MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_006396	CGG	2	6	507293	507298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377443
12003	NC_006396	GTG	2	6	507315	507320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377443
12004	NC_006396	CGT	2	6	507340	507345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377443
12005	NC_006396	GTC	2	6	507365	507370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377443
12006	NC_006396	TTC	2	6	507377	507382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377443
12007	NC_006396	CTC	2	6	507452	507457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377443
12008	NC_006396	CTC	2	6	507476	507481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377443
12009	NC_006396	TCC	2	6	507494	507499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377443
12010	NC_006396	CGG	2	6	507537	507542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377443
12011	NC_006396	CCG	3	9	507567	507575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377443
12012	NC_006396	GAC	2	6	507635	507640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377443
12013	NC_006396	AC	3	6	507639	507644	50 %	0 %	0 %	50 %	55377443
12014	NC_006396	AC	3	6	507675	507680	50 %	0 %	0 %	50 %	55377443
12015	NC_006396	TCC	2	6	507684	507689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377443
12016	NC_006396	CT	3	6	507757	507762	0 %	50 %	0 %	50 %	55377443
12017	NC_006396	GAC	2	6	507794	507799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377443
12018	NC_006396	ATC	2	6	507923	507928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377443
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12021	NC_006396	CGG	3	9	508039	508047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377443
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12030	NC_006396	GTC	2	6	508523	508528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377443
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12039	NC_006396	CGCTGA	2	12	508932	508943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55377444
12040	NC_006396	CGA	2	6	508944	508949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377444
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12050	NC_006396	GCT	2	6	509918	509923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377444
12051	NC_006396	CGC	2	6	509931	509936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377444
12052	NC_006396	CCGC	2	8	509967	509974	0 %	0 %	25 %	75 %	55377444
12053	NC_006396	GCC	2	6	509979	509984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377444
12054	NC_006396	CGT	2	6	510031	510036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377444
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12057	NC_006396	GTC	2	6	510230	510235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377444
12058	NC_006396	CGACA	2	10	510265	510274	40 %	0 %	20 %	40 %	55377444
12059	NC_006396	GTG	2	6	510296	510301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377444
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12061	NC_006396	GA	3	6	510383	510388	50 %	0 %	50 %	0 %	55377444
12062	NC_006396	GAC	2	6	510392	510397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377444
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12065	NC_006396	CTGAC	2	10	510450	510459	20 %	20 %	20 %	40 %	55377444
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12069	NC_006396	TCG	2	6	510591	510596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377444
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12073	NC_006396	ACC	2	6	510725	510730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12074	NC_006396	GCC	2	6	510743	510748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12075	NC_006396	TCG	2	6	510786	510791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377445
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12079	NC_006396	TCG	2	6	510994	510999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377445
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12091	NC_006396	CGT	2	6	511471	511476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377445
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12104	NC_006396	CGT	2	6	512011	512016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377445
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12106	NC_006396	GT	3	6	512178	512183	0 %	50 %	50 %	0 %	55377446
12107	NC_006396	TCG	2	6	512192	512197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377446
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12109	NC_006396	GCCA	2	8	512242	512249	25 %	0 %	25 %	50 %	55377446
12110	NC_006396	CGT	2	6	512280	512285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377446
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12114	NC_006396	GCCG	2	8	512530	512537	0 %	0 %	50 %	50 %	55377446
12115	NC_006396	GTCAC	2	10	512570	512579	20 %	20 %	20 %	40 %	55377446
12116	NC_006396	GCA	2	6	512609	512614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377446
12117	NC_006396	CG	3	6	512630	512635	0 %	0 %	50 %	50 %	55377446
12118	NC_006396	TG	3	6	512739	512744	0 %	50 %	50 %	0 %	55377446
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12120	NC_006396	CCG	2	6	512835	512840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377446
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12122	NC_006396	CTG	2	6	512865	512870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377446
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12223	NC_006396	TCAG	2	8	517138	517145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12224	NC_006396	TGA	2	6	517169	517174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12226	NC_006396	TAT	2	6	517289	517294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12227	NC_006396	GATT	2	8	517381	517388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12228	NC_006396	ACT	2	6	517441	517446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12230	NC_006396	A	7	7	517502	517508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12231	NC_006396	CTG	2	6	517704	517709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12232	NC_006396	TAA	2	6	517765	517770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12233	NC_006396	AT	3	6	517809	517814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12234	NC_006396	CTT	2	6	517860	517865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12235	NC_006396	ATT	2	6	517871	517876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12236	NC_006396	ACG	2	6	517902	517907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12237	NC_006396	ATT	2	6	517982	517987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12238	NC_006396	ATT	2	6	518015	518020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12239	NC_006396	ATT	2	6	518033	518038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12240	NC_006396	TAA	2	6	518077	518082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12241	NC_006396	TG	3	6	518099	518104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12242	NC_006396	ACC	2	6	518171	518176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377453
12243	NC_006396	TCG	2	6	518186	518191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377453
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12368	NC_006396	CTC	2	6	522990	522995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377462
12369	NC_006396	GCG	2	6	523030	523035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377463
12370	NC_006396	GCCG	2	8	523038	523045	0 %	0 %	50 %	50 %	55377463
12371	NC_006396	GCT	2	6	523076	523081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377463
12372	NC_006396	GCC	2	6	523095	523100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377463
12373	NC_006396	TG	3	6	523111	523116	0 %	50 %	50 %	0 %	55377463
12374	NC_006396	TCG	2	6	523126	523131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377463
12375	NC_006396	GGCT	2	8	523162	523169	0 %	25 %	50 %	25 %	55377463
12376	NC_006396	TGGG	2	8	523184	523191	0 %	25 %	75 %	0 %	55377463
12377	NC_006396	TCG	2	6	523192	523197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377463
12378	NC_006396	CGT	2	6	523224	523229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377463
12379	NC_006396	CCG	2	6	523294	523299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377463
12380	NC_006396	CTG	2	6	523378	523383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377463
12381	NC_006396	GAG	2	6	523414	523419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377463
12382	NC_006396	GATG	2	8	523485	523492	25 %	25 %	50 %	0 %	55377463
12383	NC_006396	TGA	2	6	523548	523553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377464
12384	NC_006396	GGCCGG	2	12	523558	523569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377464
12385	NC_006396	AGC	2	6	523605	523610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377464
12386	NC_006396	CCG	2	6	523611	523616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377464
12387	NC_006396	TGA	2	6	523648	523653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377464
12388	NC_006396	ACTG	2	8	523820	523827	25 %	25 %	25 %	25 %	55377464
12389	NC_006396	TGGGTC	2	12	523857	523868	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55377464
12390	NC_006396	TCGC	2	8	523893	523900	0 %	25 %	25 %	50 %	55377464
12391	NC_006396	GTC	2	6	523934	523939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377464
12392	NC_006396	GTC	2	6	524081	524086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377464
12393	NC_006396	CCGA	2	8	524137	524144	25 %	0 %	25 %	50 %	55377464
12394	NC_006396	GTG	2	6	524174	524179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377464
12395	NC_006396	CGT	2	6	524245	524250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377464
12396	NC_006396	CGGT	2	8	524271	524278	0 %	25 %	50 %	25 %	55377464
12397	NC_006396	CCGT	2	8	524283	524290	0 %	25 %	25 %	50 %	55377464
12398	NC_006396	TTC	2	6	524310	524315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377464
12399	NC_006396	CTG	2	6	524320	524325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377464
12400	NC_006396	CCG	2	6	524355	524360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377464
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12402	NC_006396	GCCG	2	8	524421	524428	0 %	0 %	50 %	50 %	55377465
12403	NC_006396	GTC	2	6	524511	524516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377465
12404	NC_006396	GAC	2	6	524559	524564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377465
12405	NC_006396	GA	3	6	524590	524595	50 %	0 %	50 %	0 %	55377465
12406	NC_006396	GCT	2	6	524603	524608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377465
12407	NC_006396	CGG	2	6	524609	524614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377465
12408	NC_006396	CCG	2	6	524620	524625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377465
12409	NC_006396	CTG	2	6	524682	524687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377465
12410	NC_006396	GTG	2	6	524707	524712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377465
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12412	NC_006396	CGT	3	9	524819	524827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377465
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12415	NC_006396	GTC	2	6	524900	524905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12416	NC_006396	GTCG	2	8	524909	524916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12417	NC_006396	TCT	2	6	524941	524946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12418	NC_006396	CTG	2	6	524970	524975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12419	NC_006396	GCA	2	6	525004	525009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12421	NC_006396	CGT	2	6	525100	525105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12422	NC_006396	GCC	2	6	525108	525113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12423	NC_006396	CGC	2	6	525130	525135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377466
12424	NC_006396	C	6	6	525137	525142	0 %	0 %	0 %	100 %	55377466
12425	NC_006396	CTC	2	6	525166	525171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377466
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12428	NC_006396	CTG	2	6	525201	525206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377466
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12430	NC_006396	CTCC	2	8	525416	525423	0 %	25 %	0 %	75 %	55377468
12431	NC_006396	CAG	2	6	525466	525471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377468
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12444	NC_006396	CAT	2	6	525990	525995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377469
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12446	NC_006396	GTC	2	6	526006	526011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377469
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12448	NC_006396	TCG	2	6	526075	526080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377469
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12452	NC_006396	AAG	2	6	526189	526194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12453	NC_006396	TCG	2	6	526288	526293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377470
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12455	NC_006396	GCT	2	6	526420	526425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377470
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12463	NC_006396	GTC	2	6	526728	526733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377470
12464	NC_006396	CTG	2	6	526736	526741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377470
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12472	NC_006396	TTC	2	6	527171	527176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377471
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12474	NC_006396	TGC	2	6	527427	527432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377471
12475	NC_006396	ACG	2	6	527500	527505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12476	NC_006396	TCCC	2	8	527535	527542	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12477	NC_006396	AG	3	6	527549	527554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12478	NC_006396	ACCG	2	8	527559	527566	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12479	NC_006396	TCG	2	6	527587	527592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12480	NC_006396	CAG	3	9	527633	527641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12481	NC_006396	TCC	2	6	527686	527691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12482	NC_006396	TA	3	6	527749	527754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12483	NC_006396	CGA	2	6	527764	527769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12484	NC_006396	GTC	2	6	527821	527826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377472
12485	NC_006396	CAG	2	6	527827	527832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377472
12486	NC_006396	CAC	2	6	527839	527844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377472
12487	NC_006396	GCT	2	6	527860	527865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377472
12488	NC_006396	TCGC	2	8	527887	527894	0 %	25 %	25 %	50 %	55377472
12489	NC_006396	GTC	2	6	527917	527922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377472
12490	NC_006396	TCA	2	6	527943	527948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377472
12491	NC_006396	GTGC	2	8	527991	527998	0 %	25 %	50 %	25 %	55377473
12492	NC_006396	CGC	2	6	528011	528016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377473
12493	NC_006396	CGC	2	6	528028	528033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377473
12494	NC_006396	CGT	3	9	528041	528049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377473
12495	NC_006396	TCG	2	6	528085	528090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377473
12496	NC_006396	CT	3	6	528120	528125	0 %	50 %	0 %	50 %	55377473
12497	NC_006396	CCG	2	6	528232	528237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377473
12498	NC_006396	CCGT	2	8	528296	528303	0 %	25 %	25 %	50 %	55377473
12499	NC_006396	GTC	2	6	528343	528348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377473
12500	NC_006396	CGA	2	6	528392	528397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377473

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