MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_008212	AT	3	6	2579164	2579169	50 %	50 %	0 %	0 %	110669124
55502	NC_008212	CGT	2	6	2579182	2579187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669124
55503	NC_008212	CG	3	6	2579201	2579206	0 %	0 %	50 %	50 %	110669124
55504	NC_008212	TCAG	2	8	2579248	2579255	25 %	25 %	25 %	25 %	110669124
55505	NC_008212	TCC	2	6	2579404	2579409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110669124
55506	NC_008212	CTT	2	6	2579423	2579428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669124
55507	NC_008212	CAT	2	6	2579474	2579479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669124
55508	NC_008212	AGA	2	6	2579570	2579575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669124
55509	NC_008212	ACGA	2	8	2579592	2579599	50 %	0 %	25 %	25 %	110669124
55510	NC_008212	GT	3	6	2579600	2579605	0 %	50 %	50 %	0 %	110669124
55511	NC_008212	GCA	2	6	2579620	2579625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669124
55512	NC_008212	TTC	2	6	2579643	2579648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669124
55513	NC_008212	GATT	2	8	2579669	2579676	25 %	50 %	25 %	0 %	110669124
55514	NC_008212	GCA	2	6	2579677	2579682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669124
55515	NC_008212	TC	3	6	2579690	2579695	0 %	50 %	0 %	50 %	110669124
55516	NC_008212	TCA	2	6	2579701	2579706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669124
55517	NC_008212	ACC	2	6	2579721	2579726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669124
55518	NC_008212	CAA	2	6	2579861	2579866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669124
55519	NC_008212	TCTCAA	2	12	2579918	2579929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669124
55520	NC_008212	TG	3	6	2580035	2580040	0 %	50 %	50 %	0 %	110669125
55521	NC_008212	TCT	2	6	2580047	2580052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669125
55522	NC_008212	TTC	2	6	2580070	2580075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669125
55523	NC_008212	ATC	2	6	2580079	2580084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669125
55524	NC_008212	TGC	2	6	2580112	2580117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669125
55525	NC_008212	TCA	2	6	2580134	2580139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669125
55526	NC_008212	TCT	2	6	2580213	2580218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669125
55527	NC_008212	GTAT	2	8	2580229	2580236	25 %	50 %	25 %	0 %	110669125
55528	NC_008212	TGGA	2	8	2580241	2580248	25 %	25 %	50 %	0 %	110669125
55529	NC_008212	TTG	2	6	2580256	2580261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669125
55530	NC_008212	GTC	2	6	2580310	2580315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669125
55531	NC_008212	TCA	2	6	2580368	2580373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669125
55532	NC_008212	GTT	2	6	2580444	2580449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669125
55533	NC_008212	AATT	2	8	2580477	2580484	50 %	50 %	0 %	0 %	110669125
55534	NC_008212	TG	3	6	2580557	2580562	0 %	50 %	50 %	0 %	110669125
55535	NC_008212	CGCT	2	8	2580652	2580659	0 %	25 %	25 %	50 %	110669125
55536	NC_008212	GCA	2	6	2580680	2580685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669125
55537	NC_008212	GAG	2	6	2580731	2580736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110669125
55538	NC_008212	ATC	2	6	2580943	2580948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669125
55539	NC_008212	ATG	2	6	2580995	2581000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669125
55540	NC_008212	TGT	2	6	2581031	2581036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669125
55541	NC_008212	TGC	2	6	2581072	2581077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669125
55542	NC_008212	AAT	2	6	2581100	2581105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669125
55543	NC_008212	TCT	2	6	2581152	2581157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669125
55544	NC_008212	CGGT	2	8	2581161	2581168	0 %	25 %	50 %	25 %	110669125
55545	NC_008212	CAC	2	6	2581212	2581217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669125
55546	NC_008212	CAA	2	6	2581227	2581232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669125
55547	NC_008212	AGT	2	6	2581267	2581272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669125
55548	NC_008212	CAC	2	6	2581278	2581283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669125
55549	NC_008212	CAT	2	6	2581497	2581502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669125
55550	NC_008212	TGT	2	6	2581609	2581614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669125
55551	NC_008212	TCA	2	6	2581655	2581660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669125
55552	NC_008212	ACA	2	6	2581670	2581675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669125
55553	NC_008212	TCTG	2	8	2581760	2581767	0 %	50 %	25 %	25 %	110669125
55554	NC_008212	TCT	2	6	2581807	2581812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669126
55555	NC_008212	TTTGA	2	10	2581839	2581848	20 %	60 %	20 %	0 %	110669126
55556	NC_008212	GCC	2	6	2581857	2581862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110669126
55557	NC_008212	CCA	3	9	2581873	2581881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669126
55558	NC_008212	ATC	2	6	2581950	2581955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669126
55559	NC_008212	CAT	3	9	2581979	2581987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669126
55560	NC_008212	TCA	2	6	2582011	2582016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669126
55561	NC_008212	TGT	2	6	2582082	2582087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669126
55562	NC_008212	CGA	2	6	2582102	2582107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669126
55563	NC_008212	AT	3	6	2582226	2582231	50 %	50 %	0 %	0 %	110669127
55564	NC_008212	ACA	2	6	2582235	2582240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669127
55565	NC_008212	TTGA	2	8	2582345	2582352	25 %	50 %	25 %	0 %	110669127
55566	NC_008212	TCA	2	6	2582367	2582372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669127
55567	NC_008212	GTA	2	6	2582468	2582473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669127
55568	NC_008212	TCA	2	6	2582580	2582585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669127
55569	NC_008212	GTA	2	6	2582612	2582617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669127
55570	NC_008212	TCGA	2	8	2582621	2582628	25 %	25 %	25 %	25 %	110669127
55571	NC_008212	CACTC	2	10	2582651	2582660	20 %	20 %	0 %	60 %	110669127
55572	NC_008212	TCA	2	6	2582661	2582666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669127
55573	NC_008212	CTG	3	9	2582710	2582718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669127
55574	NC_008212	AAG	2	6	2582768	2582773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669127
55575	NC_008212	TCA	2	6	2582775	2582780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669127
55576	NC_008212	ATC	2	6	2582804	2582809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669127
55577	NC_008212	ATC	2	6	2582936	2582941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669127
55578	NC_008212	CTG	2	6	2583061	2583066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669127
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55580	NC_008212	GTT	2	6	2583183	2583188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669128
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55583	NC_008212	C	7	7	2583285	2583291	0 %	0 %	0 %	100 %	110669128
55584	NC_008212	CTC	2	6	2583331	2583336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110669128
55585	NC_008212	CAG	2	6	2583337	2583342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669128
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55587	NC_008212	TCA	3	9	2583392	2583400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669128
55588	NC_008212	TGC	2	6	2583415	2583420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669128
55589	NC_008212	TGGTT	2	10	2583430	2583439	0 %	60 %	40 %	0 %	110669128
55590	NC_008212	CAT	2	6	2583498	2583503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669128
55591	NC_008212	GTTTT	2	10	2583532	2583541	0 %	80 %	20 %	0 %	110669128
55592	NC_008212	TGCT	2	8	2583565	2583572	0 %	50 %	25 %	25 %	110669128
55593	NC_008212	CACGCT	2	12	2583573	2583584	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	110669128
55594	NC_008212	GCTTCT	2	12	2583638	2583649	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	110669128
55595	NC_008212	CATCTG	2	12	2583672	2583683	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110669128
55596	NC_008212	GC	4	8	2583698	2583705	0 %	0 %	50 %	50 %	110669128
55597	NC_008212	CGA	2	6	2583729	2583734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669128
55598	NC_008212	TAT	2	6	2583770	2583775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669129
55599	NC_008212	GAA	2	6	2583781	2583786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669129
55600	NC_008212	GAGAAT	2	12	2583799	2583810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	110669129
55601	NC_008212	GCG	2	6	2583884	2583889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110669129
55602	NC_008212	GCG	4	12	2583944	2583955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110669129
55603	NC_008212	CTG	2	6	2583988	2583993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669129
55604	NC_008212	TAG	2	6	2583994	2583999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669129
55605	NC_008212	GACA	2	8	2584055	2584062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55606	NC_008212	AT	3	6	2584166	2584171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55607	NC_008212	TGA	2	6	2584172	2584177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55608	NC_008212	TCGT	2	8	2584238	2584245	0 %	50 %	25 %	25 %	110669130
55609	NC_008212	TCC	2	6	2584268	2584273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110669130
55610	NC_008212	GAA	2	6	2584292	2584297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669130
55611	NC_008212	GCA	2	6	2584404	2584409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669130
55612	NC_008212	TCC	2	6	2584424	2584429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110669130
55613	NC_008212	ATA	2	6	2584434	2584439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669130
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55615	NC_008212	CGC	2	6	2584571	2584576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110669130
55616	NC_008212	AAG	2	6	2584670	2584675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669130
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55668	NC_008212	TA	5	10	2587031	2587040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55732	NC_008212	GCGA	2	8	2589485	2589492	25 %	0 %	50 %	25 %	110669134
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55840	NC_008212	T	6	6	2593916	2593921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55841	NC_008212	TTC	2	6	2593932	2593937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55843	NC_008212	ATA	2	6	2593951	2593956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55845	NC_008212	ATA	4	12	2594016	2594027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55966	NC_008212	CGTT	2	8	2598665	2598672	0 %	50 %	25 %	25 %	110669143
55967	NC_008212	GTC	2	6	2598684	2598689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669143
55968	NC_008212	TGAT	2	8	2598714	2598721	25 %	50 %	25 %	0 %	110669143
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55971	NC_008212	AT	3	6	2598862	2598867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55974	NC_008212	CATAT	2	10	2598954	2598963	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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55981	NC_008212	TAT	2	6	2599196	2599201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55999	NC_008212	GCGT	2	8	2600235	2600242	0 %	25 %	50 %	25 %	110669145
56000	NC_008212	CGAG	2	8	2600292	2600299	25 %	0 %	50 %	25 %	110669145

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