MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008212	CATT	2	8	701530	701537	25 %	50 %	0 %	25 %	110667530
15002	NC_008212	GTC	2	6	701548	701553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667530
15003	NC_008212	TTGGTG	2	12	701569	701580	0 %	50 %	50 %	0 %	110667530
15004	NC_008212	TTTA	2	8	701592	701599	25 %	75 %	0 %	0 %	110667530
15005	NC_008212	TGAT	2	8	701631	701638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_008212	TTAC	2	8	701643	701650	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15007	NC_008212	CAGACA	2	12	701763	701774	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	110667531
15008	NC_008212	GGT	2	6	701804	701809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667531
15009	NC_008212	AT	3	6	701878	701883	50 %	50 %	0 %	0 %	110667531
15010	NC_008212	CAT	2	6	702009	702014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667531
15011	NC_008212	ATG	2	6	702076	702081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667531
15012	NC_008212	GA	3	6	702148	702153	50 %	0 %	50 %	0 %	110667531
15013	NC_008212	CAG	2	6	702172	702177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667531
15014	NC_008212	CACG	2	8	702234	702241	25 %	0 %	25 %	50 %	110667531
15015	NC_008212	TGA	2	6	702245	702250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667531
15016	NC_008212	TGA	2	6	702254	702259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667531
15017	NC_008212	CGT	2	6	702339	702344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667531
15018	NC_008212	AACC	2	8	702429	702436	50 %	0 %	0 %	50 %	110667531
15019	NC_008212	CG	3	6	702478	702483	0 %	0 %	50 %	50 %	110667531
15020	NC_008212	TGA	2	6	702509	702514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667531
15021	NC_008212	TATG	2	8	702531	702538	25 %	50 %	25 %	0 %	110667531
15022	NC_008212	TCA	2	6	702564	702569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667531
15023	NC_008212	GAA	2	6	702614	702619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667531
15024	NC_008212	CTC	2	6	702653	702658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110667531
15025	NC_008212	TCCA	2	8	702692	702699	25 %	25 %	0 %	50 %	110667531
15026	NC_008212	CAA	2	6	702704	702709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667531
15027	NC_008212	TGG	2	6	702710	702715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667531
15028	NC_008212	TAT	2	6	702743	702748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667531
15029	NC_008212	CAT	2	6	702753	702758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667531
15030	NC_008212	TGCA	2	8	702781	702788	25 %	25 %	25 %	25 %	110667531
15031	NC_008212	TCA	2	6	702829	702834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667531
15032	NC_008212	TGA	2	6	702884	702889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667531
15033	NC_008212	TCCA	2	8	702907	702914	25 %	25 %	0 %	50 %	110667531
15034	NC_008212	CGA	2	6	702937	702942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667531
15035	NC_008212	TGG	2	6	702944	702949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667531
15036	NC_008212	AAT	2	6	702999	703004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667531
15037	NC_008212	TTG	2	6	703009	703014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667531
15038	NC_008212	GAG	2	6	703104	703109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110667531
15039	NC_008212	GCA	2	6	703179	703184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667531
15040	NC_008212	ACA	2	6	703262	703267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667531
15041	NC_008212	GTT	2	6	703310	703315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667531
15042	NC_008212	GCT	2	6	703332	703337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667531
15043	NC_008212	CGAG	2	8	703340	703347	25 %	0 %	50 %	25 %	110667531
15044	NC_008212	CAC	2	6	703411	703416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667531
15045	NC_008212	TGA	2	6	703427	703432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667531
15046	NC_008212	GAA	2	6	703461	703466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667531
15047	NC_008212	TGA	2	6	703472	703477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667531
15048	NC_008212	CCGAC	2	10	703507	703516	20 %	0 %	20 %	60 %	110667531
15049	NC_008212	GAT	3	9	703518	703526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667531
15050	NC_008212	GATACA	2	12	703533	703544	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	110667531
15051	NC_008212	TGA	2	6	703622	703627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667531
15052	NC_008212	GAG	2	6	703641	703646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110667531
15053	NC_008212	GAA	2	6	703650	703655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667531
15054	NC_008212	CTCG	2	8	703713	703720	0 %	25 %	25 %	50 %	110667531
15055	NC_008212	GTT	2	6	703725	703730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667531
15056	NC_008212	AAC	2	6	703744	703749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667531
15057	NC_008212	TGA	2	6	703787	703792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667531
15058	NC_008212	GTT	2	6	703809	703814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667531
15059	NC_008212	TTG	2	6	703816	703821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667531
15060	NC_008212	TTGC	2	8	703869	703876	0 %	50 %	25 %	25 %	110667531
15061	NC_008212	CTT	2	6	703896	703901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667531
15062	NC_008212	AATA	2	8	703960	703967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_008212	CGG	2	6	703972	703977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15064	NC_008212	GTTA	2	8	704140	704147	25 %	50 %	25 %	0 %	110667532
15065	NC_008212	TCGA	2	8	704148	704155	25 %	25 %	25 %	25 %	110667532
15066	NC_008212	CGT	2	6	704235	704240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667532
15067	NC_008212	GATTC	2	10	704272	704281	20 %	40 %	20 %	20 %	110667532
15068	NC_008212	ACC	2	6	704282	704287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667532
15069	NC_008212	TGA	2	6	704290	704295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667532
15070	NC_008212	TC	3	6	704317	704322	0 %	50 %	0 %	50 %	110667532
15071	NC_008212	TGA	2	6	704365	704370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667532
15072	NC_008212	TCGAA	2	10	704374	704383	40 %	20 %	20 %	20 %	110667532
15073	NC_008212	ACA	2	6	704384	704389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667532
15074	NC_008212	GGT	2	6	704447	704452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667532
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15076	NC_008212	TGC	2	6	704530	704535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667532
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15078	NC_008212	TCGT	2	8	704564	704571	0 %	50 %	25 %	25 %	110667532
15079	NC_008212	TGT	2	6	704635	704640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667532
15080	NC_008212	GC	3	6	704653	704658	0 %	0 %	50 %	50 %	110667532
15081	NC_008212	TGA	2	6	704677	704682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667532
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15086	NC_008212	CTG	2	6	705039	705044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667532
15087	NC_008212	CACG	2	8	705054	705061	25 %	0 %	25 %	50 %	110667532
15088	NC_008212	TTG	2	6	705117	705122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667532
15089	NC_008212	TCG	2	6	705211	705216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667532
15090	NC_008212	ATG	2	6	705281	705286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667532
15091	NC_008212	TTG	2	6	705342	705347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667532
15092	NC_008212	GAT	2	6	705358	705363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667532
15093	NC_008212	ACA	2	6	705386	705391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667532
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15102	NC_008212	CTG	2	6	705615	705620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667532
15103	NC_008212	GAT	2	6	705646	705651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667532
15104	NC_008212	TATG	2	8	705808	705815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_008212	TAA	2	6	705827	705832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_008212	TCC	2	6	705857	705862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15107	NC_008212	GAG	2	6	705890	705895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_008212	TTCAA	2	10	705896	705905	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15109	NC_008212	GCT	2	6	705923	705928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_008212	TAC	2	6	705972	705977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_008212	GGA	3	9	705982	705990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_008212	CAG	2	6	706033	706038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_008212	TC	3	6	706065	706070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15114	NC_008212	ACACTA	2	12	706091	706102	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_008212	TGA	2	6	706147	706152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667533
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15120	NC_008212	ACT	2	6	706379	706384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667533
15121	NC_008212	AATCT	2	10	706404	706413	40 %	40 %	0 %	20 %	110667533
15122	NC_008212	ATC	2	6	706449	706454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_008212	T	6	6	706456	706461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_008212	CTA	2	6	706586	706591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667534
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15126	NC_008212	CGG	2	6	706634	706639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110667534
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15130	NC_008212	GTC	2	6	706801	706806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667534
15131	NC_008212	CTT	2	6	706825	706830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667534
15132	NC_008212	AT	3	6	706849	706854	50 %	50 %	0 %	0 %	110667534
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15150	NC_008212	TGA	2	6	707214	707219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667534
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15152	NC_008212	TGA	2	6	707320	707325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15153	NC_008212	ATT	2	6	707336	707341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15154	NC_008212	CGA	2	6	707344	707349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15157	NC_008212	CAC	2	6	707429	707434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15208	NC_008212	CT	3	6	709687	709692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15224	NC_008212	GTCCGA	2	12	710500	710511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110667538
15225	NC_008212	AGTCTA	2	12	710517	710528	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110667538
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15237	NC_008212	TCA	2	6	711151	711156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667539
15238	NC_008212	A	6	6	711162	711167	100 %	0 %	0 %	0 %	110667539
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15240	NC_008212	CAGT	2	8	711241	711248	25 %	25 %	25 %	25 %	110667539
15241	NC_008212	GAT	2	6	711267	711272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667539
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15243	NC_008212	TGAA	2	8	711342	711349	50 %	25 %	25 %	0 %	110667539
15244	NC_008212	AATC	2	8	711389	711396	50 %	25 %	0 %	25 %	110667539
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15252	NC_008212	ACT	2	6	711836	711841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15333	NC_008212	CGAA	2	8	715571	715578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15361	NC_008212	TTG	2	6	717046	717051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667542
15362	NC_008212	TGA	2	6	717111	717116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667542
15363	NC_008212	CAC	2	6	717133	717138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667542
15364	NC_008212	TC	3	6	717223	717228	0 %	50 %	0 %	50 %	110667542
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15367	NC_008212	CAT	2	6	717319	717324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667542
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15377	NC_008212	CTG	2	6	717702	717707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15380	NC_008212	ACATC	4	20	717799	717818	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15381	NC_008212	TTGAT	2	10	717843	717852	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15382	NC_008212	CGGTGA	2	12	717873	717884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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15384	NC_008212	CTG	2	6	717944	717949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667543
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15393	NC_008212	TCG	2	6	718353	718358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667543
15394	NC_008212	TCG	2	6	718378	718383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667543
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15396	NC_008212	CTTT	2	8	718453	718460	0 %	75 %	0 %	25 %	110667543
15397	NC_008212	TGG	2	6	718521	718526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667543
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15447	NC_008212	T	6	6	720282	720287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15448	NC_008212	AATAT	2	10	720337	720346	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15449	NC_008212	TACA	2	8	720348	720355	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15450	NC_008212	CA	3	6	720361	720366	50 %	0 %	0 %	50 %	110667545
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15459	NC_008212	TTCC	2	8	720923	720930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15460	NC_008212	TAT	2	6	720984	720989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15461	NC_008212	ATA	2	6	720994	720999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15462	NC_008212	CCGC	2	8	721011	721018	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15463	NC_008212	TATT	2	8	721046	721053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15464	NC_008212	CGCA	2	8	721097	721104	25 %	0 %	25 %	50 %	110667546
15465	NC_008212	ATCC	2	8	721121	721128	25 %	25 %	0 %	50 %	110667546
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15467	NC_008212	A	6	6	721295	721300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15468	NC_008212	CAT	2	6	721304	721309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15470	NC_008212	ACT	2	6	721359	721364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15471	NC_008212	AT	3	6	721371	721376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15472	NC_008212	CAGAC	2	10	721439	721448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15473	NC_008212	CTT	2	6	721539	721544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667547
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15482	NC_008212	GAT	2	6	721707	721712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667547
15483	NC_008212	TCA	2	6	721719	721724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667547
15484	NC_008212	AAC	2	6	721787	721792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667547
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15487	NC_008212	ATCA	2	8	721999	722006	50 %	25 %	0 %	25 %	110667547
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15495	NC_008212	CCGATG	2	12	722428	722439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110667547
15496	NC_008212	ATA	3	9	722443	722451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667547
15497	NC_008212	GAT	2	6	722463	722468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667547
15498	NC_008212	GACA	2	8	722481	722488	50 %	0 %	25 %	25 %	110667547
15499	NC_008212	GAGT	2	8	722493	722500	25 %	25 %	50 %	0 %	110667547
15500	NC_008212	ATA	2	6	722512	722517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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