MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008212	TGA	2	6	471370	471375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667334
10002	NC_008212	CT	3	6	471377	471382	0 %	50 %	0 %	50 %	110667334
10003	NC_008212	GA	3	6	471389	471394	50 %	0 %	50 %	0 %	110667334
10004	NC_008212	GCA	2	6	471410	471415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667334
10005	NC_008212	TGA	2	6	471424	471429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667334
10006	NC_008212	AGC	2	6	471477	471482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667334
10007	NC_008212	AAT	2	6	471521	471526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667334
10008	NC_008212	TGAT	2	8	471564	471571	25 %	50 %	25 %	0 %	110667334
10009	NC_008212	CGAT	2	8	471580	471587	25 %	25 %	25 %	25 %	110667334
10010	NC_008212	GAAT	2	8	471654	471661	50 %	25 %	25 %	0 %	110667334
10011	NC_008212	CCG	2	6	471691	471696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110667334
10012	NC_008212	GAAC	2	8	471701	471708	50 %	0 %	25 %	25 %	110667334
10013	NC_008212	TAA	2	6	471724	471729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667334
10014	NC_008212	ACA	2	6	471760	471765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667334
10015	NC_008212	TAC	3	9	471773	471781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667334
10016	NC_008212	GGGT	2	8	471834	471841	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_008212	GAG	2	6	471867	471872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_008212	ATT	2	6	471888	471893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_008212	TAC	2	6	471915	471920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_008212	AT	3	6	471962	471967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_008212	TAA	2	6	471989	471994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_008212	ATTAT	2	10	472018	472027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_008212	TATC	2	8	472032	472039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10024	NC_008212	A	6	6	472077	472082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_008212	ATG	2	6	472088	472093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667335
10026	NC_008212	ATT	2	6	472180	472185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667335
10027	NC_008212	TTG	2	6	472215	472220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667335
10028	NC_008212	ATG	2	6	472221	472226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667335
10029	NC_008212	AGC	2	6	472240	472245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667335
10030	NC_008212	GAA	2	6	472334	472339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110667335
10031	NC_008212	GCT	2	6	472378	472383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667335
10032	NC_008212	AGT	2	6	472409	472414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667335
10033	NC_008212	ATT	2	6	472442	472447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667335
10034	NC_008212	TGT	2	6	472537	472542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667335
10035	NC_008212	AT	3	6	472605	472610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_008212	AAT	2	6	472627	472632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_008212	ATCA	2	8	472636	472643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10038	NC_008212	AAC	2	6	472668	472673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_008212	CGC	2	6	472674	472679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_008212	CGG	2	6	472681	472686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_008212	AC	3	6	472718	472723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_008212	ATG	2	6	472768	472773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_008212	TGC	2	6	472795	472800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_008212	GAA	2	6	472846	472851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_008212	CGT	2	6	472861	472866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_008212	GA	3	6	472880	472885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_008212	GTG	2	6	473033	473038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_008212	CGT	2	6	473111	473116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_008212	CGT	2	6	473140	473145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_008212	AATTC	2	10	473227	473236	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10051	NC_008212	GCT	2	6	473256	473261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_008212	GTA	2	6	473301	473306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_008212	TCT	2	6	473379	473384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110667336
10054	NC_008212	CA	3	6	473423	473428	50 %	0 %	0 %	50 %	110667336
10055	NC_008212	CCT	2	6	473482	473487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110667336
10056	NC_008212	CCA	2	6	473535	473540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667336
10057	NC_008212	ATA	2	6	473627	473632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667336
10058	NC_008212	CAG	2	6	473641	473646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667336
10059	NC_008212	T	7	7	473658	473664	0 %	100 %	0 %	0 %	110667336
10060	NC_008212	CAC	2	6	473665	473670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667336
10061	NC_008212	GGT	2	6	473880	473885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_008212	CCG	2	6	473898	473903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110667337
10063	NC_008212	TCA	2	6	473942	473947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667337
10064	NC_008212	CTG	2	6	473955	473960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667337
10065	NC_008212	CCAC	2	8	474056	474063	25 %	0 %	0 %	75 %	110667337
10066	NC_008212	ATG	2	6	474078	474083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667337
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10068	NC_008212	ACG	2	6	474221	474226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667337
10069	NC_008212	ATG	2	6	474234	474239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667337
10070	NC_008212	TGG	2	6	474274	474279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667337
10071	NC_008212	TTG	2	6	474294	474299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667337
10072	NC_008212	AAT	3	9	474321	474329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_008212	AACA	2	8	474413	474420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10074	NC_008212	GACA	2	8	474569	474576	50 %	0 %	25 %	25 %	110667338
10075	NC_008212	TGG	2	6	474596	474601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667338
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10077	NC_008212	TAC	2	6	474686	474691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667338
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10080	NC_008212	GTT	2	6	474735	474740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110667338
10081	NC_008212	CTG	2	6	474757	474762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667338
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10083	NC_008212	AT	3	6	474887	474892	50 %	50 %	0 %	0 %	110667338
10084	NC_008212	ATT	2	6	474909	474914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667338
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10087	NC_008212	GGA	2	6	475055	475060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110667338
10088	NC_008212	TCG	2	6	475126	475131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110667338
10089	NC_008212	TGA	2	6	475142	475147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667338
10090	NC_008212	TAG	2	6	475181	475186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667338
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10092	NC_008212	TGG	2	6	475217	475222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110667338
10093	NC_008212	AT	3	6	475323	475328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_008212	ATT	2	6	475366	475371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_008212	GAT	2	6	475372	475377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_008212	AAT	2	6	475389	475394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_008212	CTT	2	6	475551	475556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_008212	AAG	2	6	475613	475618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_008212	TTA	2	6	475624	475629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667339
10100	NC_008212	ACG	2	6	475644	475649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667339
10101	NC_008212	GC	3	6	475664	475669	0 %	0 %	50 %	50 %	110667339
10102	NC_008212	AAT	2	6	475674	475679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667339
10103	NC_008212	CTAT	2	8	475690	475697	25 %	50 %	0 %	25 %	110667339
10104	NC_008212	ATC	2	6	475701	475706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667339
10105	NC_008212	ATA	2	6	475719	475724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667339
10106	NC_008212	TGA	2	6	475796	475801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667339
10107	NC_008212	TCA	2	6	475849	475854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667339
10108	NC_008212	CAT	2	6	475862	475867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667339
10109	NC_008212	ACG	2	6	475873	475878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667339
10110	NC_008212	CG	3	6	475895	475900	0 %	0 %	50 %	50 %	110667339
10111	NC_008212	GT	3	6	475940	475945	0 %	50 %	50 %	0 %	110667339
10112	NC_008212	AAC	2	6	475947	475952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667339
10113	NC_008212	CAGTAT	2	12	475979	475990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110667339
10114	NC_008212	TAAA	2	8	476100	476107	75 %	25 %	0 %	0 %	110667339
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10118	NC_008212	TGCAT	2	10	476205	476214	20 %	40 %	20 %	20 %	110667339
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10120	NC_008212	AT	3	6	476257	476262	50 %	50 %	0 %	0 %	110667339
10121	NC_008212	TGT	2	6	476280	476285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_008212	TCA	2	6	476351	476356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_008212	ATC	2	6	476472	476477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_008212	AT	3	6	476487	476492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_008212	AT	3	6	476494	476499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_008212	AT	4	8	476522	476529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_008212	ATA	2	6	476554	476559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_008212	AATC	2	8	476604	476611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10129	NC_008212	ACG	2	6	476678	476683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667340
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10137	NC_008212	AT	3	6	476934	476939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10139	NC_008212	AT	3	6	476987	476992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_008212	AGT	2	6	476995	477000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10242	NC_008212	GTCA	2	8	481323	481330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10243	NC_008212	TGT	2	6	481344	481349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_008212	TTAA	2	8	481377	481384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_008212	TA	3	6	481407	481412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_008212	ATC	2	6	481426	481431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667346
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10248	NC_008212	ATGT	2	8	481463	481470	25 %	50 %	25 %	0 %	110667346
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10265	NC_008212	CCT	2	6	482146	482151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10309	NC_008212	ACC	2	6	484554	484559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110667349
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10361	NC_008212	CGG	2	6	486738	486743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10365	NC_008212	ATT	2	6	486903	486908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667351
10366	NC_008212	ATTC	2	8	486947	486954	25 %	50 %	0 %	25 %	110667351
10367	NC_008212	TTGT	2	8	487009	487016	0 %	75 %	25 %	0 %	110667351
10368	NC_008212	AAT	2	6	487109	487114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110667351
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10374	NC_008212	TG	3	6	487325	487330	0 %	50 %	50 %	0 %	110667352
10375	NC_008212	CGAG	2	8	487348	487355	25 %	0 %	50 %	25 %	110667352
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10385	NC_008212	TA	3	6	487978	487983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10386	NC_008212	GCACA	2	10	488103	488112	40 %	0 %	20 %	40 %	110667353
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10394	NC_008212	GGA	2	6	488589	488594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10395	NC_008212	GCACC	2	10	488603	488612	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10396	NC_008212	GCATC	2	10	488613	488622	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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10398	NC_008212	GT	3	6	488710	488715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10399	NC_008212	GGTC	2	8	488716	488723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10400	NC_008212	TTGT	2	8	488792	488799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10401	NC_008212	ACACTC	2	12	488916	488927	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10404	NC_008212	AG	3	6	489130	489135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10485	NC_008212	TCA	2	6	492749	492754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10486	NC_008212	ACG	2	6	492854	492859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667357
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10488	NC_008212	CAG	2	6	493064	493069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110667357
10489	NC_008212	TGA	2	6	493107	493112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110667357
10490	NC_008212	CAAT	2	8	493139	493146	50 %	25 %	0 %	25 %	110667357
10491	NC_008212	TAT	3	9	493166	493174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110667357
10492	NC_008212	TA	3	6	493276	493281	50 %	50 %	0 %	0 %	110667357
10493	NC_008212	TC	3	6	493318	493323	0 %	50 %	0 %	50 %	110667357
10494	NC_008212	AGAA	2	8	493403	493410	75 %	0 %	25 %	0 %	110667357
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10497	NC_008212	TCC	2	6	493532	493537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110667357
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