MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006396	ATC	2	6	253142	253147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377194
6002	NC_006396	CGA	2	6	253203	253208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377194
6003	NC_006396	CTA	2	6	253219	253224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377194
6004	NC_006396	GTACA	2	10	253280	253289	40 %	20 %	20 %	20 %	55377194
6005	NC_006396	CGG	2	6	253329	253334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377194
6006	NC_006396	GACG	2	8	253337	253344	25 %	0 %	50 %	25 %	55377194
6007	NC_006396	ACTC	2	8	253345	253352	25 %	25 %	0 %	50 %	55377194
6008	NC_006396	CCG	2	6	253387	253392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377195
6009	NC_006396	GTC	3	9	253402	253410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377195
6010	NC_006396	TCC	2	6	253499	253504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_006396	CCA	2	6	253527	253532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_006396	CGT	2	6	253599	253604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_006396	TCG	2	6	253667	253672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377196
6014	NC_006396	GAT	2	6	253707	253712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377196
6015	NC_006396	CGA	2	6	253725	253730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377196
6016	NC_006396	TCG	2	6	253813	253818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377196
6017	NC_006396	CGG	2	6	253842	253847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377197
6018	NC_006396	GCCC	2	8	253895	253902	0 %	0 %	25 %	75 %	55377197
6019	NC_006396	GTGA	2	8	253912	253919	25 %	25 %	50 %	0 %	55377197
6020	NC_006396	GTC	2	6	253941	253946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377197
6021	NC_006396	GCC	3	9	253997	254005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377197
6022	NC_006396	GCA	2	6	254032	254037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377197
6023	NC_006396	AGC	2	6	254038	254043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377197
6024	NC_006396	TTG	2	6	254101	254106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377197
6025	NC_006396	CCG	2	6	254161	254166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377197
6026	NC_006396	GCC	2	6	254191	254196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377197
6027	NC_006396	CG	3	6	254212	254217	0 %	0 %	50 %	50 %	55377197
6028	NC_006396	AGT	2	6	254285	254290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377197
6029	NC_006396	GAC	2	6	254292	254297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377197
6030	NC_006396	GT	3	6	254362	254367	0 %	50 %	50 %	0 %	55377197
6031	NC_006396	CGA	2	6	254384	254389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377197
6032	NC_006396	CAGC	2	8	254447	254454	25 %	0 %	25 %	50 %	55377197
6033	NC_006396	AAG	2	6	254455	254460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55377197
6034	NC_006396	ACCA	2	8	254502	254509	50 %	0 %	0 %	50 %	55377197
6035	NC_006396	AC	3	6	254594	254599	50 %	0 %	0 %	50 %	55377197
6036	NC_006396	GCC	2	6	254639	254644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377197
6037	NC_006396	CTG	2	6	254649	254654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377197
6038	NC_006396	AGA	2	6	254671	254676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55377197
6039	NC_006396	TCGG	2	8	254818	254825	0 %	25 %	50 %	25 %	55377197
6040	NC_006396	AATC	2	8	254878	254885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_006396	ACT	2	6	254915	254920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_006396	ATA	2	6	254943	254948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55377198
6043	NC_006396	GGT	2	6	254968	254973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377198
6044	NC_006396	GAC	2	6	254981	254986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377198
6045	NC_006396	ACC	2	6	254989	254994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377198
6046	NC_006396	GGCC	2	8	255034	255041	0 %	0 %	50 %	50 %	55377198
6047	NC_006396	GCC	2	6	255109	255114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377198
6048	NC_006396	CA	3	6	255152	255157	50 %	0 %	0 %	50 %	55377198
6049	NC_006396	CGT	3	9	255177	255185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377198
6050	NC_006396	GCC	2	6	255214	255219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377198
6051	NC_006396	TCGC	2	8	255233	255240	0 %	25 %	25 %	50 %	55377198
6052	NC_006396	GAC	2	6	255323	255328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377198
6053	NC_006396	CG	3	6	255441	255446	0 %	0 %	50 %	50 %	55377198
6054	NC_006396	GT	3	6	255471	255476	0 %	50 %	50 %	0 %	55377198
6055	NC_006396	ACG	2	6	255479	255484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377198
6056	NC_006396	ACCC	2	8	255488	255495	25 %	0 %	0 %	75 %	55377198
6057	NC_006396	AG	3	6	255544	255549	50 %	0 %	50 %	0 %	55377198
6058	NC_006396	CGC	2	6	255637	255642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377198
6059	NC_006396	TGA	2	6	255661	255666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377198
6060	NC_006396	TTCTT	2	10	255796	255805	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6061	NC_006396	TGA	2	6	255806	255811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377199
6062	NC_006396	CAC	3	9	255854	255862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377199
6063	NC_006396	CGT	2	6	255984	255989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377199
6064	NC_006396	CTC	2	6	256019	256024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377200
6065	NC_006396	GAG	2	6	256038	256043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377200
6066	NC_006396	GCGG	2	8	256059	256066	0 %	0 %	75 %	25 %	55377200
6067	NC_006396	TGA	2	6	256075	256080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377200
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6070	NC_006396	GGA	2	6	256216	256221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377200
6071	NC_006396	GTC	2	6	256229	256234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377200
6072	NC_006396	CTT	2	6	256244	256249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_006396	CAA	2	6	256259	256264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_006396	CTG	2	6	256302	256307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_006396	GAAC	2	8	256321	256328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6076	NC_006396	CAG	2	6	256332	256337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_006396	CGT	2	6	256357	256362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377201
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6079	NC_006396	GGCGT	2	10	256392	256401	0 %	20 %	60 %	20 %	55377201
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6081	NC_006396	CGA	2	6	256516	256521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377201
6082	NC_006396	CGT	2	6	256534	256539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377201
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6090	NC_006396	CGT	2	6	256834	256839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377201
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6104	NC_006396	CA	3	6	257470	257475	50 %	0 %	0 %	50 %	55377202
6105	NC_006396	CGA	2	6	257485	257490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377202
6106	NC_006396	TGGC	2	8	257550	257557	0 %	25 %	50 %	25 %	55377202
6107	NC_006396	TGT	2	6	257590	257595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377202
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6110	NC_006396	GAC	2	6	257753	257758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377203
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6112	NC_006396	CCG	2	6	257833	257838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377203
6113	NC_006396	TG	3	6	257860	257865	0 %	50 %	50 %	0 %	55377203
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6118	NC_006396	GAC	2	6	258023	258028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377203
6119	NC_006396	CGA	2	6	258049	258054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377203
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6122	NC_006396	GTA	2	6	258215	258220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377203
6123	NC_006396	GAC	2	6	258268	258273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377203
6124	NC_006396	TCG	2	6	258376	258381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377203
6125	NC_006396	GAC	2	6	258443	258448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377203
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6142	NC_006396	TGG	2	6	259230	259235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6143	NC_006396	CGA	2	6	259281	259286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6144	NC_006396	ACT	2	6	259347	259352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6213	NC_006396	TA	3	6	261666	261671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6226	NC_006396	CGTT	2	8	262155	262162	0 %	50 %	25 %	25 %	55377207
6227	NC_006396	CGTCGG	2	12	262287	262298	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55377207
6228	NC_006396	GTC	2	6	262302	262307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377207
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6230	NC_006396	TCG	2	6	262355	262360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377207
6231	NC_006396	CGCC	2	8	262385	262392	0 %	0 %	25 %	75 %	55377207
6232	NC_006396	AC	3	6	262472	262477	50 %	0 %	0 %	50 %	55377207
6233	NC_006396	GGT	2	6	262502	262507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377207
6234	NC_006396	ACG	2	6	262537	262542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377207
6235	NC_006396	CGC	2	6	262583	262588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377207
6236	NC_006396	TGA	2	6	262598	262603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377207
6237	NC_006396	C	6	6	262638	262643	0 %	0 %	0 %	100 %	55377207
6238	NC_006396	GTT	2	6	262698	262703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377207
6239	NC_006396	CGA	2	6	262784	262789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377207
6240	NC_006396	CGA	2	6	262817	262822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377207
6241	NC_006396	G	6	6	262829	262834	0 %	0 %	100 %	0 %	55377207
6242	NC_006396	GGA	2	6	262859	262864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377207
6243	NC_006396	CGA	2	6	262892	262897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377207
6244	NC_006396	GCCA	2	8	262910	262917	25 %	0 %	25 %	50 %	55377207
6245	NC_006396	GTA	2	6	262935	262940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377207
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6489	NC_006396	CGCGG	2	10	273060	273069	0 %	0 %	60 %	40 %	55377214
6490	NC_006396	GCG	2	6	273110	273115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377214
6491	NC_006396	CCGC	2	8	273120	273127	0 %	0 %	25 %	75 %	55377214
6492	NC_006396	TCG	2	6	273140	273145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377214
6493	NC_006396	GGCC	2	8	273177	273184	0 %	0 %	50 %	50 %	55377214
6494	NC_006396	GAC	2	6	273216	273221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377214
6495	NC_006396	CTGA	2	8	273328	273335	25 %	25 %	25 %	25 %	55377214
6496	NC_006396	GCG	2	6	273347	273352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6497	NC_006396	ACG	2	6	273381	273386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6498	NC_006396	GCC	2	6	273396	273401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377215
6499	NC_006396	GAC	2	6	273473	273478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377215
6500	NC_006396	CGG	2	6	273584	273589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377215

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