MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008212	ATC	2	6	541742	541747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667400
11502	NC_008212	AGC	2	6	541751	541756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667400
11503	NC_008212	GGT	2	6	541788	541793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667400
11504	NC_008212	CTT	2	6	541922	541927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667400
11505	NC_008212	GCA	2	6	541944	541949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667400
11506	NC_008212	ATG	2	6	541985	541990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667400
11507	NC_008212	CTG	2	6	542005	542010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667400
11508	NC_008212	GCTC	2	8	542017	542024	0 %	25 %	25 %	50 %	110667400
11509	NC_008212	CAT	2	6	542035	542040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667400
11510	NC_008212	TTC	2	6	542105	542110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667400
11511	NC_008212	ACT	2	6	542129	542134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667400
11512	NC_008212	AGT	2	6	542291	542296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667400
11513	NC_008212	CT	3	6	542436	542441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11514	NC_008212	AT	4	8	542455	542462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_008212	GCT	2	6	542464	542469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_008212	ATATT	2	10	542547	542556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_008212	CGT	2	6	542586	542591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_008212	GGT	2	6	542625	542630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_008212	CA	3	6	542680	542685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11520	NC_008212	TAT	2	6	542765	542770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_008212	CAG	2	6	542783	542788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_008212	GTGA	2	8	542790	542797	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_008212	ATGA	2	8	542806	542813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_008212	TTG	2	6	542983	542988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_008212	CAA	2	6	543108	543113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_008212	TCG	2	6	543199	543204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_008212	AAT	2	6	543284	543289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_008212	A	6	6	543330	543335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_008212	TGA	2	6	543396	543401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_008212	TGA	2	6	543417	543422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_008212	AAT	2	6	543474	543479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667401
11532	NC_008212	TAG	2	6	543495	543500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667401
11533	NC_008212	CAA	2	6	543501	543506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667401
11534	NC_008212	TGC	2	6	543532	543537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667401
11535	NC_008212	TCA	2	6	543548	543553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667401
11536	NC_008212	TGA	2	6	543645	543650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667401
11537	NC_008212	AG	3	6	543660	543665	50 %	0 %	50 %	0 %	110667401
11538	NC_008212	CCA	2	6	543672	543677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667401
11539	NC_008212	A	6	6	543685	543690	100 %	0 %	0 %	0 %	110667401
11540	NC_008212	TGT	2	6	543721	543726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667401
11541	NC_008212	CTG	2	6	543751	543756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667401
11542	NC_008212	AATAC	2	10	543815	543824	60 %	20 %	0 %	20 %	110667401
11543	NC_008212	TG	3	6	543825	543830	0 %	50 %	50 %	0 %	110667401
11544	NC_008212	TAA	2	6	543846	543851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667401
11545	NC_008212	CAT	3	9	543895	543903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667401
11546	NC_008212	CA	3	6	543946	543951	50 %	0 %	0 %	50 %	110667401
11547	NC_008212	GCCC	2	8	543952	543959	0 %	0 %	25 %	75 %	110667401
11548	NC_008212	TGT	2	6	543970	543975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667401
11549	NC_008212	TC	3	6	544007	544012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11550	NC_008212	CATA	2	8	544037	544044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11551	NC_008212	TGC	2	6	544057	544062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_008212	TTC	2	6	544121	544126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_008212	CGA	2	6	544232	544237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_008212	GGC	2	6	544239	544244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_008212	GATGCA	2	12	544314	544325	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11556	NC_008212	CAC	2	6	544351	544356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11557	NC_008212	CAAAA	2	10	544397	544406	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11558	NC_008212	AGT	2	6	544471	544476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_008212	ACTCG	2	10	544480	544489	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11560	NC_008212	CCA	2	6	544559	544564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11561	NC_008212	TCACGC	2	12	544566	544577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11562	NC_008212	TCC	2	6	544585	544590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11563	NC_008212	AGT	2	6	544646	544651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_008212	TC	3	6	544652	544657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11565	NC_008212	TTG	2	6	544691	544696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_008212	GGA	3	9	544710	544718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_008212	CAA	2	6	544752	544757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11569	NC_008212	ACA	2	6	544790	544795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_008212	TA	3	6	544820	544825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_008212	ATA	2	6	544856	544861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_008212	TGA	2	6	544877	544882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667402
11573	NC_008212	TAA	2	6	545110	545115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_008212	CTC	2	6	545131	545136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11575	NC_008212	A	6	6	545198	545203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_008212	TGA	2	6	545528	545533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_008212	TTG	2	6	545597	545602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_008212	T	7	7	545755	545761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_008212	GCT	2	6	545796	545801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11582	NC_008212	A	6	6	545861	545866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_008212	TAT	2	6	545867	545872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_008212	CGA	2	6	545903	545908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_008212	TAAA	2	8	545986	545993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_008212	AT	4	8	545999	546006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_008212	TACA	2	8	546010	546017	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11588	NC_008212	TCAGA	2	10	546037	546046	40 %	20 %	20 %	20 %	110667404
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11592	NC_008212	TGA	2	6	546126	546131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667404
11593	NC_008212	CGA	2	6	546150	546155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667404
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11595	NC_008212	CT	3	6	546251	546256	0 %	50 %	0 %	50 %	110667404
11596	NC_008212	GTT	2	6	546274	546279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667404
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11598	NC_008212	GTC	2	6	546490	546495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667404
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11602	NC_008212	CAA	3	9	546734	546742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667404
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11606	NC_008212	TCGA	2	8	547012	547019	25 %	25 %	25 %	25 %	110667404
11607	NC_008212	TTC	2	6	547042	547047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667404
11608	NC_008212	CAT	2	6	547060	547065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_008212	ATAA	2	8	547073	547080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_008212	TAAT	2	8	547103	547110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_008212	TAA	2	6	547137	547142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_008212	GATA	2	8	547155	547162	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_008212	TGA	2	6	547168	547173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_008212	AAT	2	6	547231	547236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_008212	TGTTA	2	10	547238	547247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_008212	AATAA	2	10	547330	547339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_008212	GCA	2	6	547354	547359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667405
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11621	NC_008212	AAC	2	6	547507	547512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667405
11622	NC_008212	CAA	2	6	547580	547585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667405
11623	NC_008212	TA	3	6	547671	547676	50 %	50 %	0 %	0 %	110667405
11624	NC_008212	CAA	2	6	547695	547700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667405
11625	NC_008212	CTT	2	6	547709	547714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667405
11626	NC_008212	CA	3	6	547739	547744	50 %	0 %	0 %	50 %	110667405
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11628	NC_008212	CGA	2	6	547960	547965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667406
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11738	NC_008212	GACA	2	8	552767	552774	50 %	0 %	25 %	25 %	110667407
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11746	NC_008212	GCT	2	6	553041	553046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667408
11747	NC_008212	ATG	2	6	553078	553083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667408
11748	NC_008212	TAC	2	6	553160	553165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11749	NC_008212	CAT	2	6	553172	553177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11750	NC_008212	TTCAT	2	10	553211	553220	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11751	NC_008212	GTA	2	6	553295	553300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11752	NC_008212	AAT	2	6	553327	553332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11753	NC_008212	GAT	2	6	553493	553498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11754	NC_008212	ATTGA	2	10	553503	553512	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11755	NC_008212	GTC	2	6	553552	553557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11756	NC_008212	TCCA	2	8	553560	553567	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11757	NC_008212	AGT	2	6	553572	553577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11758	NC_008212	TTA	2	6	553588	553593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11759	NC_008212	ATT	2	6	553680	553685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11760	NC_008212	TCA	2	6	553828	553833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11762	NC_008212	TGTTCG	2	12	553942	553953	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	110667409
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11771	NC_008212	ATC	2	6	554338	554343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667410
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11791	NC_008212	ATG	2	6	555289	555294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11793	NC_008212	CAT	2	6	555340	555345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11800	NC_008212	CAA	2	6	555755	555760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11801	NC_008212	AAT	2	6	555771	555776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11802	NC_008212	ATAA	2	8	555783	555790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11803	NC_008212	CAA	2	6	555815	555820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11804	NC_008212	CCCG	2	8	555846	555853	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11805	NC_008212	AT	3	6	555902	555907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11866	NC_008212	GCG	2	6	558542	558547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110667414
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11986	NC_008212	ATT	2	6	563823	563828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11987	NC_008212	CT	3	6	563878	563883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11988	NC_008212	TGAT	2	8	563930	563937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11989	NC_008212	AT	3	6	563959	563964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11990	NC_008212	TC	3	6	563970	563975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11991	NC_008212	GA	3	6	564046	564051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11992	NC_008212	ATT	3	9	564095	564103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11993	NC_008212	ACT	2	6	564135	564140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11994	NC_008212	AGTT	2	8	564166	564173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11995	NC_008212	GT	3	6	564174	564179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11996	NC_008212	GAA	2	6	564205	564210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11997	NC_008212	AT	3	6	564305	564310	50 %	50 %	0 %	0 %	110667419
11998	NC_008212	CAT	2	6	564384	564389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667419
11999	NC_008212	ACA	2	6	564530	564535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667419
12000	NC_008212	TGT	2	6	564537	564542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667419

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