MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 6145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006397	GCT	2	6	143982	143987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3002	NC_006397	CT	4	8	144021	144028	0 %	50 %	0 %	50 %	55380223
3003	NC_006397	TCG	2	6	144041	144046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3004	NC_006397	CGA	2	6	144099	144104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3005	NC_006397	GTTCG	2	10	144121	144130	0 %	40 %	40 %	20 %	55380223
3006	NC_006397	TCA	2	6	144176	144181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380223
3007	NC_006397	TCG	2	6	144203	144208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3008	NC_006397	GCT	2	6	144232	144237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3009	NC_006397	CGG	2	6	144267	144272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
3010	NC_006397	CGT	2	6	144292	144297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3011	NC_006397	TCGC	2	8	144358	144365	0 %	25 %	25 %	50 %	55380223
3012	NC_006397	CGTCC	2	10	144375	144384	0 %	20 %	20 %	60 %	55380223
3013	NC_006397	GTGAC	2	10	144396	144405	20 %	20 %	40 %	20 %	55380223
3014	NC_006397	CGG	2	6	144507	144512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
3015	NC_006397	TGC	2	6	144539	144544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3016	NC_006397	CCA	2	6	144562	144567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380223
3017	NC_006397	CGA	2	6	144675	144680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3018	NC_006397	AAC	2	6	144698	144703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380223
3019	NC_006397	CGTTG	2	10	144720	144729	0 %	40 %	40 %	20 %	55380223
3020	NC_006397	CGT	4	12	144798	144809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3021	NC_006397	GTC	4	12	144844	144855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3022	NC_006397	GCA	2	6	144893	144898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3023	NC_006397	CT	3	6	144928	144933	0 %	50 %	0 %	50 %	55380223
3024	NC_006397	GTC	2	6	144934	144939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3025	NC_006397	CTC	2	6	144964	144969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380223
3026	NC_006397	CGTC	2	8	145026	145033	0 %	25 %	25 %	50 %	55380223
3027	NC_006397	GTTC	2	8	145060	145067	0 %	50 %	25 %	25 %	55380223
3028	NC_006397	CTG	2	6	145093	145098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3029	NC_006397	GCT	2	6	145125	145130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3030	NC_006397	CCCA	2	8	145142	145149	25 %	0 %	0 %	75 %	55380223
3031	NC_006397	CGAG	2	8	145167	145174	25 %	0 %	50 %	25 %	55380223
3032	NC_006397	TCG	2	6	145241	145246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3033	NC_006397	ACG	2	6	145253	145258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3034	NC_006397	C	6	6	145261	145266	0 %	0 %	0 %	100 %	55380223
3035	NC_006397	AGC	2	6	145388	145393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3036	NC_006397	GTC	3	9	145462	145470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3037	NC_006397	TCT	2	6	145542	145547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380223
3038	NC_006397	GTC	2	6	145571	145576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3039	NC_006397	CTGC	2	8	145614	145621	0 %	25 %	25 %	50 %	55380223
3040	NC_006397	CT	3	6	145630	145635	0 %	50 %	0 %	50 %	55380223
3041	NC_006397	CCGTT	2	10	145677	145686	0 %	40 %	20 %	40 %	55380223
3042	NC_006397	AG	3	6	145708	145713	50 %	0 %	50 %	0 %	55380223
3043	NC_006397	CGTCC	2	10	145729	145738	0 %	20 %	20 %	60 %	55380223
3044	NC_006397	TTC	2	6	145748	145753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380223
3045	NC_006397	GGA	2	6	145833	145838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380223
3046	NC_006397	CCGA	2	8	145849	145856	25 %	0 %	25 %	50 %	55380223
3047	NC_006397	CAG	2	6	145866	145871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3048	NC_006397	CGT	2	6	145896	145901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3049	NC_006397	GTCGG	2	10	145931	145940	0 %	20 %	60 %	20 %	55380223
3050	NC_006397	TCG	2	6	146051	146056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3051	NC_006397	ATG	2	6	146057	146062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380223
3052	NC_006397	TCG	3	9	146183	146191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3053	NC_006397	TCG	2	6	146231	146236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3054	NC_006397	CGTACT	2	12	146268	146279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55380223
3055	NC_006397	GCC	2	6	146309	146314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380223
3056	NC_006397	CGCT	2	8	146348	146355	0 %	25 %	25 %	50 %	55380223
3057	NC_006397	TCGC	2	8	146362	146369	0 %	25 %	25 %	50 %	55380223
3058	NC_006397	TGA	2	6	146379	146384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380223
3059	NC_006397	CCGTC	2	10	146448	146457	0 %	20 %	20 %	60 %	55380223
3060	NC_006397	CGG	2	6	146532	146537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
3061	NC_006397	GGCC	2	8	146541	146548	0 %	0 %	50 %	50 %	55380223
3062	NC_006397	TTC	2	6	146593	146598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380223
3063	NC_006397	CGG	2	6	146625	146630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
3064	NC_006397	GAC	2	6	146644	146649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3065	NC_006397	TGA	2	6	146667	146672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380223
3066	NC_006397	GGA	2	6	146751	146756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380223
3067	NC_006397	TCG	2	6	146777	146782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3068	NC_006397	ACG	2	6	146815	146820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3069	NC_006397	TCT	2	6	146828	146833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380223
3070	NC_006397	GCT	2	6	146918	146923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3071	NC_006397	GAT	2	6	146950	146955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380223
3072	NC_006397	CTC	2	6	146956	146961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380223
3073	NC_006397	CGT	2	6	146988	146993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3074	NC_006397	GTC	2	6	147037	147042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3075	NC_006397	CGA	2	6	147089	147094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3076	NC_006397	GAG	2	6	147124	147129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380223
3077	NC_006397	CGA	2	6	147132	147137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3078	NC_006397	CCGGT	2	10	147177	147186	0 %	20 %	40 %	40 %	55380223
3079	NC_006397	CGA	2	6	147192	147197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3080	NC_006397	CGA	2	6	147216	147221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3081	NC_006397	CA	4	8	147229	147236	50 %	0 %	0 %	50 %	55380223
3082	NC_006397	CACG	2	8	147246	147253	25 %	0 %	25 %	50 %	55380223
3083	NC_006397	CG	3	6	147295	147300	0 %	0 %	50 %	50 %	55380223
3084	NC_006397	AAT	2	6	147334	147339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380223
3085	NC_006397	TTC	2	6	147343	147348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380223
3086	NC_006397	GGT	2	6	147391	147396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380223
3087	NC_006397	ACGT	2	8	147407	147414	25 %	25 %	25 %	25 %	55380223
3088	NC_006397	GTC	3	9	147415	147423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3089	NC_006397	GCTC	2	8	147445	147452	0 %	25 %	25 %	50 %	55380223
3090	NC_006397	GTC	3	9	147505	147513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3091	NC_006397	CGTT	2	8	147520	147527	0 %	50 %	25 %	25 %	55380223
3092	NC_006397	CGG	2	6	147559	147564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380223
3093	NC_006397	TCG	2	6	147576	147581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3094	NC_006397	CGC	3	9	147586	147594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380223
3095	NC_006397	CGT	2	6	147619	147624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3096	NC_006397	GT	3	6	147631	147636	0 %	50 %	50 %	0 %	55380223
3097	NC_006397	GTT	2	6	147666	147671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380223
3098	NC_006397	TCAC	2	8	147881	147888	25 %	25 %	0 %	50 %	55380223
3099	NC_006397	TCG	3	9	147899	147907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
3100	NC_006397	AGC	2	6	147952	147957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_006397	TAAG	2	8	147998	148005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_006397	AC	3	6	148051	148056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_006397	ACA	2	6	148123	148128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_006397	GAC	2	6	148158	148163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_006397	TC	3	6	148169	148174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_006397	CTA	2	6	148203	148208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_006397	TGC	2	6	148265	148270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380224
3108	NC_006397	ACGT	2	8	148351	148358	25 %	25 %	25 %	25 %	55380224
3109	NC_006397	TGC	2	6	148368	148373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380224
3110	NC_006397	GCA	2	6	148379	148384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380224
3111	NC_006397	CAA	2	6	148440	148445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380224
3112	NC_006397	GGT	2	6	148526	148531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380224
3113	NC_006397	CGA	2	6	148554	148559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380224
3114	NC_006397	GGAA	2	8	148580	148587	50 %	0 %	50 %	0 %	55380224
3115	NC_006397	CGA	2	6	148668	148673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380224
3116	NC_006397	GAC	2	6	148717	148722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380224
3117	NC_006397	AGACG	2	10	148740	148749	40 %	0 %	40 %	20 %	55380224
3118	NC_006397	GAA	2	6	148786	148791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380224
3119	NC_006397	AGGT	2	8	148793	148800	25 %	25 %	50 %	0 %	55380224
3120	NC_006397	GAG	2	6	148844	148849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_006397	CCT	2	6	148883	148888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380225
3122	NC_006397	AG	3	6	148995	149000	50 %	0 %	50 %	0 %	55380225
3123	NC_006397	CTG	2	6	149019	149024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380225
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3155	NC_006397	TCG	2	6	150620	150625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3238	NC_006397	GCC	2	6	154393	154398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380232
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3242	NC_006397	CGA	2	6	154756	154761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_006397	GA	3	6	154760	154765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_006397	CTTC	2	8	154778	154785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3245	NC_006397	GCC	2	6	154793	154798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3246	NC_006397	CGTC	2	8	154845	154852	0 %	25 %	25 %	50 %	55380233
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3248	NC_006397	ATCG	2	8	154929	154936	25 %	25 %	25 %	25 %	55380233
3249	NC_006397	TCG	2	6	154951	154956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380233
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3254	NC_006397	ACACT	2	10	155160	155169	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3376	NC_006397	GC	3	6	161167	161172	0 %	0 %	50 %	50 %	55380239
3377	NC_006397	CTG	2	6	161218	161223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380239
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3379	NC_006397	TCA	2	6	161294	161299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380239
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3381	NC_006397	CGT	2	6	161365	161370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380239
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3432	NC_006397	A	6	6	164321	164326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_006397	GCAGG	2	10	164382	164391	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3434	NC_006397	AT	3	6	164415	164420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3435	NC_006397	TTGT	2	8	164445	164452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3436	NC_006397	GCT	2	6	164503	164508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3438	NC_006397	AC	3	6	164541	164546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3439	NC_006397	GCT	2	6	164639	164644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3441	NC_006397	TCC	2	6	164834	164839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380242
3442	NC_006397	CCG	2	6	164923	164928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380242
3443	NC_006397	CCT	2	6	164934	164939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380242
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3481	NC_006397	TACG	2	8	166963	166970	25 %	25 %	25 %	25 %	55380244
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3492	NC_006397	GAAG	2	8	167723	167730	50 %	0 %	50 %	0 %	55380245
3493	NC_006397	CTGG	2	8	167731	167738	0 %	25 %	50 %	25 %	55380245
3494	NC_006397	CCG	2	6	167782	167787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380245
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3498	NC_006397	CGC	2	6	167924	167929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380245
3499	NC_006397	GCG	2	6	168070	168075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380245
3500	NC_006397	ACG	2	6	168076	168081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380245

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