MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 8557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_002608	TGA	2	6	363377	363382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120350
8502	NC_002608	GTC	2	6	363384	363389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120350
8503	NC_002608	TCG	2	6	363439	363444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120350
8504	NC_002608	AT	3	6	363449	363454	50 %	50 %	0 %	0 %	16120350
8505	NC_002608	AGC	2	6	363467	363472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120350
8506	NC_002608	ACT	2	6	363474	363479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120350
8507	NC_002608	GCA	2	6	363532	363537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120350
8508	NC_002608	CGA	2	6	363629	363634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120350
8509	NC_002608	CTA	3	9	363725	363733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120350
8510	NC_002608	ACG	2	6	363736	363741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120350
8511	NC_002608	TGAAAT	2	12	363815	363826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16120350
8512	NC_002608	CGG	2	6	363830	363835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120350
8513	NC_002608	TGC	2	6	363853	363858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120350
8514	NC_002608	GGAG	2	8	363959	363966	25 %	0 %	75 %	0 %	16120350
8515	NC_002608	TGA	2	6	364022	364027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120350
8516	NC_002608	ATC	2	6	364032	364037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120350
8517	NC_002608	TCTGT	2	10	364079	364088	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8518	NC_002608	GTC	2	6	364097	364102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_002608	GCTGTC	2	12	364136	364147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_002608	GGC	2	6	364148	364153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_002608	GCC	2	6	364159	364164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8522	NC_002608	GGTG	2	8	364203	364210	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_002608	GTC	2	6	364227	364232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_002608	TGG	2	6	364233	364238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_002608	CCA	3	9	364320	364328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8526	NC_002608	CGCC	2	8	364336	364343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8527	NC_002608	CGGCG	2	10	364345	364354	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8528	NC_002608	CAG	2	6	364398	364403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_002608	CAC	2	6	364407	364412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8530	NC_002608	CAG	2	6	364419	364424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_002608	CGT	2	6	364443	364448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_002608	GTC	2	6	364450	364455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_002608	CTCGA	2	10	364483	364492	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8534	NC_002608	AGT	2	6	364508	364513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_002608	GCG	2	6	364555	364560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_002608	TCG	2	6	364585	364590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_002608	CCGT	2	8	364593	364600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8538	NC_002608	GTAC	2	8	364605	364612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8539	NC_002608	CTG	2	6	364710	364715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_002608	GAT	2	6	364734	364739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_002608	CTG	2	6	364873	364878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_002608	TTC	2	6	364927	364932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_002608	CG	3	6	364936	364941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8544	NC_002608	GGT	2	6	364968	364973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_002608	GTC	2	6	365010	365015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_002608	TCA	2	6	365017	365022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_002608	GTA	2	6	365025	365030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_002608	CGA	2	6	365081	365086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_002608	GAA	2	6	365096	365101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_002608	GAT	2	6	365150	365155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_002608	CGG	2	6	365222	365227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_002608	CGA	2	6	365234	365239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_002608	GTT	2	6	365274	365279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_002608	GA	3	6	365289	365294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_002608	TGCT	2	8	365358	365365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8556	NC_002608	AGCA	2	8	365384	365391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8557	NC_002608	CTAA	2	8	365398	365405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.