MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 58906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_002607	GA	3	6	1609517	1609522	50 %	0 %	50 %	0 %	15791007
47003	NC_002607	TGT	2	6	1609555	1609560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15791007
47004	NC_002607	TCA	2	6	1609599	1609604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791007
47005	NC_002607	TTGGAA	2	12	1609689	1609700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15791007
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47021	NC_002607	TTG	2	6	1610594	1610599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47111	NC_002607	CCCT	2	8	1613655	1613662	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47112	NC_002607	CAG	2	6	1613714	1613719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47358	NC_002607	CAT	2	6	1622249	1622254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791020
47359	NC_002607	TCA	2	6	1622278	1622283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791020
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47362	NC_002607	GAG	2	6	1622496	1622501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791020
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47364	NC_002607	CG	3	6	1622602	1622607	0 %	0 %	50 %	50 %	15791020
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47373	NC_002607	CGA	2	6	1622891	1622896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791020
47374	NC_002607	CTG	2	6	1622925	1622930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791020
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47377	NC_002607	CGA	2	6	1623047	1623052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791020
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47385	NC_002607	TCG	3	9	1623232	1623240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791020
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47407	NC_002607	GAGC	2	8	1623731	1623738	25 %	0 %	50 %	25 %	15791020
47408	NC_002607	CGA	2	6	1623755	1623760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791020
47409	NC_002607	TGA	2	6	1623772	1623777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15791020
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47412	NC_002607	GGGA	2	8	1623849	1623856	25 %	0 %	75 %	0 %	15791020
47413	NC_002607	TCG	2	6	1623889	1623894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791020
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47421	NC_002607	GAG	2	6	1624188	1624193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791020
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47423	NC_002607	GAT	2	6	1624214	1624219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15791020
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47433	NC_002607	CGC	2	6	1624588	1624593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791021
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47439	NC_002607	GTC	2	6	1624666	1624671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791021
47440	NC_002607	CCGTCA	2	12	1624673	1624684	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15791021
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47443	NC_002607	GCC	2	6	1624720	1624725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791021
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47446	NC_002607	GC	3	6	1624764	1624769	0 %	0 %	50 %	50 %	15791021
47447	NC_002607	CAGC	2	8	1624774	1624781	25 %	0 %	25 %	50 %	15791021
47448	NC_002607	CGT	2	6	1624794	1624799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791021
47449	NC_002607	GGTG	2	8	1624837	1624844	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47450	NC_002607	GAT	2	6	1624924	1624929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16554513
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47455	NC_002607	CAG	2	6	1625104	1625109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16554513
47456	NC_002607	GCC	2	6	1625113	1625118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16554513
47457	NC_002607	ACC	2	6	1625156	1625161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16554513
47458	NC_002607	GCC	2	6	1625174	1625179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16554513
47459	NC_002607	GCC	2	6	1625230	1625235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16554513
47460	NC_002607	CCAG	2	8	1625340	1625347	25 %	0 %	25 %	50 %	16554513
47461	NC_002607	CAT	2	6	1625359	1625364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16554513
47462	NC_002607	CGG	2	6	1625478	1625483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16554513
47463	NC_002607	ACG	2	6	1625517	1625522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16554513
47464	NC_002607	GC	4	8	1625538	1625545	0 %	0 %	50 %	50 %	16554513
47465	NC_002607	AGCC	2	8	1625546	1625553	25 %	0 %	25 %	50 %	16554513
47466	NC_002607	GCC	2	6	1625566	1625571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16554513
47467	NC_002607	GGCG	2	8	1625577	1625584	0 %	0 %	75 %	25 %	16554513
47468	NC_002607	CAG	2	6	1625620	1625625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16554513
47469	NC_002607	CAG	2	6	1625635	1625640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16554513
47470	NC_002607	TGG	3	9	1625702	1625710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16554513
47471	NC_002607	GAC	2	6	1625749	1625754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16554513
47472	NC_002607	GCC	2	6	1625782	1625787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16554513
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47474	NC_002607	GCA	2	6	1625829	1625834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16554513
47475	NC_002607	GAC	2	6	1625845	1625850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16554513
47476	NC_002607	CGA	2	6	1625937	1625942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16554513
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