MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008212	TGAA	2	8	517482	517489	50 %	25 %	25 %	0 %	110667380
11002	NC_008212	TTA	2	6	517525	517530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667380
11003	NC_008212	GCA	2	6	517561	517566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667380
11004	NC_008212	CAT	2	6	517577	517582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667380
11005	NC_008212	AATG	2	8	517590	517597	50 %	25 %	25 %	0 %	110667380
11006	NC_008212	GTC	2	6	517707	517712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667380
11007	NC_008212	TAA	2	6	517715	517720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667380
11008	NC_008212	AAG	2	6	517746	517751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667380
11009	NC_008212	CAT	2	6	517781	517786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667380
11010	NC_008212	TGC	2	6	517872	517877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667380
11011	NC_008212	GTA	2	6	518019	518024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667380
11012	NC_008212	CA	3	6	518027	518032	50 %	0 %	0 %	50 %	110667380
11013	NC_008212	TG	3	6	518065	518070	0 %	50 %	50 %	0 %	110667380
11014	NC_008212	GTC	2	6	518089	518094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667380
11015	NC_008212	AAG	2	6	518148	518153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667380
11016	NC_008212	GCTCAC	2	12	518156	518167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	110667380
11017	NC_008212	TGT	2	6	518196	518201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667380
11018	NC_008212	CAT	2	6	518228	518233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667380
11019	NC_008212	CGAT	2	8	518254	518261	25 %	25 %	25 %	25 %	110667380
11020	NC_008212	TTG	2	6	518270	518275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667380
11021	NC_008212	GA	3	6	518356	518361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_008212	GTT	2	6	518380	518385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_008212	TCC	3	9	518432	518440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_008212	TCC	3	9	518475	518483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_008212	GTG	2	6	518488	518493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_008212	AATTC	2	10	518514	518523	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11027	NC_008212	GCT	2	6	518543	518548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_008212	ATA	2	6	518626	518631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_008212	TGA	2	6	518725	518730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_008212	ATT	2	6	518748	518753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_008212	ATTG	2	8	518774	518781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_008212	A	6	6	518790	518795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_008212	CATG	2	8	518893	518900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11034	NC_008212	AT	3	6	519022	519027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_008212	T	6	6	519069	519074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_008212	CCT	2	6	519077	519082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11037	NC_008212	ATC	2	6	519090	519095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_008212	GAT	2	6	519126	519131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_008212	ATT	3	9	519156	519164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_008212	CGA	2	6	519174	519179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_008212	CGA	2	6	519197	519202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_008212	AT	3	6	519224	519229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_008212	GAA	2	6	519246	519251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_008212	TC	3	6	519263	519268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11045	NC_008212	CGC	2	6	519338	519343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110667381
11046	NC_008212	CAC	2	6	519407	519412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667381
11047	NC_008212	CAT	2	6	519422	519427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667381
11048	NC_008212	CGA	2	6	519437	519442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667381
11049	NC_008212	TGT	2	6	519487	519492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667381
11050	NC_008212	TTGG	2	8	519624	519631	0 %	50 %	50 %	0 %	110667381
11051	NC_008212	CG	3	6	519632	519637	0 %	0 %	50 %	50 %	110667381
11052	NC_008212	AG	3	6	519657	519662	50 %	0 %	50 %	0 %	110667381
11053	NC_008212	ATC	2	6	519678	519683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667381
11054	NC_008212	TCGA	2	8	519722	519729	25 %	25 %	25 %	25 %	110667381
11055	NC_008212	CTC	2	6	519741	519746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110667381
11056	NC_008212	ACG	2	6	519757	519762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667381
11057	NC_008212	CATACC	2	12	519793	519804	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	110667381
11058	NC_008212	TCA	2	6	519829	519834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667381
11059	NC_008212	TCG	2	6	519874	519879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667381
11060	NC_008212	TCG	2	6	519937	519942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667381
11061	NC_008212	TAA	2	6	519956	519961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667381
11062	NC_008212	GCAG	2	8	519968	519975	25 %	0 %	50 %	25 %	110667381
11063	NC_008212	ATC	2	6	519999	520004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667381
11064	NC_008212	TGG	2	6	520171	520176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667381
11065	NC_008212	CTC	2	6	520227	520232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110667381
11066	NC_008212	CAG	2	6	520240	520245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667381
11067	NC_008212	AGGC	2	8	520291	520298	25 %	0 %	50 %	25 %	110667381
11068	NC_008212	CAT	2	6	520304	520309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667381
11069	NC_008212	CGA	2	6	520370	520375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667381
11070	NC_008212	TAA	2	6	520482	520487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_008212	ACT	2	6	520493	520498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_008212	AGC	2	6	520523	520528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_008212	CAC	2	6	520549	520554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11074	NC_008212	TGTCTG	2	12	520579	520590	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11075	NC_008212	ACG	2	6	520602	520607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_008212	TGA	2	6	520625	520630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_008212	TTA	2	6	520654	520659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_008212	CGA	3	9	520673	520681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_008212	TCAG	2	8	520919	520926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11080	NC_008212	GC	3	6	520964	520969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11081	NC_008212	T	6	6	521000	521005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_008212	AC	3	6	521087	521092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11083	NC_008212	TTA	2	6	521142	521147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_008212	TA	3	6	521169	521174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_008212	TCA	2	6	521217	521222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_008212	AAT	2	6	521223	521228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_008212	TGA	2	6	521252	521257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667382
11088	NC_008212	GAG	2	6	521368	521373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110667382
11089	NC_008212	ATG	2	6	521465	521470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667382
11090	NC_008212	CAC	2	6	521522	521527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667382
11091	NC_008212	AG	3	6	521541	521546	50 %	0 %	50 %	0 %	110667382
11092	NC_008212	AG	3	6	521596	521601	50 %	0 %	50 %	0 %	110667382
11093	NC_008212	GCGCGA	2	12	521628	521639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	110667382
11094	NC_008212	CAG	2	6	521827	521832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667382
11095	NC_008212	GTAC	2	8	521889	521896	25 %	25 %	25 %	25 %	110667382
11096	NC_008212	GTGA	2	8	521926	521933	25 %	25 %	50 %	0 %	110667382
11097	NC_008212	CGAA	2	8	522036	522043	50 %	0 %	25 %	25 %	110667382
11098	NC_008212	AG	3	6	522204	522209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_008212	CAAG	2	8	522239	522246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11100	NC_008212	TAAA	2	8	522295	522302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_008212	A	6	6	522333	522338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_008212	AC	3	6	522430	522435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11103	NC_008212	GAA	2	6	522542	522547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_008212	TTA	2	6	522665	522670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_008212	GCT	2	6	522744	522749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_008212	TCAAA	2	10	522778	522787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11107	NC_008212	GTG	2	6	522801	522806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_008212	TAAG	2	8	522843	522850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_008212	CTA	2	6	522875	522880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_008212	ATC	2	6	522944	522949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_008212	T	7	7	522979	522985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_008212	AAG	2	6	523043	523048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_008212	CG	3	6	523075	523080	0 %	0 %	50 %	50 %	110667383
11114	NC_008212	TGA	2	6	523100	523105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667383
11115	NC_008212	TGGA	2	8	523160	523167	25 %	25 %	50 %	0 %	110667383
11116	NC_008212	TCAT	2	8	523284	523291	25 %	50 %	0 %	25 %	110667383
11117	NC_008212	ATC	2	6	523343	523348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667383
11118	NC_008212	CTGT	2	8	523375	523382	0 %	50 %	25 %	25 %	110667383
11119	NC_008212	AGCG	2	8	523459	523466	25 %	0 %	50 %	25 %	110667383
11120	NC_008212	ATC	2	6	523521	523526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667383
11121	NC_008212	TGTT	2	8	523568	523575	0 %	75 %	25 %	0 %	110667383
11122	NC_008212	AT	3	6	523589	523594	50 %	50 %	0 %	0 %	110667383
11123	NC_008212	AAT	2	6	523617	523622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667383
11124	NC_008212	CGA	2	6	523647	523652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667383
11125	NC_008212	TCA	2	6	523680	523685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667383
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11162	NC_008212	GATT	2	8	525074	525081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11230	NC_008212	GCT	2	6	528384	528389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667388
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11233	NC_008212	GCAA	2	8	528446	528453	50 %	0 %	25 %	25 %	110667388
11234	NC_008212	AAT	4	12	528487	528498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667388
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11237	NC_008212	ATCG	2	8	528585	528592	25 %	25 %	25 %	25 %	110667388
11238	NC_008212	GCA	2	6	528656	528661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667388
11239	NC_008212	TC	3	6	528681	528686	0 %	50 %	0 %	50 %	110667388
11240	NC_008212	CCAAGT	2	12	528725	528736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110667388
11241	NC_008212	CAG	2	6	528738	528743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667388
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11243	NC_008212	TA	3	6	528808	528813	50 %	50 %	0 %	0 %	110667388
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11245	NC_008212	CTG	2	6	528924	528929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667388
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11288	NC_008212	TGG	2	6	530840	530845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11368	NC_008212	TGA	2	6	534680	534685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667395
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11375	NC_008212	CTTT	2	8	535118	535125	0 %	75 %	0 %	25 %	110667395
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11397	NC_008212	A	6	6	536718	536723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11402	NC_008212	GCT	2	6	536997	537002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11411	NC_008212	CCCCG	2	10	537346	537355	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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11478	NC_008212	TTAT	2	8	540660	540667	25 %	75 %	0 %	0 %	110667399
11479	NC_008212	ACCG	2	8	540747	540754	25 %	0 %	25 %	50 %	110667399
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11482	NC_008212	TGA	2	6	540923	540928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667399
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11484	NC_008212	CTT	3	9	540980	540988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11485	NC_008212	CA	3	6	541038	541043	50 %	0 %	0 %	50 %	110667400
11486	NC_008212	GC	3	6	541159	541164	0 %	0 %	50 %	50 %	110667400
11487	NC_008212	CTGA	2	8	541189	541196	25 %	25 %	25 %	25 %	110667400
11488	NC_008212	TGC	2	6	541202	541207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667400
11489	NC_008212	CGTC	2	8	541210	541217	0 %	25 %	25 %	50 %	110667400
11490	NC_008212	CAA	2	6	541234	541239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667400
11491	NC_008212	ATCG	2	8	541243	541250	25 %	25 %	25 %	25 %	110667400
11492	NC_008212	AATG	2	8	541256	541263	50 %	25 %	25 %	0 %	110667400
11493	NC_008212	CGG	2	6	541331	541336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110667400
11494	NC_008212	GCT	2	6	541413	541418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667400
11495	NC_008212	ATC	2	6	541499	541504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667400
11496	NC_008212	ACG	2	6	541550	541555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667400
11497	NC_008212	TGTT	2	8	541622	541629	0 %	75 %	25 %	0 %	110667400
11498	NC_008212	GA	3	6	541669	541674	50 %	0 %	50 %	0 %	110667400
11499	NC_008212	CAG	2	6	541693	541698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667400
11500	NC_008212	ACA	2	6	541728	541733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667400

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