MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 8557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_002608	TGA	2	6	277073	277078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120247
6502	NC_002608	CT	3	6	277114	277119	0 %	50 %	0 %	50 %	16120247
6503	NC_002608	GCC	2	6	277133	277138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120247
6504	NC_002608	GAG	2	6	277141	277146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120247
6505	NC_002608	GAT	2	6	277191	277196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120247
6506	NC_002608	CGA	2	6	277215	277220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120247
6507	NC_002608	GTT	2	6	277239	277244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120247
6508	NC_002608	ACGG	2	8	277265	277272	25 %	0 %	50 %	25 %	16120247
6509	NC_002608	CCG	2	6	277305	277310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120247
6510	NC_002608	CGA	2	6	277323	277328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120247
6511	NC_002608	ACG	2	6	277331	277336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120247
6512	NC_002608	CTT	2	6	277338	277343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120247
6513	NC_002608	CGG	2	6	277382	277387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120247
6514	NC_002608	GGCGCG	2	12	277400	277411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120247
6515	NC_002608	CGA	2	6	277449	277454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120247
6516	NC_002608	CGT	2	6	277548	277553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120247
6517	NC_002608	CGA	2	6	277575	277580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120247
6518	NC_002608	GA	3	6	277608	277613	50 %	0 %	50 %	0 %	16120247
6519	NC_002608	GTT	2	6	277671	277676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120247
6520	NC_002608	CTG	2	6	277768	277773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120247
6521	NC_002608	GCAG	2	8	277806	277813	25 %	0 %	50 %	25 %	16120247
6522	NC_002608	CCG	2	6	277831	277836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120247
6523	NC_002608	GCG	2	6	277846	277851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120247
6524	NC_002608	TCC	2	6	277877	277882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120247
6525	NC_002608	CCG	2	6	277915	277920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120247
6526	NC_002608	CGA	2	6	277938	277943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120247
6527	NC_002608	AGA	2	6	277949	277954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16120247
6528	NC_002608	CCA	2	6	277956	277961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120247
6529	NC_002608	CGCT	2	8	277985	277992	0 %	25 %	25 %	50 %	16120247
6530	NC_002608	CTAA	2	8	278019	278026	50 %	25 %	0 %	25 %	16120247
6531	NC_002608	CGA	2	6	278076	278081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120248
6532	NC_002608	TCG	2	6	278090	278095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120248
6533	NC_002608	CGTCT	2	10	278104	278113	0 %	40 %	20 %	40 %	16120248
6534	NC_002608	ATA	2	6	278120	278125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16120248
6535	NC_002608	TAC	2	6	278271	278276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120248
6536	NC_002608	TCA	2	6	278390	278395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120248
6537	NC_002608	AGAT	2	8	278504	278511	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_002608	ATC	2	6	278563	278568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120249
6539	NC_002608	TGG	2	6	278597	278602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120249
6540	NC_002608	GTT	2	6	278636	278641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120249
6541	NC_002608	GAC	2	6	278666	278671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120249
6542	NC_002608	CGAC	3	12	278668	278679	25 %	0 %	25 %	50 %	16120249
6543	NC_002608	AGG	2	6	278689	278694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120249
6544	NC_002608	CAGC	2	8	278708	278715	25 %	0 %	25 %	50 %	16120249
6545	NC_002608	CTT	2	6	278784	278789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120249
6546	NC_002608	TGG	2	6	278829	278834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120249
6547	NC_002608	CGG	2	6	278866	278871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120249
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6549	NC_002608	TTC	2	6	279166	279171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120250
6550	NC_002608	ATT	2	6	279177	279182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16120250
6551	NC_002608	TCCGC	2	10	279209	279218	0 %	20 %	20 %	60 %	16120250
6552	NC_002608	TCC	3	9	279232	279240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120250
6553	NC_002608	TTC	2	6	279268	279273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120250
6554	NC_002608	TTG	2	6	279346	279351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120250
6555	NC_002608	CGT	2	6	279407	279412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120250
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6557	NC_002608	TCG	2	6	279448	279453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120250
6558	NC_002608	TCG	2	6	279469	279474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120250
6559	NC_002608	TCCTTG	2	12	279597	279608	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16120250
6560	NC_002608	ATA	2	6	279652	279657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16120250
6561	NC_002608	TGA	2	6	279787	279792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_002608	GAT	2	6	279849	279854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_002608	CCCA	2	8	279859	279866	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6564	NC_002608	ACCGA	2	10	279871	279880	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6565	NC_002608	CAC	2	6	279883	279888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6566	NC_002608	AAAC	2	8	279899	279906	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6567	NC_002608	CTG	2	6	279915	279920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_002608	ACTC	2	8	279922	279929	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6569	NC_002608	TAG	2	6	279974	279979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6571	NC_002608	GAG	2	6	280019	280024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_002608	G	6	6	280024	280029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_002608	ACT	2	6	280046	280051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_002608	CAG	2	6	280061	280066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_002608	TA	3	6	280100	280105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6577	NC_002608	TC	3	6	280147	280152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6578	NC_002608	AATT	2	8	280201	280208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6582	NC_002608	GAA	2	6	280394	280399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_002608	CA	3	6	280438	280443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6584	NC_002608	CTT	2	6	280518	280523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_002608	ACG	2	6	280618	280623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6597	NC_002608	GCC	2	6	281240	281245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120251
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6605	NC_002608	AG	3	6	281640	281645	50 %	0 %	50 %	0 %	16120251
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6608	NC_002608	TAG	2	6	281784	281789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120251
6609	NC_002608	ATGAG	2	10	281803	281812	40 %	20 %	40 %	0 %	16120251
6610	NC_002608	CTT	2	6	282014	282019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_002608	GT	3	6	282082	282087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_002608	TCT	2	6	282224	282229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120252
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6620	NC_002608	CGTC	2	8	282447	282454	0 %	25 %	25 %	50 %	16120252
6621	NC_002608	CTT	2	6	282491	282496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120252
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6624	NC_002608	AGGC	2	8	282538	282545	25 %	0 %	50 %	25 %	16120252
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6626	NC_002608	CGAT	2	8	282661	282668	25 %	25 %	25 %	25 %	16120252
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6866	NC_002608	ACG	2	6	293213	293218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6999	NC_002608	GAG	2	6	299045	299050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120267
7000	NC_002608	TGGC	2	8	299093	299100	0 %	25 %	50 %	25 %	16120267

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