MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006396	TAC	2	6	41873	41878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376986
1002	NC_006396	ACG	2	6	41889	41894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376986
1003	NC_006396	CGA	2	6	41920	41925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376986
1004	NC_006396	TC	3	6	41965	41970	0 %	50 %	0 %	50 %	55376986
1005	NC_006396	GCA	2	6	41977	41982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376986
1006	NC_006396	GCG	2	6	41983	41988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376986
1007	NC_006396	CGA	2	6	42045	42050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376986
1008	NC_006396	AC	3	6	42134	42139	50 %	0 %	0 %	50 %	55376986
1009	NC_006396	GGA	2	6	42145	42150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376986
1010	NC_006396	CCT	2	6	42178	42183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376986
1011	NC_006396	CGG	2	6	42238	42243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376986
1012	NC_006396	CAGC	2	8	42247	42254	25 %	0 %	25 %	50 %	55376986
1013	NC_006396	CGA	2	6	42274	42279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376986
1014	NC_006396	CGG	2	6	42306	42311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376986
1015	NC_006396	CGGC	2	8	42328	42335	0 %	0 %	50 %	50 %	55376986
1016	NC_006396	GTC	2	6	42338	42343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376986
1017	NC_006396	CCGG	2	8	42352	42359	0 %	0 %	50 %	50 %	55376986
1018	NC_006396	GGA	2	6	42439	42444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376986
1019	NC_006396	GTG	2	6	42516	42521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376986
1020	NC_006396	CG	4	8	42557	42564	0 %	0 %	50 %	50 %	55376987
1021	NC_006396	TCC	2	6	42578	42583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376987
1022	NC_006396	TCT	2	6	42599	42604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376987
1023	NC_006396	CTT	3	9	42609	42617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376987
1024	NC_006396	TCA	2	6	42623	42628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376987
1025	NC_006396	GTC	2	6	42631	42636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376987
1026	NC_006396	GCG	3	9	42668	42676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376987
1027	NC_006396	CGT	2	6	42723	42728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376987
1028	NC_006396	CGC	2	6	42740	42745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376987
1029	NC_006396	CGA	2	6	42806	42811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376987
1030	NC_006396	CGT	2	6	42858	42863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376987
1031	NC_006396	CAT	2	6	42864	42869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376987
1032	NC_006396	GCT	2	6	43059	43064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376987
1033	NC_006396	TC	3	6	43068	43073	0 %	50 %	0 %	50 %	55376987
1034	NC_006396	CGC	2	6	43127	43132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376987
1035	NC_006396	GCG	2	6	43159	43164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376987
1036	NC_006396	CGT	2	6	43218	43223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376987
1037	NC_006396	GCT	2	6	43245	43250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376987
1038	NC_006396	ACGG	2	8	43254	43261	25 %	0 %	50 %	25 %	55376987
1039	NC_006396	GC	3	6	43291	43296	0 %	0 %	50 %	50 %	55376988
1040	NC_006396	GAC	2	6	43301	43306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376988
1041	NC_006396	ACG	2	6	43478	43483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376988
1042	NC_006396	TCG	2	6	43529	43534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376988
1043	NC_006396	GGT	2	6	43560	43565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376988
1044	NC_006396	TGA	2	6	43588	43593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376988
1045	NC_006396	CGT	2	6	43635	43640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376988
1046	NC_006396	CAG	2	6	43664	43669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376988
1047	NC_006396	ATC	2	6	43708	43713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376988
1048	NC_006396	GGC	2	6	43732	43737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376988
1049	NC_006396	ACCC	2	8	43867	43874	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1050	NC_006396	CGG	2	6	44003	44008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376989
1051	NC_006396	CTC	2	6	44025	44030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376989
1052	NC_006396	CGA	2	6	44039	44044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376989
1053	NC_006396	CGG	2	6	44056	44061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376989
1054	NC_006396	CGA	2	6	44062	44067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376989
1055	NC_006396	GTC	2	6	44070	44075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376989
1056	NC_006396	CGA	2	6	44087	44092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376989
1057	NC_006396	GTG	2	6	44174	44179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376989
1058	NC_006396	CGA	2	6	44189	44194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376989
1059	NC_006396	CCG	2	6	44197	44202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376989
1060	NC_006396	AC	4	8	44205	44212	50 %	0 %	0 %	50 %	55376989
1061	NC_006396	GCC	2	6	44235	44240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376989
1062	NC_006396	CGG	2	6	44249	44254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376989
1063	NC_006396	CGA	2	6	44270	44275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376989
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1065	NC_006396	TCACG	2	10	44366	44375	20 %	20 %	20 %	40 %	55376989
1066	NC_006396	GCT	2	6	44384	44389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376989
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1069	NC_006396	GGTC	2	8	44534	44541	0 %	25 %	50 %	25 %	55376989
1070	NC_006396	GACG	2	8	44600	44607	25 %	0 %	50 %	25 %	55376989
1071	NC_006396	CGA	2	6	44624	44629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376989
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1080	NC_006396	CGA	2	6	45088	45093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376990
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1082	NC_006396	GACCGC	2	12	45125	45136	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55376990
1083	NC_006396	CGA	2	6	45151	45156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376990
1084	NC_006396	CGTT	2	8	45165	45172	0 %	50 %	25 %	25 %	55376990
1085	NC_006396	GAC	2	6	45173	45178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376990
1086	NC_006396	GCC	3	9	45257	45265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376990
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1094	NC_006396	TCG	2	6	45561	45566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376990
1095	NC_006396	AAC	2	6	45572	45577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376990
1096	NC_006396	TC	3	6	45610	45615	0 %	50 %	0 %	50 %	55376990
1097	NC_006396	GTCG	2	8	45638	45645	0 %	25 %	50 %	25 %	55376990
1098	NC_006396	GAGC	2	8	45723	45730	25 %	0 %	50 %	25 %	55376990
1099	NC_006396	TGC	2	6	45761	45766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_006396	ACG	2	6	45818	45823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_006396	CG	3	6	45880	45885	0 %	0 %	50 %	50 %	55376991
1102	NC_006396	CCG	2	6	45920	45925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376991
1103	NC_006396	GGCC	2	8	45936	45943	0 %	0 %	50 %	50 %	55376991
1104	NC_006396	GGC	2	6	45993	45998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376991
1105	NC_006396	ACG	2	6	46054	46059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376991
1106	NC_006396	CGC	2	6	46068	46073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376991
1107	NC_006396	CGA	2	6	46113	46118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376991
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1109	NC_006396	GC	3	6	46183	46188	0 %	0 %	50 %	50 %	55376991
1110	NC_006396	GAC	2	6	46191	46196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376991
1111	NC_006396	CG	3	6	46321	46326	0 %	0 %	50 %	50 %	55376991
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1118	NC_006396	CCGGAC	2	12	46745	46756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55376992
1119	NC_006396	CG	3	6	46801	46806	0 %	0 %	50 %	50 %	55376992
1120	NC_006396	GGC	2	6	46826	46831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376992
1121	NC_006396	GAC	2	6	46851	46856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376992
1122	NC_006396	CGA	3	9	46990	46998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376992
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1251	NC_006396	CAC	2	6	51753	51758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1252	NC_006396	CCGC	2	8	51768	51775	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1491	NC_006396	CGGG	2	8	62059	62066	0 %	0 %	75 %	25 %	55377013
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1495	NC_006396	GTC	2	6	62212	62217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1496	NC_006396	ACTG	2	8	62261	62268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1497	NC_006396	TGCT	2	8	62284	62291	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1498	NC_006396	CGT	2	6	62329	62334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1499	NC_006396	GTC	2	6	62432	62437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377014
1500	NC_006396	GGC	2	6	62450	62455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377014

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