MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_008212	CTG	2	6	3015569	3015574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65002	NC_008212	AGTG	2	8	3015619	3015626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65003	NC_008212	AAT	2	6	3015672	3015677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65004	NC_008212	AAG	2	6	3015678	3015683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65005	NC_008212	ACC	2	6	3015729	3015734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65006	NC_008212	GGT	2	6	3015752	3015757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65007	NC_008212	GAT	2	6	3015774	3015779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65008	NC_008212	ATGA	2	8	3015826	3015833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65009	NC_008212	TC	3	6	3015852	3015857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65010	NC_008212	TGAGT	2	10	3015873	3015882	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65011	NC_008212	TGA	2	6	3015927	3015932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669490
65012	NC_008212	TGC	2	6	3015979	3015984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669490
65013	NC_008212	TCC	2	6	3016126	3016131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110669490
65014	NC_008212	GTT	2	6	3016184	3016189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669490
65015	NC_008212	ATC	2	6	3016213	3016218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669490
65016	NC_008212	ATT	2	6	3016219	3016224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669490
65017	NC_008212	ACCA	2	8	3016234	3016241	50 %	0 %	0 %	50 %	110669490
65018	NC_008212	CA	3	6	3016281	3016286	50 %	0 %	0 %	50 %	110669490
65019	NC_008212	TGCG	2	8	3016297	3016304	0 %	25 %	50 %	25 %	110669490
65020	NC_008212	AAAT	2	8	3016410	3016417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65021	NC_008212	CA	3	6	3016453	3016458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65022	NC_008212	TAC	2	6	3016622	3016627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65023	NC_008212	GCA	2	6	3016726	3016731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669491
65024	NC_008212	TGA	2	6	3016848	3016853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669491
65025	NC_008212	CTTG	2	8	3016872	3016879	0 %	50 %	25 %	25 %	110669491
65026	NC_008212	AT	3	6	3016902	3016907	50 %	50 %	0 %	0 %	110669491
65027	NC_008212	TGA	2	6	3016920	3016925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669491
65028	NC_008212	CTG	2	6	3016940	3016945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669491
65029	NC_008212	TCG	2	6	3016974	3016979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669491
65030	NC_008212	TG	3	6	3017094	3017099	0 %	50 %	50 %	0 %	110669491
65031	NC_008212	ATCA	2	8	3017138	3017145	50 %	25 %	0 %	25 %	110669491
65032	NC_008212	GGT	2	6	3017269	3017274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669491
65033	NC_008212	TGA	2	6	3017448	3017453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669491
65034	NC_008212	GAAT	2	8	3017486	3017493	50 %	25 %	25 %	0 %	110669491
65035	NC_008212	TGA	2	6	3017529	3017534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669491
65036	NC_008212	A	6	6	3017534	3017539	100 %	0 %	0 %	0 %	110669491
65037	NC_008212	TCG	2	6	3017636	3017641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669491
65038	NC_008212	GAA	2	6	3017710	3017715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669491
65039	NC_008212	AGC	2	6	3017734	3017739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65040	NC_008212	CAG	2	6	3017779	3017784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65041	NC_008212	CATATA	2	12	3017815	3017826	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65042	NC_008212	TA	4	8	3017823	3017830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65043	NC_008212	TCA	2	6	3017855	3017860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65044	NC_008212	ATG	2	6	3017862	3017867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65045	NC_008212	GAA	2	6	3017895	3017900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65046	NC_008212	AGC	2	6	3018007	3018012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669492
65047	NC_008212	TTTGA	2	10	3018015	3018024	20 %	60 %	20 %	0 %	110669492
65048	NC_008212	TCAT	2	8	3018025	3018032	25 %	50 %	0 %	25 %	110669492
65049	NC_008212	CAT	2	6	3018068	3018073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669492
65050	NC_008212	CTTC	2	8	3018148	3018155	0 %	50 %	0 %	50 %	110669492
65051	NC_008212	CAT	2	6	3018182	3018187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669492
65052	NC_008212	CAT	2	6	3018197	3018202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669492
65053	NC_008212	ACG	2	6	3018229	3018234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669492
65054	NC_008212	TGT	2	6	3018270	3018275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669492
65055	NC_008212	G	6	6	3018393	3018398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65056	NC_008212	GACG	2	8	3018504	3018511	25 %	0 %	50 %	25 %	110669493
65057	NC_008212	CAG	2	6	3018551	3018556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669493
65058	NC_008212	GAA	2	6	3018583	3018588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669493
65059	NC_008212	A	6	6	3018639	3018644	100 %	0 %	0 %	0 %	110669493
65060	NC_008212	TTC	2	6	3018779	3018784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669493
65061	NC_008212	CGGT	2	8	3018795	3018802	0 %	25 %	50 %	25 %	110669493
65062	NC_008212	TAAT	2	8	3018824	3018831	50 %	50 %	0 %	0 %	110669493
65063	NC_008212	GAAA	2	8	3018876	3018883	75 %	0 %	25 %	0 %	110669493
65064	NC_008212	GC	3	6	3018891	3018896	0 %	0 %	50 %	50 %	110669493
65065	NC_008212	TCT	2	6	3018925	3018930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669493
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65068	NC_008212	GGT	2	6	3018997	3019002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669493
65069	NC_008212	TCG	2	6	3019041	3019046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669493
65070	NC_008212	ATT	2	6	3019051	3019056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669493
65071	NC_008212	GAG	2	6	3019066	3019071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110669493
65072	NC_008212	CAT	2	6	3019096	3019101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669493
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65075	NC_008212	GCA	2	6	3019201	3019206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669493
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65081	NC_008212	GCAC	2	8	3019380	3019387	25 %	0 %	25 %	50 %	110669493
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65083	NC_008212	CAT	2	6	3019559	3019564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669493
65084	NC_008212	CTTGCA	2	12	3019576	3019587	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110669493
65085	NC_008212	CTG	2	6	3019598	3019603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669493
65086	NC_008212	TGA	2	6	3019617	3019622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669493
65087	NC_008212	GATA	2	8	3019855	3019862	50 %	25 %	25 %	0 %	110669493
65088	NC_008212	TGG	2	6	3019893	3019898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65089	NC_008212	TA	3	6	3019933	3019938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65090	NC_008212	ACC	2	6	3019962	3019967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65091	NC_008212	TATAT	2	10	3020020	3020029	40 %	60 %	0 %	0 %	110669494
65092	NC_008212	TAT	2	6	3020060	3020065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669494
65093	NC_008212	GCA	2	6	3020070	3020075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669494
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65101	NC_008212	TGC	2	6	3020294	3020299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669494
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65103	NC_008212	GGC	2	6	3020366	3020371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110669494
65104	NC_008212	GC	3	6	3020416	3020421	0 %	0 %	50 %	50 %	110669494
65105	NC_008212	ATA	3	9	3020460	3020468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669494
65106	NC_008212	ACA	2	6	3020514	3020519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669494
65107	NC_008212	AAT	2	6	3020531	3020536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669494
65108	NC_008212	AAT	3	9	3020555	3020563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669494
65109	NC_008212	CAC	2	6	3020566	3020571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669494
65110	NC_008212	TCG	2	6	3020585	3020590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669494
65111	NC_008212	CCA	2	6	3020591	3020596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669494
65112	NC_008212	CAA	2	6	3020612	3020617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669494
65113	NC_008212	GCT	2	6	3020619	3020624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669494
65114	NC_008212	TGT	2	6	3020639	3020644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669494
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65116	NC_008212	GCA	2	6	3020745	3020750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669494
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65118	NC_008212	GCT	2	6	3020772	3020777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669494
65119	NC_008212	CGT	2	6	3020778	3020783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669494
65120	NC_008212	AAG	2	6	3020789	3020794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669494
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65126	NC_008212	TA	3	6	3021073	3021078	50 %	50 %	0 %	0 %	110669495
65127	NC_008212	A	7	7	3021099	3021105	100 %	0 %	0 %	0 %	110669495
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65220	NC_008212	GGA	2	6	3025407	3025412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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65225	NC_008212	CGAA	2	8	3025733	3025740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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65227	NC_008212	CGT	2	6	3025855	3025860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65228	NC_008212	GTC	2	6	3025889	3025894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65229	NC_008212	TGCC	2	8	3025967	3025974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65230	NC_008212	A	6	6	3026133	3026138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65231	NC_008212	CCGATC	2	12	3026267	3026278	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65232	NC_008212	TAA	2	6	3026362	3026367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65233	NC_008212	TCC	2	6	3026393	3026398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65234	NC_008212	CAA	2	6	3026439	3026444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669499
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65236	NC_008212	TA	3	6	3026460	3026465	50 %	50 %	0 %	0 %	110669499
65237	NC_008212	CGA	2	6	3026620	3026625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669499
65238	NC_008212	TTC	2	6	3026631	3026636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669499
65239	NC_008212	ATC	2	6	3026643	3026648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669499
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65241	NC_008212	GA	3	6	3026784	3026789	50 %	0 %	50 %	0 %	110669499
65242	NC_008212	GAT	2	6	3026825	3026830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669499
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65252	NC_008212	ACT	2	6	3027344	3027349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669499
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65258	NC_008212	TGC	2	6	3027574	3027579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669500
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65306	NC_008212	GCA	2	6	3029768	3029773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669502
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65319	NC_008212	ATGTGA	2	12	3030214	3030225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65322	NC_008212	ATA	2	6	3030281	3030286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65323	NC_008212	CAA	2	6	3030305	3030310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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65341	NC_008212	TCG	2	6	3030956	3030961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65342	NC_008212	TAT	2	6	3030962	3030967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65343	NC_008212	GTTA	2	8	3031000	3031007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65344	NC_008212	CTA	2	6	3031044	3031049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65345	NC_008212	CCGA	2	8	3031064	3031071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65346	NC_008212	CTG	2	6	3031130	3031135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669504
65347	NC_008212	TC	3	6	3031141	3031146	0 %	50 %	0 %	50 %	110669504
65348	NC_008212	ACA	2	6	3031147	3031152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669504
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65351	NC_008212	TAT	2	6	3031235	3031240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669504
65352	NC_008212	GAC	2	6	3031285	3031290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669504
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65472	NC_008212	TGGA	2	8	3036835	3036842	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65473	NC_008212	GTG	2	6	3036906	3036911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65474	NC_008212	CCG	2	6	3036953	3036958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65475	NC_008212	CCGTG	2	10	3036966	3036975	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65476	NC_008212	ATCA	2	8	3037037	3037044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65477	NC_008212	TTGAT	2	10	3037070	3037079	20 %	60 %	20 %	0 %	110669510
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65479	NC_008212	TGA	2	6	3037207	3037212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669510
65480	NC_008212	CTC	2	6	3037312	3037317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110669510
65481	NC_008212	ATA	2	6	3037447	3037452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65482	NC_008212	TAT	2	6	3037517	3037522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65483	NC_008212	TCG	2	6	3037725	3037730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669511
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65485	NC_008212	GAT	2	6	3037795	3037800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669511
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