MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 6145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006397	GTCA	2	8	25436	25443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_006397	GAG	2	6	25484	25489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_006397	ATT	2	6	25510	25515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_006397	TA	3	6	25565	25570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_006397	TAC	2	6	25587	25592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_006397	A	6	6	25631	25636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_006397	AGG	2	6	25638	25643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_006397	AGA	2	6	25674	25679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380098
509	NC_006397	CTG	2	6	25699	25704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380098
510	NC_006397	ACG	2	6	25850	25855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380098
511	NC_006397	CT	3	6	25921	25926	0 %	50 %	0 %	50 %	55380098
512	NC_006397	TGT	2	6	25947	25952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380098
513	NC_006397	TAA	2	6	25962	25967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380098
514	NC_006397	AGCA	2	8	26048	26055	50 %	0 %	25 %	25 %	55380098
515	NC_006397	GAAAA	2	10	26136	26145	80 %	0 %	20 %	0 %	55380098
516	NC_006397	CAG	2	6	26155	26160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380098
517	NC_006397	TCA	2	6	26194	26199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380098
518	NC_006397	AGC	3	9	26232	26240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380098
519	NC_006397	CT	3	6	26263	26268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_006397	TGA	2	6	26335	26340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380099
521	NC_006397	CGA	2	6	26383	26388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380099
522	NC_006397	CGTG	2	8	26424	26431	0 %	25 %	50 %	25 %	55380099
523	NC_006397	GCGT	2	8	26445	26452	0 %	25 %	50 %	25 %	55380099
524	NC_006397	GTTC	2	8	26487	26494	0 %	50 %	25 %	25 %	55380099
525	NC_006397	GCG	2	6	26504	26509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380099
526	NC_006397	GTC	2	6	26603	26608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380099
527	NC_006397	CAG	2	6	26654	26659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380099
528	NC_006397	TCT	2	6	26757	26762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380099
529	NC_006397	T	6	6	26803	26808	0 %	100 %	0 %	0 %	55380099
530	NC_006397	AGCCGT	2	12	26830	26841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55380099
531	NC_006397	AGT	2	6	26842	26847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380099
532	NC_006397	GGC	2	6	26954	26959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380099
533	NC_006397	CGA	2	6	26965	26970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380099
534	NC_006397	GGT	2	6	26971	26976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380099
535	NC_006397	TCG	2	6	26985	26990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380099
536	NC_006397	ACG	2	6	26991	26996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380099
537	NC_006397	CGG	2	6	27038	27043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380099
538	NC_006397	TCGA	2	8	27044	27051	25 %	25 %	25 %	25 %	55380099
539	NC_006397	CAG	2	6	27094	27099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380099
540	NC_006397	GGA	2	6	27133	27138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380099
541	NC_006397	GCA	2	6	27145	27150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380099
542	NC_006397	TGG	2	6	27155	27160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380099
543	NC_006397	CCG	2	6	27187	27192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380099
544	NC_006397	GA	3	6	27228	27233	50 %	0 %	50 %	0 %	55380099
545	NC_006397	AAC	2	6	27240	27245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380099
546	NC_006397	GAA	2	6	27272	27277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380099
547	NC_006397	ACC	2	6	27320	27325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_006397	GTG	2	6	27421	27426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_006397	AGATG	2	10	27453	27462	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
550	NC_006397	AC	3	6	27541	27546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_006397	CTG	2	6	27551	27556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_006397	TTCC	2	8	27604	27611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_006397	GACA	2	8	27715	27722	50 %	0 %	25 %	25 %	55380100
554	NC_006397	CGA	2	6	27735	27740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380100
555	NC_006397	GCA	2	6	27749	27754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380100
556	NC_006397	TCG	2	6	27950	27955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380100
557	NC_006397	GTC	2	6	27997	28002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380100
558	NC_006397	CGA	2	6	28016	28021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380100
559	NC_006397	TCG	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380100
560	NC_006397	GAC	2	6	28057	28062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380100
561	NC_006397	ACG	2	6	28082	28087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380100
562	NC_006397	CGA	2	6	28146	28151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380100
563	NC_006397	GAG	2	6	28165	28170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380100
564	NC_006397	GCCA	2	8	28309	28316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
565	NC_006397	TG	5	10	28386	28395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_006397	AGC	2	6	28466	28471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_006397	CCAA	2	8	28511	28518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_006397	CAA	2	6	28573	28578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_006397	TG	3	6	28713	28718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_006397	TAT	2	6	28842	28847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380101
571	NC_006397	GGT	2	6	28882	28887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380101
572	NC_006397	TGCCT	2	10	28934	28943	0 %	40 %	20 %	40 %	55380101
573	NC_006397	CTG	2	6	29100	29105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380101
574	NC_006397	GCT	2	6	29150	29155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380101
575	NC_006397	TTA	2	6	29168	29173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380101
576	NC_006397	TGT	2	6	29183	29188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380101
577	NC_006397	CGT	2	6	29190	29195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380101
578	NC_006397	TA	3	6	29272	29277	50 %	50 %	0 %	0 %	55380101
579	NC_006397	TCA	2	6	29285	29290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380101
580	NC_006397	CTGT	2	8	29307	29314	0 %	50 %	25 %	25 %	55380101
581	NC_006397	AGCT	2	8	29389	29396	25 %	25 %	25 %	25 %	55380101
582	NC_006397	T	7	7	29498	29504	0 %	100 %	0 %	0 %	55380101
583	NC_006397	ACT	2	6	29510	29515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380101
584	NC_006397	TTC	2	6	29567	29572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380101
585	NC_006397	GCG	2	6	29576	29581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380101
586	NC_006397	TAT	2	6	29613	29618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380101
587	NC_006397	AAT	2	6	29689	29694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380101
588	NC_006397	TGT	2	6	29817	29822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380101
589	NC_006397	CTC	2	6	29905	29910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380101
590	NC_006397	CGCT	2	8	29946	29953	0 %	25 %	25 %	50 %	55380101
591	NC_006397	CAC	2	6	29965	29970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380101
592	NC_006397	ACC	2	6	29972	29977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380101
593	NC_006397	AAT	2	6	30098	30103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_006397	TTG	2	6	30139	30144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_006397	CAGT	2	8	30171	30178	25 %	25 %	25 %	25 %	55380102
596	NC_006397	ATC	2	6	30193	30198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380102
597	NC_006397	TCG	2	6	30221	30226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380102
598	NC_006397	CAC	2	6	30252	30257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380102
599	NC_006397	GGT	2	6	30297	30302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380102
600	NC_006397	GGT	2	6	30358	30363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380102
601	NC_006397	CGAC	2	8	30368	30375	25 %	0 %	25 %	50 %	55380102
602	NC_006397	GCG	2	6	30393	30398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380102
603	NC_006397	CGA	2	6	30420	30425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380102
604	NC_006397	GGA	2	6	30426	30431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380102
605	NC_006397	CG	3	6	30438	30443	0 %	0 %	50 %	50 %	55380102
606	NC_006397	GTG	2	6	30472	30477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_006397	CACC	2	8	30537	30544	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
608	NC_006397	GAG	2	6	30547	30552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_006397	CAG	2	6	30555	30560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_006397	ACG	2	6	30563	30568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_006397	GCG	2	6	30599	30604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_006397	GGC	2	6	30635	30640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_006397	AC	3	6	30661	30666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_006397	TCG	2	6	30671	30676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380103
615	NC_006397	CAT	2	6	30709	30714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380103
616	NC_006397	TCG	2	6	30755	30760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380103
617	NC_006397	TTC	2	6	30772	30777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380103
618	NC_006397	CGC	2	6	30778	30783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380103
619	NC_006397	CG	3	6	30808	30813	0 %	0 %	50 %	50 %	55380103
620	NC_006397	CAG	2	6	30859	30864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380103
621	NC_006397	CAG	2	6	30936	30941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380103
622	NC_006397	TCG	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380103
623	NC_006397	GCA	2	6	30998	31003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380103
624	NC_006397	GTCC	2	8	31078	31085	0 %	25 %	25 %	50 %	55380103
625	NC_006397	ACC	2	6	31091	31096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380103
626	NC_006397	CAT	2	6	31176	31181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_006397	GGT	2	6	31192	31197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_006397	GGT	2	6	31285	31290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_006397	TGAC	2	8	31302	31309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_006397	TGGCG	2	10	31356	31365	0 %	20 %	60 %	20 %	55380104
631	NC_006397	CTC	2	6	31367	31372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380104
632	NC_006397	CGAG	2	8	31405	31412	25 %	0 %	50 %	25 %	55380104
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