MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 6145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006397	GT	3	6	236417	236422	0 %	50 %	50 %	0 %	55380307
5002	NC_006397	CGA	2	6	236433	236438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380307
5003	NC_006397	ATG	2	6	236594	236599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380307
5004	NC_006397	GTAGGT	2	12	236602	236613	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	55380307
5005	NC_006397	GTC	2	6	236653	236658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380307
5006	NC_006397	GCG	2	6	236679	236684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380307
5007	NC_006397	GCC	2	6	236731	236736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380307
5008	NC_006397	GTG	2	6	236791	236796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380307
5009	NC_006397	CGA	2	6	236850	236855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380307
5010	NC_006397	ACG	2	6	236927	236932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380307
5011	NC_006397	CGA	2	6	236961	236966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380307
5012	NC_006397	CGG	2	6	236981	236986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380307
5013	NC_006397	CGG	2	6	237084	237089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380307
5014	NC_006397	ACC	2	6	237136	237141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380307
5015	NC_006397	GCC	2	6	237145	237150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380307
5016	NC_006397	CGA	2	6	237153	237158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380307
5017	NC_006397	TTC	2	6	237181	237186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380308
5018	NC_006397	TCG	2	6	237244	237249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380308
5019	NC_006397	CGA	3	9	237267	237275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380308
5020	NC_006397	TGG	2	6	237413	237418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380308
5021	NC_006397	TAA	2	6	237457	237462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_006397	CA	3	6	237524	237529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_006397	GCC	2	6	237559	237564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_006397	GGA	2	6	237576	237581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_006397	CGA	2	6	237602	237607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_006397	TCG	2	6	237628	237633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_006397	CGG	2	6	237655	237660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_006397	AC	3	6	237672	237677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_006397	CGG	2	6	237724	237729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_006397	AGTC	2	8	237745	237752	25 %	25 %	25 %	25 %	55380309
5031	NC_006397	CGC	2	6	237766	237771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380309
5032	NC_006397	CGT	2	6	237810	237815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380309
5033	NC_006397	CGAC	2	8	237833	237840	25 %	0 %	25 %	50 %	55380309
5034	NC_006397	TCA	2	6	237841	237846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380309
5035	NC_006397	TCG	2	6	237877	237882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380309
5036	NC_006397	TTG	2	6	237892	237897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380309
5037	NC_006397	GCCGA	2	10	237960	237969	20 %	0 %	40 %	40 %	55380309
5038	NC_006397	GCAG	2	8	238015	238022	25 %	0 %	50 %	25 %	55380309
5039	NC_006397	GT	3	6	238041	238046	0 %	50 %	50 %	0 %	55380309
5040	NC_006397	ACG	2	6	238061	238066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380309
5041	NC_006397	CCTCG	2	10	238091	238100	0 %	20 %	20 %	60 %	55380309
5042	NC_006397	GA	3	6	238158	238163	50 %	0 %	50 %	0 %	55380309
5043	NC_006397	TGG	2	6	238177	238182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380309
5044	NC_006397	ACG	2	6	238235	238240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380309
5045	NC_006397	GTC	2	6	238263	238268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380309
5046	NC_006397	CGT	2	6	238304	238309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380309
5047	NC_006397	CGC	2	6	238319	238324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380309
5048	NC_006397	CGT	2	6	238368	238373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380309
5049	NC_006397	CGA	2	6	238433	238438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380309
5050	NC_006397	G	6	6	238462	238467	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_006397	TCG	2	6	238492	238497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_006397	GCC	2	6	238548	238553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380310
5053	NC_006397	CGT	3	9	238570	238578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380310
5054	NC_006397	GTC	2	6	238583	238588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380310
5055	NC_006397	TCG	2	6	238590	238595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380310
5056	NC_006397	TCG	2	6	238668	238673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380310
5057	NC_006397	TCG	2	6	238675	238680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380310
5058	NC_006397	GTC	2	6	238691	238696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380310
5059	NC_006397	CAT	2	6	238709	238714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380310
5060	NC_006397	TCGGCA	2	12	238759	238770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55380310
5061	NC_006397	GGA	2	6	238822	238827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380310
5062	NC_006397	GCG	2	6	238900	238905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380310
5063	NC_006397	CGA	2	6	238936	238941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380310
5064	NC_006397	TCT	2	6	238948	238953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380310
5065	NC_006397	TCG	3	9	238959	238967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380310
5066	NC_006397	CGCC	2	8	239044	239051	0 %	0 %	25 %	75 %	55380310
5067	NC_006397	GT	3	6	239056	239061	0 %	50 %	50 %	0 %	55380310
5068	NC_006397	TCT	2	6	239081	239086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380311
5069	NC_006397	TCG	2	6	239113	239118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380311
5070	NC_006397	AGT	2	6	239128	239133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380311
5071	NC_006397	CGTT	2	8	239141	239148	0 %	50 %	25 %	25 %	55380311
5072	NC_006397	GTCG	2	8	239187	239194	0 %	25 %	50 %	25 %	55380311
5073	NC_006397	GTC	2	6	239226	239231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380311
5074	NC_006397	GAC	2	6	239250	239255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380311
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5077	NC_006397	ATT	2	6	239389	239394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_006397	AG	3	6	239446	239451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_006397	TAC	2	6	239562	239567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_006397	CGA	2	6	239642	239647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5081	NC_006397	CG	3	6	239672	239677	0 %	0 %	50 %	50 %	55380312
5082	NC_006397	CAT	2	6	239777	239782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380312
5083	NC_006397	GAC	2	6	239796	239801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5084	NC_006397	ACG	2	6	239875	239880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5085	NC_006397	CAC	2	6	239883	239888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380312
5086	NC_006397	GC	3	6	239913	239918	0 %	0 %	50 %	50 %	55380312
5087	NC_006397	ACG	2	6	239947	239952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5088	NC_006397	TCC	2	6	239985	239990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380312
5089	NC_006397	ACG	3	9	240013	240021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5090	NC_006397	ATC	2	6	240033	240038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380312
5091	NC_006397	GC	3	6	240047	240052	0 %	0 %	50 %	50 %	55380312
5092	NC_006397	CCGA	2	8	240058	240065	25 %	0 %	25 %	50 %	55380312
5093	NC_006397	CGA	2	6	240071	240076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5094	NC_006397	GCG	2	6	240162	240167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380312
5095	NC_006397	GCC	2	6	240192	240197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380312
5096	NC_006397	CGC	2	6	240218	240223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380312
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5098	NC_006397	GAC	2	6	240278	240283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5099	NC_006397	TCG	2	6	240373	240378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380312
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5101	NC_006397	GAT	2	6	240519	240524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380312
5102	NC_006397	GC	3	6	240538	240543	0 %	0 %	50 %	50 %	55380312
5103	NC_006397	ACG	2	6	240571	240576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5104	NC_006397	GAG	2	6	240609	240614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380312
5105	NC_006397	GGACGA	2	12	240632	240643	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55380312
5106	NC_006397	TCG	2	6	240646	240651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5107	NC_006397	CAT	2	6	240698	240703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380312
5108	NC_006397	CGA	2	6	240706	240711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5109	NC_006397	CGA	3	9	240731	240739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380312
5110	NC_006397	AAC	2	6	240768	240773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380312
5111	NC_006397	GCG	2	6	240777	240782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380312
5112	NC_006397	TCGC	2	8	240792	240799	0 %	25 %	25 %	50 %	55380312
5113	NC_006397	GCC	2	6	240846	240851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380313
5114	NC_006397	CGG	2	6	240887	240892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380313
5115	NC_006397	TCG	2	6	240898	240903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380313
5116	NC_006397	CGGCG	2	10	240908	240917	0 %	0 %	60 %	40 %	55380313
5117	NC_006397	CAG	2	6	241005	241010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380313
5118	NC_006397	GGC	2	6	241030	241035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380313
5119	NC_006397	CAT	2	6	241052	241057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380313
5120	NC_006397	GTC	2	6	241080	241085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380313
5121	NC_006397	TGG	2	6	241119	241124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380313
5122	NC_006397	TGG	2	6	241136	241141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380313
5123	NC_006397	TCG	2	6	241147	241152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380313
5124	NC_006397	GGCG	2	8	241232	241239	0 %	0 %	75 %	25 %	55380313
5125	NC_006397	CTG	2	6	241251	241256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380313
5126	NC_006397	ACTG	2	8	241265	241272	25 %	25 %	25 %	25 %	55380313
5127	NC_006397	GTC	2	6	241278	241283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380313
5128	NC_006397	CGG	2	6	241357	241362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380314
5129	NC_006397	CTTCGG	2	12	241369	241380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380314
5130	NC_006397	GGT	2	6	241411	241416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380314
5131	NC_006397	TCC	2	6	241425	241430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380314
5132	NC_006397	CTG	2	6	241448	241453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380314
5133	NC_006397	CGG	2	6	241465	241470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380314
5134	NC_006397	CG	3	6	241506	241511	0 %	0 %	50 %	50 %	55380314
5135	NC_006397	CGG	2	6	241585	241590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380314
5136	NC_006397	GCC	2	6	241637	241642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380314
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5139	NC_006397	CCG	2	6	241828	241833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380315
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5143	NC_006397	TCG	2	6	241945	241950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380315
5144	NC_006397	CGG	2	6	242021	242026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380315
5145	NC_006397	TCG	2	6	242053	242058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380315
5146	NC_006397	GCT	2	6	242060	242065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380315
5147	NC_006397	ATC	2	6	242142	242147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380315
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5150	NC_006397	TGC	2	6	242263	242268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380315
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5152	NC_006397	CGT	2	6	242324	242329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380315
5153	NC_006397	CGG	3	9	242363	242371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380315
5154	NC_006397	CGT	2	6	242420	242425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380315
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5160	NC_006397	CGGT	2	8	242581	242588	0 %	25 %	50 %	25 %	55380315
5161	NC_006397	GTC	2	6	242634	242639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380315
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5164	NC_006397	GGTCG	2	10	242666	242675	0 %	20 %	60 %	20 %	55380315
5165	NC_006397	GC	3	6	242683	242688	0 %	0 %	50 %	50 %	55380315
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5196	NC_006397	ATT	2	6	243992	243997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5198	NC_006397	ATA	2	6	244096	244101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5199	NC_006397	TGC	2	6	244276	244281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380317
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5207	NC_006397	CTG	2	6	244488	244493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380318
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5231	NC_006397	GTC	2	6	245340	245345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380318
5232	NC_006397	CAG	2	6	245348	245353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380318
5233	NC_006397	GTC	2	6	245381	245386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380318
5234	NC_006397	T	6	6	245416	245421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_006397	TACT	2	8	245456	245463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5236	NC_006397	AAC	2	6	245582	245587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380319
5237	NC_006397	GTTG	2	8	245629	245636	0 %	50 %	50 %	0 %	55380319
5238	NC_006397	TTGC	2	8	245711	245718	0 %	50 %	25 %	25 %	55380319
5239	NC_006397	GAT	2	6	245756	245761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380319
5240	NC_006397	CAAG	2	8	245767	245774	50 %	0 %	25 %	25 %	55380319
5241	NC_006397	GACG	3	12	245794	245805	25 %	0 %	50 %	25 %	55380319
5242	NC_006397	ACG	2	6	245900	245905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380319
5243	NC_006397	CGA	2	6	245963	245968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380319
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5245	NC_006397	GC	3	6	246060	246065	0 %	0 %	50 %	50 %	55380319
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5368	NC_006397	GA	3	6	252077	252082	50 %	0 %	50 %	0 %	55380322
5369	NC_006397	ACG	2	6	252159	252164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380322
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5371	NC_006397	GTG	2	6	252304	252309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380322
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5440	NC_006397	TCG	2	6	255402	255407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380323
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5470	NC_006397	CGAG	2	8	256675	256682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5471	NC_006397	GTCGGC	2	12	256829	256840	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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5475	NC_006397	ACG	2	6	256925	256930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5479	NC_006397	CGAG	2	8	257162	257169	25 %	0 %	50 %	25 %	55380325
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