MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_006396	TTG	2	6	678996	679001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377630
16003	NC_006396	CGC	2	6	679009	679014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377630
16004	NC_006396	GCT	2	6	679018	679023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377630
16005	NC_006396	TGC	2	6	679027	679032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377630
16006	NC_006396	TCG	2	6	679065	679070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377630
16007	NC_006396	CGA	3	9	679131	679139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377630
16008	NC_006396	CGG	2	6	679152	679157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377630
16009	NC_006396	CTC	2	6	679166	679171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377630
16010	NC_006396	G	6	6	679221	679226	0 %	0 %	100 %	0 %	55377630
16011	NC_006396	TGT	2	6	679255	679260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377630
16012	NC_006396	CTG	2	6	679283	679288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377630
16013	NC_006396	TCAGC	2	10	679342	679351	20 %	20 %	20 %	40 %	55377630
16014	NC_006396	TCG	2	6	679395	679400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377630
16015	NC_006396	CG	3	6	679413	679418	0 %	0 %	50 %	50 %	55377630
16016	NC_006396	CGGG	2	8	679443	679450	0 %	0 %	75 %	25 %	55377630
16017	NC_006396	GT	3	6	679554	679559	0 %	50 %	50 %	0 %	55377630
16018	NC_006396	GTC	2	6	679589	679594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377630
16019	NC_006396	TCG	3	9	679596	679604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377630
16020	NC_006396	GGA	2	6	679651	679656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377630
16021	NC_006396	CGA	2	6	679751	679756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16022	NC_006396	GTT	2	6	679780	679785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377631
16023	NC_006396	CGT	2	6	679792	679797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16024	NC_006396	TCG	2	6	679803	679808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16025	NC_006396	CTG	2	6	679856	679861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16026	NC_006396	CGG	2	6	679914	679919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377631
16027	NC_006396	GCT	2	6	679927	679932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16028	NC_006396	TTCG	2	8	679954	679961	0 %	50 %	25 %	25 %	55377631
16029	NC_006396	TGC	2	6	679989	679994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16030	NC_006396	GACG	2	8	679996	680003	25 %	0 %	50 %	25 %	55377631
16031	NC_006396	CGG	2	6	680008	680013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377631
16032	NC_006396	TCG	2	6	680040	680045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16033	NC_006396	CGT	2	6	680071	680076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16034	NC_006396	CGA	2	6	680125	680130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16035	NC_006396	ATC	3	9	680162	680170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377631
16036	NC_006396	TC	3	6	680230	680235	0 %	50 %	0 %	50 %	55377631
16037	NC_006396	GAT	2	6	680242	680247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377631
16038	NC_006396	CGT	2	6	680299	680304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16039	NC_006396	CGT	2	6	680317	680322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377631
16040	NC_006396	CGG	2	6	680328	680333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377631
16041	NC_006396	GGCC	2	8	680344	680351	0 %	0 %	50 %	50 %	55377631
16042	NC_006396	CAG	2	6	680425	680430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_006396	TGG	2	6	680488	680493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_006396	CAG	2	6	680537	680542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_006396	TA	3	6	680570	680575	50 %	50 %	0 %	0 %	55377632
16046	NC_006396	TC	3	6	680583	680588	0 %	50 %	0 %	50 %	55377632
16047	NC_006396	CGC	2	6	680589	680594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377632
16048	NC_006396	CTT	2	6	680602	680607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377632
16049	NC_006396	CT	3	6	680652	680657	0 %	50 %	0 %	50 %	55377632
16050	NC_006396	T	7	7	680660	680666	0 %	100 %	0 %	0 %	55377632
16051	NC_006396	TGG	2	6	680683	680688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377632
16052	NC_006396	CGAC	2	8	680717	680724	25 %	0 %	25 %	50 %	55377632
16053	NC_006396	CTC	2	6	680857	680862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377632
16054	NC_006396	TGA	2	6	680873	680878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377632
16055	NC_006396	GGT	2	6	680909	680914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377632
16056	NC_006396	GCTC	2	8	680945	680952	0 %	25 %	25 %	50 %	55377632
16057	NC_006396	CGT	2	6	681009	681014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377632
16058	NC_006396	GCA	2	6	681100	681105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377632
16059	NC_006396	CTC	2	6	681106	681111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377632
16060	NC_006396	GGA	2	6	681118	681123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377632
16061	NC_006396	TGACC	2	10	681159	681168	20 %	20 %	20 %	40 %	55377632
16062	NC_006396	G	6	6	681201	681206	0 %	0 %	100 %	0 %	55377632
16063	NC_006396	TCG	2	6	681216	681221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377632
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16065	NC_006396	TCG	2	6	681272	681277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377632
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16069	NC_006396	CGA	2	6	681438	681443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377632
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16071	NC_006396	CACT	2	8	681557	681564	25 %	25 %	0 %	50 %	55377632
16072	NC_006396	AAC	2	6	681581	681586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377632
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16075	NC_006396	GTC	2	6	681625	681630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377632
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16078	NC_006396	AGCG	2	8	681766	681773	25 %	0 %	50 %	25 %	55377632
16079	NC_006396	TCG	2	6	681794	681799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377632
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16085	NC_006396	CAGT	2	8	682295	682302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16086	NC_006396	TG	3	6	682306	682311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_006396	TGA	2	6	682361	682366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377633
16088	NC_006396	AGG	2	6	682375	682380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377633
16089	NC_006396	CG	4	8	682482	682489	0 %	0 %	50 %	50 %	55377633
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16092	NC_006396	CGG	2	6	682588	682593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377633
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16094	NC_006396	GTCT	2	8	682857	682864	0 %	50 %	25 %	25 %	55377633
16095	NC_006396	CAA	2	6	682877	682882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377633
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16099	NC_006396	GGTC	2	8	682980	682987	0 %	25 %	50 %	25 %	55377633
16100	NC_006396	GGC	2	6	683003	683008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377633
16101	NC_006396	CA	3	6	683011	683016	50 %	0 %	0 %	50 %	55377633
16102	NC_006396	GT	3	6	683019	683024	0 %	50 %	50 %	0 %	55377633
16103	NC_006396	CAG	2	6	683066	683071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377633
16104	NC_006396	CTC	2	6	683198	683203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16105	NC_006396	TA	3	6	683240	683245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_006396	ACTT	2	8	683254	683261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16107	NC_006396	CAG	2	6	683283	683288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377634
16108	NC_006396	CGA	2	6	683294	683299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377634
16109	NC_006396	CCG	2	6	683309	683314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377634
16110	NC_006396	ACG	2	6	683323	683328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377634
16111	NC_006396	CGT	2	6	683333	683338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377634
16112	NC_006396	CGG	2	6	683344	683349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377634
16113	NC_006396	GCC	2	6	683361	683366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377634
16114	NC_006396	TCG	3	9	683401	683409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377634
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16116	NC_006396	TGA	2	6	683514	683519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377634
16117	NC_006396	CCGCG	2	10	683578	683587	0 %	0 %	40 %	60 %	55377635
16118	NC_006396	CGAACT	2	12	683593	683604	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55377635
16119	NC_006396	CGA	2	6	683746	683751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16120	NC_006396	GAT	2	6	683845	683850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377635
16121	NC_006396	CAA	2	6	683854	683859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377635
16122	NC_006396	AGA	2	6	683940	683945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55377635
16123	NC_006396	GTC	2	6	683984	683989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16124	NC_006396	CCG	2	6	684027	684032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377635
16125	NC_006396	GCG	2	6	684045	684050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377635
16126	NC_006396	AGCG	2	8	684064	684071	25 %	0 %	50 %	25 %	55377635
16127	NC_006396	CGG	2	6	684100	684105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377635
16128	NC_006396	GAT	2	6	684136	684141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377635
16129	NC_006396	GCC	2	6	684190	684195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377635
16130	NC_006396	TCC	2	6	684204	684209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377635
16131	NC_006396	GCCC	2	8	684216	684223	0 %	0 %	25 %	75 %	55377635
16132	NC_006396	CAC	2	6	684280	684285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377635
16133	NC_006396	TAC	2	6	684314	684319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377635
16134	NC_006396	AAC	2	6	684333	684338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377635
16135	NC_006396	CGA	2	6	684352	684357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16136	NC_006396	CGA	2	6	684391	684396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16137	NC_006396	CGT	2	6	684451	684456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16138	NC_006396	GCT	2	6	684463	684468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16139	NC_006396	GTCATC	2	12	684503	684514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55377635
16140	NC_006396	CGA	2	6	684532	684537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16141	NC_006396	GGC	2	6	684560	684565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377635
16142	NC_006396	AAG	2	6	684602	684607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55377635
16143	NC_006396	GAG	2	6	684656	684661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377635
16144	NC_006396	TCG	2	6	684699	684704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16145	NC_006396	AG	3	6	684730	684735	50 %	0 %	50 %	0 %	55377635
16146	NC_006396	CGA	2	6	684784	684789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16147	NC_006396	TCG	2	6	684885	684890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16148	NC_006396	GCT	2	6	685057	685062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16149	NC_006396	GTG	2	6	685199	685204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377635
16150	NC_006396	TTC	2	6	685205	685210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377635
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16152	NC_006396	CGAC	2	8	685251	685258	25 %	0 %	25 %	50 %	55377635
16153	NC_006396	CGT	2	6	685276	685281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16154	NC_006396	CGT	2	6	685327	685332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16155	NC_006396	GTC	2	6	685334	685339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16156	NC_006396	CCGG	2	8	685351	685358	0 %	0 %	50 %	50 %	55377635
16157	NC_006396	CGA	2	6	685366	685371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16158	NC_006396	GC	3	6	685433	685438	0 %	0 %	50 %	50 %	55377635
16159	NC_006396	CGA	2	6	685495	685500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377635
16160	NC_006396	ACGG	2	8	685514	685521	25 %	0 %	50 %	25 %	55377635
16161	NC_006396	TCA	2	6	685584	685589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377635
16162	NC_006396	CT	3	6	685664	685669	0 %	50 %	0 %	50 %	55377635
16163	NC_006396	GAG	2	6	685691	685696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377635
16164	NC_006396	ACG	2	6	685710	685715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377635
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16166	NC_006396	GCTG	2	8	685834	685841	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16167	NC_006396	CTTC	2	8	685891	685898	0 %	50 %	0 %	50 %	55377636
16168	NC_006396	CCG	2	6	685911	685916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377636
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16170	NC_006396	GTGA	2	8	685947	685954	25 %	25 %	50 %	0 %	55377636
16171	NC_006396	GTT	2	6	686028	686033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377636
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16175	NC_006396	AGTC	2	8	686272	686279	25 %	25 %	25 %	25 %	55377636
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16183	NC_006396	TGG	2	6	686658	686663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16184	NC_006396	AAT	2	6	686671	686676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16185	NC_006396	GTG	2	6	686687	686692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16186	NC_006396	CTT	2	6	686696	686701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16187	NC_006396	GT	3	6	686707	686712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16188	NC_006396	CTC	2	6	686713	686718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16189	NC_006396	TGA	2	6	686726	686731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377637
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16191	NC_006396	GTC	2	6	686977	686982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377637
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16194	NC_006396	TCAA	2	8	687173	687180	50 %	25 %	0 %	25 %	55377637
16195	NC_006396	CGG	2	6	687227	687232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377637
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16202	NC_006396	CGA	2	6	687798	687803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377637
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16204	NC_006396	GGC	2	6	687826	687831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377637
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16211	NC_006396	CACT	2	8	688355	688362	25 %	25 %	0 %	50 %	55377638
16212	NC_006396	ATC	2	6	688510	688515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377638
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16223	NC_006396	CTTC	2	8	688971	688978	0 %	50 %	0 %	50 %	55377639
16224	NC_006396	ACC	2	6	688997	689002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377639
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16228	NC_006396	CCGGG	2	10	689217	689226	0 %	0 %	60 %	40 %	55377639
16229	NC_006396	CCGG	2	8	689231	689238	0 %	0 %	50 %	50 %	55377639
16230	NC_006396	TCG	2	6	689270	689275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377639
16231	NC_006396	GTA	2	6	689290	689295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377639
16232	NC_006396	GGT	2	6	689311	689316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377639
16233	NC_006396	CGG	2	6	689317	689322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377639
16234	NC_006396	GTC	2	6	689386	689391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377639
16235	NC_006396	TCGG	2	8	689416	689423	0 %	25 %	50 %	25 %	55377639
16236	NC_006396	GCA	2	6	689490	689495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16237	NC_006396	CGA	2	6	689497	689502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16238	NC_006396	GTC	2	6	689508	689513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377640
16239	NC_006396	TCGCC	2	10	689564	689573	0 %	20 %	20 %	60 %	55377640
16240	NC_006396	AG	3	6	689661	689666	50 %	0 %	50 %	0 %	55377640
16241	NC_006396	TCG	2	6	689692	689697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377640
16242	NC_006396	TCG	2	6	689734	689739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377640
16243	NC_006396	CGA	2	6	689774	689779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377640
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16483	NC_006396	TCC	2	6	699703	699708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377650
16484	NC_006396	GCTC	2	8	699718	699725	0 %	25 %	25 %	50 %	55377650
16485	NC_006396	GTCG	2	8	699740	699747	0 %	25 %	50 %	25 %	55377650
16486	NC_006396	TCG	2	6	699809	699814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377650
16487	NC_006396	TGCT	2	8	699841	699848	0 %	50 %	25 %	25 %	55377650
16488	NC_006396	CTC	2	6	699873	699878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377650
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