MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 8557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_002608	G	6	6	299102	299107	0 %	0 %	100 %	0 %	16120267
7002	NC_002608	GCT	3	9	299122	299130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120267
7003	NC_002608	CGT	2	6	299131	299136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120267
7004	NC_002608	CTC	2	6	299141	299146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120267
7005	NC_002608	CAT	2	6	299158	299163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120267
7006	NC_002608	TGAAC	2	10	299292	299301	40 %	20 %	20 %	20 %	16120268
7007	NC_002608	GTC	2	6	299308	299313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120268
7008	NC_002608	TCT	2	6	299378	299383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120268
7009	NC_002608	GAT	2	6	299410	299415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120268
7010	NC_002608	TGA	2	6	299418	299423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120268
7011	NC_002608	TC	3	6	299644	299649	0 %	50 %	0 %	50 %	16120269
7012	NC_002608	GCA	2	6	299710	299715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120269
7013	NC_002608	TCG	2	6	299739	299744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120269
7014	NC_002608	CTC	2	6	299753	299758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120269
7015	NC_002608	GCCG	2	8	299956	299963	0 %	0 %	50 %	50 %	16120270
7016	NC_002608	TGT	2	6	299971	299976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120270
7017	NC_002608	GTC	3	9	299993	300001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120270
7018	NC_002608	CG	3	6	300046	300051	0 %	0 %	50 %	50 %	16120270
7019	NC_002608	TCG	2	6	300059	300064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120270
7020	NC_002608	GGTC	2	8	300068	300075	0 %	25 %	50 %	25 %	16120270
7021	NC_002608	GAC	2	6	300121	300126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120270
7022	NC_002608	GCG	2	6	300144	300149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120270
7023	NC_002608	TCG	2	6	300170	300175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120270
7024	NC_002608	TCG	2	6	300212	300217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120270
7025	NC_002608	CTC	2	6	300226	300231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120270
7026	NC_002608	CGT	2	6	300261	300266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120270
7027	NC_002608	CGA	2	6	300269	300274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120270
7028	NC_002608	CCG	2	6	300280	300285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120270
7029	NC_002608	CGA	2	6	300324	300329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_002608	CGT	2	6	300365	300370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120271
7031	NC_002608	GCCGTC	2	12	300375	300386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16120271
7032	NC_002608	TCG	2	6	300400	300405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120271
7033	NC_002608	GAC	2	6	300444	300449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120271
7034	NC_002608	GGA	2	6	300464	300469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120271
7035	NC_002608	CAGC	2	8	300479	300486	25 %	0 %	25 %	50 %	16120271
7036	NC_002608	CGTC	2	8	300614	300621	0 %	25 %	25 %	50 %	16120271
7037	NC_002608	CGG	2	6	300625	300630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120271
7038	NC_002608	CGG	2	6	300677	300682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120271
7039	NC_002608	CGT	2	6	300684	300689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120271
7040	NC_002608	GCG	2	6	300712	300717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120271
7041	NC_002608	TCG	3	9	300733	300741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120271
7042	NC_002608	CGA	2	6	300749	300754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120271
7043	NC_002608	CGA	2	6	300764	300769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120271
7044	NC_002608	GTC	2	6	300813	300818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120271
7045	NC_002608	CCTCCC	2	12	300839	300850	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
7046	NC_002608	CTC	2	6	300885	300890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7047	NC_002608	GAG	2	6	300891	300896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_002608	CGA	2	6	301026	301031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_002608	CTC	2	6	301036	301041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120272
7050	NC_002608	CCCA	2	8	301069	301076	25 %	0 %	0 %	75 %	16120272
7051	NC_002608	CCAC	2	8	301125	301132	25 %	0 %	0 %	75 %	16120272
7052	NC_002608	TCG	2	6	301199	301204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120272
7053	NC_002608	CGGG	2	8	301299	301306	0 %	0 %	75 %	25 %	16120272
7054	NC_002608	GAA	2	6	301312	301317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16120272
7055	NC_002608	GCTT	2	8	301361	301368	0 %	50 %	25 %	25 %	16120272
7056	NC_002608	CG	3	6	301429	301434	0 %	0 %	50 %	50 %	16120272
7057	NC_002608	ATC	2	6	301460	301465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_002608	CCGA	2	8	301475	301482	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7059	NC_002608	GGAAG	2	10	301491	301500	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_002608	ACT	2	6	301501	301506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_002608	GCC	2	6	301507	301512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7062	NC_002608	ACT	2	6	301547	301552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120273
7063	NC_002608	GAG	2	6	301593	301598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120273
7064	NC_002608	ACG	2	6	301619	301624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7065	NC_002608	CGA	2	6	301634	301639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7066	NC_002608	GTG	2	6	301663	301668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120273
7067	NC_002608	CGA	2	6	301676	301681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7068	NC_002608	GTA	2	6	301710	301715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120273
7069	NC_002608	GTC	2	6	301768	301773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7070	NC_002608	GCT	2	6	301832	301837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7071	NC_002608	TCG	2	6	301864	301869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7072	NC_002608	CCG	2	6	301870	301875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120273
7073	NC_002608	GCG	2	6	301957	301962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120273
7074	NC_002608	GTC	2	6	301965	301970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7075	NC_002608	GAC	3	9	302028	302036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7076	NC_002608	GGCG	2	8	302055	302062	0 %	0 %	75 %	25 %	16120273
7077	NC_002608	CGT	2	6	302069	302074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7078	NC_002608	GGCGTT	2	12	302079	302090	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	16120273
7079	NC_002608	GC	3	6	302128	302133	0 %	0 %	50 %	50 %	16120273
7080	NC_002608	GCGG	2	8	302146	302153	0 %	0 %	75 %	25 %	16120273
7081	NC_002608	TCG	2	6	302266	302271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7082	NC_002608	CGAC	2	8	302272	302279	25 %	0 %	25 %	50 %	16120273
7083	NC_002608	CGG	2	6	302341	302346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120273
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7085	NC_002608	GC	3	6	302379	302384	0 %	0 %	50 %	50 %	16120273
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7087	NC_002608	GAC	2	6	302565	302570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7088	NC_002608	CA	3	6	302613	302618	50 %	0 %	0 %	50 %	16120273
7089	NC_002608	CGG	2	6	302651	302656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120273
7090	NC_002608	GCC	2	6	302700	302705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120273
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7092	NC_002608	GTC	2	6	302868	302873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7093	NC_002608	GTTC	2	8	302885	302892	0 %	50 %	25 %	25 %	16120273
7094	NC_002608	CCG	2	6	302893	302898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120273
7095	NC_002608	CGG	2	6	302916	302921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120273
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7099	NC_002608	CGAGCG	2	12	303092	303103	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16120273
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7101	NC_002608	CTC	2	6	303198	303203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120273
7102	NC_002608	CGA	2	6	303287	303292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120273
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7104	NC_002608	TCG	2	6	303307	303312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120273
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7107	NC_002608	CGC	2	6	303359	303364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120273
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7109	NC_002608	CGA	2	6	303437	303442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7110	NC_002608	CCT	2	6	303443	303448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120273
7111	NC_002608	CGG	2	6	303467	303472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120273
7112	NC_002608	CGT	2	6	303473	303478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120273
7113	NC_002608	GCC	2	6	303495	303500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120273
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7116	NC_002608	CGG	2	6	303712	303717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120273
7117	NC_002608	CATC	2	8	303761	303768	25 %	25 %	0 %	50 %	16120274
7118	NC_002608	GC	3	6	303791	303796	0 %	0 %	50 %	50 %	16120274
7119	NC_002608	GAT	2	6	303828	303833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120274
7120	NC_002608	GGC	2	6	303909	303914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120274
7121	NC_002608	GAC	2	6	303915	303920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120274
7122	NC_002608	CTC	2	6	303954	303959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120274
7123	NC_002608	GAT	2	6	303978	303983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120274
7124	NC_002608	GCA	2	6	304015	304020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120274
7125	NC_002608	CGC	2	6	304032	304037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120274
7126	NC_002608	TCG	2	6	304159	304164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120274
7127	NC_002608	TCG	2	6	304195	304200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120274
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7130	NC_002608	TCC	2	6	304274	304279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120274
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7132	NC_002608	AAGT	2	8	304356	304363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_002608	ATGG	2	8	304369	304376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7134	NC_002608	TCG	2	6	304436	304441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7135	NC_002608	CGT	2	6	304443	304448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7137	NC_002608	GCT	2	6	304521	304526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120275
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7165	NC_002608	TGA	2	6	305271	305276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120275
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7237	NC_002608	G	6	6	308376	308381	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7238	NC_002608	CGG	2	6	308391	308396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7239	NC_002608	ACGC	2	8	308400	308407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7240	NC_002608	CGAT	2	8	308409	308416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7241	NC_002608	GTC	2	6	308481	308486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7242	NC_002608	GTT	2	6	308521	308526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7243	NC_002608	GGC	2	6	308539	308544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7244	NC_002608	CTC	2	6	308612	308617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120280
7245	NC_002608	CGT	2	6	308629	308634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120280
7246	NC_002608	GAAGA	2	10	308790	308799	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7247	NC_002608	AAG	2	6	308864	308869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7248	NC_002608	CGA	2	6	309033	309038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120281
7249	NC_002608	TCA	2	6	309050	309055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120281
7250	NC_002608	AGTTC	2	10	309059	309068	20 %	40 %	20 %	20 %	16120281
7251	NC_002608	AGT	2	6	309287	309292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7252	NC_002608	AGC	2	6	309393	309398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120282
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7260	NC_002608	GTC	3	9	309783	309791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7261	NC_002608	GTAGCG	2	12	309848	309859	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16120283
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7359	NC_002608	CGT	2	6	313990	313995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120288
7360	NC_002608	TTCT	2	8	314059	314066	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7361	NC_002608	GC	4	8	314084	314091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7362	NC_002608	CGA	2	6	314094	314099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7363	NC_002608	GAGC	2	8	314103	314110	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7364	NC_002608	CGGAG	2	10	314112	314121	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7365	NC_002608	CA	3	6	314152	314157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7366	NC_002608	A	7	7	314160	314166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7367	NC_002608	CAC	2	6	314195	314200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120289
7368	NC_002608	ACC	2	6	314229	314234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120289
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7370	NC_002608	CTCG	2	8	314295	314302	0 %	25 %	25 %	50 %	16120289
7371	NC_002608	GACC	2	8	314376	314383	25 %	0 %	25 %	50 %	16120289
7372	NC_002608	CCT	2	6	314442	314447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120289
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7385	NC_002608	GCT	2	6	314775	314780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120289
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7494	NC_002608	TCG	2	6	319285	319290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120295
7495	NC_002608	CG	3	6	319299	319304	0 %	0 %	50 %	50 %	16120295
7496	NC_002608	GGC	2	6	319308	319313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120295
7497	NC_002608	TC	3	6	319332	319337	0 %	50 %	0 %	50 %	16120295
7498	NC_002608	GCCA	2	8	319370	319377	25 %	0 %	25 %	50 %	16120295
7499	NC_002608	CAG	2	6	319384	319389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120295
7500	NC_002608	GTC	2	6	319410	319415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120295

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