MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG300

Total Repeats: 839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006391	CCG	2	6	25552	25557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376212
502	NC_006391	CGCT	2	8	25562	25569	0 %	25 %	25 %	50 %	55376212
503	NC_006391	GTC	2	6	25619	25624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
504	NC_006391	AAC	2	6	25640	25645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376212
505	NC_006391	GTC	2	6	25676	25681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
506	NC_006391	CGA	2	6	25692	25697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376212
507	NC_006391	TCG	2	6	25805	25810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
508	NC_006391	TGT	2	6	25896	25901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376212
509	NC_006391	CGA	2	6	25923	25928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376212
510	NC_006391	GAC	2	6	25981	25986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376212
511	NC_006391	CGTC	2	8	26000	26007	0 %	25 %	25 %	50 %	55376212
512	NC_006391	CGG	2	6	26029	26034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376212
513	NC_006391	CTT	2	6	26080	26085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376212
514	NC_006391	GAA	2	6	26092	26097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376212
515	NC_006391	TCG	2	6	26225	26230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
516	NC_006391	AG	3	6	26268	26273	50 %	0 %	50 %	0 %	55376212
517	NC_006391	TCG	2	6	26315	26320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
518	NC_006391	CAG	2	6	26533	26538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_006391	CTC	2	6	26591	26596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_006391	TCAC	2	8	26624	26631	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_006391	TC	3	6	26646	26651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_006391	GCT	2	6	26802	26807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_006391	CGT	2	6	26832	26837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_006391	GCG	2	6	26872	26877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_006391	TGG	2	6	26891	26896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_006391	TTA	2	6	26900	26905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_006391	TG	3	6	26955	26960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_006391	TA	3	6	27004	27009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_006391	CCG	2	6	27015	27020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_006391	AAC	2	6	27079	27084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_006391	ACA	2	6	27089	27094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_006391	AGG	2	6	27164	27169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376213
533	NC_006391	GAC	2	6	27179	27184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376213
534	NC_006391	ATC	2	6	27214	27219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376213
535	NC_006391	ACG	2	6	27226	27231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376213
536	NC_006391	TCG	2	6	27238	27243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376213
537	NC_006391	ACG	2	6	27295	27300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376213
538	NC_006391	ACC	2	6	27305	27310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376213
539	NC_006391	AC	3	6	27322	27327	50 %	0 %	0 %	50 %	55376213
540	NC_006391	TCT	2	6	27362	27367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376213
541	NC_006391	ATC	2	6	27373	27378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376213
542	NC_006391	CCT	2	6	27389	27394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376213
543	NC_006391	TGC	2	6	27449	27454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376213
544	NC_006391	GGA	2	6	27512	27517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376213
545	NC_006391	CGA	2	6	27527	27532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376213
546	NC_006391	CGCT	2	8	27545	27552	0 %	25 %	25 %	50 %	55376213
547	NC_006391	TCG	2	6	27604	27609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376213
548	NC_006391	CGC	2	6	27613	27618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376213
549	NC_006391	CGT	2	6	27665	27670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376213
550	NC_006391	ATG	2	6	27721	27726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376213
551	NC_006391	CGA	2	6	27802	27807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376213
552	NC_006391	GCCG	2	8	27906	27913	0 %	0 %	50 %	50 %	55376213
553	NC_006391	GACC	2	8	27947	27954	25 %	0 %	25 %	50 %	55376213
554	NC_006391	CGC	2	6	27965	27970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376213
555	NC_006391	GGA	2	6	27980	27985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376213
556	NC_006391	CTT	2	6	27986	27991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376213
557	NC_006391	GAC	2	6	28000	28005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376213
558	NC_006391	CGA	2	6	28077	28082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376214
559	NC_006391	AAC	2	6	28091	28096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376214
560	NC_006391	ACA	2	6	28119	28124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376214
561	NC_006391	AAC	2	6	28133	28138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376214
562	NC_006391	AAC	2	6	28169	28174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376214
563	NC_006391	ACA	2	6	28197	28202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376214
564	NC_006391	AAC	2	6	28211	28216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376214
565	NC_006391	CTA	2	6	28245	28250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376214
566	NC_006391	AGG	2	6	28271	28276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376214
567	NC_006391	CTTG	2	8	28368	28375	0 %	50 %	25 %	25 %	55376214
568	NC_006391	AG	3	6	28380	28385	50 %	0 %	50 %	0 %	55376214
569	NC_006391	GATG	2	8	28395	28402	25 %	25 %	50 %	0 %	55376214
570	NC_006391	TTG	2	6	28424	28429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376214
571	NC_006391	CGA	2	6	28443	28448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376214
572	NC_006391	TC	3	6	28455	28460	0 %	50 %	0 %	50 %	55376214
573	NC_006391	ACG	2	6	28496	28501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376215
574	NC_006391	CGA	2	6	28525	28530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376215
575	NC_006391	TAAA	2	8	28560	28567	75 %	25 %	0 %	0 %	55376215
576	NC_006391	CTG	2	6	28600	28605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376215
577	NC_006391	ACCT	2	8	28654	28661	25 %	25 %	0 %	50 %	55376215
578	NC_006391	GGA	2	6	28662	28667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376215
579	NC_006391	CTGA	2	8	28790	28797	25 %	25 %	25 %	25 %	55376215
580	NC_006391	GAC	2	6	28829	28834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376215
581	NC_006391	TC	3	6	28836	28841	0 %	50 %	0 %	50 %	55376215
582	NC_006391	GGT	2	6	28862	28867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376215
583	NC_006391	TCG	2	6	28908	28913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_006391	ACC	2	6	28918	28923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_006391	A	6	6	29000	29005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_006391	CGA	2	6	29169	29174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376216
587	NC_006391	GCG	2	6	29178	29183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376216
588	NC_006391	CG	4	8	29182	29189	0 %	0 %	50 %	50 %	55376216
589	NC_006391	GAGC	2	8	29210	29217	25 %	0 %	50 %	25 %	55376216
590	NC_006391	CCG	2	6	29231	29236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376216
591	NC_006391	GCTGG	2	10	29303	29312	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
592	NC_006391	ATC	2	6	29361	29366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_006391	CGG	3	9	29381	29389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_006391	GATG	2	8	29468	29475	25 %	25 %	50 %	0 %	55376217
595	NC_006391	ACG	2	6	29530	29535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376217
596	NC_006391	GGT	2	6	29594	29599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376217
597	NC_006391	CGGA	2	8	29610	29617	25 %	0 %	50 %	25 %	55376217
598	NC_006391	ACT	2	6	29626	29631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376217
599	NC_006391	GCG	2	6	29646	29651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376217
600	NC_006391	ACG	2	6	29663	29668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376217
601	NC_006391	GCCG	2	8	29712	29719	0 %	0 %	50 %	50 %	55376217
602	NC_006391	CGAC	2	8	29728	29735	25 %	0 %	25 %	50 %	55376217
603	NC_006391	GGC	2	6	29736	29741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376217
604	NC_006391	CCGT	2	8	29794	29801	0 %	25 %	25 %	50 %	55376217
605	NC_006391	CTG	3	9	29927	29935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
606	NC_006391	GAC	2	6	29992	29997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376218
607	NC_006391	CGCCA	2	10	29998	30007	20 %	0 %	20 %	60 %	55376218
608	NC_006391	CGACCT	2	12	30012	30023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376218
609	NC_006391	CAA	2	6	30055	30060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376218
610	NC_006391	CAG	2	6	30068	30073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376218
611	NC_006391	CGG	2	6	30174	30179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376218
612	NC_006391	GCG	2	6	30183	30188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376218
613	NC_006391	TCG	2	6	30218	30223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
614	NC_006391	ACG	2	6	30228	30233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376218
615	NC_006391	GTC	2	6	30245	30250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
616	NC_006391	CTG	2	6	30282	30287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
617	NC_006391	CAG	2	6	30314	30319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376218
618	NC_006391	CGGG	2	8	30324	30331	0 %	0 %	75 %	25 %	55376218
619	NC_006391	CGG	4	12	30340	30351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376218
620	NC_006391	GCT	2	6	30391	30396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
621	NC_006391	GCG	3	9	30401	30409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376218
622	NC_006391	CTG	2	6	30413	30418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
623	NC_006391	CTT	2	6	30640	30645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376219
624	NC_006391	CCT	2	6	30718	30723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376219
625	NC_006391	GCTG	2	8	30778	30785	0 %	25 %	50 %	25 %	55376219
626	NC_006391	TGA	2	6	30819	30824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376219
627	NC_006391	TGC	2	6	30876	30881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376219
628	NC_006391	GCCT	2	8	30885	30892	0 %	25 %	25 %	50 %	55376219
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630	NC_006391	TGG	2	6	30980	30985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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838	NC_006391	TGAC	2	8	39472	39479	25 %	25 %	25 %	25 %	55376227
839	NC_006391	CGC	2	6	39487	39492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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