MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 2813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_006393	GGAA	2	8	118343	118350	50 %	0 %	50 %	0 %	55376399
2502	NC_006393	TGAC	2	8	118409	118416	25 %	25 %	25 %	25 %	55376399
2503	NC_006393	CGAT	2	8	118436	118443	25 %	25 %	25 %	25 %	55376399
2504	NC_006393	CAT	2	6	118478	118483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376399
2505	NC_006393	GA	3	6	118558	118563	50 %	0 %	50 %	0 %	55376399
2506	NC_006393	AGA	3	9	118572	118580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376399
2507	NC_006393	TAGC	2	8	118628	118635	25 %	25 %	25 %	25 %	55376400
2508	NC_006393	GTC	2	6	118653	118658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376400
2509	NC_006393	CAAG	2	8	118667	118674	50 %	0 %	25 %	25 %	55376400
2510	NC_006393	CTT	2	6	118745	118750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376400
2511	NC_006393	AGGTGA	2	12	118762	118773	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	55376400
2512	NC_006393	TGC	2	6	118843	118848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376400
2513	NC_006393	GGA	2	6	118895	118900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376400
2514	NC_006393	GTC	2	6	118904	118909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376400
2515	NC_006393	GTT	2	6	118955	118960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376400
2516	NC_006393	AC	3	6	119063	119068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_006393	GGT	2	6	119091	119096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_006393	TTC	2	6	119139	119144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376401
2519	NC_006393	GTT	2	6	119171	119176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376401
2520	NC_006393	CGA	2	6	119224	119229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376401
2521	NC_006393	TG	3	6	119265	119270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_006393	CGC	2	6	119286	119291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376402
2523	NC_006393	CGTC	2	8	119300	119307	0 %	25 %	25 %	50 %	55376402
2524	NC_006393	TCGA	2	8	119326	119333	25 %	25 %	25 %	25 %	55376402
2525	NC_006393	CTC	2	6	119334	119339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376402
2526	NC_006393	GGA	2	6	119411	119416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376402
2527	NC_006393	CGA	2	6	119423	119428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376402
2528	NC_006393	TCC	2	6	119439	119444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376402
2529	NC_006393	GGC	2	6	119514	119519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376402
2530	NC_006393	GAA	2	6	119538	119543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376402
2531	NC_006393	CCT	2	6	119555	119560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376402
2532	NC_006393	GAA	2	6	119588	119593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376402
2533	NC_006393	TCA	2	6	119611	119616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376402
2534	NC_006393	CGA	2	6	119741	119746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376402
2535	NC_006393	CGA	2	6	119765	119770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376402
2536	NC_006393	ATG	2	6	119776	119781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376402
2537	NC_006393	CAA	2	6	119789	119794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376402
2538	NC_006393	TCG	2	6	119824	119829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376402
2539	NC_006393	ACGG	2	8	119844	119851	25 %	0 %	50 %	25 %	55376402
2540	NC_006393	CGA	2	6	119924	119929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376402
2541	NC_006393	CTTCT	2	10	120058	120067	0 %	60 %	0 %	40 %	55376402
2542	NC_006393	AC	3	6	120079	120084	50 %	0 %	0 %	50 %	55376402
2543	NC_006393	AG	3	6	120266	120271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_006393	CTT	2	6	120272	120277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_006393	TG	3	6	120320	120325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_006393	TGAG	2	8	120375	120382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_006393	GTA	2	6	120423	120428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_006393	AG	3	6	120441	120446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_006393	ACT	2	6	120509	120514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_006393	CTC	2	6	120527	120532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2551	NC_006393	CAGCT	2	10	120555	120564	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2552	NC_006393	TAC	2	6	120627	120632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_006393	CCA	2	6	120687	120692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_006393	CCA	2	6	120731	120736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2555	NC_006393	TAC	2	6	120748	120753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_006393	CGCT	2	8	120760	120767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2557	NC_006393	ACT	2	6	120820	120825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_006393	CCG	2	6	120828	120833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_006393	TCG	2	6	120931	120936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_006393	AGT	2	6	121019	121024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_006393	TGT	2	6	121061	121066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_006393	CTG	2	6	121092	121097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2563	NC_006393	ACAAA	2	10	121130	121139	80 %	0 %	0 %	20 %	55376403
2564	NC_006393	A	6	6	121137	121142	100 %	0 %	0 %	0 %	55376403
2565	NC_006393	GCC	2	6	121190	121195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376403
2566	NC_006393	GCT	2	6	121211	121216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2567	NC_006393	GGC	3	9	121274	121282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376403
2568	NC_006393	GAG	2	6	121334	121339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376403
2569	NC_006393	CGG	2	6	121351	121356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376403
2570	NC_006393	GTG	2	6	121548	121553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376403
2571	NC_006393	CAT	2	6	121578	121583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376403
2572	NC_006393	CGTG	2	8	121603	121610	0 %	25 %	50 %	25 %	55376403
2573	NC_006393	AAG	2	6	121626	121631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376403
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2575	NC_006393	A	6	6	121698	121703	100 %	0 %	0 %	0 %	55376403
2576	NC_006393	CAA	2	6	121726	121731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376403
2577	NC_006393	TGA	2	6	121798	121803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376403
2578	NC_006393	GACCT	2	10	121838	121847	20 %	20 %	20 %	40 %	55376403
2579	NC_006393	CAG	2	6	121892	121897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376403
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2582	NC_006393	AAG	2	6	122070	122075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376403
2583	NC_006393	ACA	2	6	122088	122093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376403
2584	NC_006393	GTC	2	6	122177	122182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2585	NC_006393	GGT	2	6	122192	122197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376403
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2587	NC_006393	AGT	2	6	122312	122317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376403
2588	NC_006393	CGATGG	2	12	122335	122346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55376403
2589	NC_006393	GAT	2	6	122396	122401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376403
2590	NC_006393	GTT	2	6	122414	122419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376403
2591	NC_006393	ACA	2	6	122532	122537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376403
2592	NC_006393	CGA	2	6	122590	122595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2593	NC_006393	GAA	2	6	122606	122611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376403
2594	NC_006393	GTC	2	6	122615	122620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2595	NC_006393	GAC	2	6	122729	122734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2596	NC_006393	GTG	2	6	122760	122765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376403
2597	NC_006393	TGA	2	6	122845	122850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376403
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2599	NC_006393	TGACGA	2	12	122950	122961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55376403
2600	NC_006393	GTC	2	6	123028	123033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2601	NC_006393	AGC	2	6	123119	123124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2602	NC_006393	TGA	2	6	123166	123171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376403
2603	NC_006393	TGA	2	6	123181	123186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376403
2604	NC_006393	ACGG	2	8	123215	123222	25 %	0 %	50 %	25 %	55376403
2605	NC_006393	GAC	2	6	123226	123231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2606	NC_006393	CGA	2	6	123370	123375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2607	NC_006393	GAC	2	6	123458	123463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2608	NC_006393	ACA	2	6	123468	123473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376403
2609	NC_006393	AGGC	2	8	123501	123508	25 %	0 %	50 %	25 %	55376403
2610	NC_006393	AGC	2	6	123522	123527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2611	NC_006393	GCCGGA	2	12	123541	123552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
2612	NC_006393	GCCGGA	2	12	123562	123573	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
2613	NC_006393	GCCGGA	2	12	123583	123594	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
2614	NC_006393	GCCGGA	2	12	123604	123615	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
2615	NC_006393	GCCGGA	2	12	123625	123636	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376403
2616	NC_006393	TGC	3	9	123712	123720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376403
2617	NC_006393	CTC	2	6	123722	123727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376403
2618	NC_006393	CGC	2	6	123734	123739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376403
2619	NC_006393	TAAC	2	8	123742	123749	50 %	25 %	0 %	25 %	55376403
2620	NC_006393	T	6	6	123778	123783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_006393	TCA	2	6	123834	123839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_006393	TGAG	2	8	124038	124045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_006393	CGC	2	6	124058	124063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_006393	CGG	2	6	124079	124084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_006393	GGT	2	6	124095	124100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2630	NC_006393	GACA	2	8	124380	124387	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2631	NC_006393	CTA	2	6	124424	124429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2633	NC_006393	CGA	2	6	124466	124471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2811	NC_006393	GCC	2	6	132381	132386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2812	NC_006393	TGG	2	6	132475	132480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2813	NC_006393	CGT	2	6	132567	132572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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