MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 6145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006397	GCC	2	6	168141	168146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380245
3502	NC_006397	GTCA	2	8	168162	168169	25 %	25 %	25 %	25 %	55380245
3503	NC_006397	GGA	2	6	168194	168199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380245
3504	NC_006397	CGACGC	2	12	168206	168217	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55380245
3505	NC_006397	ATC	2	6	168223	168228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380245
3506	NC_006397	GGC	2	6	168291	168296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380245
3507	NC_006397	CGA	2	6	168311	168316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380245
3508	NC_006397	AGCC	2	8	168320	168327	25 %	0 %	25 %	50 %	55380245
3509	NC_006397	ACA	2	6	168349	168354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380245
3510	NC_006397	GCC	2	6	168390	168395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380245
3511	NC_006397	GAA	2	6	168635	168640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380245
3512	NC_006397	GTA	2	6	168720	168725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380245
3513	NC_006397	GCC	2	6	168733	168738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380245
3514	NC_006397	AC	3	6	168836	168841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_006397	TTG	2	6	168847	168852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_006397	CGA	2	6	168946	168951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_006397	CGCT	2	8	168990	168997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_006397	CAGT	2	8	169006	169013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_006397	CTG	2	6	169023	169028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_006397	AG	3	6	169038	169043	50 %	0 %	50 %	0 %	55380246
3521	NC_006397	TCAGC	2	10	169078	169087	20 %	20 %	20 %	40 %	55380246
3522	NC_006397	GC	3	6	169109	169114	0 %	0 %	50 %	50 %	55380246
3523	NC_006397	GAC	2	6	169151	169156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380246
3524	NC_006397	TCT	2	6	169177	169182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380246
3525	NC_006397	TCCG	2	8	169190	169197	0 %	25 %	25 %	50 %	55380246
3526	NC_006397	CTC	2	6	169286	169291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380246
3527	NC_006397	TC	4	8	169306	169313	0 %	50 %	0 %	50 %	55380246
3528	NC_006397	CAG	2	6	169345	169350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380246
3529	NC_006397	GTAC	2	8	169381	169388	25 %	25 %	25 %	25 %	55380246
3530	NC_006397	GCC	2	6	169428	169433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380246
3531	NC_006397	AGCCG	2	10	169438	169447	20 %	0 %	40 %	40 %	55380246
3532	NC_006397	GCAC	2	8	169475	169482	25 %	0 %	25 %	50 %	55380246
3533	NC_006397	CCG	2	6	169516	169521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380246
3534	NC_006397	GTG	2	6	169526	169531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380246
3535	NC_006397	TCT	2	6	169549	169554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380246
3536	NC_006397	GA	3	6	169569	169574	50 %	0 %	50 %	0 %	55380246
3537	NC_006397	CG	3	6	169602	169607	0 %	0 %	50 %	50 %	55380246
3538	NC_006397	TGCAC	2	10	169632	169641	20 %	20 %	20 %	40 %	55380246
3539	NC_006397	CAG	2	6	169705	169710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380246
3540	NC_006397	GTC	2	6	169727	169732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380246
3541	NC_006397	CGC	2	6	169756	169761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380246
3542	NC_006397	GTT	2	6	169777	169782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380246
3543	NC_006397	TCG	2	6	169818	169823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380246
3544	NC_006397	CTGG	2	8	169825	169832	0 %	25 %	50 %	25 %	55380246
3545	NC_006397	CGG	2	6	169873	169878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380246
3546	NC_006397	CT	3	6	169943	169948	0 %	50 %	0 %	50 %	55380246
3547	NC_006397	TTG	2	6	169965	169970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380246
3548	NC_006397	TGC	2	6	170135	170140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380246
3549	NC_006397	GTGA	2	8	170199	170206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_006397	ACA	2	6	170228	170233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_006397	CTG	2	6	170281	170286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_006397	GTAATC	2	12	170297	170308	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3553	NC_006397	GTC	2	6	170421	170426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380247
3554	NC_006397	GCC	2	6	170476	170481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380247
3555	NC_006397	CCGC	2	8	170540	170547	0 %	0 %	25 %	75 %	55380247
3556	NC_006397	GCC	2	6	170584	170589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380247
3557	NC_006397	GCA	2	6	170614	170619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380247
3558	NC_006397	CTG	2	6	170628	170633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380247
3559	NC_006397	GTCC	2	8	170777	170784	0 %	25 %	25 %	50 %	55380247
3560	NC_006397	ATATCC	2	12	170794	170805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380247
3561	NC_006397	GAT	2	6	170865	170870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380247
3562	NC_006397	CTC	3	9	170973	170981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380247
3563	NC_006397	GTT	2	6	171024	171029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380247
3564	NC_006397	CAG	2	6	171084	171089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380247
3565	NC_006397	GGC	2	6	171112	171117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380247
3566	NC_006397	TCC	2	6	171139	171144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380247
3567	NC_006397	GAG	2	6	171148	171153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380247
3568	NC_006397	TGA	2	6	171234	171239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380247
3569	NC_006397	AAT	2	6	171255	171260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380247
3570	NC_006397	CCA	2	6	171268	171273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380247
3571	NC_006397	CAC	2	6	171290	171295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380247
3572	NC_006397	CTG	2	6	171389	171394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380247
3573	NC_006397	ACCC	2	8	171425	171432	25 %	0 %	0 %	75 %	55380247
3574	NC_006397	ACT	2	6	171471	171476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380247
3575	NC_006397	ACC	2	6	171477	171482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380247
3576	NC_006397	TTA	2	6	171605	171610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_006397	GCT	2	6	171684	171689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_006397	CGT	2	6	171861	171866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_006397	ATCG	2	8	171949	171956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3580	NC_006397	CCG	2	6	171968	171973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_006397	GAT	2	6	171991	171996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_006397	AT	3	6	172076	172081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_006397	ATT	2	6	172110	172115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380248
3584	NC_006397	CGG	2	6	172120	172125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380248
3585	NC_006397	GAA	2	6	172222	172227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_006397	GTT	2	6	172298	172303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_006397	GCT	2	6	172315	172320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_006397	ATT	2	6	172343	172348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_006397	AGT	2	6	172375	172380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_006397	AGA	2	6	172438	172443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_006397	TGT	2	6	172487	172492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_006397	AT	3	6	172530	172535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_006397	CTC	2	6	172557	172562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_006397	ACTT	2	8	172634	172641	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_006397	ACT	2	6	172701	172706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_006397	GAA	2	6	172824	172829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380249
3597	NC_006397	GGT	2	6	172869	172874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380249
3598	NC_006397	AGCG	2	8	173094	173101	25 %	0 %	50 %	25 %	55380249
3599	NC_006397	CAG	2	6	173130	173135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380249
3600	NC_006397	CTG	2	6	173260	173265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380249
3601	NC_006397	GCCG	2	8	173266	173273	0 %	0 %	50 %	50 %	55380249
3602	NC_006397	GAG	2	6	173313	173318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380249
3603	NC_006397	GATCC	2	10	173328	173337	20 %	20 %	20 %	40 %	55380249
3604	NC_006397	CCGG	2	8	173435	173442	0 %	0 %	50 %	50 %	55380249
3605	NC_006397	ATC	2	6	173445	173450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380249
3606	NC_006397	CGC	2	6	173468	173473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380249
3607	NC_006397	CGT	2	6	173519	173524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380249
3608	NC_006397	CCT	2	6	173530	173535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380249
3609	NC_006397	GTC	2	6	173619	173624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380249
3610	NC_006397	CTC	2	6	173640	173645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380249
3611	NC_006397	CGA	2	6	173708	173713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380249
3612	NC_006397	CAT	2	6	173720	173725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380249
3613	NC_006397	AC	3	6	173740	173745	50 %	0 %	0 %	50 %	55380249
3614	NC_006397	CA	3	6	173797	173802	50 %	0 %	0 %	50 %	55380249
3615	NC_006397	GGC	2	6	173816	173821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380249
3616	NC_006397	CGCAG	2	10	173870	173879	20 %	0 %	40 %	40 %	55380249
3617	NC_006397	GTC	2	6	173958	173963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380249
3618	NC_006397	CCG	2	6	173983	173988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380249
3619	NC_006397	AAC	2	6	173997	174002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380249
3620	NC_006397	CTA	2	6	174047	174052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380249
3621	NC_006397	GTG	2	6	174058	174063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380249
3622	NC_006397	GATGG	2	10	174074	174083	20 %	20 %	60 %	0 %	55380249
3623	NC_006397	ACG	2	6	174114	174119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380249
3624	NC_006397	ATC	2	6	174129	174134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380249
3625	NC_006397	ACGATG	2	12	174159	174170	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55380249
3626	NC_006397	TCG	2	6	174214	174219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380249
3627	NC_006397	GAG	2	6	174264	174269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380249
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3633	NC_006397	ACG	2	6	174571	174576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380250
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3742	NC_006397	GAAA	2	8	179525	179532	75 %	0 %	25 %	0 %	55380254
3743	NC_006397	TCT	2	6	179533	179538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380254
3744	NC_006397	TTCG	2	8	179540	179547	0 %	50 %	25 %	25 %	55380254
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3746	NC_006397	CGA	2	6	179768	179773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380254
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3854	NC_006397	CCTG	2	8	184985	184992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3855	NC_006397	AAC	2	6	185009	185014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3857	NC_006397	TAT	2	6	185099	185104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3858	NC_006397	GCA	2	6	185158	185163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3861	NC_006397	TCAG	2	8	185331	185338	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3862	NC_006397	GCA	2	6	185384	185389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3863	NC_006397	ACT	2	6	185404	185409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3864	NC_006397	TCC	3	9	185419	185427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3865	NC_006397	AGAA	2	8	185454	185461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3866	NC_006397	AGT	2	6	185475	185480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3867	NC_006397	AAT	2	6	185577	185582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3868	NC_006397	CCG	2	6	185637	185642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380259
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3996	NC_006397	GC	3	6	191288	191293	0 %	0 %	50 %	50 %	55380263
3997	NC_006397	ACT	2	6	191346	191351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380263
3998	NC_006397	CG	3	6	191461	191466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3999	NC_006397	GTC	2	6	191520	191525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380264
4000	NC_006397	CTGT	2	8	191526	191533	0 %	50 %	25 %	25 %	55380264

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