MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_006396	CCG	3	9	3128384	3128392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74002	NC_006396	CGG	2	6	3128457	3128462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380070
74003	NC_006396	CGC	2	6	3128475	3128480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380070
74004	NC_006396	CAG	2	6	3128621	3128626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380070
74005	NC_006396	CGAG	2	8	3128629	3128636	25 %	0 %	50 %	25 %	55380070
74006	NC_006396	ACG	2	6	3128658	3128663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380070
74007	NC_006396	CCG	2	6	3128707	3128712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380070
74008	NC_006396	ACG	3	9	3128727	3128735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380070
74009	NC_006396	ACT	2	6	3128743	3128748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380070
74010	NC_006396	GGCC	2	8	3128806	3128813	0 %	0 %	50 %	50 %	55380070
74011	NC_006396	CAC	2	6	3128897	3128902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380070
74012	NC_006396	TGA	2	6	3129030	3129035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380070
74013	NC_006396	CAC	2	6	3129053	3129058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380070
74014	NC_006396	TGC	2	6	3129081	3129086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380070
74015	NC_006396	GAA	2	6	3129098	3129103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380070
74016	NC_006396	CGC	2	6	3129109	3129114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380070
74017	NC_006396	GCGAC	2	10	3129183	3129192	20 %	0 %	40 %	40 %	55380070
74018	NC_006396	GGC	2	6	3129193	3129198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380070
74019	NC_006396	CGG	2	6	3129206	3129211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380070
74020	NC_006396	CGA	2	6	3129268	3129273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380070
74021	NC_006396	GGC	2	6	3129280	3129285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380070
74022	NC_006396	ACG	2	6	3129291	3129296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380070
74023	NC_006396	CGA	2	6	3129325	3129330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380070
74024	NC_006396	CAG	2	6	3129394	3129399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380070
74025	NC_006396	CGC	2	6	3129466	3129471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380070
74026	NC_006396	GGC	2	6	3129486	3129491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380070
74027	NC_006396	CGGCG	2	10	3129529	3129538	0 %	0 %	60 %	40 %	55380070
74028	NC_006396	CTCGAC	2	12	3129557	3129568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55380070
74029	NC_006396	ACGG	2	8	3129589	3129596	25 %	0 %	50 %	25 %	55380070
74030	NC_006396	GA	3	6	3129627	3129632	50 %	0 %	50 %	0 %	55380070
74031	NC_006396	GTC	3	9	3129707	3129715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74032	NC_006396	CGA	2	6	3129760	3129765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74033	NC_006396	AGG	2	6	3129822	3129827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74034	NC_006396	CTCG	2	8	3129841	3129848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74035	NC_006396	TCG	2	6	3129855	3129860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74036	NC_006396	CCG	2	6	3129863	3129868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74037	NC_006396	CTC	2	6	3129887	3129892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74038	NC_006396	CG	3	6	3130007	3130012	0 %	0 %	50 %	50 %	55380071
74039	NC_006396	CGT	2	6	3130048	3130053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380071
74040	NC_006396	GAC	2	6	3130066	3130071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380071
74041	NC_006396	CG	3	6	3130142	3130147	0 %	0 %	50 %	50 %	55380071
74042	NC_006396	CCG	2	6	3130346	3130351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380071
74043	NC_006396	GAC	2	6	3130372	3130377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380071
74044	NC_006396	GGAC	2	8	3130389	3130396	25 %	0 %	50 %	25 %	55380071
74045	NC_006396	GGC	2	6	3130520	3130525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380071
74046	NC_006396	TCA	2	6	3130530	3130535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380071
74047	NC_006396	CTG	2	6	3130556	3130561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380071
74048	NC_006396	GCG	2	6	3130590	3130595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380071
74049	NC_006396	TCGT	2	8	3130617	3130624	0 %	50 %	25 %	25 %	55380071
74050	NC_006396	CGA	2	6	3130646	3130651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380071
74051	NC_006396	GTC	2	6	3130652	3130657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380071
74052	NC_006396	AAT	2	6	3130671	3130676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380071
74053	NC_006396	CCA	2	6	3130716	3130721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380072
74054	NC_006396	GTT	2	6	3130783	3130788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380072
74055	NC_006396	GTC	2	6	3130790	3130795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380072
74056	NC_006396	TTC	2	6	3130826	3130831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380072
74057	NC_006396	CTC	2	6	3130856	3130861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380072
74058	NC_006396	TC	3	6	3130860	3130865	0 %	50 %	0 %	50 %	55380072
74059	NC_006396	CCA	2	6	3130872	3130877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380072
74060	NC_006396	CA	3	6	3130986	3130991	50 %	0 %	0 %	50 %	55380072
74061	NC_006396	CT	3	6	3131030	3131035	0 %	50 %	0 %	50 %	55380072
74062	NC_006396	CCGT	2	8	3131105	3131112	0 %	25 %	25 %	50 %	55380072
74063	NC_006396	ACA	2	6	3131238	3131243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380073
74064	NC_006396	GA	3	6	3131278	3131283	50 %	0 %	50 %	0 %	55380073
74065	NC_006396	CA	3	6	3131290	3131295	50 %	0 %	0 %	50 %	55380073
74066	NC_006396	CGT	2	6	3131344	3131349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380073
74067	NC_006396	TCGG	2	8	3131355	3131362	0 %	25 %	50 %	25 %	55380073
74068	NC_006396	TGG	2	6	3131442	3131447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380073
74069	NC_006396	TTG	2	6	3131454	3131459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380073
74070	NC_006396	CGA	2	6	3131461	3131466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380073
74071	NC_006396	TCG	2	6	3131514	3131519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380073
74072	NC_006396	CGG	2	6	3131572	3131577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380073
74073	NC_006396	GTC	2	6	3131615	3131620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380073
74074	NC_006396	GTC	2	6	3131639	3131644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380073
74075	NC_006396	GGA	2	6	3131680	3131685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380073
74076	NC_006396	AGC	2	6	3131688	3131693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380073

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.