MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 6145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006397	CGG	2	6	257971	257976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380325
5502	NC_006397	GTT	2	6	258017	258022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380325
5503	NC_006397	AAC	2	6	258066	258071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380325
5504	NC_006397	CTA	2	6	258090	258095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380325
5505	NC_006397	CTG	2	6	258114	258119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380325
5506	NC_006397	GTT	2	6	258131	258136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380325
5507	NC_006397	CGA	2	6	258158	258163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380325
5508	NC_006397	CCG	2	6	258177	258182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380325
5509	NC_006397	GCG	2	6	258192	258197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380325
5510	NC_006397	TCC	2	6	258223	258228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380325
5511	NC_006397	CCG	2	6	258261	258266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380325
5512	NC_006397	AGA	2	6	258295	258300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380325
5513	NC_006397	CCA	2	6	258302	258307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380325
5514	NC_006397	CGCT	2	8	258331	258338	0 %	25 %	25 %	50 %	55380325
5515	NC_006397	CAA	2	6	258456	258461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_006397	CTGA	2	8	258540	258547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_006397	CTG	2	6	258574	258579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_006397	AGC	2	6	258617	258622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_006397	GGT	2	6	258696	258701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380326
5520	NC_006397	CTT	2	6	258725	258730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380326
5521	NC_006397	GAG	2	6	258771	258776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380326
5522	NC_006397	CAG	2	6	258916	258921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380326
5523	NC_006397	CTG	2	6	258933	258938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380326
5524	NC_006397	CGG	3	9	258956	258964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380326
5525	NC_006397	AC	3	6	258965	258970	50 %	0 %	0 %	50 %	55380326
5526	NC_006397	CTC	2	6	258984	258989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380326
5527	NC_006397	ATC	2	6	259020	259025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380326
5528	NC_006397	TCG	2	6	259069	259074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380326
5529	NC_006397	ATC	2	6	259128	259133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380326
5530	NC_006397	GCC	2	6	259270	259275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380326
5531	NC_006397	CAGT	2	8	259336	259343	25 %	25 %	25 %	25 %	55380326
5532	NC_006397	TCG	2	6	259369	259374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380326
5533	NC_006397	CGA	2	6	259381	259386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380326
5534	NC_006397	GAC	2	6	259389	259394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380326
5535	NC_006397	CGT	2	6	259478	259483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380326
5536	NC_006397	CGC	2	6	259558	259563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380326
5537	NC_006397	GCT	2	6	259572	259577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380326
5538	NC_006397	CG	3	6	259725	259730	0 %	0 %	50 %	50 %	55380326
5539	NC_006397	CG	3	6	259827	259832	0 %	0 %	50 %	50 %	55380327
5540	NC_006397	GAC	2	6	259833	259838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380327
5541	NC_006397	GTG	2	6	259942	259947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380327
5542	NC_006397	CGA	2	6	259967	259972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380327
5543	NC_006397	TCA	2	6	260027	260032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380327
5544	NC_006397	CCT	2	6	260124	260129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5545	NC_006397	CGGGA	2	10	260138	260147	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5546	NC_006397	TGTA	2	8	260158	260165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_006397	CGG	2	6	260177	260182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_006397	ACC	2	6	260208	260213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_006397	GAA	2	6	260226	260231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380328
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5551	NC_006397	ACTGA	2	10	260421	260430	40 %	20 %	20 %	20 %	55380328
5552	NC_006397	TGA	2	6	260462	260467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380328
5553	NC_006397	TGTC	2	8	260531	260538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_006397	CTGA	2	8	260544	260551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5555	NC_006397	ATCG	2	8	260585	260592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_006397	AC	3	6	260612	260617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_006397	ACA	2	6	260623	260628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_006397	CTC	2	6	260726	260731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_006397	TCC	2	6	260784	260789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380329
5560	NC_006397	ACGT	2	8	260828	260835	25 %	25 %	25 %	25 %	55380329
5561	NC_006397	TCG	2	6	260886	260891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380329
5562	NC_006397	GTC	4	12	260897	260908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380329
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5564	NC_006397	CTA	2	6	261145	261150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380329
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5568	NC_006397	TGGGG	2	10	261407	261416	0 %	20 %	80 %	0 %	55380329
5569	NC_006397	TGCT	2	8	261450	261457	0 %	50 %	25 %	25 %	55380329
5570	NC_006397	TCA	2	6	261480	261485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380329
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5574	NC_006397	CGG	2	6	261574	261579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380329
5575	NC_006397	CGT	2	6	261619	261624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380329
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5578	NC_006397	CGA	2	6	261720	261725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_006397	CAG	2	6	261742	261747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5589	NC_006397	TGACGG	2	12	262255	262266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55380331
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5600	NC_006397	GCG	2	6	262792	262797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380331
5601	NC_006397	GCG	2	6	262869	262874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380331
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5604	NC_006397	GCC	2	6	263010	263015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380331
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5607	NC_006397	CGC	2	6	263065	263070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380331
5608	NC_006397	AGCGCG	2	12	263124	263135	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55380331
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5611	NC_006397	GGCC	2	8	263182	263189	0 %	0 %	50 %	50 %	55380331
5612	NC_006397	CGA	2	6	263263	263268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380331
5613	NC_006397	CGG	2	6	263272	263277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380331
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5616	NC_006397	TAGT	2	8	263419	263426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_006397	AC	3	6	263470	263475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_006397	AGA	2	6	263498	263503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_006397	CT	3	6	263590	263595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_006397	GAGC	2	8	263598	263605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5622	NC_006397	CAGT	2	8	263717	263724	25 %	25 %	25 %	25 %	55380332
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5996	NC_006397	GCA	2	6	280499	280504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380346
5997	NC_006397	GTC	2	6	280541	280546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380346
5998	NC_006397	AAT	2	6	280558	280563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380346
5999	NC_006397	CGA	2	6	280699	280704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380346
6000	NC_006397	GAC	2	6	280729	280734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380346

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