MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG600

Total Repeats: 3444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006394	TCCG	2	8	135532	135539	0 %	25 %	25 %	50 %	55376565
3002	NC_006394	CCCAA	2	10	135542	135551	40 %	0 %	0 %	60 %	55376565
3003	NC_006394	ACG	2	6	135637	135642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3004	NC_006394	TCA	2	6	135664	135669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376565
3005	NC_006394	TG	3	6	135748	135753	0 %	50 %	50 %	0 %	55376565
3006	NC_006394	CGA	2	6	135797	135802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3007	NC_006394	GGC	2	6	135931	135936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376565
3008	NC_006394	CGA	2	6	135986	135991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3009	NC_006394	GC	3	6	136013	136018	0 %	0 %	50 %	50 %	55376565
3010	NC_006394	TCG	3	9	136138	136146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3011	NC_006394	CGA	2	6	136178	136183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3012	NC_006394	GAC	2	6	136191	136196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3013	NC_006394	CGG	2	6	136205	136210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376565
3014	NC_006394	CAA	2	6	136233	136238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376565
3015	NC_006394	CG	4	8	136244	136251	0 %	0 %	50 %	50 %	55376565
3016	NC_006394	ATTG	2	8	136257	136264	25 %	50 %	25 %	0 %	55376565
3017	NC_006394	GTT	2	6	136296	136301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376565
3018	NC_006394	CGA	2	6	136325	136330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3019	NC_006394	TCG	2	6	136366	136371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3020	NC_006394	TCG	2	6	136390	136395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3021	NC_006394	GGC	2	6	136416	136421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376565
3022	NC_006394	TCG	2	6	136429	136434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3023	NC_006394	CG	3	6	136433	136438	0 %	0 %	50 %	50 %	55376565
3024	NC_006394	GAT	2	6	136443	136448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376565
3025	NC_006394	GGA	2	6	136454	136459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376565
3026	NC_006394	CGA	2	6	136463	136468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3027	NC_006394	GTC	2	6	136479	136484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3028	NC_006394	GAT	2	6	136572	136577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376565
3029	NC_006394	GAG	2	6	136591	136596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376565
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3031	NC_006394	CGC	2	6	136727	136732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376565
3032	NC_006394	CCT	2	6	136793	136798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376565
3033	NC_006394	AGA	2	6	136859	136864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376565
3034	NC_006394	GAT	2	6	136881	136886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376565
3035	NC_006394	GC	3	6	136908	136913	0 %	0 %	50 %	50 %	55376565
3036	NC_006394	GCT	2	6	136964	136969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376565
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3041	NC_006394	GTC	2	6	137182	137187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376565
3042	NC_006394	GA	3	6	137218	137223	50 %	0 %	50 %	0 %	55376565
3043	NC_006394	GA	3	6	137278	137283	50 %	0 %	50 %	0 %	55376565
3044	NC_006394	CGAT	2	8	137359	137366	25 %	25 %	25 %	25 %	55376565
3045	NC_006394	TCG	3	9	137395	137403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376565
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3049	NC_006394	AGT	2	6	137534	137539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376565
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3053	NC_006394	GT	3	6	137687	137692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_006394	TCCA	2	8	137760	137767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_006394	CAA	2	6	137820	137825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_006394	CTA	2	6	137858	137863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3058	NC_006394	ACG	2	6	138028	138033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376566
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3061	NC_006394	CGC	2	6	138179	138184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376566
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3081	NC_006394	GTC	2	6	139078	139083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376568
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3088	NC_006394	GCTG	2	8	139299	139306	0 %	25 %	50 %	25 %	55376568
3089	NC_006394	GTC	3	9	139328	139336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376568
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3093	NC_006394	GCC	2	6	139426	139431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376568
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3097	NC_006394	CGG	2	6	139765	139770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_006394	ACC	2	6	139882	139887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376569
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3101	NC_006394	TCGT	2	8	140098	140105	0 %	50 %	25 %	25 %	55376569
3102	NC_006394	AC	3	6	140228	140233	50 %	0 %	0 %	50 %	55376569
3103	NC_006394	TAC	2	6	140273	140278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376569
3104	NC_006394	TC	3	6	140306	140311	0 %	50 %	0 %	50 %	55376569
3105	NC_006394	AC	3	6	140312	140317	50 %	0 %	0 %	50 %	55376569
3106	NC_006394	TGA	3	9	140318	140326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376569
3107	NC_006394	TGA	2	6	140345	140350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376569
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3109	NC_006394	CTT	2	6	140394	140399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376569
3110	NC_006394	AGC	2	6	140405	140410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376569
3111	NC_006394	CCGA	2	8	140433	140440	25 %	0 %	25 %	50 %	55376569
3112	NC_006394	TAA	2	6	140603	140608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_006394	GAC	2	6	140632	140637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_006394	ACG	2	6	140691	140696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_006394	TGA	2	6	140771	140776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376570
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3118	NC_006394	CAA	2	6	140847	140852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376570
3119	NC_006394	AAATC	2	10	140861	140870	60 %	20 %	0 %	20 %	55376570
3120	NC_006394	GAA	2	6	140919	140924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376570
3121	NC_006394	AAG	2	6	140929	140934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376570
3122	NC_006394	GAGAA	2	10	140976	140985	60 %	0 %	40 %	0 %	55376570
3123	NC_006394	GGA	2	6	141129	141134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376570
3124	NC_006394	CGA	2	6	141147	141152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376570
3125	NC_006394	GA	3	6	141212	141217	50 %	0 %	50 %	0 %	55376570
3126	NC_006394	GGA	2	6	141234	141239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376570
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3128	NC_006394	AGA	2	6	141324	141329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376570
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3130	NC_006394	GAA	2	6	141394	141399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376570
3131	NC_006394	GA	4	8	141468	141475	50 %	0 %	50 %	0 %	55376570
3132	NC_006394	CAG	2	6	141493	141498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376570
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3136	NC_006394	AGA	2	6	141720	141725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376570
3137	NC_006394	CAT	2	6	141786	141791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376570
3138	NC_006394	GTC	2	6	141802	141807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376570
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3140	NC_006394	CA	3	6	141878	141883	50 %	0 %	0 %	50 %	55376570
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3144	NC_006394	AAG	2	6	141970	141975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376570
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3155	NC_006394	CTT	2	6	142397	142402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376571
3156	NC_006394	TCTG	2	8	142424	142431	0 %	50 %	25 %	25 %	55376571
3157	NC_006394	CTT	2	6	142503	142508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3158	NC_006394	TCC	2	6	142543	142548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3159	NC_006394	TGG	2	6	142591	142596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3160	NC_006394	ATA	2	6	142642	142647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_006394	ATGT	2	8	142733	142740	25 %	50 %	25 %	0 %	55376572
3162	NC_006394	GTC	2	6	142800	142805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376572
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3164	NC_006394	AC	3	6	142819	142824	50 %	0 %	0 %	50 %	55376572
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3168	NC_006394	GATT	2	8	142906	142913	25 %	50 %	25 %	0 %	55376572
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3172	NC_006394	CGA	2	6	142970	142975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376572
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3220	NC_006394	C	6	6	144727	144732	0 %	0 %	0 %	100 %	55376574
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3229	NC_006394	TCC	2	6	145046	145051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376574
3230	NC_006394	TCG	2	6	145076	145081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376574
3231	NC_006394	GTC	2	6	145096	145101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376574
3232	NC_006394	TCG	2	6	145299	145304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376574
3233	NC_006394	CTT	2	6	145377	145382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376574
3234	NC_006394	CGA	2	6	145383	145388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376574
3235	NC_006394	CT	3	6	145402	145407	0 %	50 %	0 %	50 %	55376574
3236	NC_006394	ATCCG	2	10	145414	145423	20 %	20 %	20 %	40 %	55376574
3237	NC_006394	TGA	2	6	145569	145574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376574
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3239	NC_006394	GTT	2	6	145623	145628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376574
3240	NC_006394	CTGT	2	8	145706	145713	0 %	50 %	25 %	25 %	55376574
3241	NC_006394	GTT	2	6	145790	145795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376574
3242	NC_006394	TCG	2	6	145796	145801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376574
3243	NC_006394	CCA	3	9	145814	145822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376574
3244	NC_006394	GTAC	2	8	145825	145832	25 %	25 %	25 %	25 %	55376574
3245	NC_006394	GAT	2	6	145900	145905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376574
3246	NC_006394	TCCGC	2	10	146016	146025	0 %	20 %	20 %	60 %	55376574
3247	NC_006394	ACT	2	6	146050	146055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376574
3248	NC_006394	TCG	2	6	146093	146098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376574
3249	NC_006394	CTA	2	6	146126	146131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376574
3250	NC_006394	CCT	2	6	146142	146147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376574
3251	NC_006394	TCG	2	6	146168	146173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376574
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3253	NC_006394	TCA	2	6	146312	146317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376574
3254	NC_006394	TCG	2	6	146402	146407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376574
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3259	NC_006394	TCC	3	9	146729	146737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376574
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3266	NC_006394	TCG	2	6	147035	147040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376574
3267	NC_006394	TCG	2	6	147065	147070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376574
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3350	NC_006394	GCG	2	6	151044	151049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376575
3351	NC_006394	TCG	2	6	151136	151141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376575
3352	NC_006394	TCAGAT	2	12	151142	151153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	55376575
3353	NC_006394	ATA	2	6	151184	151189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376575
3354	NC_006394	GCGA	2	8	151257	151264	25 %	0 %	50 %	25 %	55376576
3355	NC_006394	AGT	2	6	151278	151283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376576
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3357	NC_006394	CGGA	2	8	151578	151585	25 %	0 %	50 %	25 %	55376576
3358	NC_006394	CCT	2	6	151605	151610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376576
3359	NC_006394	CT	3	6	151647	151652	0 %	50 %	0 %	50 %	55376576
3360	NC_006394	TCG	2	6	151663	151668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376576
3361	NC_006394	GTC	2	6	151720	151725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376576
3362	NC_006394	GTCG	2	8	151751	151758	0 %	25 %	50 %	25 %	55376576
3363	NC_006394	GGT	2	6	151774	151779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376576
3364	NC_006394	CGAA	2	8	151785	151792	50 %	0 %	25 %	25 %	55376576
3365	NC_006394	GAG	2	6	151893	151898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376577
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3432	NC_006394	GT	3	6	154635	154640	0 %	50 %	50 %	0 %	55376577
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3440	NC_006394	TCG	2	6	155075	155080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376577
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3442	NC_006394	GAG	2	6	155144	155149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376578
3443	NC_006394	ATC	2	6	155235	155240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376578
3444	NC_006394	TAG	2	6	155286	155291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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