MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 8557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002608	CAC	3	9	194732	194740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120176
4502	NC_002608	CGA	2	6	194752	194757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120176
4503	NC_002608	GT	3	6	194766	194771	0 %	50 %	50 %	0 %	16120176
4504	NC_002608	GCT	2	6	194810	194815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120176
4505	NC_002608	CGC	2	6	194885	194890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120176
4506	NC_002608	CCG	2	6	194920	194925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120176
4507	NC_002608	CGA	2	6	195041	195046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120176
4508	NC_002608	CG	3	6	195092	195097	0 %	0 %	50 %	50 %	16120176
4509	NC_002608	GAC	2	6	195104	195109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120176
4510	NC_002608	CAC	2	6	195152	195157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120176
4511	NC_002608	GGCG	2	8	195228	195235	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_002608	ACGG	2	8	195264	195271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4513	NC_002608	TCAT	2	8	195307	195314	25 %	50 %	0 %	25 %	16120177
4514	NC_002608	GCTTC	2	10	195316	195325	0 %	40 %	20 %	40 %	16120177
4515	NC_002608	CGG	2	6	195404	195409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120177
4516	NC_002608	GCA	2	6	195491	195496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120177
4517	NC_002608	GCC	2	6	195550	195555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120177
4518	NC_002608	GCG	2	6	195556	195561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120177
4519	NC_002608	GCT	2	6	195564	195569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120177
4520	NC_002608	CCG	2	6	195572	195577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120177
4521	NC_002608	TCA	2	6	195584	195589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120177
4522	NC_002608	TCACCG	2	12	195629	195640	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16120177
4523	NC_002608	GGGC	2	8	195653	195660	0 %	0 %	75 %	25 %	16120177
4524	NC_002608	TCG	2	6	195731	195736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120177
4525	NC_002608	CGCT	2	8	195755	195762	0 %	25 %	25 %	50 %	16120177
4526	NC_002608	GAT	2	6	195840	195845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120177
4527	NC_002608	TGC	2	6	195857	195862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120177
4528	NC_002608	GC	3	6	195875	195880	0 %	0 %	50 %	50 %	16120177
4529	NC_002608	CGT	2	6	195897	195902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120177
4530	NC_002608	CG	3	6	195903	195908	0 %	0 %	50 %	50 %	16120177
4531	NC_002608	GTG	2	6	195925	195930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120177
4532	NC_002608	CAC	2	6	195933	195938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120177
4533	NC_002608	GGT	2	6	195966	195971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120177
4534	NC_002608	GCG	2	6	195999	196004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120177
4535	NC_002608	GAC	2	6	196011	196016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120177
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4538	NC_002608	CTG	2	6	196147	196152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120177
4539	NC_002608	CGG	2	6	196158	196163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120177
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4541	NC_002608	CGC	2	6	196196	196201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120177
4542	NC_002608	GGC	2	6	196290	196295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120177
4543	NC_002608	TGA	2	6	196331	196336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120177
4544	NC_002608	CAT	2	6	196344	196349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120177
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4548	NC_002608	GGGTC	2	10	196427	196436	0 %	20 %	60 %	20 %	16120177
4549	NC_002608	TGG	2	6	196439	196444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120177
4550	NC_002608	GCT	2	6	196476	196481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120177
4551	NC_002608	GGC	2	6	196482	196487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120177
4552	NC_002608	AC	5	10	196593	196602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_002608	GAG	2	6	196603	196608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_002608	AC	3	6	196628	196633	50 %	0 %	0 %	50 %	16120178
4555	NC_002608	G	6	6	196679	196684	0 %	0 %	100 %	0 %	16120178
4556	NC_002608	G	6	6	196695	196700	0 %	0 %	100 %	0 %	16120178
4557	NC_002608	GTC	2	6	196725	196730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120178
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4561	NC_002608	TGC	2	6	196828	196833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120178
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4563	NC_002608	GAC	2	6	196860	196865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120178
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4566	NC_002608	CGG	2	6	197006	197011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120179
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4579	NC_002608	ACC	2	6	197345	197350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_002608	GCA	2	6	197392	197397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120180
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4583	NC_002608	GC	3	6	197507	197512	0 %	0 %	50 %	50 %	16120180
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4585	NC_002608	CGC	2	6	197557	197562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120180
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4587	NC_002608	GCC	3	9	197627	197635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120180
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4589	NC_002608	CAG	2	6	197698	197703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4591	NC_002608	GTG	2	6	197860	197865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_002608	GC	3	6	197868	197873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_002608	CGGTG	2	10	197904	197913	0 %	20 %	60 %	20 %	16120181
4594	NC_002608	CCCG	2	8	197934	197941	0 %	0 %	25 %	75 %	16120181
4595	NC_002608	CGA	2	6	197952	197957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120181
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4599	NC_002608	ACG	2	6	198118	198123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120181
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4601	NC_002608	TGA	2	6	198227	198232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120181
4602	NC_002608	CGCGT	2	10	198246	198255	0 %	20 %	40 %	40 %	16120181
4603	NC_002608	TCG	2	6	198263	198268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120181
4604	NC_002608	GCG	2	6	198280	198285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120181
4605	NC_002608	CGG	2	6	198307	198312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120181
4606	NC_002608	CGG	2	6	198323	198328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120181
4607	NC_002608	GGC	2	6	198339	198344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120181
4608	NC_002608	GC	3	6	198343	198348	0 %	0 %	50 %	50 %	16120181
4609	NC_002608	CGG	2	6	198374	198379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120181
4610	NC_002608	CG	3	6	198447	198452	0 %	0 %	50 %	50 %	16120182
4611	NC_002608	TG	3	6	198494	198499	0 %	50 %	50 %	0 %	16120182
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4622	NC_002608	GAG	2	6	198837	198842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120182
4623	NC_002608	TCCAGG	2	12	198850	198861	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16120182
4624	NC_002608	GGAT	2	8	198865	198872	25 %	25 %	50 %	0 %	16120182
4625	NC_002608	GGC	2	6	198930	198935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120182
4626	NC_002608	TCG	2	6	198940	198945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120182
4627	NC_002608	GTCGTT	2	12	198951	198962	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	16120182
4628	NC_002608	CGG	3	9	199049	199057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120182
4629	NC_002608	GGC	2	6	199079	199084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120182
4630	NC_002608	CAGG	2	8	199101	199108	25 %	0 %	50 %	25 %	16120182
4631	NC_002608	CCA	2	6	199157	199162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120182
4632	NC_002608	GTC	4	12	199164	199175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120182
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4634	NC_002608	CGG	2	6	199209	199214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120182
4635	NC_002608	CGT	2	6	199223	199228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120182
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4637	NC_002608	ATG	2	6	199306	199311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120182
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4639	NC_002608	GGT	2	6	199549	199554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120182
4640	NC_002608	CGG	2	6	199578	199583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120182
4641	NC_002608	CGG	2	6	199587	199592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120182
4642	NC_002608	TCG	2	6	199598	199603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120182
4643	NC_002608	CGT	2	6	199637	199642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120183
4644	NC_002608	CGG	2	6	199650	199655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120183
4645	NC_002608	GACC	2	8	199668	199675	25 %	0 %	25 %	50 %	16120183
4646	NC_002608	GCTG	2	8	199683	199690	0 %	25 %	50 %	25 %	16120183
4647	NC_002608	GAG	2	6	199708	199713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120183
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4650	NC_002608	ATC	2	6	199852	199857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120183
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4652	NC_002608	TGC	2	6	199958	199963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120183
4653	NC_002608	GAG	2	6	199975	199980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120183
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4656	NC_002608	GCG	2	6	200026	200031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120183
4657	NC_002608	ACG	2	6	200054	200059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120183
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4659	NC_002608	ACG	2	6	200078	200083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120183
4660	NC_002608	CGA	2	6	200217	200222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120183
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4662	NC_002608	CGA	2	6	200234	200239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120183
4663	NC_002608	CGCC	2	8	200247	200254	0 %	0 %	25 %	75 %	16120183
4664	NC_002608	GAC	2	6	200275	200280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120183
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4667	NC_002608	GAC	2	6	200325	200330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120183
4668	NC_002608	CGA	2	6	200334	200339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120183
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4675	NC_002608	CGA	2	6	200505	200510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120183
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4679	NC_002608	CCG	2	6	200654	200659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4680	NC_002608	CCG	2	6	200814	200819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4681	NC_002608	CGG	2	6	200824	200829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4682	NC_002608	GCG	2	6	200908	200913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120184
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4684	NC_002608	GC	3	6	200934	200939	0 %	0 %	50 %	50 %	16120184
4685	NC_002608	CGCT	2	8	200942	200949	0 %	25 %	25 %	50 %	16120184
4686	NC_002608	TCA	2	6	200991	200996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120184
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4694	NC_002608	GTC	2	6	201230	201235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120184
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4696	NC_002608	GCTG	2	8	201250	201257	0 %	25 %	50 %	25 %	16120184
4697	NC_002608	ACCCA	2	10	201269	201278	40 %	0 %	0 %	60 %	16120184
4698	NC_002608	CCG	3	9	201282	201290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120184
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4701	NC_002608	CCT	2	6	201417	201422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120184
4702	NC_002608	CGA	3	9	201427	201435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120184
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4715	NC_002608	TCG	2	6	201864	201869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120184
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4719	NC_002608	GCCG	2	8	201914	201921	0 %	0 %	50 %	50 %	16120184
4720	NC_002608	GTGG	2	8	201943	201950	0 %	25 %	75 %	0 %	16120184
4721	NC_002608	GGT	2	6	201973	201978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120184
4722	NC_002608	CGT	2	6	201979	201984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120184
4723	NC_002608	GAC	3	9	201994	202002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120184
4724	NC_002608	GCG	2	6	202046	202051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120184
4725	NC_002608	TGGCG	2	10	202060	202069	0 %	20 %	60 %	20 %	16120184
4726	NC_002608	TCG	2	6	202117	202122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4727	NC_002608	GTC	2	6	202144	202149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120185
4728	NC_002608	GTC	3	9	202151	202159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120185
4729	NC_002608	GTA	2	6	202300	202305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120185
4730	NC_002608	GCGA	2	8	202378	202385	25 %	0 %	50 %	25 %	16120185
4731	NC_002608	GAC	2	6	202408	202413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120185
4732	NC_002608	CGC	2	6	202420	202425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120185
4733	NC_002608	CGA	3	9	202458	202466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120185
4734	NC_002608	ATG	2	6	202487	202492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120185
4735	NC_002608	GCG	2	6	202529	202534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120185
4736	NC_002608	CAG	2	6	202555	202560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120185
4737	NC_002608	GAT	3	9	202588	202596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120185
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4742	NC_002608	TGA	2	6	202701	202706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120185
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4746	NC_002608	GTCG	2	8	202768	202775	0 %	25 %	50 %	25 %	16120185
4747	NC_002608	CCG	2	6	202824	202829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120185
4748	NC_002608	CG	3	6	202999	203004	0 %	0 %	50 %	50 %	16120185
4749	NC_002608	GGA	2	6	203022	203027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120185
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4751	NC_002608	AGC	2	6	203102	203107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120185
4752	NC_002608	CGTC	2	8	203136	203143	0 %	25 %	25 %	50 %	16120185
4753	NC_002608	GTC	2	6	203148	203153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120186
4754	NC_002608	CGG	2	6	203162	203167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120186
4755	NC_002608	GTG	2	6	203170	203175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120186
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4757	NC_002608	CGA	2	6	203204	203209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120186
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4759	NC_002608	CGT	3	9	203318	203326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120186
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4777	NC_002608	CTG	2	6	204029	204034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120187
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4833	NC_002608	CGG	2	6	206411	206416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120189
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4986	NC_002608	CGCT	2	8	212163	212170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4987	NC_002608	C	6	6	212173	212178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4990	NC_002608	CCT	2	6	212324	212329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4993	NC_002608	AGC	2	6	212499	212504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120193
4994	NC_002608	CGG	2	6	212526	212531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120193
4995	NC_002608	CGATGA	2	12	212558	212569	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16120193
4996	NC_002608	CGA	2	6	212601	212606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120193
4997	NC_002608	CGT	2	6	212622	212627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120193
4998	NC_002608	GGC	2	6	212635	212640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120193
4999	NC_002608	GGA	2	6	212679	212684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120193
5000	NC_002608	TCC	2	6	212709	212714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120193

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