MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 6145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006397	CCG	2	6	72706	72711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380152
1502	NC_006397	CGT	2	6	72715	72720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1503	NC_006397	GAC	2	6	72737	72742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1504	NC_006397	GTCAC	2	10	72780	72789	20 %	20 %	20 %	40 %	55380152
1505	NC_006397	GCG	2	6	72804	72809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380152
1506	NC_006397	CGT	2	6	72823	72828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1507	NC_006397	CGT	2	6	72844	72849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1508	NC_006397	TTTC	2	8	72892	72899	0 %	75 %	0 %	25 %	55380152
1509	NC_006397	TGGTCG	2	12	72912	72923	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55380152
1510	NC_006397	TCG	2	6	72927	72932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1511	NC_006397	CGGT	2	8	72937	72944	0 %	25 %	50 %	25 %	55380152
1512	NC_006397	CCG	2	6	72957	72962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380152
1513	NC_006397	GCGA	2	8	72963	72970	25 %	0 %	50 %	25 %	55380152
1514	NC_006397	TCG	3	9	72972	72980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1515	NC_006397	GCC	2	6	72989	72994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380152
1516	NC_006397	GGC	2	6	73022	73027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380152
1517	NC_006397	TCGT	2	8	73038	73045	0 %	50 %	25 %	25 %	55380152
1518	NC_006397	TCG	2	6	73059	73064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1519	NC_006397	GAG	2	6	73094	73099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380152
1520	NC_006397	GAAC	2	8	73171	73178	50 %	0 %	25 %	25 %	55380152
1521	NC_006397	GAA	2	6	73214	73219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380152
1522	NC_006397	CAT	2	6	73226	73231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380152
1523	NC_006397	CGC	2	6	73232	73237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380152
1524	NC_006397	CCG	2	6	73290	73295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380152
1525	NC_006397	CGT	2	6	73304	73309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1526	NC_006397	CTT	2	6	73310	73315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380152
1527	NC_006397	TCC	2	6	73320	73325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380152
1528	NC_006397	GA	3	6	73401	73406	50 %	0 %	50 %	0 %	55380152
1529	NC_006397	GAC	2	6	73436	73441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1530	NC_006397	TGA	2	6	73444	73449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380152
1531	NC_006397	CGA	2	6	73471	73476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1532	NC_006397	GCG	2	6	73501	73506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380152
1533	NC_006397	ACC	2	6	73527	73532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380152
1534	NC_006397	CGG	2	6	73540	73545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380152
1535	NC_006397	AGC	2	6	73578	73583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1536	NC_006397	CGA	2	6	73609	73614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1537	NC_006397	TCGT	2	8	73665	73672	0 %	50 %	25 %	25 %	55380152
1538	NC_006397	GCGG	2	8	73697	73704	0 %	0 %	75 %	25 %	55380152
1539	NC_006397	GTA	2	6	73712	73717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380152
1540	NC_006397	GGT	2	6	73723	73728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380152
1541	NC_006397	C	6	6	73880	73885	0 %	0 %	0 %	100 %	55380152
1542	NC_006397	CTG	2	6	73895	73900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1543	NC_006397	CGT	2	6	73915	73920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1544	NC_006397	GTC	2	6	73968	73973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1545	NC_006397	CGA	2	6	74011	74016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380152
1546	NC_006397	GCG	2	6	74064	74069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380152
1547	NC_006397	GTT	2	6	74080	74085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380152
1548	NC_006397	ATC	2	6	74111	74116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380152
1549	NC_006397	AAT	2	6	74167	74172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380152
1550	NC_006397	ATATT	2	10	74179	74188	40 %	60 %	0 %	0 %	55380152
1551	NC_006397	AT	3	6	74212	74217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_006397	GCTG	2	8	74328	74335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_006397	CATAG	2	10	74382	74391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1554	NC_006397	ATTGCG	2	12	74405	74416	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1555	NC_006397	GAAC	2	8	74428	74435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_006397	TC	3	6	74473	74478	0 %	50 %	0 %	50 %	55380153
1557	NC_006397	GAA	2	6	74555	74560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380153
1558	NC_006397	CT	3	6	74576	74581	0 %	50 %	0 %	50 %	55380153
1559	NC_006397	CGA	2	6	74617	74622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380153
1560	NC_006397	ATT	2	6	74694	74699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380153
1561	NC_006397	TGA	2	6	74707	74712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380153
1562	NC_006397	CGA	2	6	74743	74748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380153
1563	NC_006397	GAC	2	6	74777	74782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380153
1564	NC_006397	CAGAG	2	10	74820	74829	40 %	0 %	40 %	20 %	55380153
1565	NC_006397	GGCGT	2	10	74833	74842	0 %	20 %	60 %	20 %	55380153
1566	NC_006397	GCA	2	6	74924	74929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380153
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1568	NC_006397	GAG	2	6	74966	74971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380153
1569	NC_006397	GAG	2	6	75008	75013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380153
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1572	NC_006397	CTC	2	6	75184	75189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380154
1573	NC_006397	AC	3	6	75210	75215	50 %	0 %	0 %	50 %	55380154
1574	NC_006397	GTT	2	6	75227	75232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380154
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1577	NC_006397	CGA	2	6	75423	75428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380154
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1584	NC_006397	AGA	2	6	75675	75680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380154
1585	NC_006397	GAC	2	6	75684	75689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380154
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1587	NC_006397	ACG	2	6	75853	75858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380154
1588	NC_006397	TGG	2	6	75860	75865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380154
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1591	NC_006397	GAA	2	6	76045	76050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_006397	TAA	3	9	76152	76160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_006397	AGCG	2	8	76189	76196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1595	NC_006397	AT	3	6	76213	76218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_006397	AAT	2	6	76222	76227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_006397	AGGC	2	8	76283	76290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1598	NC_006397	GT	3	6	76380	76385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_006397	AC	3	6	76421	76426	50 %	0 %	0 %	50 %	55380155
1600	NC_006397	TCG	2	6	76493	76498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1601	NC_006397	CGA	2	6	76524	76529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1602	NC_006397	CGA	2	6	76550	76555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1603	NC_006397	TGG	2	6	76568	76573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380155
1604	NC_006397	GCC	2	6	76618	76623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380155
1605	NC_006397	CGG	2	6	76661	76666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380155
1606	NC_006397	CAG	2	6	76672	76677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1607	NC_006397	CA	3	6	76850	76855	50 %	0 %	0 %	50 %	55380155
1608	NC_006397	CGA	2	6	76876	76881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1609	NC_006397	CGT	2	6	76893	76898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1610	NC_006397	GTC	2	6	76906	76911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1611	NC_006397	TTGC	2	8	76930	76937	0 %	50 %	25 %	25 %	55380155
1612	NC_006397	CGC	2	6	76962	76967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380155
1613	NC_006397	GTC	2	6	76978	76983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1614	NC_006397	CGT	2	6	77058	77063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1615	NC_006397	GTC	2	6	77068	77073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1616	NC_006397	TC	3	6	77108	77113	0 %	50 %	0 %	50 %	55380155
1617	NC_006397	TGA	2	6	77168	77173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380155
1618	NC_006397	GCC	2	6	77176	77181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380155
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1621	NC_006397	TCG	2	6	77360	77365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380155
1622	NC_006397	TCC	2	6	77507	77512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380155
1623	NC_006397	GAG	2	6	77530	77535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380155
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