MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006396	CGA	2	6	232095	232100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377168
5502	NC_006396	CGG	2	6	232140	232145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377168
5503	NC_006396	CGG	2	6	232164	232169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377168
5504	NC_006396	CGA	2	6	232239	232244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377168
5505	NC_006396	CGT	2	6	232275	232280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377168
5506	NC_006396	CGG	2	6	232362	232367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377168
5507	NC_006396	CGC	2	6	232392	232397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377168
5508	NC_006396	TTG	3	9	232442	232450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377168
5509	NC_006396	GTA	2	6	232453	232458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377168
5510	NC_006396	GTC	2	6	232516	232521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377168
5511	NC_006396	CTG	2	6	232564	232569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377168
5512	NC_006396	TGA	2	6	232575	232580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377168
5513	NC_006396	TCG	2	6	232625	232630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377168
5514	NC_006396	GGTC	2	8	232641	232648	0 %	25 %	50 %	25 %	55377168
5515	NC_006396	AGT	2	6	232746	232751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_006396	AATC	2	8	232798	232805	50 %	25 %	0 %	25 %	55377169
5517	NC_006396	GAC	2	6	232821	232826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377169
5518	NC_006396	GCT	2	6	232859	232864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377169
5519	NC_006396	TCGC	2	8	232882	232889	0 %	25 %	25 %	50 %	55377169
5520	NC_006396	CTG	2	6	232921	232926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377169
5521	NC_006396	CGC	2	6	232943	232948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377169
5522	NC_006396	CGA	2	6	232988	232993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377169
5523	NC_006396	CCGT	2	8	232998	233005	0 %	25 %	25 %	50 %	55377169
5524	NC_006396	GTGC	2	8	233021	233028	0 %	25 %	50 %	25 %	55377169
5525	NC_006396	TCCA	2	8	233029	233036	25 %	25 %	0 %	50 %	55377169
5526	NC_006396	GTC	2	6	233037	233042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377169
5527	NC_006396	GCG	2	6	233057	233062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377169
5528	NC_006396	CGA	2	6	233120	233125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377169
5529	NC_006396	CGC	2	6	233129	233134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377169
5530	NC_006396	GCC	2	6	233158	233163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377169
5531	NC_006396	CTCG	2	8	233282	233289	0 %	25 %	25 %	50 %	55377169
5532	NC_006396	CAG	2	6	233304	233309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377169
5533	NC_006396	TCC	2	6	233317	233322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377169
5534	NC_006396	GCTG	2	8	233323	233330	0 %	25 %	50 %	25 %	55377169
5535	NC_006396	CGC	2	6	233399	233404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377169
5536	NC_006396	TCG	2	6	233522	233527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377170
5537	NC_006396	ACC	2	6	233537	233542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377170
5538	NC_006396	GAA	2	6	233641	233646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55377170
5539	NC_006396	GTC	2	6	233647	233652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377170
5540	NC_006396	CGG	2	6	233734	233739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377170
5541	NC_006396	CGA	2	6	233748	233753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377170
5542	NC_006396	GCC	2	6	233790	233795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377170
5543	NC_006396	GTC	2	6	233800	233805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377170
5544	NC_006396	CGG	2	6	233817	233822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377170
5545	NC_006396	CTG	2	6	233842	233847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377170
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5547	NC_006396	CGA	2	6	233973	233978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377170
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5549	NC_006396	CGGT	2	8	234086	234093	0 %	25 %	50 %	25 %	55377170
5550	NC_006396	GTCG	2	8	234148	234155	0 %	25 %	50 %	25 %	55377170
5551	NC_006396	GTC	2	6	234184	234189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377170
5552	NC_006396	CCG	2	6	234235	234240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377170
5553	NC_006396	TGG	2	6	234330	234335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_006396	CCCTA	2	10	234336	234345	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5555	NC_006396	GCT	2	6	234346	234351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_006396	GTC	2	6	234411	234416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377171
5557	NC_006396	TCG	2	6	234526	234531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377171
5558	NC_006396	TTC	2	6	234550	234555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377171
5559	NC_006396	AGG	2	6	234568	234573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377171
5560	NC_006396	TGG	2	6	234580	234585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377171
5561	NC_006396	CGT	2	6	234608	234613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377171
5562	NC_006396	CGA	2	6	234623	234628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377171
5563	NC_006396	GTTC	2	8	234635	234642	0 %	50 %	25 %	25 %	55377171
5564	NC_006396	CCT	2	6	234653	234658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377171
5565	NC_006396	GTC	2	6	234858	234863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377171
5566	NC_006396	GCC	2	6	234869	234874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377171
5567	NC_006396	GGA	2	6	234881	234886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377171
5568	NC_006396	GCC	2	6	234898	234903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377171
5569	NC_006396	CGC	3	9	234914	234922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377171
5570	NC_006396	AGCAC	2	10	234952	234961	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5571	NC_006396	CT	3	6	235008	235013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_006396	GTTCG	2	10	235018	235027	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5573	NC_006396	GCG	2	6	235087	235092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_006396	CGT	2	6	235109	235114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377172
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5580	NC_006396	CTC	2	6	235438	235443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377172
5581	NC_006396	GAT	2	6	235500	235505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377173
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5584	NC_006396	CGT	2	6	235649	235654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377173
5585	NC_006396	GC	3	6	235669	235674	0 %	0 %	50 %	50 %	55377173
5586	NC_006396	GCG	2	6	235679	235684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377173
5587	NC_006396	TAA	2	6	235785	235790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_006396	GCCA	2	8	235812	235819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_006396	CGA	2	6	235860	235865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_006396	CCA	2	6	235950	235955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377174
5591	NC_006396	CGA	2	6	235990	235995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377174
5592	NC_006396	GTC	2	6	236075	236080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377174
5593	NC_006396	GCT	2	6	236121	236126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377174
5594	NC_006396	CTG	2	6	236215	236220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377175
5595	NC_006396	CGG	2	6	236244	236249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377175
5596	NC_006396	GC	3	6	236290	236295	0 %	0 %	50 %	50 %	55377175
5597	NC_006396	AGCGC	2	10	236417	236426	20 %	0 %	40 %	40 %	55377176
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5600	NC_006396	CCCA	2	8	236511	236518	25 %	0 %	0 %	75 %	55377176
5601	NC_006396	GCC	2	6	236568	236573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377176
5602	NC_006396	GAT	2	6	236659	236664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377176
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5604	NC_006396	GAC	2	6	236803	236808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377176
5605	NC_006396	CGG	2	6	236844	236849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377176
5606	NC_006396	CGCA	2	8	236851	236858	25 %	0 %	25 %	50 %	55377176
5607	NC_006396	CGA	2	6	236895	236900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377176
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5609	NC_006396	TCG	2	6	236942	236947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377176
5610	NC_006396	TCC	2	6	236948	236953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377176
5611	NC_006396	G	6	6	236969	236974	0 %	0 %	100 %	0 %	55377176
5612	NC_006396	TCC	2	6	236975	236980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377176
5613	NC_006396	GTC	2	6	237046	237051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377177
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5617	NC_006396	GT	3	6	237356	237361	0 %	50 %	50 %	0 %	55377177
5618	NC_006396	ACG	2	6	237367	237372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377177
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5620	NC_006396	CGC	2	6	237423	237428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377177
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5622	NC_006396	GAC	2	6	237447	237452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377177
5623	NC_006396	CGA	2	6	237455	237460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377177
5624	NC_006396	CGA	2	6	237479	237484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377177
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5635	NC_006396	CGA	2	6	238048	238053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377178
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5655	NC_006396	TA	3	6	239013	239018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5744	NC_006396	TCC	2	6	242450	242455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377182
5745	NC_006396	CTG	2	6	242467	242472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377182
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5749	NC_006396	GCA	2	6	242676	242681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377183
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5774	NC_006396	CGA	2	6	243712	243717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5863	NC_006396	GT	3	6	247106	247111	0 %	50 %	50 %	0 %	55377185
5864	NC_006396	GACG	2	8	247140	247147	25 %	0 %	50 %	25 %	55377185
5865	NC_006396	CCG	2	6	247166	247171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377185
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5991	NC_006396	CGG	2	6	252741	252746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377194
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5993	NC_006396	CGA	2	6	252825	252830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377194
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