MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 8557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_002608	GCC	2	6	342488	342493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120324
8002	NC_002608	TCG	2	6	342498	342503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120324
8003	NC_002608	CGA	2	6	342664	342669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120325
8004	NC_002608	CGC	2	6	342715	342720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120325
8005	NC_002608	TCG	2	6	342753	342758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120325
8006	NC_002608	CGA	2	6	342805	342810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120325
8007	NC_002608	ACG	2	6	342864	342869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120325
8008	NC_002608	CGT	2	6	342886	342891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120325
8009	NC_002608	GTA	2	6	342977	342982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_002608	CA	3	6	343016	343021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8011	NC_002608	TAC	2	6	343023	343028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_002608	CGC	2	6	343063	343068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_002608	GAA	2	6	343137	343142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_002608	GTA	2	6	343296	343301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120326
8015	NC_002608	GCC	2	6	343302	343307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120326
8016	NC_002608	GGA	2	6	343349	343354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120326
8017	NC_002608	TCG	2	6	343411	343416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120326
8018	NC_002608	CGA	2	6	343439	343444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120326
8019	NC_002608	CAG	2	6	343494	343499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120326
8020	NC_002608	GTT	2	6	343526	343531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120326
8021	NC_002608	GTC	2	6	343699	343704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8022	NC_002608	CAC	2	6	343737	343742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120327
8023	NC_002608	ACG	3	9	343745	343753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8024	NC_002608	GGC	2	6	343825	343830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120327
8025	NC_002608	TCG	2	6	343857	343862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8026	NC_002608	GTC	2	6	343879	343884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8027	NC_002608	TCG	2	6	343886	343891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8028	NC_002608	GC	4	8	343918	343925	0 %	0 %	50 %	50 %	16120327
8029	NC_002608	GC	3	6	343929	343934	0 %	0 %	50 %	50 %	16120327
8030	NC_002608	AGC	2	6	343943	343948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8031	NC_002608	CGA	2	6	343968	343973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8032	NC_002608	GGA	2	6	344025	344030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120327
8033	NC_002608	CGATGG	2	12	344040	344051	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16120327
8034	NC_002608	CAT	2	6	344074	344079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120327
8035	NC_002608	GCC	3	9	344098	344106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120327
8036	NC_002608	CGA	2	6	344133	344138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8037	NC_002608	GAT	2	6	344155	344160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120327
8038	NC_002608	GGA	2	6	344201	344206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120327
8039	NC_002608	CAG	2	6	344299	344304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8040	NC_002608	TGA	2	6	344322	344327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120327
8041	NC_002608	CGA	2	6	344361	344366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8042	NC_002608	ATG	2	6	344408	344413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120327
8043	NC_002608	GC	3	6	344457	344462	0 %	0 %	50 %	50 %	16120327
8044	NC_002608	AGT	2	6	344534	344539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120327
8045	NC_002608	GAA	2	6	344572	344577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16120327
8046	NC_002608	AACCCG	2	12	344600	344611	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	16120327
8047	NC_002608	GAA	2	6	344614	344619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16120327
8048	NC_002608	AGC	2	6	344627	344632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120327
8049	NC_002608	GGA	2	6	344727	344732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120328
8050	NC_002608	CTG	2	6	344766	344771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120328
8051	NC_002608	CGGT	2	8	344778	344785	0 %	25 %	50 %	25 %	16120328
8052	NC_002608	ATC	2	6	344804	344809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120328
8053	NC_002608	GAC	2	6	344900	344905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_002608	GCA	2	6	344924	344929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_002608	AG	3	6	344971	344976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_002608	GCGCAG	2	12	345041	345052	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16120329
8057	NC_002608	TCC	2	6	345085	345090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120329
8058	NC_002608	ACT	2	6	345103	345108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120329
8059	NC_002608	GCT	2	6	345151	345156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8060	NC_002608	CCG	2	6	345242	345247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120329
8061	NC_002608	TCA	2	6	345284	345289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120329
8062	NC_002608	CGA	2	6	345359	345364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8063	NC_002608	CGCCCG	2	12	345380	345391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120329
8064	NC_002608	ACG	2	6	345409	345414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8065	NC_002608	CGG	2	6	345421	345426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120329
8066	NC_002608	C	6	6	345444	345449	0 %	0 %	0 %	100 %	16120329
8067	NC_002608	GGA	2	6	345461	345466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120329
8068	NC_002608	CGA	3	9	345488	345496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8069	NC_002608	CCG	2	6	345503	345508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120329
8070	NC_002608	CGA	2	6	345566	345571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8071	NC_002608	GGCC	2	8	345584	345591	0 %	0 %	50 %	50 %	16120329
8072	NC_002608	GCC	2	6	345595	345600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120329
8073	NC_002608	CG	3	6	345627	345632	0 %	0 %	50 %	50 %	16120329
8074	NC_002608	CGT	2	6	345662	345667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8075	NC_002608	GGT	2	6	345668	345673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120329
8076	NC_002608	CGT	2	6	345674	345679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8077	NC_002608	ACG	2	6	345745	345750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8078	NC_002608	TCG	2	6	345853	345858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8079	NC_002608	CAG	2	6	345948	345953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8080	NC_002608	GAT	2	6	345999	346004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120329
8081	NC_002608	GAC	2	6	346116	346121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8082	NC_002608	TCC	2	6	346162	346167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120329
8083	NC_002608	GAC	2	6	346179	346184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120329
8084	NC_002608	GTT	2	6	346314	346319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120330
8085	NC_002608	TCC	2	6	346345	346350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120330
8086	NC_002608	CGG	2	6	346401	346406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120330
8087	NC_002608	CTC	2	6	346431	346436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120330
8088	NC_002608	GTC	2	6	346464	346469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120330
8089	NC_002608	GGC	2	6	346497	346502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120330
8090	NC_002608	CGG	2	6	346506	346511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120330
8091	NC_002608	TCA	2	6	346552	346557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120330
8092	NC_002608	GCC	2	6	346696	346701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120330
8093	NC_002608	AGCG	2	8	346815	346822	25 %	0 %	50 %	25 %	16120330
8094	NC_002608	TGG	2	6	346831	346836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120330
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8101	NC_002608	CGTC	2	8	347120	347127	0 %	25 %	25 %	50 %	16120330
8102	NC_002608	CGT	2	6	347138	347143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120330
8103	NC_002608	GGA	2	6	347156	347161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120330
8104	NC_002608	GAC	2	6	347181	347186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120330
8105	NC_002608	GTC	2	6	347229	347234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120330
8106	NC_002608	GTC	2	6	347259	347264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120330
8107	NC_002608	TCG	2	6	347272	347277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120330
8108	NC_002608	TCT	2	6	347323	347328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120330
8109	NC_002608	CAT	3	9	347357	347365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120330
8110	NC_002608	ACG	2	6	347621	347626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120331
8111	NC_002608	GAC	2	6	347629	347634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120331
8112	NC_002608	CGA	2	6	347641	347646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120331
8113	NC_002608	ACT	2	6	347647	347652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120331
8114	NC_002608	CGA	2	6	347653	347658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120331
8115	NC_002608	CGG	2	6	347691	347696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120331
8116	NC_002608	CGT	2	6	347713	347718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120331
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8118	NC_002608	GAG	2	6	347768	347773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120331
8119	NC_002608	CGA	2	6	347796	347801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120331
8120	NC_002608	GTC	2	6	347831	347836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120331
8121	NC_002608	AG	3	6	347888	347893	50 %	0 %	50 %	0 %	16120331
8122	NC_002608	CTC	2	6	347900	347905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120331
8123	NC_002608	GTT	2	6	347965	347970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120331
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8126	NC_002608	TCGC	2	8	348081	348088	0 %	25 %	25 %	50 %	16120331
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8194	NC_002608	GCG	2	6	350524	350529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120335
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8196	NC_002608	TCG	2	6	350589	350594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
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8202	NC_002608	GC	3	6	350740	350745	0 %	0 %	50 %	50 %	16120335
8203	NC_002608	CGT	2	6	350746	350751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
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8206	NC_002608	GTC	2	6	350819	350824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
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8209	NC_002608	TGG	2	6	350878	350883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120335
8210	NC_002608	GCG	2	6	350913	350918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120335
8211	NC_002608	GTC	2	6	350919	350924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
8212	NC_002608	GTC	2	6	350927	350932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
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8221	NC_002608	GCA	2	6	351184	351189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120335
8222	NC_002608	CGT	2	6	351202	351207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
8223	NC_002608	CTTCGA	2	12	351211	351222	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16120335
8224	NC_002608	CGT	2	6	351226	351231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
8225	NC_002608	GC	3	6	351236	351241	0 %	0 %	50 %	50 %	16120335
8226	NC_002608	GGT	2	6	351265	351270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120335
8227	NC_002608	CGT	2	6	351274	351279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
8228	NC_002608	CGA	2	6	351304	351309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120335
8229	NC_002608	GCC	2	6	351320	351325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120335
8230	NC_002608	GTC	2	6	351353	351358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
8231	NC_002608	TCG	2	6	351381	351386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
8232	NC_002608	GTC	2	6	351389	351394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
8233	NC_002608	GACGT	2	10	351426	351435	20 %	20 %	40 %	20 %	16120335
8234	NC_002608	GAG	2	6	351485	351490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120335
8235	NC_002608	GTC	2	6	351572	351577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120335
8236	NC_002608	AGT	2	6	351741	351746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8237	NC_002608	AGAC	2	8	351810	351817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8238	NC_002608	AGT	2	6	351898	351903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120336
8239	NC_002608	CGA	2	6	351922	351927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120336
8240	NC_002608	GACT	2	8	351961	351968	25 %	25 %	25 %	25 %	16120336
8241	NC_002608	TCG	2	6	352023	352028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120336
8242	NC_002608	AGG	2	6	352032	352037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120336
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8494	NC_002608	TTC	2	6	362906	362911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120349
8495	NC_002608	ATC	2	6	362937	362942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8496	NC_002608	ACT	2	6	363019	363024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8497	NC_002608	CAG	2	6	363089	363094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8498	NC_002608	ATTC	2	8	363117	363124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8499	NC_002608	CAAA	2	8	363137	363144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8500	NC_002608	TCA	2	6	363251	363256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120350

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