MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_008212	CTA	2	6	2368782	2368787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668949
51002	NC_008212	GAA	2	6	2368906	2368911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110668949
51003	NC_008212	TGA	2	6	2368956	2368961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668949
51004	NC_008212	GCCC	3	12	2368966	2368977	0 %	0 %	25 %	75 %	110668949
51005	NC_008212	CCCA	2	8	2369000	2369007	25 %	0 %	0 %	75 %	110668949
51006	NC_008212	GGCT	2	8	2369031	2369038	0 %	25 %	50 %	25 %	110668949
51007	NC_008212	ACG	2	6	2369045	2369050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110668949
51008	NC_008212	TG	3	6	2369117	2369122	0 %	50 %	50 %	0 %	110668949
51009	NC_008212	TGACC	2	10	2369145	2369154	20 %	20 %	20 %	40 %	110668949
51010	NC_008212	CGA	2	6	2369193	2369198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110668949
51011	NC_008212	GGC	2	6	2369201	2369206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110668949
51012	NC_008212	ACC	2	6	2369241	2369246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110668949
51013	NC_008212	GCC	2	6	2369290	2369295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110668949
51014	NC_008212	TAC	2	6	2369353	2369358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668949
51015	NC_008212	GAA	3	9	2369364	2369372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110668949
51016	NC_008212	CGA	2	6	2369382	2369387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110668949
51017	NC_008212	TTC	2	6	2369388	2369393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110668949
51018	NC_008212	CTT	2	6	2369445	2369450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110668949
51019	NC_008212	GCAC	2	8	2369451	2369458	25 %	0 %	25 %	50 %	110668949
51020	NC_008212	GT	3	6	2369481	2369486	0 %	50 %	50 %	0 %	110668949
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51022	NC_008212	CGG	2	6	2369523	2369528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110668949
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51025	NC_008212	CA	3	6	2369710	2369715	50 %	0 %	0 %	50 %	110668949
51026	NC_008212	GAG	2	6	2369755	2369760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110668949
51027	NC_008212	CAGC	2	8	2369869	2369876	25 %	0 %	25 %	50 %	110668949
51028	NC_008212	GGA	2	6	2369986	2369991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51029	NC_008212	CGA	2	6	2370008	2370013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51030	NC_008212	CTA	2	6	2370051	2370056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51031	NC_008212	TCC	3	9	2370063	2370071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51032	NC_008212	ATG	2	6	2370076	2370081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51033	NC_008212	AATTC	2	10	2370102	2370111	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51034	NC_008212	GCT	2	6	2370131	2370136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51035	NC_008212	TGT	2	6	2370142	2370147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51036	NC_008212	GGA	2	6	2370190	2370195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51037	NC_008212	TGAGCG	2	12	2370200	2370211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51038	NC_008212	TGG	2	6	2370216	2370221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51039	NC_008212	CTG	2	6	2370305	2370310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51040	NC_008212	TGA	2	6	2370479	2370484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51041	NC_008212	TA	3	6	2370522	2370527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51042	NC_008212	AT	3	6	2370556	2370561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51043	NC_008212	A	6	6	2370570	2370575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51044	NC_008212	TGC	2	6	2370585	2370590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51045	NC_008212	ATC	2	6	2370653	2370658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668950
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51052	NC_008212	ATG	2	6	2370959	2370964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668950
51053	NC_008212	TTG	2	6	2371010	2371015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110668950
51054	NC_008212	AATT	2	8	2371022	2371029	50 %	50 %	0 %	0 %	110668950
51055	NC_008212	TGA	2	6	2371032	2371037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668950
51056	NC_008212	TGTC	2	8	2371041	2371048	0 %	50 %	25 %	25 %	110668950
51057	NC_008212	CTA	2	6	2371094	2371099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668950
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51060	NC_008212	GAG	2	6	2371262	2371267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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51063	NC_008212	CAT	2	6	2371365	2371370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51064	NC_008212	ACG	2	6	2371434	2371439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51068	NC_008212	TAT	2	6	2371706	2371711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51069	NC_008212	TAGAA	2	10	2371832	2371841	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51070	NC_008212	ATTA	2	8	2371847	2371854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51071	NC_008212	TCA	2	6	2371917	2371922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668951
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51073	NC_008212	TGA	2	6	2371958	2371963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668951
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51098	NC_008212	AAT	2	6	2372830	2372835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51099	NC_008212	GAGT	2	8	2372842	2372849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51100	NC_008212	TA	3	6	2372915	2372920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51103	NC_008212	CGAA	2	8	2373031	2373038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51104	NC_008212	ACTC	2	8	2373112	2373119	25 %	25 %	0 %	50 %	110668952
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51106	NC_008212	ATT	2	6	2373165	2373170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110668952
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51109	NC_008212	GAGT	2	8	2373248	2373255	25 %	25 %	50 %	0 %	110668952
51110	NC_008212	CAA	2	6	2373353	2373358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110668952
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51115	NC_008212	ACC	2	6	2373613	2373618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110668952
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51119	NC_008212	CGT	2	6	2373787	2373792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110668952
51120	NC_008212	TGTC	2	8	2373810	2373817	0 %	50 %	25 %	25 %	110668952
51121	NC_008212	GAT	2	6	2373832	2373837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668952
51122	NC_008212	CGG	2	6	2373853	2373858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110668952
51123	NC_008212	AATTGG	2	12	2373918	2373929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668952
51124	NC_008212	TTC	2	6	2373933	2373938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110668952
51125	NC_008212	TGT	2	6	2373951	2373956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110668952
51126	NC_008212	AGAT	2	8	2374003	2374010	50 %	25 %	25 %	0 %	110668952
51127	NC_008212	CAT	2	6	2374022	2374027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668952
51128	NC_008212	ACG	2	6	2374032	2374037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110668952
51129	NC_008212	TGA	2	6	2374076	2374081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668952
51130	NC_008212	CTT	2	6	2374109	2374114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110668952
51131	NC_008212	TCA	2	6	2374129	2374134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668952
51132	NC_008212	CAA	2	6	2374205	2374210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110668952
51133	NC_008212	ATC	2	6	2374242	2374247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668952
51134	NC_008212	ATCA	2	8	2374281	2374288	50 %	25 %	0 %	25 %	110668952
51135	NC_008212	CAGTTG	2	12	2374421	2374432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110668952
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51139	NC_008212	CGT	2	6	2374554	2374559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110668952
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51145	NC_008212	TGT	2	6	2374696	2374701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110668952
51146	NC_008212	AT	3	6	2374780	2374785	50 %	50 %	0 %	0 %	110668952
51147	NC_008212	GTAC	2	8	2374858	2374865	25 %	25 %	25 %	25 %	110668952
51148	NC_008212	TTC	2	6	2374998	2375003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110668952
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51151	NC_008212	TCT	2	6	2375119	2375124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110668952
51152	NC_008212	ATT	2	6	2375178	2375183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51153	NC_008212	CTT	2	6	2375277	2375282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51154	NC_008212	TTC	2	6	2375408	2375413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110668953
51155	NC_008212	ATT	2	6	2375415	2375420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110668953
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51160	NC_008212	AT	3	6	2375748	2375753	50 %	50 %	0 %	0 %	110668953
51161	NC_008212	TTA	2	6	2375759	2375764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110668953
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51176	NC_008212	ATGCA	2	10	2376341	2376350	40 %	20 %	20 %	20 %	110668953
51177	NC_008212	TC	3	6	2376416	2376421	0 %	50 %	0 %	50 %	110668953
51178	NC_008212	GAT	2	6	2376515	2376520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668953
51179	NC_008212	TCTG	2	8	2376598	2376605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51180	NC_008212	TGG	2	6	2376631	2376636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51181	NC_008212	CAG	2	6	2376759	2376764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110668954
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51184	NC_008212	ATC	2	6	2376853	2376858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668954
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51187	NC_008212	TGT	2	6	2377054	2377059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110668954
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51190	NC_008212	AAG	2	6	2377514	2377519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51191	NC_008212	TGC	2	6	2377626	2377631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110668955
51192	NC_008212	GAC	2	6	2377651	2377656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110668955
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51199	NC_008212	TGA	2	6	2377977	2377982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668955
51200	NC_008212	TGCA	2	8	2378066	2378073	25 %	25 %	25 %	25 %	110668955
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51203	NC_008212	TTG	2	6	2378258	2378263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110668955
51204	NC_008212	TCGTGA	2	12	2378340	2378351	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110668955
51205	NC_008212	T	6	6	2378383	2378388	0 %	100 %	0 %	0 %	110668955
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51211	NC_008212	AC	3	6	2378454	2378459	50 %	0 %	0 %	50 %	110668955
51212	NC_008212	GTG	2	6	2378498	2378503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110668955
51213	NC_008212	TGC	2	6	2378517	2378522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110668955
51214	NC_008212	TGA	2	6	2378649	2378654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668955
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51216	NC_008212	GCG	2	6	2378698	2378703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110668955
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51218	NC_008212	ACC	2	6	2378712	2378717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110668955
51219	NC_008212	TGA	2	6	2378760	2378765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668955
51220	NC_008212	TGA	2	6	2378808	2378813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668955
51221	NC_008212	ATG	3	9	2378825	2378833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668955
51222	NC_008212	TAAC	2	8	2378856	2378863	50 %	25 %	0 %	25 %	110668955
51223	NC_008212	CTG	2	6	2378878	2378883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51224	NC_008212	CAA	2	6	2378900	2378905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51225	NC_008212	GA	3	6	2378939	2378944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51226	NC_008212	CTGA	2	8	2378951	2378958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51227	NC_008212	TTC	2	6	2378982	2378987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51228	NC_008212	ACT	2	6	2378993	2378998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51229	NC_008212	ATC	2	6	2378999	2379004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51230	NC_008212	TCA	2	6	2379007	2379012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51231	NC_008212	TCA	2	6	2379014	2379019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51232	NC_008212	TCA	2	6	2379021	2379026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51233	NC_008212	GATCT	2	10	2379084	2379093	20 %	40 %	20 %	20 %	110668956
51234	NC_008212	GGC	2	6	2379163	2379168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110668956
51235	NC_008212	GTC	2	6	2379248	2379253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110668956
51236	NC_008212	C	6	6	2379259	2379264	0 %	0 %	0 %	100 %	110668956
51237	NC_008212	ATG	2	6	2379333	2379338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668956
51238	NC_008212	CGC	2	6	2379348	2379353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110668956
51239	NC_008212	CCA	2	6	2379386	2379391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110668956
51240	NC_008212	ACGA	2	8	2379397	2379404	50 %	0 %	25 %	25 %	110668956
51241	NC_008212	ATC	2	6	2379407	2379412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668956
51242	NC_008212	TC	3	6	2379411	2379416	0 %	50 %	0 %	50 %	110668956
51243	NC_008212	AGG	2	6	2379434	2379439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51244	NC_008212	GTC	2	6	2379481	2379486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51245	NC_008212	TAAT	2	8	2379597	2379604	50 %	50 %	0 %	0 %	110668957
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51248	NC_008212	GAT	2	6	2379956	2379961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668957
51249	NC_008212	CGT	2	6	2379992	2379997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110668957
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51252	NC_008212	GT	3	6	2380221	2380226	0 %	50 %	50 %	0 %	110668957
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51262	NC_008212	AGA	2	6	2380603	2380608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110668957
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51264	NC_008212	TGA	2	6	2380837	2380842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668957
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51282	NC_008212	TTGA	2	8	2381519	2381526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51283	NC_008212	TATG	2	8	2381555	2381562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51284	NC_008212	CT	3	6	2381576	2381581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51285	NC_008212	TTGTT	2	10	2381652	2381661	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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51295	NC_008212	ACCTG	2	10	2382048	2382057	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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51298	NC_008212	AT	3	6	2382206	2382211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51299	NC_008212	CATC	2	8	2382247	2382254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51300	NC_008212	GGA	2	6	2382298	2382303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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51307	NC_008212	CTA	2	6	2382835	2382840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51347	NC_008212	ATT	2	6	2384649	2384654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110668959
51348	NC_008212	GTCCTG	2	12	2384662	2384673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110668959
51349	NC_008212	GGT	2	6	2384682	2384687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110668959
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51351	NC_008212	GTG	2	6	2384821	2384826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110668959
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51353	NC_008212	CATG	2	8	2384921	2384928	25 %	25 %	25 %	25 %	110668959
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51355	NC_008212	GA	3	6	2384953	2384958	50 %	0 %	50 %	0 %	110668959
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51473	NC_008212	GTC	2	6	2390070	2390075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110668961
51474	NC_008212	CGA	2	6	2390104	2390109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110668961
51475	NC_008212	GCATTT	2	12	2390136	2390147	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	110668961
51476	NC_008212	AGT	2	6	2390171	2390176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668961
51477	NC_008212	ATAA	2	8	2390217	2390224	75 %	25 %	0 %	0 %	110668961
51478	NC_008212	TA	4	8	2390241	2390248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51479	NC_008212	CTA	2	6	2390251	2390256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51480	NC_008212	TCA	2	6	2390280	2390285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51481	NC_008212	TGAG	2	8	2390360	2390367	25 %	25 %	50 %	0 %	110668962
51482	NC_008212	CTA	2	6	2390476	2390481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668962
51483	NC_008212	TCG	2	6	2390640	2390645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110668963
51484	NC_008212	GAC	2	6	2390673	2390678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110668963
51485	NC_008212	GAA	2	6	2390703	2390708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110668963
51486	NC_008212	AGC	2	6	2390720	2390725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110668963
51487	NC_008212	CATATC	2	12	2390760	2390771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110668963
51488	NC_008212	GGC	2	6	2390778	2390783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110668963
51489	NC_008212	GCA	2	6	2390805	2390810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110668963
51490	NC_008212	CTC	2	6	2390856	2390861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110668963
51491	NC_008212	GAT	2	6	2390898	2390903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110668963
51492	NC_008212	ATGCA	2	10	2390905	2390914	40 %	20 %	20 %	20 %	110668963
51493	NC_008212	ATT	2	6	2390949	2390954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110668963
51494	NC_008212	A	6	6	2391068	2391073	100 %	0 %	0 %	0 %	110668963
51495	NC_008212	CAA	2	6	2391274	2391279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51496	NC_008212	GA	3	6	2391313	2391318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51497	NC_008212	ACT	2	6	2391319	2391324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51498	NC_008212	TTC	2	6	2391356	2391361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51499	NC_008212	ACT	2	6	2391367	2391372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51500	NC_008212	CGA	2	6	2391389	2391394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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