MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 58906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48235	NC_002607	GTC	2	6	1649448	1649453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791042
48236	NC_002607	TCG	2	6	1649506	1649511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791042
48237	NC_002607	CGG	2	6	1649552	1649557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791042
48238	NC_002607	TCACGA	2	12	1649563	1649574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15791042
48239	NC_002607	CGG	2	6	1649588	1649593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791042
48240	NC_002607	ATC	2	6	1649610	1649615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791042
48241	NC_002607	CGA	2	6	1649654	1649659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791042
48242	NC_002607	GCGG	2	8	1649687	1649694	0 %	0 %	75 %	25 %	15791042
48243	NC_002607	TCGA	2	8	1649718	1649725	25 %	25 %	25 %	25 %	15791042
48244	NC_002607	CTGA	2	8	1649784	1649791	25 %	25 %	25 %	25 %	15791042
48245	NC_002607	ACT	4	12	1649798	1649809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791042
48246	NC_002607	AAT	2	6	1649812	1649817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15791042
48247	NC_002607	GACG	2	8	1649845	1649852	25 %	0 %	50 %	25 %	15791043
48248	NC_002607	GGC	2	6	1649887	1649892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791043
48249	NC_002607	CG	3	6	1649897	1649902	0 %	0 %	50 %	50 %	15791043
48250	NC_002607	TCG	2	6	1649928	1649933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791043
48251	NC_002607	CGG	2	6	1649947	1649952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791043
48252	NC_002607	GAT	2	6	1649989	1649994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15791043
48253	NC_002607	GAG	2	6	1650032	1650037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791043
48254	NC_002607	GACGTG	2	12	1650059	1650070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15791043
48255	NC_002607	CGT	2	6	1650097	1650102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791043
48256	NC_002607	GCG	2	6	1650117	1650122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791043
48257	NC_002607	GC	3	6	1650166	1650171	0 %	0 %	50 %	50 %	15791043
48258	NC_002607	CGG	2	6	1650208	1650213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791043
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48262	NC_002607	GCG	2	6	1650375	1650380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791043
48263	NC_002607	CGT	2	6	1650436	1650441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791043
48264	NC_002607	CGA	2	6	1650475	1650480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791043
48265	NC_002607	CG	3	6	1650484	1650489	0 %	0 %	50 %	50 %	15791043
48266	NC_002607	GC	3	6	1650502	1650507	0 %	0 %	50 %	50 %	15791043
48267	NC_002607	GGAC	2	8	1650555	1650562	25 %	0 %	50 %	25 %	15791043
48268	NC_002607	CGA	2	6	1650565	1650570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791043
48269	NC_002607	CCG	3	9	1650585	1650593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791043
48270	NC_002607	GAG	2	6	1650605	1650610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791043
48271	NC_002607	GCC	2	6	1650648	1650653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791043
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48273	NC_002607	GACC	2	8	1650721	1650728	25 %	0 %	25 %	50 %	15791043
48274	NC_002607	GCCCG	2	10	1650778	1650787	0 %	0 %	40 %	60 %	15791043
48275	NC_002607	AGG	2	6	1650810	1650815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791043
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48278	NC_002607	CGG	3	9	1650876	1650884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791043
48279	NC_002607	GAC	2	6	1650926	1650931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791043
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48283	NC_002607	CAC	2	6	1650997	1651002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15791043
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48286	NC_002607	CGA	2	6	1651036	1651041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791043
48287	NC_002607	CTG	2	6	1651055	1651060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791043
48288	NC_002607	GC	3	6	1651062	1651067	0 %	0 %	50 %	50 %	15791043
48289	NC_002607	TCG	2	6	1651071	1651076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791043
48290	NC_002607	TCG	2	6	1651095	1651100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791043
48291	NC_002607	GGA	2	6	1651138	1651143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791043
48292	NC_002607	CCA	2	6	1651152	1651157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15791043
48293	NC_002607	GCC	2	6	1651196	1651201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791043
48294	NC_002607	CA	3	6	1651246	1651251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48295	NC_002607	CGG	2	6	1651315	1651320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791044
48296	NC_002607	CCGCG	2	10	1651334	1651343	0 %	0 %	40 %	60 %	15791044
48297	NC_002607	TCG	2	6	1651393	1651398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791044
48298	NC_002607	CGT	2	6	1651430	1651435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791044
48299	NC_002607	GTC	2	6	1651509	1651514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791044
48300	NC_002607	GGT	2	6	1651520	1651525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791044
48301	NC_002607	GCT	2	6	1651544	1651549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791044
48302	NC_002607	GAC	2	6	1651557	1651562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791044
48303	NC_002607	GCCA	2	8	1651578	1651585	25 %	0 %	25 %	50 %	15791044
48304	NC_002607	CCAC	2	8	1651624	1651631	25 %	0 %	0 %	75 %	15791044
48305	NC_002607	CGG	2	6	1651633	1651638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791044
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48307	NC_002607	CGTCG	2	10	1651652	1651661	0 %	20 %	40 %	40 %	15791044
48308	NC_002607	CG	4	8	1651664	1651671	0 %	0 %	50 %	50 %	15791044
48309	NC_002607	GC	3	6	1651683	1651688	0 %	0 %	50 %	50 %	15791044
48310	NC_002607	ACG	2	6	1651690	1651695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791044
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48313	NC_002607	GCGA	2	8	1651812	1651819	25 %	0 %	50 %	25 %	15791044
48314	NC_002607	GCCG	2	8	1651826	1651833	0 %	0 %	50 %	50 %	15791044
48315	NC_002607	ATC	2	6	1651848	1651853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791044
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48317	NC_002607	GCT	2	6	1651880	1651885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791044
48318	NC_002607	GCT	2	6	1651892	1651897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791044
48319	NC_002607	GAG	2	6	1652007	1652012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791044
48320	NC_002607	GCG	2	6	1652066	1652071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791044
48321	NC_002607	GTC	2	6	1652112	1652117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48322	NC_002607	TCG	2	6	1652122	1652127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48323	NC_002607	GCCG	2	8	1652137	1652144	0 %	0 %	50 %	50 %	15791045
48324	NC_002607	CGG	2	6	1652174	1652179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791045
48325	NC_002607	CGG	2	6	1652186	1652191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791045
48326	NC_002607	AGC	2	6	1652227	1652232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48327	NC_002607	GC	3	6	1652239	1652244	0 %	0 %	50 %	50 %	15791045
48328	NC_002607	GTCCG	2	10	1652265	1652274	0 %	20 %	40 %	40 %	15791045
48329	NC_002607	GGC	2	6	1652301	1652306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791045
48330	NC_002607	CGG	2	6	1652324	1652329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791045
48331	NC_002607	TGC	2	6	1652341	1652346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791045
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48334	NC_002607	CGG	2	6	1652390	1652395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791045
48335	NC_002607	CG	3	6	1652400	1652405	0 %	0 %	50 %	50 %	15791045
48336	NC_002607	CGT	2	6	1652414	1652419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48337	NC_002607	GAC	2	6	1652439	1652444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48338	NC_002607	CGA	2	6	1652480	1652485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48339	NC_002607	CG	3	6	1652526	1652531	0 %	0 %	50 %	50 %	15791045
48340	NC_002607	CGA	2	6	1652579	1652584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48341	NC_002607	CGC	2	6	1652591	1652596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791045
48342	NC_002607	CTC	2	6	1652613	1652618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791045
48343	NC_002607	G	6	6	1652627	1652632	0 %	0 %	100 %	0 %	15791045
48344	NC_002607	AGC	2	6	1652644	1652649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48345	NC_002607	CGG	2	6	1652654	1652659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791045
48346	NC_002607	CGC	2	6	1652666	1652671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791045
48347	NC_002607	GC	3	6	1652670	1652675	0 %	0 %	50 %	50 %	15791045
48348	NC_002607	GAC	2	6	1652676	1652681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48349	NC_002607	GCG	2	6	1652689	1652694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791045
48350	NC_002607	TCG	2	6	1652695	1652700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48351	NC_002607	CAG	2	6	1652718	1652723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48352	NC_002607	TCG	2	6	1652734	1652739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48353	NC_002607	GTC	2	6	1652769	1652774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791045
48354	NC_002607	GTG	2	6	1652782	1652787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791045
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48416	NC_002607	GACC	2	8	1654792	1654799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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48448	NC_002607	GAGC	2	8	1656016	1656023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48449	NC_002607	CTGG	2	8	1656032	1656039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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48471	NC_002607	GGA	2	6	1656630	1656635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791047
48472	NC_002607	CGA	2	6	1656669	1656674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791047
48473	NC_002607	TCG	2	6	1656683	1656688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791047
48474	NC_002607	CCG	2	6	1656689	1656694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791047
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