MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_008212	CGT	2	6	2853348	2853353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669340
61502	NC_008212	CAT	2	6	2853361	2853366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669340
61503	NC_008212	TTC	2	6	2853401	2853406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669340
61504	NC_008212	AGG	2	6	2853417	2853422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110669340
61505	NC_008212	GA	3	6	2853660	2853665	50 %	0 %	50 %	0 %	110669340
61506	NC_008212	TCC	2	6	2853678	2853683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110669340
61507	NC_008212	TGA	2	6	2853780	2853785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61508	NC_008212	GTA	2	6	2853803	2853808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61509	NC_008212	AGC	2	6	2853829	2853834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61510	NC_008212	CT	3	6	2853845	2853850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61511	NC_008212	GAA	2	6	2853883	2853888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61512	NC_008212	GTG	2	6	2853896	2853901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61513	NC_008212	CAG	2	6	2853930	2853935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61514	NC_008212	TGA	2	6	2854039	2854044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61515	NC_008212	GATCG	2	10	2854090	2854099	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61516	NC_008212	TAC	2	6	2854122	2854127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61517	NC_008212	TA	3	6	2854129	2854134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61518	NC_008212	A	6	6	2854134	2854139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61519	NC_008212	GTA	2	6	2854178	2854183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61520	NC_008212	TGA	2	6	2854214	2854219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61521	NC_008212	GA	3	6	2854218	2854223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61522	NC_008212	GTT	2	6	2854279	2854284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61523	NC_008212	GCT	2	6	2854319	2854324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61524	NC_008212	T	6	6	2854342	2854347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61525	NC_008212	TAA	2	6	2854391	2854396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61526	NC_008212	CAGCCA	2	12	2854444	2854455	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61527	NC_008212	GCA	2	6	2854458	2854463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61528	NC_008212	TAT	2	6	2854469	2854474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61529	NC_008212	TAT	2	6	2854507	2854512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61530	NC_008212	GAAC	2	8	2854514	2854521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61531	NC_008212	AAG	2	6	2854527	2854532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61532	NC_008212	GACACG	2	12	2854540	2854551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669341
61533	NC_008212	ATA	2	6	2854585	2854590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669341
61534	NC_008212	TCAT	2	8	2854609	2854616	25 %	50 %	0 %	25 %	110669341
61535	NC_008212	TCA	2	6	2854687	2854692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669341
61536	NC_008212	TGT	2	6	2854854	2854859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669341
61537	NC_008212	TGCA	2	8	2854880	2854887	25 %	25 %	25 %	25 %	110669341
61538	NC_008212	TAT	2	6	2854980	2854985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669341
61539	NC_008212	TAG	2	6	2854989	2854994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669341
61540	NC_008212	ATG	2	6	2854999	2855004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669341
61541	NC_008212	TCAA	2	8	2855050	2855057	50 %	25 %	0 %	25 %	110669341
61542	NC_008212	TCA	2	6	2855086	2855091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669341
61543	NC_008212	TGA	2	6	2855130	2855135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669341
61544	NC_008212	TGA	2	6	2855162	2855167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669341
61545	NC_008212	GTT	2	6	2855271	2855276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669341
61546	NC_008212	GGA	2	6	2855302	2855307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110669341
61547	NC_008212	CAA	2	6	2855327	2855332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669341
61548	NC_008212	TTA	2	6	2855350	2855355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669341
61549	NC_008212	ATT	2	6	2855394	2855399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669341
61550	NC_008212	TTCA	2	8	2855417	2855424	25 %	50 %	0 %	25 %	110669341
61551	NC_008212	TAT	2	6	2855434	2855439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669341
61552	NC_008212	AGA	2	6	2855469	2855474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669341
61553	NC_008212	TGACGA	2	12	2855646	2855657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	110669341
61554	NC_008212	AAT	2	6	2855666	2855671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669342
61555	NC_008212	AT	3	6	2855708	2855713	50 %	50 %	0 %	0 %	110669342
61556	NC_008212	CGGT	2	8	2855730	2855737	0 %	25 %	50 %	25 %	110669342
61557	NC_008212	GCA	2	6	2855843	2855848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669342
61558	NC_008212	CAG	2	6	2855913	2855918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669342
61559	NC_008212	GAC	2	6	2855947	2855952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669342
61560	NC_008212	GTT	2	6	2855996	2856001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669342
61561	NC_008212	TGA	2	6	2856004	2856009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669342
61562	NC_008212	AATC	2	8	2856010	2856017	50 %	25 %	0 %	25 %	110669342
61563	NC_008212	ACAG	2	8	2856064	2856071	50 %	0 %	25 %	25 %	110669342
61564	NC_008212	CGG	2	6	2856079	2856084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110669342
61565	NC_008212	CT	4	8	2856092	2856099	0 %	50 %	0 %	50 %	110669342
61566	NC_008212	CATT	2	8	2856108	2856115	25 %	50 %	0 %	25 %	110669342
61567	NC_008212	GAG	2	6	2856217	2856222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110669342
61568	NC_008212	TTG	2	6	2856236	2856241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669342
61569	NC_008212	TGA	2	6	2856250	2856255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669342
61570	NC_008212	GAT	2	6	2856275	2856280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669342
61571	NC_008212	CA	3	6	2856283	2856288	50 %	0 %	0 %	50 %	110669342
61572	NC_008212	TC	3	6	2856294	2856299	0 %	50 %	0 %	50 %	110669342
61573	NC_008212	ATT	2	6	2856307	2856312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669342
61574	NC_008212	CAA	2	6	2856387	2856392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669342
61575	NC_008212	ATG	2	6	2856396	2856401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669342
61576	NC_008212	AGC	2	6	2856430	2856435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669342
61577	NC_008212	GTT	2	6	2856442	2856447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669342
61578	NC_008212	AGGCTG	2	12	2856459	2856470	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110669342
61579	NC_008212	GGT	2	6	2856541	2856546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669342
61580	NC_008212	ACA	2	6	2856578	2856583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669342
61581	NC_008212	AGA	2	6	2856625	2856630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669342
61582	NC_008212	TCTGAG	2	12	2856644	2856655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110669342
61583	NC_008212	ATACTG	2	12	2856678	2856689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110669342
61584	NC_008212	TAA	2	6	2856725	2856730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61585	NC_008212	AT	3	6	2856745	2856750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61586	NC_008212	CCA	2	6	2856802	2856807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61587	NC_008212	CATT	2	8	2856821	2856828	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61588	NC_008212	CAATTA	2	12	2856836	2856847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61589	NC_008212	GCT	2	6	2856856	2856861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61590	NC_008212	GAGGGG	2	12	2856890	2856901	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
61591	NC_008212	CTG	2	6	2856920	2856925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61592	NC_008212	ATT	2	6	2856929	2856934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61593	NC_008212	GTGA	2	8	2856935	2856942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61594	NC_008212	GTCTC	2	10	2856954	2856963	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61595	NC_008212	CAG	2	6	2856992	2856997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61596	NC_008212	GAA	2	6	2857045	2857050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61597	NC_008212	ATA	2	6	2857075	2857080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61598	NC_008212	AAC	2	6	2857111	2857116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61599	NC_008212	TGA	2	6	2857123	2857128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61600	NC_008212	AGG	2	6	2857160	2857165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61601	NC_008212	CAG	2	6	2857171	2857176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669343
61602	NC_008212	AACT	2	8	2857261	2857268	50 %	25 %	0 %	25 %	110669343
61603	NC_008212	CAC	2	6	2857285	2857290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669343
61604	NC_008212	CGA	2	6	2857296	2857301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669343
61605	NC_008212	CGA	2	6	2857356	2857361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669343
61606	NC_008212	TTC	2	6	2857372	2857377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669343
61607	NC_008212	CGA	2	6	2857537	2857542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61608	NC_008212	GAACTT	2	12	2857580	2857591	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61609	NC_008212	TAT	2	6	2857607	2857612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61610	NC_008212	ATT	2	6	2857619	2857624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61611	NC_008212	ATA	2	6	2857634	2857639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61612	NC_008212	TGC	2	6	2857700	2857705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61613	NC_008212	CAC	2	6	2857817	2857822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669344
61614	NC_008212	ACA	2	6	2857844	2857849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669344
61615	NC_008212	TAA	2	6	2857850	2857855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669344
61616	NC_008212	AAT	2	6	2857869	2857874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669344
61617	NC_008212	CAC	2	6	2857934	2857939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669344
61618	NC_008212	CAA	2	6	2857949	2857954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669344
61619	NC_008212	GCA	2	6	2857972	2857977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669344
61620	NC_008212	GTT	3	9	2857987	2857995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669344
61621	NC_008212	GAC	2	6	2858085	2858090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669344
61622	NC_008212	AGA	2	6	2858095	2858100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669344
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61624	NC_008212	TTG	3	9	2858193	2858201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669344
61625	NC_008212	CAT	2	6	2858231	2858236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669344
61626	NC_008212	GTC	2	6	2858239	2858244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669344
61627	NC_008212	TGA	2	6	2858252	2858257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669344
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61631	NC_008212	CAC	2	6	2858498	2858503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669344
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61633	NC_008212	CAT	2	6	2858654	2858659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669344
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61641	NC_008212	TGT	2	6	2858877	2858882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669344
61642	NC_008212	TCGT	2	8	2858974	2858981	0 %	50 %	25 %	25 %	110669345
61643	NC_008212	CA	3	6	2858991	2858996	50 %	0 %	0 %	50 %	110669345
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61654	NC_008212	GCT	3	9	2859648	2859656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669345
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61680	NC_008212	TATCG	2	10	2860982	2860991	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61681	NC_008212	AATC	2	8	2861125	2861132	50 %	25 %	0 %	25 %	110669347
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61688	NC_008212	TAT	2	6	2861476	2861481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669347
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61722	NC_008212	CTGT	2	8	2863209	2863216	0 %	50 %	25 %	25 %	110669347
61723	NC_008212	GTT	2	6	2863224	2863229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669347
61724	NC_008212	CAGT	2	8	2863240	2863247	25 %	25 %	25 %	25 %	110669347
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61726	NC_008212	ACA	2	6	2863314	2863319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61727	NC_008212	T	6	6	2863330	2863335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61728	NC_008212	AT	3	6	2863398	2863403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61729	NC_008212	TCGG	2	8	2863424	2863431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61730	NC_008212	AAT	2	6	2863456	2863461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61731	NC_008212	CA	3	6	2863462	2863467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61732	NC_008212	GC	3	6	2863514	2863519	0 %	0 %	50 %	50 %	110669348
61733	NC_008212	CGC	2	6	2863534	2863539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110669348
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61853	NC_008212	TAAT	2	8	2869574	2869581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61858	NC_008212	TGA	2	6	2869755	2869760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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61978	NC_008212	CGA	2	6	2875760	2875765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669360
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61993	NC_008212	CGGT	2	8	2876333	2876340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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61996	NC_008212	CGG	2	6	2876457	2876462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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61999	NC_008212	GAC	2	6	2876542	2876547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62000	NC_008212	ACT	2	6	2876560	2876565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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