTC	2	8	268745	268752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5990	NC_008358	TCT	2	6	268841	268846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5991	NC_008358	CG	3	6	268873	268878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5992	NC_008358	TCG	2	6	269084	269089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5993	NC_008358	GCAA	2	8	269122	269129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5994	NC_008358	CAA	2	6	269136	269141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5995	NC_008358	CA	3	6	269214	269219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5996	NC_008358	GGTA	2	8	269235	269242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5997	NC_008358	CTT	2	6	269256	269261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5998	NC_008358	ATA	2	6	269326	269331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5999	NC_008358	CGGC	2	8	269388	269395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6000	NC_008358	TCA	2	6	269404	269409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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