MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 8557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_002608	CAG	2	6	319421	319426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120295
7502	NC_002608	TGA	2	6	319682	319687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120296
7503	NC_002608	GTTT	2	8	319688	319695	0 %	75 %	25 %	0 %	16120296
7504	NC_002608	CTC	2	6	319710	319715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120296
7505	NC_002608	TTC	2	6	319791	319796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120296
7506	NC_002608	TTC	2	6	319800	319805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120296
7507	NC_002608	AGA	2	6	319867	319872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16120297
7508	NC_002608	CTC	2	6	319898	319903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120297
7509	NC_002608	TCA	2	6	319914	319919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120297
7510	NC_002608	AAC	2	6	319923	319928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16120297
7511	NC_002608	CTT	2	6	319933	319938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120297
7512	NC_002608	TCG	2	6	319989	319994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120297
7513	NC_002608	GC	3	6	320033	320038	0 %	0 %	50 %	50 %	16120297
7514	NC_002608	TTCG	2	8	320192	320199	0 %	50 %	25 %	25 %	16120297
7515	NC_002608	AGT	2	6	320284	320289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120297
7516	NC_002608	CGAGG	2	10	320303	320312	20 %	0 %	60 %	20 %	16120297
7517	NC_002608	GAG	2	6	320327	320332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120297
7518	NC_002608	GA	3	6	320364	320369	50 %	0 %	50 %	0 %	16120297
7519	NC_002608	CGC	2	6	320382	320387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120297
7520	NC_002608	TGCCGG	2	12	320444	320455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16120297
7521	NC_002608	GTCC	2	8	320459	320466	0 %	25 %	25 %	50 %	16120297
7522	NC_002608	AG	3	6	320531	320536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_002608	GAG	2	6	320597	320602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_002608	GCC	2	6	320633	320638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7525	NC_002608	GATC	2	8	320678	320685	25 %	25 %	25 %	25 %	16120298
7526	NC_002608	TCA	2	6	320700	320705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120298
7527	NC_002608	CGT	2	6	320880	320885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120298
7528	NC_002608	TCA	2	6	320889	320894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120298
7529	NC_002608	ACC	2	6	320922	320927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120298
7530	NC_002608	GCT	2	6	320977	320982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120298
7531	NC_002608	ACG	2	6	321127	321132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120298
7532	NC_002608	GATATC	2	12	321170	321181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16120298
7533	NC_002608	AGG	2	6	321189	321194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120298
7534	NC_002608	GGCC	2	8	321354	321361	0 %	0 %	50 %	50 %	16120298
7535	NC_002608	TGA	2	6	321415	321420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120298
7536	NC_002608	TGC	2	6	321502	321507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120298
7537	NC_002608	ACGA	2	8	321516	321523	50 %	0 %	25 %	25 %	16120298
7538	NC_002608	CG	3	6	321770	321775	0 %	0 %	50 %	50 %	16120299
7539	NC_002608	CCA	2	6	321793	321798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120299
7540	NC_002608	CGA	2	6	321881	321886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120299
7541	NC_002608	CGT	2	6	321899	321904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120299
7542	NC_002608	TGG	2	6	321910	321915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120299
7543	NC_002608	GGGT	2	8	321967	321974	0 %	25 %	75 %	0 %	16120299
7544	NC_002608	GCG	2	6	322025	322030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120299
7545	NC_002608	CGA	2	6	322049	322054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120299
7546	NC_002608	CTG	2	6	322059	322064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120299
7547	NC_002608	CGGC	2	8	322092	322099	0 %	0 %	50 %	50 %	16120300
7548	NC_002608	GTG	2	6	322146	322151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120300
7549	NC_002608	GCTCG	2	10	322154	322163	0 %	20 %	40 %	40 %	16120300
7550	NC_002608	GAC	2	6	322196	322201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120300
7551	NC_002608	CGA	2	6	322210	322215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120300
7552	NC_002608	GTC	2	6	322244	322249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120300
7553	NC_002608	CCG	2	6	322255	322260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120300
7554	NC_002608	TGG	2	6	322270	322275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120300
7555	NC_002608	TTCT	2	8	322298	322305	0 %	75 %	0 %	25 %	16120300
7556	NC_002608	GTC	2	6	322331	322336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120300
7557	NC_002608	CG	3	6	322382	322387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7558	NC_002608	CGT	2	6	322526	322531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120301
7559	NC_002608	CAC	2	6	322614	322619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120301
7560	NC_002608	CGGC	2	8	322641	322648	0 %	0 %	50 %	50 %	16120301
7561	NC_002608	CTT	2	6	322653	322658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120301
7562	NC_002608	TCG	2	6	322690	322695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120301
7563	NC_002608	TTC	2	6	322702	322707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120301
7564	NC_002608	CGCT	2	8	322708	322715	0 %	25 %	25 %	50 %	16120301
7565	NC_002608	GCGTCG	2	12	322741	322752	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16120301
7566	NC_002608	GCC	2	6	322812	322817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120301
7567	NC_002608	GGC	2	6	322818	322823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120301
7568	NC_002608	TCGTAC	2	12	322831	322842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16120301
7569	NC_002608	TCG	2	6	322895	322900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120301
7570	NC_002608	ATC	2	6	322959	322964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120301
7571	NC_002608	GCTC	2	8	322997	323004	0 %	25 %	25 %	50 %	16120301
7572	NC_002608	CCT	2	6	323015	323020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120301
7573	NC_002608	CGA	3	9	323021	323029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120301
7574	NC_002608	CGA	2	6	323043	323048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_002608	ACTC	2	8	323108	323115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7576	NC_002608	GAG	2	6	323116	323121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_002608	GGTG	2	8	323128	323135	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_002608	GGT	2	6	323191	323196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_002608	GAT	2	6	323272	323277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_002608	TGA	2	6	323349	323354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120302
7581	NC_002608	CGA	3	9	323397	323405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120302
7582	NC_002608	CGTG	2	8	323438	323445	0 %	25 %	50 %	25 %	16120302
7583	NC_002608	GTTC	2	8	323501	323508	0 %	50 %	25 %	25 %	16120302
7584	NC_002608	CGG	2	6	323519	323524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120302
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7586	NC_002608	GTC	2	6	323617	323622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120302
7587	NC_002608	CG	3	6	323630	323635	0 %	0 %	50 %	50 %	16120302
7588	NC_002608	CAG	2	6	323668	323673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120302
7589	NC_002608	CT	3	6	323789	323794	0 %	50 %	0 %	50 %	16120302
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7591	NC_002608	AGCCGT	2	12	323844	323855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16120302
7592	NC_002608	GTA	2	6	323857	323862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120302
7593	NC_002608	TCG	2	6	323864	323869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120302
7594	NC_002608	GGCA	2	8	323905	323912	25 %	0 %	50 %	25 %	16120302
7595	NC_002608	GGC	2	6	323968	323973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120302
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7599	NC_002608	TC	3	6	324044	324049	0 %	50 %	0 %	50 %	16120302
7600	NC_002608	CGG	2	6	324052	324057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120302
7601	NC_002608	TCGA	2	8	324058	324065	25 %	25 %	25 %	25 %	16120302
7602	NC_002608	GTA	2	6	324136	324141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120302
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7604	NC_002608	CCG	2	6	324201	324206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120302
7605	NC_002608	GAA	2	6	324286	324291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16120302
7606	NC_002608	ATC	2	6	324307	324312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120302
7607	NC_002608	TGGC	2	8	324419	324426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7608	NC_002608	CTT	2	6	324458	324463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7609	NC_002608	CTG	2	6	324505	324510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_002608	CGA	2	6	324519	324524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_002608	CACGT	2	10	324578	324587	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7612	NC_002608	CGA	2	6	324655	324660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_002608	G	6	6	324784	324789	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_002608	CCT	2	6	324827	324832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7615	NC_002608	CGATG	2	10	324842	324851	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7616	NC_002608	TAG	3	9	324900	324908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_002608	GAT	2	6	324916	324921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7619	NC_002608	GCA	2	6	325057	325062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120303
7620	NC_002608	ACC	2	6	325072	325077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120303
7621	NC_002608	GAC	2	6	325087	325092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120303
7622	NC_002608	TCG	2	6	325094	325099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120303
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7998	NC_002608	CGA	2	6	342277	342282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120324
7999	NC_002608	GCC	2	6	342428	342433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120324
8000	NC_002608	GTCG	2	8	342467	342474	0 %	25 %	50 %	25 %	16120324

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