MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_006396	CGT	2	6	634317	634322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377583
15002	NC_006396	GTT	2	6	634487	634492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377584
15003	NC_006396	GAA	2	6	634532	634537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55377584
15004	NC_006396	GAT	2	6	634553	634558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377584
15005	NC_006396	GCC	4	12	634637	634648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377584
15006	NC_006396	CTC	2	6	634667	634672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377584
15007	NC_006396	ACA	2	6	634677	634682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377584
15008	NC_006396	TCC	2	6	634740	634745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377584
15009	NC_006396	TGC	2	6	634786	634791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377584
15010	NC_006396	GAC	2	6	634820	634825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377584
15011	NC_006396	GCC	2	6	634832	634837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377584
15012	NC_006396	CGC	2	6	634912	634917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377584
15013	NC_006396	CCGA	2	8	634992	634999	25 %	0 %	25 %	50 %	55377584
15014	NC_006396	CCG	2	6	635010	635015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377584
15015	NC_006396	TCC	2	6	635049	635054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377584
15016	NC_006396	GCG	2	6	635058	635063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377584
15017	NC_006396	CGC	2	6	635087	635092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377584
15018	NC_006396	CGG	2	6	635098	635103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377584
15019	NC_006396	C	7	7	635104	635110	0 %	0 %	0 %	100 %	55377584
15020	NC_006396	ACC	2	6	635185	635190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15021	NC_006396	GAAC	2	8	635270	635277	50 %	0 %	25 %	25 %	55377585
15022	NC_006396	CTC	2	6	635328	635333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377585
15023	NC_006396	CG	3	6	635356	635361	0 %	0 %	50 %	50 %	55377585
15024	NC_006396	AC	3	6	635390	635395	50 %	0 %	0 %	50 %	55377585
15025	NC_006396	AGC	2	6	635422	635427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377585
15026	NC_006396	TGC	2	6	635472	635477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377585
15027	NC_006396	CGT	2	6	635612	635617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377585
15028	NC_006396	TCG	2	6	635716	635721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377585
15029	NC_006396	CGG	2	6	635739	635744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377585
15030	NC_006396	GCGA	2	8	635763	635770	25 %	0 %	50 %	25 %	55377585
15031	NC_006396	GAG	2	6	635820	635825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377585
15032	NC_006396	TCG	2	6	635827	635832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377585
15033	NC_006396	TCG	2	6	635851	635856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377585
15034	NC_006396	CTC	2	6	635871	635876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377585
15035	NC_006396	CCG	2	6	635897	635902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377585
15036	NC_006396	TTC	2	6	635928	635933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377585
15037	NC_006396	CAT	2	6	635981	635986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377585
15038	NC_006396	TCC	2	6	636094	636099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377585
15039	NC_006396	AGCCTC	2	12	636261	636272	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55377586
15040	NC_006396	TAC	2	6	636294	636299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377586
15041	NC_006396	ATC	2	6	636300	636305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377586
15042	NC_006396	ACC	2	6	636375	636380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377586
15043	NC_006396	GAT	2	6	636398	636403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377586
15044	NC_006396	TGG	2	6	636425	636430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377586
15045	NC_006396	CTG	2	6	636436	636441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377586
15046	NC_006396	GCT	2	6	636473	636478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377586
15047	NC_006396	CG	3	6	636513	636518	0 %	0 %	50 %	50 %	55377586
15048	NC_006396	ACG	2	6	636547	636552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377586
15049	NC_006396	CGA	2	6	636578	636583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377586
15050	NC_006396	TCT	2	6	636637	636642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377586
15051	NC_006396	GCT	2	6	636644	636649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377586
15052	NC_006396	AGC	3	9	636827	636835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377587
15053	NC_006396	ACG	2	6	636871	636876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377587
15054	NC_006396	CAT	2	6	636887	636892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377587
15055	NC_006396	CGT	2	6	636907	636912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377587
15056	NC_006396	CGC	2	6	636913	636918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377587
15057	NC_006396	GGAG	2	8	636944	636951	25 %	0 %	75 %	0 %	55377587
15058	NC_006396	CGA	2	6	636952	636957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377587
15059	NC_006396	GGA	2	6	636971	636976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377587
15060	NC_006396	ACG	2	6	636979	636984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377587
15061	NC_006396	TCG	2	6	637026	637031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377587
15062	NC_006396	TCG	2	6	637054	637059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377587
15063	NC_006396	GCG	2	6	637065	637070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377587
15064	NC_006396	GAC	2	6	637278	637283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377587
15065	NC_006396	CGC	2	6	637320	637325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377588
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15067	NC_006396	GC	3	6	637402	637407	0 %	0 %	50 %	50 %	55377588
15068	NC_006396	CA	3	6	637410	637415	50 %	0 %	0 %	50 %	55377588
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15073	NC_006396	CGA	2	6	637575	637580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377588
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15080	NC_006396	CTG	2	6	637818	637823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377588
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15085	NC_006396	GCG	2	6	637980	637985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377588
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15087	NC_006396	ATC	2	6	638087	638092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15088	NC_006396	GCA	2	6	638157	638162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15090	NC_006396	AGCC	2	8	638246	638253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15091	NC_006396	GTG	2	6	638273	638278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_006396	TCG	2	6	638291	638296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15093	NC_006396	TG	3	6	638299	638304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_006396	GAT	2	6	638308	638313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15098	NC_006396	GAC	2	6	638543	638548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377589
15099	NC_006396	CTG	2	6	638587	638592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377589
15100	NC_006396	CTCA	2	8	638631	638638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15101	NC_006396	CA	3	6	638637	638642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15102	NC_006396	CTT	2	6	638653	638658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15103	NC_006396	TCG	2	6	638670	638675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15104	NC_006396	TCC	2	6	638700	638705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377590
15105	NC_006396	CAA	2	6	638770	638775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377590
15106	NC_006396	TC	3	6	638794	638799	0 %	50 %	0 %	50 %	55377590
15107	NC_006396	GCG	2	6	638856	638861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377590
15108	NC_006396	TGA	2	6	638866	638871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377590
15109	NC_006396	CGGT	2	8	638904	638911	0 %	25 %	50 %	25 %	55377590
15110	NC_006396	CGAC	2	8	639000	639007	25 %	0 %	25 %	50 %	55377590
15111	NC_006396	GCC	2	6	639008	639013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377590
15112	NC_006396	TCG	2	6	639075	639080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377590
15113	NC_006396	GTC	2	6	639281	639286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377591
15114	NC_006396	CGA	3	9	639322	639330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377591
15115	NC_006396	CGC	2	6	639332	639337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377591
15116	NC_006396	CAG	2	6	639401	639406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377591
15117	NC_006396	CGC	3	9	639425	639433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377591
15118	NC_006396	GTC	2	6	639446	639451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377591
15119	NC_006396	CTG	2	6	639457	639462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377591
15120	NC_006396	GTC	2	6	639548	639553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377591
15121	NC_006396	GAAC	2	8	639559	639566	50 %	0 %	25 %	25 %	55377591
15122	NC_006396	CCG	2	6	639574	639579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377591
15123	NC_006396	GC	3	6	639580	639585	0 %	0 %	50 %	50 %	55377591
15124	NC_006396	TCG	2	6	639589	639594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377591
15125	NC_006396	TCCG	2	8	639623	639630	0 %	25 %	25 %	50 %	55377591
15126	NC_006396	GAC	2	6	639725	639730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15127	NC_006396	TGC	2	6	639795	639800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_006396	CGC	2	6	639818	639823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15129	NC_006396	AAG	2	6	639840	639845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_006396	ACCA	2	8	639862	639869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15131	NC_006396	CGT	2	6	639871	639876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_006396	TCG	2	6	639950	639955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377592
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15134	NC_006396	TCA	2	6	640067	640072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377592
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15142	NC_006396	AGAT	2	8	640432	640439	50 %	25 %	25 %	0 %	55377593
15143	NC_006396	ATC	2	6	640443	640448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377593
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15153	NC_006396	CGAC	2	8	640904	640911	25 %	0 %	25 %	50 %	55377593
15154	NC_006396	CCA	2	6	640943	640948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377593
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15157	NC_006396	CG	3	6	641022	641027	0 %	0 %	50 %	50 %	55377593
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15178	NC_006396	GT	3	6	641814	641819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15179	NC_006396	GTCG	2	8	641943	641950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15180	NC_006396	CGA	2	6	641981	641986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15182	NC_006396	GGT	2	6	642062	642067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15183	NC_006396	CG	3	6	642145	642150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15184	NC_006396	AGCGA	2	10	642152	642161	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15185	NC_006396	GTA	2	6	642234	642239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15187	NC_006396	CT	3	6	642301	642306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15188	NC_006396	AGGC	2	8	642318	642325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15189	NC_006396	TCG	2	6	642384	642389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377594
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15198	NC_006396	ACG	2	6	642942	642947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15199	NC_006396	CT	3	6	642955	642960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15200	NC_006396	GAC	2	6	643015	643020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15202	NC_006396	ACT	2	6	643068	643073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15203	NC_006396	T	7	7	643100	643106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15204	NC_006396	CGT	2	6	643172	643177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15206	NC_006396	ATC	2	6	643323	643328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377595
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15209	NC_006396	CTG	2	6	643349	643354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377595
15210	NC_006396	CGA	2	6	643447	643452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377595
15211	NC_006396	TGG	2	6	643455	643460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377595
15212	NC_006396	CTC	2	6	643520	643525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377595
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15232	NC_006396	GTCA	2	8	644270	644277	25 %	25 %	25 %	25 %	55377595
15233	NC_006396	CGT	2	6	644293	644298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377595
15234	NC_006396	GTCC	2	8	644327	644334	0 %	25 %	25 %	50 %	55377595
15235	NC_006396	GAT	2	6	644339	644344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377595
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15239	NC_006396	CAT	2	6	644405	644410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377595
15240	NC_006396	TCG	2	6	644412	644417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377595
15241	NC_006396	TCG	2	6	644472	644477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377595
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15365	NC_006396	GCTG	2	8	650936	650943	0 %	25 %	50 %	25 %	55377602
15366	NC_006396	CGT	2	6	650964	650969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377602
15367	NC_006396	TC	3	6	650973	650978	0 %	50 %	0 %	50 %	55377602
15368	NC_006396	CGA	2	6	651005	651010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377602
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15390	NC_006396	AACTG	2	10	652050	652059	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15391	NC_006396	ACAA	2	8	652066	652073	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15392	NC_006396	ACTC	2	8	652094	652101	25 %	25 %	0 %	50 %	55377604
15393	NC_006396	ATC	2	6	652172	652177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377604
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15397	NC_006396	GCCGA	2	10	652417	652426	20 %	0 %	40 %	40 %	55377604
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15422	NC_006396	AT	3	6	653819	653824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15482	NC_006396	CGT	2	6	656573	656578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377606
15483	NC_006396	TTC	2	6	656666	656671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377607
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