MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_008212	GTT	3	9	722646	722654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667548
15503	NC_008212	TCA	3	9	722679	722687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667548
15504	NC_008212	CAA	2	6	722698	722703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667548
15505	NC_008212	GTG	2	6	722734	722739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667548
15506	NC_008212	GATT	2	8	722883	722890	25 %	50 %	25 %	0 %	110667548
15507	NC_008212	TTC	2	6	722891	722896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667548
15508	NC_008212	TCA	2	6	722943	722948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667548
15509	NC_008212	TTG	3	9	722970	722978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667549
15510	NC_008212	CA	3	6	722980	722985	50 %	0 %	0 %	50 %	110667549
15511	NC_008212	TCC	2	6	722995	723000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110667549
15512	NC_008212	ATT	2	6	723049	723054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667549
15513	NC_008212	C	6	6	723128	723133	0 %	0 %	0 %	100 %	110667549
15514	NC_008212	TCA	2	6	723176	723181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667549
15515	NC_008212	CCAG	2	8	723190	723197	25 %	0 %	25 %	50 %	110667549
15516	NC_008212	GGA	2	6	723231	723236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110667549
15517	NC_008212	CATGT	2	10	723253	723262	20 %	40 %	20 %	20 %	110667549
15518	NC_008212	TCA	2	6	723281	723286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667549
15519	NC_008212	TGA	2	6	723319	723324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667549
15520	NC_008212	CAA	2	6	723327	723332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667549
15521	NC_008212	TCG	2	6	723342	723347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667549
15522	NC_008212	TC	3	6	723427	723432	0 %	50 %	0 %	50 %	110667549
15523	NC_008212	CAA	2	6	723513	723518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667549
15524	NC_008212	CCT	2	6	723549	723554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110667549
15525	NC_008212	GTG	2	6	723627	723632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667549
15526	NC_008212	CAT	2	6	723633	723638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667549
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15528	NC_008212	GT	3	6	723712	723717	0 %	50 %	50 %	0 %	110667549
15529	NC_008212	ATG	2	6	723720	723725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667549
15530	NC_008212	CAG	2	6	723744	723749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667549
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15532	NC_008212	CAC	2	6	723771	723776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667549
15533	NC_008212	CAA	2	6	723777	723782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667549
15534	NC_008212	GCA	2	6	723824	723829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667549
15535	NC_008212	AC	3	6	723831	723836	50 %	0 %	0 %	50 %	110667549
15536	NC_008212	TGA	2	6	723847	723852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667549
15537	NC_008212	ACTC	2	8	723988	723995	25 %	25 %	0 %	50 %	110667549
15538	NC_008212	ATCC	2	8	724043	724050	25 %	25 %	0 %	50 %	110667549
15539	NC_008212	CTA	2	6	724106	724111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15540	NC_008212	CGG	2	6	724119	724124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15541	NC_008212	TG	3	6	724144	724149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_008212	AAT	2	6	724188	724193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_008212	ATC	2	6	724214	724219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15544	NC_008212	TTCA	2	8	724249	724256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15545	NC_008212	ATG	2	6	724266	724271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_008212	TC	3	6	724273	724278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15547	NC_008212	CTT	2	6	724316	724321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667550
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15553	NC_008212	ATT	2	6	724534	724539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667550
15554	NC_008212	CTG	2	6	724660	724665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667550
15555	NC_008212	ATC	2	6	724700	724705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667550
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15557	NC_008212	TGA	2	6	724914	724919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_008212	CGC	2	6	724995	725000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15559	NC_008212	CGTC	2	8	725001	725008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15560	NC_008212	TG	3	6	725060	725065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_008212	CCA	2	6	725100	725105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15562	NC_008212	CGG	2	6	725197	725202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15563	NC_008212	TCG	2	6	725240	725245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15565	NC_008212	TCG	2	6	725292	725297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_008212	GGA	2	6	725316	725321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15570	NC_008212	ATG	2	6	725509	725514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_008212	AAAAT	2	10	725521	725530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_008212	GCCG	2	8	725565	725572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15573	NC_008212	ACC	2	6	725622	725627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15574	NC_008212	TGC	2	6	725634	725639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_008212	TCTCT	2	10	725711	725720	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15576	NC_008212	TG	3	6	725727	725732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_008212	GTC	2	6	725817	725822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15579	NC_008212	TA	3	6	725840	725845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_008212	TAA	2	6	725849	725854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_008212	A	6	6	725883	725888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_008212	GAA	2	6	725889	725894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_008212	ACG	2	6	725896	725901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15585	NC_008212	GTC	2	6	725942	725947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667551
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15589	NC_008212	CGG	2	6	726017	726022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110667551
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15593	NC_008212	GC	3	6	726172	726177	0 %	0 %	50 %	50 %	110667551
15594	NC_008212	AC	3	6	726235	726240	50 %	0 %	0 %	50 %	110667551
15595	NC_008212	GTT	2	6	726249	726254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667551
15596	NC_008212	CAT	3	9	726283	726291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667551
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15599	NC_008212	CCAT	2	8	726404	726411	25 %	25 %	0 %	50 %	110667551
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15606	NC_008212	CAA	2	6	726607	726612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667551
15607	NC_008212	TGG	2	6	726668	726673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667551
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15612	NC_008212	CCA	2	6	726918	726923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667551
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15614	NC_008212	CGT	2	6	726956	726961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667551
15615	NC_008212	TAT	2	6	727049	727054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15616	NC_008212	TG	4	8	727084	727091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_008212	GAC	2	6	727105	727110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15618	NC_008212	CTG	2	6	727120	727125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15619	NC_008212	AT	3	6	727144	727149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15620	NC_008212	CAT	2	6	727207	727212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15621	NC_008212	CTG	2	6	727250	727255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15622	NC_008212	GAT	3	9	727269	727277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15623	NC_008212	CAT	4	12	727297	727308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15624	NC_008212	TAT	4	12	727309	727320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_008212	TAT	2	6	727330	727335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15626	NC_008212	CTC	2	6	727346	727351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15627	NC_008212	T	6	6	727357	727362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_008212	CAT	2	6	727365	727370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15629	NC_008212	CGCCA	2	10	727374	727383	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15630	NC_008212	ATA	2	6	727554	727559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15631	NC_008212	GAG	2	6	727562	727567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15632	NC_008212	GCCC	2	8	727663	727670	0 %	0 %	25 %	75 %	110667552
15633	NC_008212	ACC	2	6	727681	727686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667552
15634	NC_008212	GAT	2	6	727733	727738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667552
15635	NC_008212	AAAT	2	8	727766	727773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15636	NC_008212	TCT	2	6	727831	727836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667553
15637	NC_008212	TAT	2	6	727898	727903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667553
15638	NC_008212	AGTATC	2	12	727944	727955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110667553
15639	NC_008212	GAT	2	6	727990	727995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667553
15640	NC_008212	CAGT	2	8	728008	728015	25 %	25 %	25 %	25 %	110667553
15641	NC_008212	GACG	2	8	728022	728029	25 %	0 %	50 %	25 %	110667553
15642	NC_008212	TTCAGA	2	12	728064	728075	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110667553
15643	NC_008212	TAT	2	6	728099	728104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667553
15644	NC_008212	GGT	2	6	728106	728111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667553
15645	NC_008212	CCG	2	6	728176	728181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110667553
15646	NC_008212	TCG	2	6	728224	728229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667553
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15648	NC_008212	ACTG	2	8	728287	728294	25 %	25 %	25 %	25 %	110667553
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15650	NC_008212	ATC	2	6	728328	728333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667553
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15655	NC_008212	TGC	2	6	728448	728453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667553
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15659	NC_008212	CCG	2	6	728617	728622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110667553
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15662	NC_008212	TGC	2	6	728751	728756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667553
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15678	NC_008212	TCTG	2	8	729411	729418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15679	NC_008212	TAAG	2	8	729425	729432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15680	NC_008212	ATC	2	6	729435	729440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15682	NC_008212	ATCA	2	8	729570	729577	50 %	25 %	0 %	25 %	110667554
15683	NC_008212	AAT	2	6	729579	729584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667554
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15688	NC_008212	ATG	2	6	729892	729897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667554
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15695	NC_008212	TTG	3	9	730149	730157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667554
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15710	NC_008212	TTAA	2	8	730733	730740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15711	NC_008212	AT	3	6	730744	730749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15712	NC_008212	TGA	2	6	730774	730779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15713	NC_008212	ATT	2	6	730780	730785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15714	NC_008212	ATC	2	6	730802	730807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15715	NC_008212	ATT	2	6	730822	730827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15716	NC_008212	ATAA	2	8	730847	730854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15717	NC_008212	TAT	2	6	730873	730878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15718	NC_008212	CGA	2	6	730975	730980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667555
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15721	NC_008212	ATC	2	6	731118	731123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667555
15722	NC_008212	GTA	2	6	731128	731133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667555
15723	NC_008212	ATC	2	6	731139	731144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667555
15724	NC_008212	ATC	2	6	731166	731171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667555
15725	NC_008212	GTC	2	6	731227	731232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667555
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15728	NC_008212	TGC	2	6	731409	731414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667555
15729	NC_008212	TGA	2	6	731484	731489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667555
15730	NC_008212	ACGGCA	2	12	731530	731541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667555
15731	NC_008212	ATC	2	6	731583	731588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667555
15732	NC_008212	CGG	2	6	731666	731671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110667555
15733	NC_008212	ACT	2	6	731755	731760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667555
15734	NC_008212	ATTGTC	2	12	731818	731829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	110667555
15735	NC_008212	CCA	3	9	731894	731902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667555
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15737	NC_008212	CTG	2	6	731966	731971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667555
15738	NC_008212	GGATT	2	10	731976	731985	20 %	40 %	40 %	0 %	110667555
15739	NC_008212	TGTCA	2	10	732093	732102	20 %	40 %	20 %	20 %	110667555
15740	NC_008212	TCC	2	6	732207	732212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110667555
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15742	NC_008212	ATT	2	6	732294	732299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667555
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15744	NC_008212	TCA	2	6	732379	732384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667555
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15990	NC_008212	TCA	2	6	743365	743370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667566
15991	NC_008212	CCA	2	6	743425	743430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667566
15992	NC_008212	AATC	2	8	743529	743536	50 %	25 %	0 %	25 %	110667566
15993	NC_008212	TAA	2	6	743594	743599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667566
15994	NC_008212	TTTA	2	8	743682	743689	25 %	75 %	0 %	0 %	110667566
15995	NC_008212	GAAG	2	8	743701	743708	50 %	0 %	50 %	0 %	110667566
15996	NC_008212	GACGGT	2	12	743766	743777	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110667566
15997	NC_008212	GAA	2	6	743801	743806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667566
15998	NC_008212	CAT	2	6	743837	743842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667566
15999	NC_008212	TCG	2	6	743874	743879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667566
16000	NC_008212	CGG	2	6	743895	743900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110667566

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