MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006396	CG	3	6	126194	126199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_006396	ACGT	2	8	126208	126215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_006396	GCC	2	6	126231	126236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_006396	ACG	2	6	126272	126277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377076
3005	NC_006396	TCG	2	6	126281	126286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377076
3006	NC_006396	CGTCG	2	10	126303	126312	0 %	20 %	40 %	40 %	55377076
3007	NC_006396	GAC	2	6	126328	126333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377076
3008	NC_006396	CAA	2	6	126359	126364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377076
3009	NC_006396	CGT	2	6	126372	126377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377076
3010	NC_006396	CG	3	6	126429	126434	0 %	0 %	50 %	50 %	55377076
3011	NC_006396	GCG	2	6	126455	126460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377076
3012	NC_006396	CGG	2	6	126486	126491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377076
3013	NC_006396	CGT	2	6	126527	126532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377076
3014	NC_006396	CGG	2	6	126543	126548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377076
3015	NC_006396	TCG	2	6	126632	126637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377076
3016	NC_006396	CGA	2	6	126657	126662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377076
3017	NC_006396	CAG	2	6	126793	126798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_006396	ACC	2	6	126816	126821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_006396	AGC	2	6	126907	126912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3020	NC_006396	CGC	2	6	126969	126974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377077
3021	NC_006396	AGCC	2	8	126990	126997	25 %	0 %	25 %	50 %	55377077
3022	NC_006396	CTG	2	6	127004	127009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3023	NC_006396	GTC	3	9	127039	127047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3024	NC_006396	GGGGCG	2	12	127057	127068	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	55377077
3025	NC_006396	CTG	2	6	127099	127104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3026	NC_006396	CGT	2	6	127125	127130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3027	NC_006396	ACC	2	6	127136	127141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377077
3028	NC_006396	CGC	2	6	127185	127190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377077
3029	NC_006396	TCA	2	6	127208	127213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377077
3030	NC_006396	CG	3	6	127257	127262	0 %	0 %	50 %	50 %	55377077
3031	NC_006396	CGT	2	6	127272	127277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3032	NC_006396	GCA	2	6	127294	127299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3033	NC_006396	GGCG	2	8	127305	127312	0 %	0 %	75 %	25 %	55377077
3034	NC_006396	CTG	2	6	127354	127359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3035	NC_006396	GTC	3	9	127360	127368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3036	NC_006396	TCG	2	6	127373	127378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3037	NC_006396	TCG	2	6	127388	127393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3038	NC_006396	CGGCG	2	10	127407	127416	0 %	0 %	60 %	40 %	55377077
3039	NC_006396	CGGC	2	8	127463	127470	0 %	0 %	50 %	50 %	55377077
3040	NC_006396	CGG	2	6	127476	127481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377077
3041	NC_006396	TCA	2	6	127499	127504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377077
3042	NC_006396	TGG	2	6	127589	127594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377077
3043	NC_006396	ACG	2	6	127660	127665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3044	NC_006396	GCT	2	6	127672	127677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3045	NC_006396	GCTG	2	8	127712	127719	0 %	25 %	50 %	25 %	55377077
3046	NC_006396	TGC	2	6	127740	127745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3047	NC_006396	CCG	2	6	127777	127782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377077
3048	NC_006396	CGC	2	6	127848	127853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377077
3049	NC_006396	GCT	2	6	127860	127865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3050	NC_006396	CGG	2	6	127887	127892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377077
3051	NC_006396	CTG	2	6	127982	127987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3052	NC_006396	GCT	2	6	128007	128012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377077
3053	NC_006396	CGG	2	6	128022	128027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377077
3054	NC_006396	CGGG	2	8	128048	128055	0 %	0 %	75 %	25 %	55377077
3055	NC_006396	CGG	2	6	128085	128090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377077
3056	NC_006396	TGGC	2	8	128150	128157	0 %	25 %	50 %	25 %	55377077
3057	NC_006396	CGG	2	6	128160	128165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377077
3058	NC_006396	TCC	2	6	128171	128176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377077
3059	NC_006396	CTC	2	6	128185	128190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377077
3060	NC_006396	GAC	2	6	128264	128269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_006396	GCC	2	6	128274	128279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_006396	GTC	2	6	128319	128324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_006396	CAC	2	6	128387	128392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_006396	ACG	2	6	128551	128556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_006396	CGA	2	6	128557	128562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_006396	CGA	2	6	128651	128656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_006396	CGAC	2	8	128702	128709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_006396	GACCG	2	10	128724	128733	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3069	NC_006396	GTCG	2	8	128753	128760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_006396	CGC	2	6	128793	128798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377078
3071	NC_006396	TCG	3	9	128834	128842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377078
3072	NC_006396	GAC	2	6	128887	128892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377078
3073	NC_006396	GAC	2	6	128929	128934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377078
3074	NC_006396	GGT	2	6	128991	128996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377078
3075	NC_006396	CGTG	2	8	129008	129015	0 %	25 %	50 %	25 %	55377078
3076	NC_006396	ACC	2	6	129064	129069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377079
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3078	NC_006396	GAT	2	6	129125	129130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377079
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3080	NC_006396	GAT	2	6	129188	129193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377079
3081	NC_006396	TGC	2	6	129203	129208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_006396	ACT	2	6	129240	129245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_006396	AG	3	6	129256	129261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_006396	AGCGGA	2	12	129275	129286	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55377080
3085	NC_006396	CGA	2	6	129339	129344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3086	NC_006396	TCG	2	6	129367	129372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3087	NC_006396	GTCG	2	8	129437	129444	0 %	25 %	50 %	25 %	55377080
3088	NC_006396	CCGCTG	2	12	129508	129519	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55377080
3089	NC_006396	TCG	2	6	129529	129534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3090	NC_006396	CGA	2	6	129581	129586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3091	NC_006396	TCCGGG	2	12	129601	129612	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55377080
3092	NC_006396	GCC	2	6	129642	129647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377080
3093	NC_006396	AG	3	6	129666	129671	50 %	0 %	50 %	0 %	55377080
3094	NC_006396	GAT	2	6	129672	129677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377080
3095	NC_006396	CCG	2	6	129718	129723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377080
3096	NC_006396	TCG	2	6	129766	129771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3097	NC_006396	GAT	2	6	129981	129986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377080
3098	NC_006396	GGTC	2	8	130016	130023	0 %	25 %	50 %	25 %	55377080
3099	NC_006396	GCC	2	6	130038	130043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377080
3100	NC_006396	GTC	2	6	130113	130118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3101	NC_006396	AC	3	6	130176	130181	50 %	0 %	0 %	50 %	55377080
3102	NC_006396	TGA	2	6	130182	130187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377080
3103	NC_006396	CGTCA	2	10	130242	130251	20 %	20 %	20 %	40 %	55377080
3104	NC_006396	GT	3	6	130270	130275	0 %	50 %	50 %	0 %	55377080
3105	NC_006396	CGG	2	6	130308	130313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377080
3106	NC_006396	CGT	2	6	130322	130327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3107	NC_006396	CGG	2	6	130331	130336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377080
3108	NC_006396	CGT	2	6	130403	130408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3109	NC_006396	GAC	2	6	130467	130472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3110	NC_006396	GCT	2	6	130526	130531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3111	NC_006396	CAG	2	6	130621	130626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3112	NC_006396	CGT	2	6	130632	130637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3113	NC_006396	TCG	2	6	130651	130656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3114	NC_006396	GCCG	2	8	130682	130689	0 %	0 %	50 %	50 %	55377080
3115	NC_006396	CGG	2	6	130708	130713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377080
3116	NC_006396	CCT	2	6	130805	130810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377080
3117	NC_006396	GAC	2	6	130848	130853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3118	NC_006396	GAC	3	9	130872	130880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3119	NC_006396	GTCCGG	2	12	130980	130991	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55377080
3120	NC_006396	TCG	2	6	131140	131145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377080
3121	NC_006396	CT	3	6	131265	131270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_006396	TCA	2	6	131278	131283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_006396	GA	3	6	131311	131316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_006396	CGC	2	6	131403	131408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_006396	CGA	2	6	131511	131516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377081
3126	NC_006396	AAACG	2	10	131532	131541	60 %	0 %	20 %	20 %	55377081
3127	NC_006396	GTTGAC	2	12	131569	131580	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55377081
3128	NC_006396	GAC	2	6	131590	131595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377081
3129	NC_006396	GCT	2	6	131605	131610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377081
3130	NC_006396	CGA	2	6	131613	131618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377081
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3132	NC_006396	GTC	2	6	131710	131715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377081
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3136	NC_006396	TCTG	2	8	131960	131967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3137	NC_006396	TAT	2	6	132005	132010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_006396	GGA	2	6	132021	132026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_006396	AGT	2	6	132115	132120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_006396	GACT	2	8	132224	132231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3141	NC_006396	GTG	2	6	132249	132254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_006396	GTTCT	2	10	132374	132383	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3143	NC_006396	CAGT	2	8	132385	132392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3144	NC_006396	CTGTG	2	10	132398	132407	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3145	NC_006396	AACGTC	2	12	132547	132558	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3146	NC_006396	GA	3	6	132592	132597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_006396	CGA	2	6	132618	132623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3149	NC_006396	CGA	2	6	132741	132746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377082
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3162	NC_006396	CG	3	6	133143	133148	0 %	0 %	50 %	50 %	55377082
3163	NC_006396	TCGCC	2	10	133176	133185	0 %	20 %	20 %	60 %	55377082
3164	NC_006396	GT	3	6	133278	133283	0 %	50 %	50 %	0 %	55377082
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3218	NC_006396	GTA	2	6	135779	135784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3221	NC_006396	AGC	2	6	135876	135881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3222	NC_006396	CAG	2	6	135926	135931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3224	NC_006396	ACG	2	6	136011	136016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3230	NC_006396	CGA	2	6	136386	136391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377086
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3232	NC_006396	TCG	2	6	136410	136415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377086
3233	NC_006396	AGG	2	6	136563	136568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377086
3234	NC_006396	ACG	2	6	136599	136604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377086
3235	NC_006396	GCGA	2	8	136621	136628	25 %	0 %	50 %	25 %	55377086
3236	NC_006396	ATC	2	6	136664	136669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377086
3237	NC_006396	GAG	2	6	136673	136678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377086
3238	NC_006396	GC	3	6	136731	136736	0 %	0 %	50 %	50 %	55377086
3239	NC_006396	CGC	2	6	136829	136834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377086
3240	NC_006396	GAC	2	6	136858	136863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377086
3241	NC_006396	CGT	2	6	136882	136887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3242	NC_006396	GTG	3	9	136949	136957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_006396	CGTT	2	8	136978	136985	0 %	50 %	25 %	25 %	55377087
3244	NC_006396	CGGCC	2	10	137003	137012	0 %	0 %	40 %	60 %	55377087
3245	NC_006396	GTC	2	6	137031	137036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377087
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3247	NC_006396	CGA	2	6	137153	137158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377087
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3373	NC_006396	GCC	2	6	142039	142044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377091
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3465	NC_006396	CAAT	2	8	146128	146135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3466	NC_006396	ACC	2	6	146186	146191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3467	NC_006396	CGT	2	6	146192	146197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3472	NC_006396	GAC	2	6	146557	146562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377092
3473	NC_006396	TCGACA	2	12	146565	146576	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55377092
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3479	NC_006396	CAG	2	6	146765	146770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377092
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3481	NC_006396	GAAGA	2	10	146894	146903	60 %	0 %	40 %	0 %	55377092
3482	NC_006396	CAG	2	6	147023	147028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377092
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3485	NC_006396	CAT	2	6	147091	147096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377092
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3487	NC_006396	CGGC	2	8	147174	147181	0 %	0 %	50 %	50 %	55377092
3488	NC_006396	T	6	6	147216	147221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3489	NC_006396	GTCG	2	8	147245	147252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3490	NC_006396	CGG	3	9	147371	147379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377093
3491	NC_006396	TCGG	2	8	147388	147395	0 %	25 %	50 %	25 %	55377093
3492	NC_006396	CA	3	6	147396	147401	50 %	0 %	0 %	50 %	55377093
3493	NC_006396	ACG	2	6	147427	147432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377093
3494	NC_006396	AC	3	6	147517	147522	50 %	0 %	0 %	50 %	55377093
3495	NC_006396	GTC	2	6	147558	147563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377093
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3497	NC_006396	CGAC	2	8	147601	147608	25 %	0 %	25 %	50 %	55377093
3498	NC_006396	GCG	2	6	147646	147651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377093
3499	NC_006396	CGC	2	6	147694	147699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377093
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