MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_008212	AAC	2	6	2463581	2463586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53002	NC_008212	CGA	2	6	2463678	2463683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53003	NC_008212	T	6	6	2463686	2463691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53004	NC_008212	TCG	2	6	2463732	2463737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53005	NC_008212	GCT	2	6	2463765	2463770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53006	NC_008212	CAG	2	6	2463804	2463809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53007	NC_008212	ACAG	2	8	2463818	2463825	50 %	0 %	25 %	25 %	110669025
53008	NC_008212	TC	3	6	2463836	2463841	0 %	50 %	0 %	50 %	110669025
53009	NC_008212	GTC	2	6	2463858	2463863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53010	NC_008212	TAT	2	6	2463900	2463905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669025
53011	NC_008212	TCG	2	6	2463922	2463927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53012	NC_008212	TC	4	8	2463950	2463957	0 %	50 %	0 %	50 %	110669025
53013	NC_008212	CGA	2	6	2463993	2463998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53014	NC_008212	TCG	2	6	2464081	2464086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53015	NC_008212	GAT	2	6	2464098	2464103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669025
53016	NC_008212	GGCTC	2	10	2464116	2464125	0 %	20 %	40 %	40 %	110669025
53017	NC_008212	A	6	6	2464136	2464141	100 %	0 %	0 %	0 %	110669025
53018	NC_008212	TCG	2	6	2464174	2464179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53019	NC_008212	ATC	2	6	2464205	2464210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669025
53020	NC_008212	CAC	2	6	2464262	2464267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669025
53021	NC_008212	GACC	2	8	2464341	2464348	25 %	0 %	25 %	50 %	110669025
53022	NC_008212	TGA	2	6	2464478	2464483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669025
53023	NC_008212	AAC	2	6	2464530	2464535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669025
53024	NC_008212	CGAT	2	8	2464541	2464548	25 %	25 %	25 %	25 %	110669025
53025	NC_008212	GCT	2	6	2464560	2464565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53026	NC_008212	ATG	2	6	2464588	2464593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669025
53027	NC_008212	ACG	2	6	2464614	2464619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53028	NC_008212	TGC	2	6	2464628	2464633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669025
53029	NC_008212	C	6	6	2464652	2464657	0 %	0 %	0 %	100 %	110669025
53030	NC_008212	TCAAAC	2	12	2464700	2464711	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53031	NC_008212	TAA	2	6	2464716	2464721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53032	NC_008212	GAGT	2	8	2464749	2464756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53033	NC_008212	ACGA	2	8	2464760	2464767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53034	NC_008212	CCG	2	6	2464782	2464787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53035	NC_008212	TCA	2	6	2464848	2464853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53036	NC_008212	GACT	2	8	2464854	2464861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53037	NC_008212	TA	3	6	2465111	2465116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53038	NC_008212	ACTA	2	8	2465125	2465132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53039	NC_008212	GTTC	2	8	2465141	2465148	0 %	50 %	25 %	25 %	110669026
53040	NC_008212	TCAGCA	2	12	2465222	2465233	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110669026
53041	NC_008212	CG	3	6	2465324	2465329	0 %	0 %	50 %	50 %	110669026
53042	NC_008212	AGG	2	6	2465350	2465355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110669026
53043	NC_008212	CTG	2	6	2465392	2465397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669026
53044	NC_008212	ATT	2	6	2465444	2465449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669026
53045	NC_008212	TGG	2	6	2465455	2465460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669026
53046	NC_008212	GCA	2	6	2465477	2465482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669026
53047	NC_008212	GGC	2	6	2465500	2465505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110669026
53048	NC_008212	GCT	2	6	2465515	2465520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669026
53049	NC_008212	GAG	2	6	2465543	2465548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110669026
53050	NC_008212	CAATG	2	10	2465650	2465659	40 %	20 %	20 %	20 %	110669026
53051	NC_008212	CAA	2	6	2465664	2465669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669026
53052	NC_008212	CGA	2	6	2465751	2465756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669026
53053	NC_008212	CTG	2	6	2465757	2465762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669026
53054	NC_008212	GCG	2	6	2465777	2465782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110669026
53055	NC_008212	ATC	2	6	2465786	2465791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669026
53056	NC_008212	CAA	2	6	2465796	2465801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669026
53057	NC_008212	CTG	2	6	2465838	2465843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669026
53058	NC_008212	GA	3	6	2465870	2465875	50 %	0 %	50 %	0 %	110669026
53059	NC_008212	CAG	2	6	2465973	2465978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669026
53060	NC_008212	ATC	2	6	2466043	2466048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669026
53061	NC_008212	ACA	2	6	2466050	2466055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669026
53062	NC_008212	TTG	2	6	2466066	2466071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669026
53063	NC_008212	ACT	2	6	2466116	2466121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669026
53064	NC_008212	TCA	2	6	2466174	2466179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669026
53065	NC_008212	AAAT	2	8	2466180	2466187	75 %	25 %	0 %	0 %	110669026
53066	NC_008212	CGAG	2	8	2466218	2466225	25 %	0 %	50 %	25 %	110669026
53067	NC_008212	ATC	2	6	2466262	2466267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669026
53068	NC_008212	TCA	2	6	2466287	2466292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669026
53069	NC_008212	ACT	2	6	2466314	2466319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669026
53070	NC_008212	TGA	2	6	2466420	2466425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669026
53071	NC_008212	TCA	2	6	2466437	2466442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669026
53072	NC_008212	TCA	2	6	2466452	2466457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669026
53073	NC_008212	TCA	2	6	2466479	2466484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669026
53074	NC_008212	CAA	2	6	2466495	2466500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669026
53075	NC_008212	TCA	2	6	2466566	2466571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53076	NC_008212	AT	3	6	2466627	2466632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53077	NC_008212	TA	3	6	2466643	2466648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53078	NC_008212	TAT	2	6	2466712	2466717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53079	NC_008212	A	6	6	2466750	2466755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53080	NC_008212	CTT	2	6	2466778	2466783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53081	NC_008212	AC	3	6	2466886	2466891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53082	NC_008212	GCG	2	6	2466965	2466970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110669027
53083	NC_008212	T	7	7	2466978	2466984	0 %	100 %	0 %	0 %	110669027
53084	NC_008212	CCA	2	6	2466985	2466990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669027
53085	NC_008212	GCA	2	6	2466991	2466996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669027
53086	NC_008212	CAT	2	6	2467100	2467105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669027
53087	NC_008212	GTC	2	6	2467138	2467143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669027
53088	NC_008212	ATC	2	6	2467158	2467163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669027
53089	NC_008212	CGA	2	6	2467228	2467233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669027
53090	NC_008212	CGA	2	6	2467283	2467288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669027
53091	NC_008212	ATCA	2	8	2467293	2467300	50 %	25 %	0 %	25 %	110669027
53092	NC_008212	GAC	2	6	2467314	2467319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669027
53093	NC_008212	AGC	2	6	2467329	2467334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669027
53094	NC_008212	CTG	2	6	2467340	2467345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669027
53095	NC_008212	ATATT	2	10	2467468	2467477	40 %	60 %	0 %	0 %	110669027
53096	NC_008212	TGAA	2	8	2467486	2467493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53097	NC_008212	TCA	2	6	2467518	2467523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53098	NC_008212	TGT	2	6	2467556	2467561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53099	NC_008212	CAA	2	6	2467610	2467615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669028
53100	NC_008212	CTT	2	6	2467628	2467633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669028
53101	NC_008212	ATC	2	6	2467686	2467691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669028
53102	NC_008212	CCT	2	6	2467763	2467768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110669028
53103	NC_008212	GAT	2	6	2467958	2467963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669028
53104	NC_008212	TTA	2	6	2467966	2467971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669028
53105	NC_008212	GAA	2	6	2467976	2467981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669028
53106	NC_008212	TGA	2	6	2467993	2467998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669028
53107	NC_008212	CAG	2	6	2468063	2468068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669028
53108	NC_008212	CGC	2	6	2468111	2468116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110669028
53109	NC_008212	AAC	2	6	2468118	2468123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669028
53110	NC_008212	TGC	2	6	2468148	2468153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669028
53111	NC_008212	GAT	2	6	2468172	2468177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669028
53112	NC_008212	TCCT	2	8	2468190	2468197	0 %	50 %	0 %	50 %	110669028
53113	NC_008212	AAT	3	9	2468241	2468249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669028
53114	NC_008212	ATA	2	6	2468285	2468290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53115	NC_008212	CAA	2	6	2468413	2468418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53116	NC_008212	CAT	2	6	2468444	2468449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53117	NC_008212	A	7	7	2468476	2468482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53118	NC_008212	GAT	2	6	2468491	2468496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53119	NC_008212	AT	3	6	2468565	2468570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53120	NC_008212	AGA	2	6	2468571	2468576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53121	NC_008212	TGA	2	6	2468582	2468587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53122	NC_008212	CTG	2	6	2468588	2468593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53123	NC_008212	CCT	2	6	2468698	2468703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53124	NC_008212	ACTC	2	8	2468811	2468818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53125	NC_008212	TCA	2	6	2468975	2468980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53126	NC_008212	AT	3	6	2468997	2469002	50 %	50 %	0 %	0 %	110669029
53127	NC_008212	GTT	2	6	2469010	2469015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669029
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53131	NC_008212	CAA	2	6	2469370	2469375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669030
53132	NC_008212	T	6	6	2469389	2469394	0 %	100 %	0 %	0 %	110669030
53133	NC_008212	CAG	2	6	2469445	2469450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669030
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53135	NC_008212	GA	3	6	2469580	2469585	50 %	0 %	50 %	0 %	110669030
53136	NC_008212	ATTG	2	8	2469597	2469604	25 %	50 %	25 %	0 %	110669030
53137	NC_008212	AT	3	6	2469606	2469611	50 %	50 %	0 %	0 %	110669030
53138	NC_008212	TGC	2	6	2469644	2469649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669030
53139	NC_008212	AGC	2	6	2469740	2469745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669030
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53144	NC_008212	AT	3	6	2469972	2469977	50 %	50 %	0 %	0 %	110669030
53145	NC_008212	CGT	2	6	2470015	2470020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53146	NC_008212	CAG	2	6	2470082	2470087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53147	NC_008212	GT	3	6	2470117	2470122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53148	NC_008212	AGT	2	6	2470123	2470128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53149	NC_008212	AT	3	6	2470155	2470160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53150	NC_008212	TGG	2	6	2470182	2470187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669031
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53154	NC_008212	TTG	2	6	2470370	2470375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669031
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53158	NC_008212	GGT	2	6	2470630	2470635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669031
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53168	NC_008212	A	6	6	2471207	2471212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53169	NC_008212	CTC	2	6	2471239	2471244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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53171	NC_008212	CATT	2	8	2471338	2471345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53172	NC_008212	TGA	2	6	2471377	2471382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53174	NC_008212	TCT	2	6	2471390	2471395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53176	NC_008212	G	6	6	2471497	2471502	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53177	NC_008212	TAA	2	6	2471504	2471509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53200	NC_008212	CCA	2	6	2472895	2472900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110669033
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53217	NC_008212	AATTT	2	10	2473540	2473549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53218	NC_008212	GAAC	2	8	2473667	2473674	50 %	0 %	25 %	25 %	110669034
53219	NC_008212	ATG	2	6	2473698	2473703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669034
53220	NC_008212	CTT	2	6	2473742	2473747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669034
53221	NC_008212	GCAA	2	8	2473768	2473775	50 %	0 %	25 %	25 %	110669034
53222	NC_008212	ACA	2	6	2473862	2473867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669034
53223	NC_008212	TGC	2	6	2473876	2473881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669034
53224	NC_008212	TAT	2	6	2473939	2473944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669034
53225	NC_008212	GAT	3	9	2473961	2473969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669034
53226	NC_008212	AG	4	8	2473993	2474000	50 %	0 %	50 %	0 %	110669034
53227	NC_008212	AT	3	6	2474014	2474019	50 %	50 %	0 %	0 %	110669034
53228	NC_008212	CAATC	2	10	2474054	2474063	40 %	20 %	0 %	40 %	110669034
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53232	NC_008212	G	6	6	2474255	2474260	0 %	0 %	100 %	0 %	110669034
53233	NC_008212	TTG	2	6	2474271	2474276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669034
53234	NC_008212	CAT	2	6	2474313	2474318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669034
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53355	NC_008212	TGA	2	6	2479335	2479340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669041
53356	NC_008212	TGA	2	6	2479362	2479367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669041
53357	NC_008212	ATG	2	6	2479385	2479390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669041
53358	NC_008212	TGA	2	6	2479440	2479445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669041
53359	NC_008212	GAT	2	6	2479459	2479464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669041
53360	NC_008212	CTG	2	6	2479505	2479510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669041
53361	NC_008212	TAC	3	9	2479527	2479535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669041
53362	NC_008212	TC	3	6	2479562	2479567	0 %	50 %	0 %	50 %	110669041
53363	NC_008212	CA	3	6	2479632	2479637	50 %	0 %	0 %	50 %	110669041
53364	NC_008212	AT	3	6	2479677	2479682	50 %	50 %	0 %	0 %	110669041
53365	NC_008212	GTAA	2	8	2479704	2479711	50 %	25 %	25 %	0 %	110669041
53366	NC_008212	TC	3	6	2479723	2479728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53367	NC_008212	CAG	2	6	2479774	2479779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53371	NC_008212	GT	3	6	2480026	2480031	0 %	50 %	50 %	0 %	110669042
53372	NC_008212	GTTC	2	8	2480034	2480041	0 %	50 %	25 %	25 %	110669042
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53472	NC_008212	ATA	2	6	2484086	2484091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669043
53473	NC_008212	AT	3	6	2484100	2484105	50 %	50 %	0 %	0 %	110669043
53474	NC_008212	CA	3	6	2484182	2484187	50 %	0 %	0 %	50 %	110669043
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53477	NC_008212	CGT	2	6	2484316	2484321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669043
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53481	NC_008212	GAG	2	6	2484544	2484549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53483	NC_008212	AAT	2	6	2484632	2484637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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