MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG200

Total Repeats: 704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006390	AGAA	2	8	23	30	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006390	CAC	2	6	31	36	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_006390	TCG	2	6	42	47	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006390	CGC	2	6	70	75	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_006390	CA	3	6	79	84	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006390	CT	3	6	251	256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006390	AGG	2	6	441	446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376145
8	NC_006390	CCG	2	6	447	452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376145
9	NC_006390	CGA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376145
10	NC_006390	CCA	2	6	557	562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376145
11	NC_006390	GTG	2	6	607	612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376145
12	NC_006390	CCG	2	6	618	623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376145
13	NC_006390	GAG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376145
14	NC_006390	CGA	2	6	724	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376145
15	NC_006390	GTA	3	9	758	766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006390	CGG	2	6	780	785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006390	TGA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006390	AGCG	2	8	940	947	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006390	GCT	2	6	963	968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006390	CGT	2	6	1032	1037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006390	CAG	2	6	1058	1063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006390	TTCC	2	8	1114	1121	0 %	50 %	0 %	50 %	55376146
23	NC_006390	GAG	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376146
24	NC_006390	CCA	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376146
25	NC_006390	GAA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376146
26	NC_006390	AGC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376146
27	NC_006390	TGT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376146
28	NC_006390	CGG	2	6	1584	1589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006390	GT	3	6	1650	1655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006390	ACCA	2	8	1670	1677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006390	ATCGA	2	10	1720	1729	40 %	20 %	20 %	20 %	55376147
32	NC_006390	CTG	2	6	1730	1735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376147
33	NC_006390	GAA	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376147
34	NC_006390	CGA	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376147
35	NC_006390	GT	3	6	1867	1872	0 %	50 %	50 %	0 %	55376147
36	NC_006390	AAG	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376147
37	NC_006390	GAAC	2	8	2010	2017	50 %	0 %	25 %	25 %	55376147
38	NC_006390	ACA	2	6	2018	2023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376147
39	NC_006390	CG	3	6	2068	2073	0 %	0 %	50 %	50 %	55376147
40	NC_006390	GCA	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376147
41	NC_006390	CTC	2	6	2173	2178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376147
42	NC_006390	CGA	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376147
43	NC_006390	GTG	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376147
44	NC_006390	GGT	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376147
45	NC_006390	CGC	2	6	2235	2240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376147
46	NC_006390	GAG	2	6	2269	2274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376147
47	NC_006390	GC	3	6	2333	2338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006390	CTG	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006390	TCC	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376148
50	NC_006390	TGC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376148
51	NC_006390	T	6	6	2583	2588	0 %	100 %	0 %	0 %	55376148
52	NC_006390	ACG	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376148
53	NC_006390	CTT	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376148
54	NC_006390	TGG	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376148
55	NC_006390	TCT	2	6	2665	2670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376148
56	NC_006390	CAGA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	55376148
57	NC_006390	GGTCC	2	10	2714	2723	0 %	20 %	40 %	40 %	55376148
58	NC_006390	ACG	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376148
59	NC_006390	GTA	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376149
60	NC_006390	GTC	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
61	NC_006390	GTT	2	6	2787	2792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376149
62	NC_006390	CTG	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
63	NC_006390	TGC	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
64	NC_006390	GTCG	2	8	2833	2840	0 %	25 %	50 %	25 %	55376149
65	NC_006390	GTCG	2	8	2933	2940	0 %	25 %	50 %	25 %	55376149
66	NC_006390	TG	3	6	2958	2963	0 %	50 %	50 %	0 %	55376149
67	NC_006390	GCT	2	6	2982	2987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376149
68	NC_006390	A	6	6	2988	2993	100 %	0 %	0 %	0 %	55376149
69	NC_006390	GTA	2	6	3082	3087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006390	TAA	2	6	3103	3108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006390	TGC	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006390	TGC	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376150
73	NC_006390	CACT	2	8	3250	3257	25 %	25 %	0 %	50 %	55376150
74	NC_006390	CAC	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376150
75	NC_006390	TG	3	6	3286	3291	0 %	50 %	50 %	0 %	55376150
76	NC_006390	TC	3	6	3320	3325	0 %	50 %	0 %	50 %	55376150
77	NC_006390	CGA	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376150
78	NC_006390	CAA	2	6	3347	3352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376150
79	NC_006390	GATA	2	8	3383	3390	50 %	25 %	25 %	0 %	55376150
80	NC_006390	ATCT	2	8	3408	3415	25 %	50 %	0 %	25 %	55376150
81	NC_006390	CTT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376150
82	NC_006390	TAC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006390	TCA	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006390	GA	3	6	3564	3569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006390	AGA	2	6	3592	3597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006390	TG	3	6	3599	3604	0 %	50 %	50 %	0 %	55376151
87	NC_006390	CAC	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
88	NC_006390	CAG	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
89	NC_006390	CAC	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
90	NC_006390	CGA	2	6	3885	3890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
91	NC_006390	CGA	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
92	NC_006390	CAG	2	6	3972	3977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
93	NC_006390	CGAGAA	2	12	3978	3989	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	55376151
94	NC_006390	CACT	2	8	4160	4167	25 %	25 %	0 %	50 %	55376151
95	NC_006390	GTC	2	6	4195	4200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376151
96	NC_006390	TGA	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376151
97	NC_006390	ACC	3	9	4243	4251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
98	NC_006390	CGA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
99	NC_006390	CAC	2	6	4290	4295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376151
100	NC_006390	GAC	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
101	NC_006390	AGG	2	6	4469	4474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376151
102	NC_006390	GCCCAA	2	12	4522	4533	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	55376151
103	NC_006390	CGT	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376151
104	NC_006390	CGA	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376151
105	NC_006390	CTC	2	6	4690	4695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376151
106	NC_006390	GAT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376152
107	NC_006390	TCG	3	9	4868	4876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376152
108	NC_006390	GAT	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376152
109	NC_006390	GAT	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376152
110	NC_006390	AGC	2	6	4986	4991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
111	NC_006390	CCCG	2	8	5013	5020	0 %	0 %	25 %	75 %	55376152
112	NC_006390	TCG	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376152
113	NC_006390	CGA	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
114	NC_006390	GTT	2	6	5107	5112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376152
115	NC_006390	AGCGA	2	10	5148	5157	40 %	0 %	40 %	20 %	55376152
116	NC_006390	GAC	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
117	NC_006390	GAA	2	6	5272	5277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376152
118	NC_006390	CGA	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
119	NC_006390	CAG	2	6	5342	5347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
120	NC_006390	GAC	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376152
121	NC_006390	TAC	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376152
122	NC_006390	CGG	2	6	5606	5611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376153
123	NC_006390	TAG	2	6	5755	5760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006390	AG	3	6	5820	5825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006390	AAC	2	6	5830	5835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006390	GCT	2	6	5854	5859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376154
127	NC_006390	GTAGA	2	10	5908	5917	40 %	20 %	40 %	0 %	55376154
128	NC_006390	GTGG	2	8	5924	5931	0 %	25 %	75 %	0 %	55376154
129	NC_006390	TGA	2	6	5934	5939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376154
130	NC_006390	TGG	2	6	5970	5975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376154
131	NC_006390	TG	3	6	5999	6004	0 %	50 %	50 %	0 %	55376154
132	NC_006390	ATC	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376154
133	NC_006390	CGAGC	2	10	6104	6113	20 %	0 %	40 %	40 %	55376154
134	NC_006390	GTCG	2	8	6251	6258	0 %	25 %	50 %	25 %	55376154
135	NC_006390	AGT	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376154
136	NC_006390	CACT	2	8	6388	6395	25 %	25 %	0 %	50 %	55376155
137	NC_006390	CAG	2	6	6452	6457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376155
138	NC_006390	TCT	2	6	6499	6504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376155
139	NC_006390	TGA	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376155
140	NC_006390	CAGT	2	8	6539	6546	25 %	25 %	25 %	25 %	55376155
141	NC_006390	TCG	2	6	6547	6552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376155
142	NC_006390	GGGT	2	8	6719	6726	0 %	25 %	75 %	0 %	55376155
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144	NC_006390	CTG	2	6	6777	6782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376155
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146	NC_006390	AT	3	6	6881	6886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006390	CCA	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_006390	TGA	2	6	7051	7056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006390	CTT	2	6	7132	7137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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267	NC_006390	TAT	2	6	12631	12636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376162
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270	NC_006390	TCG	2	6	12718	12723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376162
271	NC_006390	CGA	2	6	12757	12762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376162
272	NC_006390	AG	3	6	12809	12814	50 %	0 %	50 %	0 %	55376162
273	NC_006390	ATC	2	6	12911	12916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376162
274	NC_006390	GA	4	8	13013	13020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
275	NC_006390	CAATGC	2	12	13034	13045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_006390	TCA	2	6	13063	13068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_006390	TGC	2	6	13109	13114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376163
278	NC_006390	CGA	2	6	13168	13173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376163
279	NC_006390	GTT	2	6	13217	13222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376163
280	NC_006390	CGA	2	6	13234	13239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376163
281	NC_006390	TTG	2	6	13353	13358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376163
282	NC_006390	GTC	2	6	13395	13400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376163
283	NC_006390	GTTTGA	2	12	13423	13434	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	55376163
284	NC_006390	AAT	2	6	13472	13477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376163
285	NC_006390	ACC	2	6	13499	13504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376163
286	NC_006390	ATC	2	6	13553	13558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376163
287	NC_006390	GAG	2	6	13596	13601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376163
288	NC_006390	CCA	2	6	13623	13628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376163
289	NC_006390	TCG	2	6	13667	13672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376163
290	NC_006390	CCA	2	6	13708	13713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_006390	TGG	2	6	13887	13892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376164
292	NC_006390	GTG	3	9	13904	13912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376164
293	NC_006390	GTG	2	6	14063	14068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376164
294	NC_006390	TGG	2	6	14079	14084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376164
295	NC_006390	CGGA	2	8	14138	14145	25 %	0 %	50 %	25 %	55376164
296	NC_006390	TTG	2	6	14225	14230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376164
297	NC_006390	ACG	2	6	14234	14239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376164
298	NC_006390	CGA	2	6	14256	14261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376164
299	NC_006390	CCT	2	6	14379	14384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376164
300	NC_006390	AGG	2	6	14394	14399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376164
301	NC_006390	TGA	3	9	14415	14423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376164
302	NC_006390	GTG	2	6	14453	14458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376164
303	NC_006390	TCAA	2	8	14612	14619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
304	NC_006390	GTC	2	6	14706	14711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376165
305	NC_006390	AGT	2	6	14777	14782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376165
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309	NC_006390	TCG	2	6	14967	14972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376165
310	NC_006390	AGGGGT	2	12	15008	15019	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55376165
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312	NC_006390	GTT	2	6	15146	15151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376165
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374	NC_006390	CT	3	6	17554	17559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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376	NC_006390	GAC	2	6	17691	17696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
377	NC_006390	TCT	2	6	17733	17738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
378	NC_006390	TG	3	6	17770	17775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
379	NC_006390	ACGT	2	8	17811	17818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
380	NC_006390	CGA	2	6	17962	17967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376166
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383	NC_006390	CA	3	6	18281	18286	50 %	0 %	0 %	50 %	55376167
384	NC_006390	CAGCC	2	10	18344	18353	20 %	0 %	20 %	60 %	55376167
385	NC_006390	CGC	2	6	18375	18380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376167
386	NC_006390	CTC	2	6	18398	18403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376168
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389	NC_006390	AGT	2	6	18553	18558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376168
390	NC_006390	CCA	2	6	18596	18601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376168
391	NC_006390	TG	3	6	18604	18609	0 %	50 %	50 %	0 %	55376168
392	NC_006390	GTC	4	12	18623	18634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376168
393	NC_006390	GAA	2	6	18677	18682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376168
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395	NC_006390	CGCC	2	8	18777	18784	0 %	0 %	25 %	75 %	55376168
396	NC_006390	TTG	2	6	18805	18810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376168
397	NC_006390	TCG	2	6	19018	19023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376169
398	NC_006390	TCG	2	6	19027	19032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376169
399	NC_006390	TTCG	2	8	19040	19047	0 %	50 %	25 %	25 %	55376169
400	NC_006390	GCT	2	6	19061	19066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376169
401	NC_006390	AC	3	6	19084	19089	50 %	0 %	0 %	50 %	55376169
402	NC_006390	CCG	2	6	19090	19095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376169
403	NC_006390	GCC	2	6	19119	19124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376169
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432	NC_006390	TAGA	2	8	20571	20578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_006390	GCC	2	6	21091	21096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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452	NC_006390	GCTGGC	2	12	21228	21239	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_006390	CGT	2	6	21285	21290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_006390	T	6	6	21324	21329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_006390	GTCA	2	8	23465	23472	25 %	25 %	25 %	25 %	55376176
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