MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_006396	CGA	3	9	294406	294414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377237
7003	NC_006396	GAG	2	6	294440	294445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377237
7004	NC_006396	CCG	2	6	294532	294537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377237
7005	NC_006396	GCG	2	6	294561	294566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377237
7006	NC_006396	CGA	2	6	294574	294579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377237
7007	NC_006396	GCAG	2	8	294610	294617	25 %	0 %	50 %	25 %	55377237
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7009	NC_006396	AGCA	2	8	294659	294666	50 %	0 %	25 %	25 %	55377237
7010	NC_006396	CGC	2	6	294676	294681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377237
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7015	NC_006396	TCG	2	6	294939	294944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377238
7016	NC_006396	GCC	2	6	294993	294998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377238
7017	NC_006396	CGT	2	6	295013	295018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377238
7018	NC_006396	GCCG	2	8	295043	295050	0 %	0 %	50 %	50 %	55377238
7019	NC_006396	CCG	2	6	295137	295142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377238
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7032	NC_006396	ACGG	2	8	295819	295826	25 %	0 %	50 %	25 %	55377239
7033	NC_006396	CACC	2	8	295869	295876	25 %	0 %	0 %	75 %	55377239
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7043	NC_006396	TCG	2	6	296140	296145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377240
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7053	NC_006396	GCG	2	6	296740	296745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377240
7054	NC_006396	CG	3	6	296748	296753	0 %	0 %	50 %	50 %	55377240
7055	NC_006396	CGA	2	6	296768	296773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377240
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7059	NC_006396	ACG	3	9	296884	296892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377240
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7109	NC_006396	TCC	2	6	298722	298727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377242
7110	NC_006396	CGT	2	6	298728	298733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377242
7111	NC_006396	A	6	6	298813	298818	100 %	0 %	0 %	0 %	55377242
7112	NC_006396	CGA	2	6	298864	298869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377242
7113	NC_006396	CGGA	2	8	298966	298973	25 %	0 %	50 %	25 %	55377242
7114	NC_006396	AT	3	6	299039	299044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7118	NC_006396	CGT	2	6	299304	299309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377243
7119	NC_006396	GGAC	2	8	299334	299341	25 %	0 %	50 %	25 %	55377243
7120	NC_006396	CTT	2	6	299346	299351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377243
7121	NC_006396	TCC	2	6	299387	299392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377243
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7123	NC_006396	AGG	2	6	299465	299470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377243
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7136	NC_006396	GTA	2	6	300011	300016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7137	NC_006396	CGT	2	6	300112	300117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7240	NC_006396	GT	3	6	305087	305092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7241	NC_006396	GC	3	6	305145	305150	0 %	0 %	50 %	50 %	55377249
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7243	NC_006396	ACG	2	6	305182	305187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377249
7244	NC_006396	TCA	2	6	305203	305208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377249
7245	NC_006396	GAG	2	6	305223	305228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377249
7246	NC_006396	GCG	2	6	305245	305250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377249
7247	NC_006396	GCC	2	6	305343	305348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377250
7248	NC_006396	TCC	2	6	305352	305357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377250
7249	NC_006396	TGT	2	6	305358	305363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377250
7250	NC_006396	GAG	2	6	305414	305419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377250
7251	NC_006396	CCG	2	6	305421	305426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377250
7252	NC_006396	CCG	2	6	305448	305453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377250
7253	NC_006396	AG	3	6	305507	305512	50 %	0 %	50 %	0 %	55377250
7254	NC_006396	CGA	2	6	305527	305532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377250
7255	NC_006396	GCG	2	6	305538	305543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377250
7256	NC_006396	TCTCGA	2	12	305560	305571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55377250
7257	NC_006396	TCA	2	6	305584	305589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377250
7258	NC_006396	CTG	2	6	305600	305605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377250
7259	NC_006396	ACG	3	9	305614	305622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377250
7260	NC_006396	CGGT	2	8	305676	305683	0 %	25 %	50 %	25 %	55377250
7261	NC_006396	CGG	2	6	305720	305725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7262	NC_006396	TAT	2	6	305817	305822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7263	NC_006396	ACT	2	6	305881	305886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377251
7264	NC_006396	GCA	2	6	305926	305931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7265	NC_006396	GGAAC	2	10	306116	306125	40 %	0 %	40 %	20 %	55377251
7266	NC_006396	CGT	2	6	306138	306143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7267	NC_006396	TCG	2	6	306145	306150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7268	NC_006396	TTC	2	6	306163	306168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377251
7269	NC_006396	CTGT	2	8	306207	306214	0 %	50 %	25 %	25 %	55377251
7270	NC_006396	GCG	2	6	306242	306247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377251
7271	NC_006396	CTG	2	6	306251	306256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7272	NC_006396	ATC	2	6	306280	306285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377251
7273	NC_006396	ACG	2	6	306293	306298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7274	NC_006396	CGA	3	9	306348	306356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7275	NC_006396	GTC	2	6	306367	306372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7276	NC_006396	GAC	2	6	306388	306393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7277	NC_006396	CAG	2	6	306403	306408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377251
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7279	NC_006396	CGT	2	6	306447	306452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7280	NC_006396	CGC	2	6	306465	306470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377251
7281	NC_006396	GGA	2	6	306609	306614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377251
7282	NC_006396	CGA	2	6	306642	306647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7283	NC_006396	CGGA	2	8	306728	306735	25 %	0 %	50 %	25 %	55377251
7284	NC_006396	CGA	2	6	306779	306784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7285	NC_006396	ACA	2	6	306791	306796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377251
7286	NC_006396	GTG	3	9	306871	306879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377251
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7288	NC_006396	CAA	2	6	306927	306932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377251
7289	NC_006396	CGG	2	6	306951	306956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377251
7290	NC_006396	GGGT	2	8	306966	306973	0 %	25 %	75 %	0 %	55377251
7291	NC_006396	TGCC	2	8	306987	306994	0 %	25 %	25 %	50 %	55377251
7292	NC_006396	GAT	2	6	306999	307004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377251
7293	NC_006396	CGA	2	6	307101	307106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7294	NC_006396	CTG	2	6	307144	307149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7295	NC_006396	GAC	2	6	307160	307165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377251
7296	NC_006396	GAA	2	6	307184	307189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7297	NC_006396	TCG	2	6	307315	307320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377252
7298	NC_006396	CCTCGA	2	12	307331	307342	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55377252
7299	NC_006396	GTC	3	9	307365	307373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377252
7300	NC_006396	CGG	2	6	307436	307441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377252
7301	NC_006396	AGG	2	6	307466	307471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377252
7302	NC_006396	CGG	2	6	307478	307483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377252
7303	NC_006396	CGA	2	6	307526	307531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377252
7304	NC_006396	ATA	2	6	307552	307557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55377252
7305	NC_006396	CT	3	6	307558	307563	0 %	50 %	0 %	50 %	55377252
7306	NC_006396	TCCT	2	8	307572	307579	0 %	50 %	0 %	50 %	55377252
7307	NC_006396	ATA	2	6	307684	307689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7308	NC_006396	ACGCG	2	10	307749	307758	20 %	0 %	40 %	40 %	55377253
7309	NC_006396	AG	3	6	307820	307825	50 %	0 %	50 %	0 %	55377253
7310	NC_006396	CT	3	6	307877	307882	0 %	50 %	0 %	50 %	55377253
7311	NC_006396	CCG	2	6	307921	307926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377253
7312	NC_006396	CGA	3	9	307935	307943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377253
7313	NC_006396	CGG	2	6	307972	307977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377253
7314	NC_006396	GGCC	2	8	307981	307988	0 %	0 %	50 %	50 %	55377253
7315	NC_006396	T	6	6	308110	308115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7316	NC_006396	TTG	2	6	308129	308134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7317	NC_006396	TTC	2	6	308304	308309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377254
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7319	NC_006396	GCTG	2	8	308391	308398	0 %	25 %	50 %	25 %	55377254
7320	NC_006396	CGG	2	6	308443	308448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377254
7321	NC_006396	GCT	2	6	308456	308461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377254
7322	NC_006396	GGTC	2	8	308462	308469	0 %	25 %	50 %	25 %	55377254
7323	NC_006396	CTG	2	6	308481	308486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377254
7324	NC_006396	CGC	2	6	308521	308526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377254
7325	NC_006396	CGA	2	6	308551	308556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377254
7326	NC_006396	CGG	2	6	308566	308571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377254
7327	NC_006396	CTA	2	6	308597	308602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377254
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7330	NC_006396	TCC	2	6	308653	308658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377254
7331	NC_006396	ATC	2	6	308679	308684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377254
7332	NC_006396	GACTAC	2	12	308697	308708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55377254
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7334	NC_006396	TGC	2	6	308846	308851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377254
7335	NC_006396	GGC	2	6	308852	308857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377254
7336	NC_006396	CGA	2	6	308914	308919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377254
7337	NC_006396	TGC	2	6	308920	308925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377254
7338	NC_006396	GCTG	2	8	309024	309031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7339	NC_006396	GTCA	2	8	309063	309070	25 %	25 %	25 %	25 %	55377255
7340	NC_006396	GT	3	6	309080	309085	0 %	50 %	50 %	0 %	55377255
7341	NC_006396	GAC	2	6	309104	309109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377255
7342	NC_006396	CGA	2	6	309148	309153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377255
7343	NC_006396	AGC	2	6	309189	309194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377255
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7345	NC_006396	CAG	2	6	309218	309223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377255
7346	NC_006396	AGC	2	6	309270	309275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377255
7347	NC_006396	TG	3	6	309294	309299	0 %	50 %	50 %	0 %	55377255
7348	NC_006396	GTA	2	6	309323	309328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377255
7349	NC_006396	TGGG	2	8	309369	309376	0 %	25 %	75 %	0 %	55377255
7350	NC_006396	CGC	2	6	309392	309397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377255
7351	NC_006396	CGTC	2	8	309403	309410	0 %	25 %	25 %	50 %	55377255
7352	NC_006396	CTG	2	6	309440	309445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377255
7353	NC_006396	ACC	2	6	309461	309466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377255
7354	NC_006396	TCCG	2	8	309479	309486	0 %	25 %	25 %	50 %	55377255
7355	NC_006396	CGC	2	6	309487	309492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377255
7356	NC_006396	CGT	2	6	309517	309522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377255
7357	NC_006396	GTCG	2	8	309529	309536	0 %	25 %	50 %	25 %	55377255
7358	NC_006396	CGCT	2	8	309542	309549	0 %	25 %	25 %	50 %	55377255
7359	NC_006396	TCA	2	6	309555	309560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377255
7360	NC_006396	TTC	2	6	309570	309575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377255
7361	NC_006396	CGG	2	6	309604	309609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377255
7362	NC_006396	GTC	2	6	309614	309619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377255
7363	NC_006396	AC	3	6	309728	309733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7364	NC_006396	TAA	2	6	309766	309771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7365	NC_006396	CCA	2	6	309839	309844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7366	NC_006396	T	7	7	309918	309924	0 %	100 %	0 %	0 %	55377256
7367	NC_006396	GGA	2	6	309953	309958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377256
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7490	NC_006396	ATCTA	2	10	316572	316581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7491	NC_006396	ATG	2	6	316587	316592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7492	NC_006396	ACG	2	6	316660	316665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7493	NC_006396	GACA	2	8	316736	316743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7494	NC_006396	ATT	2	6	316786	316791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7495	NC_006396	AC	3	6	316842	316847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7496	NC_006396	AC	3	6	316895	316900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7497	NC_006396	CAT	2	6	316933	316938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7498	NC_006396	CGG	2	6	316942	316947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7499	NC_006396	CGGG	2	8	316978	316985	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7500	NC_006396	GCG	2	6	317014	317019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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