MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 6145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006397	AGC	2	6	49548	49553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380127
1002	NC_006397	CGC	2	6	49595	49600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380127
1003	NC_006397	GCT	2	6	49618	49623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380127
1004	NC_006397	TCG	2	6	49642	49647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380127
1005	NC_006397	TG	3	6	49728	49733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_006397	CAGA	2	8	49806	49813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_006397	CA	3	6	49828	49833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_006397	TAT	2	6	49848	49853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_006397	TTG	2	6	49859	49864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_006397	A	6	6	50028	50033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_006397	ATC	2	6	50043	50048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_006397	TGTC	2	8	50085	50092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_006397	GTAA	2	8	50102	50109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_006397	CAA	2	6	50152	50157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_006397	TTG	3	9	50174	50182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_006397	CGT	2	6	50220	50225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380128
1017	NC_006397	AAC	2	6	50245	50250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380128
1018	NC_006397	CG	3	6	50295	50300	0 %	0 %	50 %	50 %	55380128
1019	NC_006397	TCC	2	6	50494	50499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380128
1020	NC_006397	AG	3	6	50522	50527	50 %	0 %	50 %	0 %	55380128
1021	NC_006397	TCG	2	6	50560	50565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380128
1022	NC_006397	CAA	2	6	50582	50587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380128
1023	NC_006397	TGA	2	6	50618	50623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380128
1024	NC_006397	CTC	2	6	50631	50636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380128
1025	NC_006397	CA	3	6	50717	50722	50 %	0 %	0 %	50 %	55380128
1026	NC_006397	CAT	2	6	50771	50776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380128
1027	NC_006397	GTTC	2	8	50840	50847	0 %	50 %	25 %	25 %	55380128
1028	NC_006397	CAT	2	6	50849	50854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380128
1029	NC_006397	TCA	3	9	51010	51018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380128
1030	NC_006397	AAC	2	6	51088	51093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380128
1031	NC_006397	ATC	2	6	51103	51108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380128
1032	NC_006397	CGGT	2	8	51122	51129	0 %	25 %	50 %	25 %	55380128
1033	NC_006397	CTG	2	6	51187	51192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380128
1034	NC_006397	CGG	2	6	51333	51338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380128
1035	NC_006397	CCCGT	2	10	51420	51429	0 %	20 %	20 %	60 %	55380128
1036	NC_006397	GA	3	6	51464	51469	50 %	0 %	50 %	0 %	55380128
1037	NC_006397	GATA	2	8	51495	51502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_006397	ACC	2	6	51521	51526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_006397	C	6	6	51626	51631	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1040	NC_006397	AG	3	6	51653	51658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_006397	AG	3	6	51666	51671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_006397	GAA	2	6	51694	51699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_006397	AGAT	2	8	51710	51717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_006397	ATT	2	6	51788	51793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_006397	TCCC	2	8	51797	51804	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1046	NC_006397	G	6	6	51833	51838	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_006397	GA	3	6	51844	51849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_006397	CATC	2	8	51906	51913	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_006397	TAG	2	6	51916	51921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_006397	GA	3	6	51971	51976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_006397	CACT	2	8	51992	51999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_006397	TAC	2	6	52026	52031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_006397	TGA	2	6	52037	52042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_006397	TAC	2	6	52056	52061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_006397	GCTGC	2	10	52085	52094	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1056	NC_006397	G	6	6	52119	52124	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_006397	G	6	6	52175	52180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_006397	CGC	2	6	52234	52239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_006397	AACAT	2	10	52300	52309	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_006397	ATT	2	6	52320	52325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_006397	CCT	2	6	52380	52385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_006397	CAT	2	6	52399	52404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_006397	CA	3	6	52466	52471	50 %	0 %	0 %	50 %	55380129
1064	NC_006397	CCA	2	6	52481	52486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380129
1065	NC_006397	GCA	2	6	52550	52555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380129
1066	NC_006397	GACG	2	8	52556	52563	25 %	0 %	50 %	25 %	55380129
1067	NC_006397	GC	3	6	52611	52616	0 %	0 %	50 %	50 %	55380129
1068	NC_006397	CGA	2	6	52621	52626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380129
1069	NC_006397	TCG	2	6	52641	52646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380129
1070	NC_006397	ACG	2	6	52683	52688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380129
1071	NC_006397	CCG	2	6	52731	52736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380129
1072	NC_006397	ACC	2	6	52825	52830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380130
1073	NC_006397	TGA	2	6	52849	52854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380130
1074	NC_006397	GCT	2	6	52858	52863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380130
1075	NC_006397	ATC	2	6	52886	52891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380130
1076	NC_006397	CGAGCG	2	12	52951	52962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55380130
1077	NC_006397	CGG	2	6	52996	53001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380130
1078	NC_006397	CGA	2	6	53068	53073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380130
1079	NC_006397	AAG	2	6	53177	53182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380130
1080	NC_006397	GCC	2	6	53204	53209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380130
1081	NC_006397	CAAG	2	8	53266	53273	50 %	0 %	25 %	25 %	55380130
1082	NC_006397	CGC	2	6	53284	53289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380130
1083	NC_006397	ACG	2	6	53379	53384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380130
1084	NC_006397	GTCG	2	8	53425	53432	0 %	25 %	50 %	25 %	55380130
1085	NC_006397	GGC	2	6	53485	53490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380130
1086	NC_006397	ACG	2	6	53502	53507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380130
1087	NC_006397	TGACGG	2	12	53551	53562	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55380130
1088	NC_006397	CTG	2	6	53588	53593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380130
1089	NC_006397	CAC	2	6	53670	53675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_006397	TAC	2	6	53695	53700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_006397	TGG	2	6	53708	53713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_006397	GGT	2	6	53729	53734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_006397	GT	3	6	53733	53738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_006397	AGT	2	6	53753	53758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_006397	TGA	2	6	53763	53768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_006397	TGT	2	6	53789	53794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_006397	CCA	2	6	53893	53898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380131
1098	NC_006397	AGC	2	6	53926	53931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380131
1099	NC_006397	CGC	2	6	53964	53969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380131
1100	NC_006397	GAG	2	6	53970	53975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380131
1101	NC_006397	CCG	2	6	54004	54009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380131
1102	NC_006397	AGT	2	6	54038	54043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380131
1103	NC_006397	GAA	3	9	54149	54157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380131
1104	NC_006397	GCA	2	6	54166	54171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380131
1105	NC_006397	GAC	2	6	54225	54230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380131
1106	NC_006397	CTT	2	6	54240	54245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380131
1107	NC_006397	TCG	2	6	54251	54256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380131
1108	NC_006397	TGA	2	6	54281	54286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380131
1109	NC_006397	T	6	6	54295	54300	0 %	100 %	0 %	0 %	55380131
1110	NC_006397	CGT	2	6	54359	54364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380131
1111	NC_006397	GTT	2	6	54441	54446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380131
1112	NC_006397	GTG	2	6	54492	54497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380131
1113	NC_006397	CGA	2	6	54641	54646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380131
1114	NC_006397	GCC	2	6	54651	54656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380131
1115	NC_006397	ATC	2	6	54690	54695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380131
1116	NC_006397	CCT	2	6	54836	54841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380131
1117	NC_006397	CT	3	6	54923	54928	0 %	50 %	0 %	50 %	55380131
1118	NC_006397	CCA	2	6	54976	54981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380131
1119	NC_006397	CGT	2	6	55055	55060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380131
1120	NC_006397	GCC	2	6	55169	55174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380131
1121	NC_006397	GGT	2	6	55182	55187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380131
1122	NC_006397	ATC	2	6	55266	55271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380131
1123	NC_006397	GCC	2	6	55287	55292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380131
1124	NC_006397	CGG	2	6	55390	55395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380131
1125	NC_006397	TCA	2	6	55420	55425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380131
1126	NC_006397	CAT	2	6	55451	55456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380131
1127	NC_006397	ATG	2	6	55613	55618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380131
1128	NC_006397	TCA	2	6	55639	55644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380131
1129	NC_006397	CGT	2	6	55713	55718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380131
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1131	NC_006397	CTG	2	6	55751	55756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380131
1132	NC_006397	TCG	2	6	55786	55791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380131
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1259	NC_006397	TAC	2	6	61950	61955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380135
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