MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome

Total Repeats: 39005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004917	TTTA	2	8	33	40	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004917	ACATA	2	10	44	53	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_004917	A	6	6	57	62	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004917	TAAATA	2	12	111	122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004917	T	6	6	173	178	0 %	100 %	0 %	0 %	32265500
6	NC_004917	T	6	6	203	208	0 %	100 %	0 %	0 %	32265500
7	NC_004917	GA	3	6	268	273	50 %	0 %	50 %	0 %	32265500
8	NC_004917	AAT	2	6	336	341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265500
9	NC_004917	TTC	2	6	380	385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32265500
10	NC_004917	TC	3	6	393	398	0 %	50 %	0 %	50 %	32265500
11	NC_004917	CT	3	6	513	518	0 %	50 %	0 %	50 %	32265500
12	NC_004917	TAA	3	9	533	541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265500
13	NC_004917	TGC	2	6	542	547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32265500
14	NC_004917	ATT	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265500
15	NC_004917	A	6	6	574	579	100 %	0 %	0 %	0 %	32265500
16	NC_004917	TCA	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265500
17	NC_004917	ATA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265500
18	NC_004917	ATA	2	6	712	717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265500
19	NC_004917	TA	3	6	802	807	50 %	50 %	0 %	0 %	32265500
20	NC_004917	ATTA	2	8	855	862	50 %	50 %	0 %	0 %	32265500
21	NC_004917	TGG	2	6	896	901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32265500
22	NC_004917	TGG	2	6	933	938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32265500
23	NC_004917	ATG	2	6	943	948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265500
24	NC_004917	TGG	2	6	983	988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32265500
25	NC_004917	TTA	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265500
26	NC_004917	TGG	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32265500
27	NC_004917	GGA	2	6	1092	1097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32265500
28	NC_004917	AAC	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32265500
29	NC_004917	TAA	2	6	1112	1117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265500
30	NC_004917	TGG	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32265500
31	NC_004917	CAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32265500
32	NC_004917	TAA	2	6	1355	1360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265500
33	NC_004917	ACA	2	6	1463	1468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32265500
34	NC_004917	ATA	2	6	1516	1521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265500
35	NC_004917	AT	3	6	1567	1572	50 %	50 %	0 %	0 %	32265500
36	NC_004917	TAT	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265500
37	NC_004917	TGC	2	6	1754	1759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32265500
38	NC_004917	AT	3	6	1859	1864	50 %	50 %	0 %	0 %	32265500
39	NC_004917	ACA	2	6	1930	1935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32265500
40	NC_004917	ACC	2	6	2091	2096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32265500
41	NC_004917	CA	3	6	2153	2158	50 %	0 %	0 %	50 %	32265500
42	NC_004917	TAC	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265500
43	NC_004917	A	6	6	2174	2179	100 %	0 %	0 %	0 %	32265500
44	NC_004917	GGA	2	6	2196	2201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32265500
45	NC_004917	TGG	2	6	2306	2311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32265500
46	NC_004917	TC	3	6	2335	2340	0 %	50 %	0 %	50 %	32265500
47	NC_004917	CAAT	2	8	2398	2405	50 %	25 %	0 %	25 %	32265500
48	NC_004917	ATT	2	6	2413	2418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265500
49	NC_004917	CTT	2	6	2451	2456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004917	ATA	3	9	2474	2482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004917	CAAAG	2	10	2566	2575	60 %	0 %	20 %	20 %	32265501
52	NC_004917	T	6	6	2613	2618	0 %	100 %	0 %	0 %	32265501
53	NC_004917	GGA	2	6	2751	2756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32265501
54	NC_004917	GTTA	2	8	2847	2854	25 %	50 %	25 %	0 %	32265501
55	NC_004917	TGC	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32265501
56	NC_004917	CAC	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32265501
57	NC_004917	CAC	2	6	3022	3027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32265501
58	NC_004917	ATC	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265501
59	NC_004917	ACT	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265501
60	NC_004917	ACT	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265501
61	NC_004917	TC	3	6	3240	3245	0 %	50 %	0 %	50 %	32265501
62	NC_004917	TGA	2	6	3368	3373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265501
63	NC_004917	A	6	6	3394	3399	100 %	0 %	0 %	0 %	32265501
64	NC_004917	TAA	2	6	3517	3522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265501
65	NC_004917	ATG	2	6	3523	3528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265501
66	NC_004917	AT	3	6	3619	3624	50 %	50 %	0 %	0 %	32265501
67	NC_004917	T	6	6	3652	3657	0 %	100 %	0 %	0 %	32265501
68	NC_004917	GGT	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32265501
69	NC_004917	GA	3	6	3801	3806	50 %	0 %	50 %	0 %	32265501
70	NC_004917	AGG	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32265501
71	NC_004917	AATC	2	8	3827	3834	50 %	25 %	0 %	25 %	32265501
72	NC_004917	CA	3	6	3835	3840	50 %	0 %	0 %	50 %	32265501
73	NC_004917	T	6	6	3851	3856	0 %	100 %	0 %	0 %	32265501
74	NC_004917	AAG	2	6	3901	3906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32265501
75	NC_004917	A	7	7	3911	3917	100 %	0 %	0 %	0 %	32265501
76	NC_004917	A	6	6	3953	3958	100 %	0 %	0 %	0 %	32265501
77	NC_004917	A	7	7	3989	3995	100 %	0 %	0 %	0 %	32265501
78	NC_004917	GGCG	2	8	4069	4076	0 %	0 %	75 %	25 %	32265502
79	NC_004917	TA	3	6	4098	4103	50 %	50 %	0 %	0 %	32265502
80	NC_004917	AAG	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32265502
81	NC_004917	ATA	2	6	4275	4280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265502
82	NC_004917	ATCTC	2	10	4299	4308	20 %	40 %	0 %	40 %	32265502
83	NC_004917	TAA	2	6	4315	4320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265502
84	NC_004917	TTC	2	6	4354	4359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32265502
85	NC_004917	GGA	2	6	4372	4377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32265502
86	NC_004917	CTG	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32265502
87	NC_004917	A	7	7	4443	4449	100 %	0 %	0 %	0 %	32265502
88	NC_004917	TA	3	6	4533	4538	50 %	50 %	0 %	0 %	32265502
89	NC_004917	TCGC	2	8	4573	4580	0 %	25 %	25 %	50 %	32265502
90	NC_004917	AAC	2	6	4644	4649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32265502
91	NC_004917	CA	3	6	4699	4704	50 %	0 %	0 %	50 %	32265502
92	NC_004917	TAT	2	6	4751	4756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265502
93	NC_004917	CAA	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32265502
94	NC_004917	TAAA	2	8	5030	5037	75 %	25 %	0 %	0 %	32265502
95	NC_004917	TGA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265503
96	NC_004917	TAG	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265503
97	NC_004917	TAA	3	9	5180	5188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265503
98	NC_004917	TGT	2	6	5213	5218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32265503
99	NC_004917	TCT	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32265503
100	NC_004917	T	6	6	5327	5332	0 %	100 %	0 %	0 %	32265503
101	NC_004917	T	7	7	5370	5376	0 %	100 %	0 %	0 %	32265503
102	NC_004917	TTC	2	6	5380	5385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32265503
103	NC_004917	AT	3	6	5411	5416	50 %	50 %	0 %	0 %	32265503
104	NC_004917	A	6	6	5452	5457	100 %	0 %	0 %	0 %	32265503
105	NC_004917	TAT	3	9	5496	5504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265503
106	NC_004917	GAGCAA	2	12	5526	5537	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32265503
107	NC_004917	TCA	2	6	5555	5560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265503
108	NC_004917	TGA	3	9	5567	5575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265503
109	NC_004917	ATC	2	6	5584	5589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265503
110	NC_004917	C	6	6	5612	5617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_004917	TACTC	2	10	5629	5638	20 %	40 %	0 %	40 %	32265504
112	NC_004917	AT	3	6	5641	5646	50 %	50 %	0 %	0 %	32265504
113	NC_004917	TCT	2	6	5838	5843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32265504
114	NC_004917	T	6	6	5919	5924	0 %	100 %	0 %	0 %	32265504
115	NC_004917	T	7	7	5962	5968	0 %	100 %	0 %	0 %	32265504
116	NC_004917	TTC	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32265504
117	NC_004917	AT	3	6	6003	6008	50 %	50 %	0 %	0 %	32265504
118	NC_004917	A	6	6	6044	6049	100 %	0 %	0 %	0 %	32265504
119	NC_004917	T	6	6	6063	6068	0 %	100 %	0 %	0 %	32265504
120	NC_004917	AGC	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32265504
121	NC_004917	GAGCAA	2	12	6115	6126	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32265504
122	NC_004917	TCA	2	6	6144	6149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265504
123	NC_004917	TGA	3	9	6156	6164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265504
124	NC_004917	ATC	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265504
125	NC_004917	CTA	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_004917	ATT	2	6	6215	6220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004917	TAAT	2	8	6258	6265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004917	GAT	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265505
129	NC_004917	T	6	6	6342	6347	0 %	100 %	0 %	0 %	32265505
130	NC_004917	AAG	2	6	6381	6386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32265505
131	NC_004917	ACA	2	6	6445	6450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32265505
132	NC_004917	ATA	2	6	6463	6468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265505
133	NC_004917	TCA	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265505
134	NC_004917	AT	3	6	6596	6601	50 %	50 %	0 %	0 %	32265505
135	NC_004917	AT	3	6	6613	6618	50 %	50 %	0 %	0 %	32265505
136	NC_004917	AAGAT	2	10	6624	6633	60 %	20 %	20 %	0 %	32265505
137	NC_004917	CT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	0 %	50 %	32265505
138	NC_004917	ACACGC	2	12	6760	6771	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	32265505
139	NC_004917	T	7	7	6785	6791	0 %	100 %	0 %	0 %	32265505
140	NC_004917	ATAA	2	8	6847	6854	75 %	25 %	0 %	0 %	32265505
141	NC_004917	C	6	6	6855	6860	0 %	0 %	0 %	100 %	32265505
142	NC_004917	TCA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265505
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144	NC_004917	T	6	6	6923	6928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004917	ATGAG	2	10	7001	7010	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004917	TTTA	2	8	7061	7068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004917	AT	3	6	7086	7091	50 %	50 %	0 %	0 %	32265506
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161	NC_004917	C	10	10	7738	7747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
162	NC_004917	AAAAT	2	10	7777	7786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_004917	AAT	2	6	7799	7804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_004917	TAT	2	6	11272	11277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_004917	ATT	2	6	12808	12813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265512
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267	NC_004917	A	6	6	13158	13163	100 %	0 %	0 %	0 %	32265512
268	NC_004917	A	8	8	13257	13264	100 %	0 %	0 %	0 %	32265512
269	NC_004917	GGA	2	6	13347	13352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32265513
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273	NC_004917	A	7	7	13441	13447	100 %	0 %	0 %	0 %	32265513
274	NC_004917	GAA	2	6	13467	13472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32265513
275	NC_004917	ATG	2	6	13477	13482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265513
276	NC_004917	AACA	2	8	13516	13523	75 %	0 %	0 %	25 %	32265513
277	NC_004917	CTC	2	6	13560	13565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32265513
278	NC_004917	AAG	2	6	13570	13575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32265513
279	NC_004917	TGA	2	6	13580	13585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265513
280	NC_004917	AAG	3	9	13597	13605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32265513
281	NC_004917	TGC	2	6	13685	13690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32265513
282	NC_004917	TAA	2	6	13718	13723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265513
283	NC_004917	TAA	2	6	13730	13735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265513
284	NC_004917	GTG	2	6	13831	13836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32265513
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287	NC_004917	TGA	2	6	14031	14036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265514
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290	NC_004917	CCA	2	6	14161	14166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32265514
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292	NC_004917	TGG	2	6	14241	14246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32265514
293	NC_004917	TGA	2	6	14352	14357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265514
294	NC_004917	TAA	2	6	14370	14375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265514
295	NC_004917	GAT	2	6	14425	14430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265514
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297	NC_004917	TGA	2	6	14667	14672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265514
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304	NC_004917	TTTA	2	8	15201	15208	25 %	75 %	0 %	0 %	32265515
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307	NC_004917	TGTA	2	8	15321	15328	25 %	50 %	25 %	0 %	32265515
308	NC_004917	TAT	2	6	15368	15373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265515
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313	NC_004917	GTT	2	6	15614	15619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32265515
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320	NC_004917	GATT	2	8	16026	16033	25 %	50 %	25 %	0 %	32265515
321	NC_004917	T	7	7	16053	16059	0 %	100 %	0 %	0 %	32265515
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334	NC_004917	AAT	2	6	16557	16562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265515
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338	NC_004917	CCT	2	6	16679	16684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
339	NC_004917	TTTG	2	8	16721	16728	0 %	75 %	25 %	0 %	32265516
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369	NC_004917	TTG	2	6	18235	18240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
370	NC_004917	A	8	8	18281	18288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
371	NC_004917	ATC	2	6	18309	18314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
372	NC_004917	ATA	2	6	18330	18335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_004917	A	6	6	18741	18746	100 %	0 %	0 %	0 %	32265517
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381	NC_004917	GCAAA	2	10	18904	18913	60 %	0 %	20 %	20 %	32265518
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383	NC_004917	AAAC	2	8	18953	18960	75 %	0 %	0 %	25 %	32265518
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390	NC_004917	A	6	6	19287	19292	100 %	0 %	0 %	0 %	32265518
391	NC_004917	A	6	6	19308	19313	100 %	0 %	0 %	0 %	32265518
392	NC_004917	TCA	2	6	19325	19330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265518
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397	NC_004917	GCT	2	6	19491	19496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32265518
398	NC_004917	A	6	6	19516	19521	100 %	0 %	0 %	0 %	32265518
399	NC_004917	TAT	2	6	19544	19549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265518
400	NC_004917	ATG	2	6	19554	19559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265518
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402	NC_004917	ACAAGA	2	12	19586	19597	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32265518
403	NC_004917	A	6	6	19626	19631	100 %	0 %	0 %	0 %	32265518
404	NC_004917	ATG	2	6	19662	19667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265518
405	NC_004917	ATT	2	6	19689	19694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265518
406	NC_004917	GAT	2	6	19719	19724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265518
407	NC_004917	TCC	2	6	19817	19822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32265518
408	NC_004917	ACA	2	6	19850	19855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32265518
409	NC_004917	AG	3	6	19863	19868	50 %	0 %	50 %	0 %	32265518
410	NC_004917	TC	3	6	19881	19886	0 %	50 %	0 %	50 %	32265518
411	NC_004917	A	7	7	19913	19919	100 %	0 %	0 %	0 %	32265518
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451	NC_004917	AT	3	6	21715	21720	50 %	50 %	0 %	0 %	32265519
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