MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hahella chejuensis KCTC 2396 chromosome

Total Repeats: 149036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007645	T	7	7	23	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007645	AAATT	2	10	77	86	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007645	TAA	2	6	109	114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007645	ATTT	2	8	116	123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007645	GGT	2	6	128	133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007645	GCC	2	6	237	242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007645	GTTTT	2	10	265	274	0 %	80 %	20 %	0 %	83642914
8	NC_007645	TA	4	8	305	312	50 %	50 %	0 %	0 %	83642914
9	NC_007645	GCC	2	6	317	322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83642914
10	NC_007645	A	7	7	338	344	100 %	0 %	0 %	0 %	83642914
11	NC_007645	AGCA	2	8	346	353	50 %	0 %	25 %	25 %	83642914
12	NC_007645	GGA	2	6	416	421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83642915
13	NC_007645	GCT	2	6	488	493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83642915
14	NC_007645	TTTG	2	8	494	501	0 %	75 %	25 %	0 %	83642915
15	NC_007645	GCA	2	6	638	643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83642915
16	NC_007645	CGG	2	6	658	663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83642915
17	NC_007645	CAA	2	6	670	675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83642915
18	NC_007645	GA	3	6	726	731	50 %	0 %	50 %	0 %	83642915
19	NC_007645	TTG	2	6	799	804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83642915
20	NC_007645	GCGG	2	8	827	834	0 %	0 %	75 %	25 %	83642915
21	NC_007645	GGC	2	6	891	896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83642915
22	NC_007645	AAG	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642915
23	NC_007645	GA	3	6	987	992	50 %	0 %	50 %	0 %	83642915
24	NC_007645	TTG	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83642915
25	NC_007645	TTC	2	6	1092	1097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83642915
26	NC_007645	GC	3	6	1098	1103	0 %	0 %	50 %	50 %	83642915
27	NC_007645	GAA	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642915
28	NC_007645	CAG	2	6	1161	1166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83642915
29	NC_007645	GCC	2	6	1262	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83642915
30	NC_007645	TGA	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642915
31	NC_007645	TTC	2	6	1344	1349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83642915
32	NC_007645	CTG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83642915
33	NC_007645	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	83642915
34	NC_007645	G	6	6	1665	1670	0 %	0 %	100 %	0 %	83642915
35	NC_007645	ACT	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83642915
36	NC_007645	CAA	2	6	1719	1724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83642915
37	NC_007645	CGC	2	6	1797	1802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007645	AG	3	6	1902	1907	50 %	0 %	50 %	0 %	83642916
39	NC_007645	AAG	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642916
40	NC_007645	GAA	2	6	2244	2249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642916
41	NC_007645	AG	3	6	2278	2283	50 %	0 %	50 %	0 %	83642916
42	NC_007645	CAG	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83642916
43	NC_007645	TTA	2	6	2339	2344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83642916
44	NC_007645	GTC	2	6	2497	2502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83642916
45	NC_007645	TTTTAC	2	12	2573	2584	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	83642916
46	NC_007645	CAGA	2	8	2659	2666	50 %	0 %	25 %	25 %	83642916
47	NC_007645	CG	4	8	2689	2696	0 %	0 %	50 %	50 %	83642916
48	NC_007645	TTG	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83642916
49	NC_007645	GGA	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83642916
50	NC_007645	GAT	2	6	2880	2885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642916
51	NC_007645	AGC	2	6	2919	2924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83642916
52	NC_007645	TGG	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83642916
53	NC_007645	TGT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83642916
54	NC_007645	CAGA	2	8	3090	3097	50 %	0 %	25 %	25 %	83642917
55	NC_007645	GCC	2	6	3158	3163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83642918
56	NC_007645	CGG	3	9	3177	3185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83642918
57	NC_007645	TTGG	2	8	3204	3211	0 %	50 %	50 %	0 %	83642918
58	NC_007645	CG	3	6	3224	3229	0 %	0 %	50 %	50 %	83642918
59	NC_007645	GAA	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642918
60	NC_007645	AAACC	2	10	3363	3372	60 %	0 %	0 %	40 %	83642918
61	NC_007645	GAAG	2	8	3403	3410	50 %	0 %	50 %	0 %	83642918
62	NC_007645	AT	3	6	3434	3439	50 %	50 %	0 %	0 %	83642918
63	NC_007645	CTG	2	6	3557	3562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83642918
64	NC_007645	CTT	2	6	3574	3579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83642918
65	NC_007645	TGC	2	6	3586	3591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83642918
66	NC_007645	GGT	2	6	3595	3600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83642918
67	NC_007645	ATG	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642918
68	NC_007645	GAA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642918
69	NC_007645	AGG	2	6	3693	3698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83642918
70	NC_007645	AG	3	6	3719	3724	50 %	0 %	50 %	0 %	83642918
71	NC_007645	T	6	6	3926	3931	0 %	100 %	0 %	0 %	83642918
72	NC_007645	TAG	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642918
73	NC_007645	TCA	2	6	4047	4052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83642918
74	NC_007645	ATG	2	6	4061	4066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642918
75	NC_007645	GCC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83642918
76	NC_007645	AT	3	6	4202	4207	50 %	50 %	0 %	0 %	83642918
77	NC_007645	CAG	2	6	4214	4219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83642918
78	NC_007645	GAT	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642918
79	NC_007645	AGC	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83642918
80	NC_007645	TGC	2	6	4308	4313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83642918
81	NC_007645	ATGTAC	2	12	4341	4352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	83642918
82	NC_007645	ACG	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83642918
83	NC_007645	GAA	2	6	4428	4433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007645	TTG	2	6	4443	4448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007645	T	7	7	4456	4462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007645	AGA	2	6	4578	4583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642919
87	NC_007645	AAG	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642919
88	NC_007645	AG	3	6	4599	4604	50 %	0 %	50 %	0 %	83642919
89	NC_007645	ATC	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83642919
90	NC_007645	AG	4	8	4750	4757	50 %	0 %	50 %	0 %	83642919
91	NC_007645	ATG	2	6	4875	4880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642919
92	NC_007645	GTG	2	6	4893	4898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83642919
93	NC_007645	CTT	2	6	4943	4948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83642919
94	NC_007645	GATTG	2	10	5087	5096	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007645	AGT	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642920
96	NC_007645	G	6	6	5244	5249	0 %	0 %	100 %	0 %	83642920
97	NC_007645	GCC	2	6	5364	5369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83642920
98	NC_007645	GGC	3	9	5434	5442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83642920
99	NC_007645	TGG	2	6	5488	5493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83642920
100	NC_007645	GA	3	6	5501	5506	50 %	0 %	50 %	0 %	83642920
101	NC_007645	GGT	2	6	5554	5559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83642920
102	NC_007645	CTGAA	2	10	5703	5712	40 %	20 %	20 %	20 %	83642920
103	NC_007645	TGGT	2	8	5794	5801	0 %	50 %	50 %	0 %	83642920
104	NC_007645	ATG	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642920
105	NC_007645	CGT	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83642920
106	NC_007645	A	7	7	5857	5863	100 %	0 %	0 %	0 %	83642920
107	NC_007645	TAAAG	2	10	5899	5908	60 %	20 %	20 %	0 %	83642920
108	NC_007645	GAAG	2	8	5926	5933	50 %	0 %	50 %	0 %	83642920
109	NC_007645	CGG	3	9	5999	6007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83642920
110	NC_007645	TGA	2	6	6034	6039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642920
111	NC_007645	GGAGC	2	10	6044	6053	20 %	0 %	60 %	20 %	83642920
112	NC_007645	CAG	2	6	6134	6139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83642920
113	NC_007645	GA	3	6	6244	6249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007645	TGA	2	6	6348	6353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642921
115	NC_007645	CAC	2	6	6367	6372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83642921
116	NC_007645	CGA	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83642921
117	NC_007645	CTGG	2	8	6412	6419	0 %	25 %	50 %	25 %	83642921
118	NC_007645	AAG	2	6	6428	6433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642921
119	NC_007645	AATC	2	8	6458	6465	50 %	25 %	0 %	25 %	83642921
120	NC_007645	GAT	2	6	6475	6480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642921
121	NC_007645	GAA	2	6	6508	6513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642921
122	NC_007645	GCA	2	6	6526	6531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83642921
123	NC_007645	GGT	2	6	6559	6564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83642921
124	NC_007645	GGC	2	6	6595	6600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83642921
125	NC_007645	GTA	2	6	6622	6627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642921
126	NC_007645	CCG	2	6	6660	6665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83642921
127	NC_007645	ACA	2	6	6668	6673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83642921
128	NC_007645	CTT	2	6	6762	6767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83642921
129	NC_007645	AAC	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83642921
130	NC_007645	ATG	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83642921
131	NC_007645	GAAA	2	8	6984	6991	75 %	0 %	25 %	0 %	83642921
132	NC_007645	CAA	2	6	7065	7070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83642921
133	NC_007645	CGG	2	6	7086	7091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83642921
134	NC_007645	TGGC	2	8	7100	7107	0 %	25 %	50 %	25 %	83642921
135	NC_007645	GCC	2	6	7114	7119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83642921
136	NC_007645	CT	3	6	7128	7133	0 %	50 %	0 %	50 %	83642921
137	NC_007645	AG	3	6	7152	7157	50 %	0 %	50 %	0 %	83642921
138	NC_007645	CG	3	6	7197	7202	0 %	0 %	50 %	50 %	83642921
139	NC_007645	ATT	2	6	7219	7224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83642921
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141	NC_007645	GAA	2	6	7359	7364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83642921
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269	NC_007645	TTA	2	6	13718	13723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_007645	AAT	2	6	13741	13746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_007645	A	6	6	13823	13828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_007645	GAT	2	6	13840	13845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_007645	TGGG	2	8	22734	22741	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_007645	CTT	2	6	22896	22901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83642933
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