MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 58906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49235	NC_002607	TGGG	2	8	1681138	1681145	0 %	25 %	75 %	0 %	15791074
49236	NC_002607	GAG	2	6	1681186	1681191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791074
49237	NC_002607	GGC	2	6	1681206	1681211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791074
49238	NC_002607	CGA	2	6	1681212	1681217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791074
49239	NC_002607	CG	3	6	1681272	1681277	0 %	0 %	50 %	50 %	15791074
49240	NC_002607	GCC	2	6	1681309	1681314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791074
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49242	NC_002607	GC	3	6	1681434	1681439	0 %	0 %	50 %	50 %	15791074
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49249	NC_002607	GCT	2	6	1681809	1681814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791074
49250	NC_002607	GC	3	6	1681817	1681822	0 %	0 %	50 %	50 %	15791074
49251	NC_002607	CGA	3	9	1681833	1681841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791074
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49254	NC_002607	CTCGAC	2	12	1681930	1681941	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15791074
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49258	NC_002607	CGA	2	6	1682010	1682015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791074
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49262	NC_002607	TGG	2	6	1682116	1682121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791075
49263	NC_002607	CAGA	2	8	1682144	1682151	50 %	0 %	25 %	25 %	15791075
49264	NC_002607	GTG	2	6	1682204	1682209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791075
49265	NC_002607	GCG	2	6	1682241	1682246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791075
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49282	NC_002607	GGC	2	6	1682624	1682629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791075
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49341	NC_002607	GC	3	6	1684231	1684236	0 %	0 %	50 %	50 %	15791077
49342	NC_002607	GTC	2	6	1684253	1684258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791077
49343	NC_002607	GACG	2	8	1684291	1684298	25 %	0 %	50 %	25 %	15791077
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49350	NC_002607	TCG	2	6	1684506	1684511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791077
49351	NC_002607	TCG	2	6	1684575	1684580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791077
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49472	NC_002607	GGC	2	6	1688365	1688370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791081
49473	NC_002607	CGA	2	6	1688394	1688399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791081
49474	NC_002607	GAG	2	6	1688425	1688430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791081
49475	NC_002607	TCG	2	6	1688480	1688485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791081
49476	NC_002607	TCA	2	6	1688507	1688512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791081
49477	NC_002607	TGC	2	6	1688531	1688536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791081
49478	NC_002607	GCG	2	6	1688540	1688545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791081
49479	NC_002607	CGAT	2	8	1688549	1688556	25 %	25 %	25 %	25 %	15791081
49480	NC_002607	TCA	3	9	1688582	1688590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791081
49481	NC_002607	GTG	2	6	1688623	1688628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791081
49482	NC_002607	GCG	2	6	1688691	1688696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791081
49483	NC_002607	TAT	2	6	1688698	1688703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15791081
49484	NC_002607	GTT	2	6	1688748	1688753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15791081
49485	NC_002607	CAC	2	6	1688838	1688843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15791081
49486	NC_002607	TGT	2	6	1688852	1688857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15791081
49487	NC_002607	GTC	2	6	1688881	1688886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791081
49488	NC_002607	TCA	2	6	1688903	1688908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791081
49489	NC_002607	CGG	2	6	1688956	1688961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791081
49490	NC_002607	CTG	2	6	1688962	1688967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791081
49491	NC_002607	G	6	6	1688972	1688977	0 %	0 %	100 %	0 %	15791081
49492	NC_002607	CGTTCA	2	12	1688993	1689004	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15791081
49493	NC_002607	CGACC	2	10	1689012	1689021	20 %	0 %	20 %	60 %	15791081
49494	NC_002607	GTT	2	6	1689081	1689086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15791081
49495	NC_002607	TGCG	2	8	1689125	1689132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49496	NC_002607	CCG	2	6	1689189	1689194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791082
49497	NC_002607	CGA	2	6	1689211	1689216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791082
49498	NC_002607	GC	3	6	1689225	1689230	0 %	0 %	50 %	50 %	15791082
49499	NC_002607	GGC	2	6	1689247	1689252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791082
49500	NC_002607	GC	3	6	1689261	1689266	0 %	0 %	50 %	50 %	15791082

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