MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 58906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002607	AC	3	6	65979	65984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_002607	AGAC	2	8	65986	65993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_002607	AGA	2	6	66086	66091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15789403
1504	NC_002607	GAA	2	6	66099	66104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15789403
1505	NC_002607	TC	3	6	66258	66263	0 %	50 %	0 %	50 %	15789404
1506	NC_002607	TAC	2	6	66280	66285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789404
1507	NC_002607	CAA	2	6	66286	66291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789404
1508	NC_002607	CGA	2	6	66294	66299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789404
1509	NC_002607	CCGGCG	2	12	66368	66379	0 %	0 %	50 %	50 %	15789404
1510	NC_002607	CGA	2	6	66504	66509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789404
1511	NC_002607	CCA	2	6	66661	66666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_002607	TCG	2	6	66711	66716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_002607	ACG	2	6	66747	66752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_002607	GCC	2	6	66953	66958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_002607	TCC	2	6	67031	67036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_002607	GGA	2	6	67049	67054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_002607	GTCGA	2	10	67075	67084	20 %	20 %	40 %	20 %	15789405
1518	NC_002607	CCA	2	6	67086	67091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789405
1519	NC_002607	GTC	3	9	67102	67110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789405
1520	NC_002607	CGT	2	6	67131	67136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789405
1521	NC_002607	CGC	2	6	67139	67144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789405
1522	NC_002607	GTC	2	6	67157	67162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789405
1523	NC_002607	GTC	2	6	67186	67191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789405
1524	NC_002607	CAT	2	6	67215	67220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789405
1525	NC_002607	CTG	2	6	67319	67324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789405
1526	NC_002607	TCG	2	6	67349	67354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789405
1527	NC_002607	CGT	2	6	67392	67397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789405
1528	NC_002607	CTG	2	6	67416	67421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789405
1529	NC_002607	TCC	2	6	67495	67500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_002607	GTC	2	6	67518	67523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_002607	TCC	2	6	67528	67533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_002607	CCA	2	6	67568	67573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_002607	CGA	2	6	67608	67613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_002607	TCG	2	6	67654	67659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_002607	CAG	2	6	67671	67676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_002607	CTG	2	6	67680	67685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_002607	TCC	2	6	67729	67734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_002607	CCA	2	6	67813	67818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_002607	TCG	2	6	67937	67942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789406
1540	NC_002607	CGC	2	6	67967	67972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789406
1541	NC_002607	CGG	2	6	68012	68017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789406
1542	NC_002607	TCG	2	6	68038	68043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789406
1543	NC_002607	CCT	2	6	68135	68140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789406
1544	NC_002607	CA	3	6	68216	68221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_002607	AG	3	6	68223	68228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_002607	ATT	2	6	68236	68241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_002607	AAT	2	6	68254	68259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_002607	CGGG	2	8	68331	68338	0 %	0 %	75 %	25 %	15789407
1549	NC_002607	CAA	2	6	68417	68422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789407
1550	NC_002607	CGA	2	6	68430	68435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789407
1551	NC_002607	TCG	2	6	68477	68482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789407
1552	NC_002607	TTC	2	6	68709	68714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_002607	CTG	2	6	68721	68726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_002607	TCAC	2	8	68822	68829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_002607	CGA	2	6	68869	68874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_002607	ATG	2	6	68958	68963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_002607	TC	3	6	69121	69126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_002607	CTG	2	6	69303	69308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789408
1559	NC_002607	GAC	2	6	69324	69329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789408
1560	NC_002607	GAC	2	6	69486	69491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_002607	AAG	2	6	69520	69525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_002607	CCTT	2	8	69542	69549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_002607	ACA	2	6	69628	69633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_002607	TGG	2	6	69638	69643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_002607	GCT	2	6	69654	69659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_002607	TCA	2	6	69686	69691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_002607	GTC	2	6	69694	69699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_002607	TCG	2	6	69707	69712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_002607	CGT	2	6	69729	69734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_002607	GCG	2	6	69745	69750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_002607	GAG	2	6	69778	69783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_002607	CTC	2	6	69792	69797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_002607	TCGGCG	2	12	69851	69862	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_002607	AC	4	8	69863	69870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_002607	GAT	2	6	69976	69981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789409
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1577	NC_002607	GCG	2	6	70055	70060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789409
1578	NC_002607	CGG	2	6	70133	70138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789409
1579	NC_002607	CGA	2	6	70146	70151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789409
1580	NC_002607	ACGCG	2	10	70220	70229	20 %	0 %	40 %	40 %	15789409
1581	NC_002607	AC	3	6	70328	70333	50 %	0 %	0 %	50 %	15789409
1582	NC_002607	CGAC	2	8	70343	70350	25 %	0 %	25 %	50 %	15789409
1583	NC_002607	GC	3	6	70488	70493	0 %	0 %	50 %	50 %	15789409
1584	NC_002607	CGA	3	9	70494	70502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789409
1585	NC_002607	ACGTCG	2	12	70523	70534	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15789409
1586	NC_002607	TCA	2	6	70547	70552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789409
1587	NC_002607	CGA	2	6	70560	70565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789409
1588	NC_002607	GTT	2	6	70579	70584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15789409
1589	NC_002607	CAC	2	6	70614	70619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789409
1590	NC_002607	CAA	2	6	70640	70645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789409
1591	NC_002607	GAC	2	6	70707	70712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789409
1592	NC_002607	CGT	2	6	70728	70733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789409
1593	NC_002607	ACCA	2	8	70790	70797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_002607	TGA	2	6	70819	70824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_002607	CAC	2	6	70871	70876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_002607	GTC	3	9	70995	71003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_002607	GCA	2	6	71056	71061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_002607	TCG	2	6	71167	71172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789410
1599	NC_002607	CCA	2	6	71193	71198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789410
1600	NC_002607	GAC	2	6	71205	71210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789410
1601	NC_002607	ACG	2	6	71215	71220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789410
1602	NC_002607	TGCT	2	8	71405	71412	0 %	50 %	25 %	25 %	15789411
1603	NC_002607	GCTCGC	2	12	71490	71501	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15789411
1604	NC_002607	CCG	2	6	71543	71548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789411
1605	NC_002607	TCGTGC	2	12	71549	71560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789411
1606	NC_002607	CTC	2	6	71578	71583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789411
1607	NC_002607	CCTC	2	8	71621	71628	0 %	25 %	0 %	75 %	15789411
1608	NC_002607	ACG	2	6	71630	71635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789411
1609	NC_002607	CTC	2	6	71659	71664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789411
1610	NC_002607	TCG	3	9	71678	71686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789411
1611	NC_002607	G	6	6	71690	71695	0 %	0 %	100 %	0 %	15789411
1612	NC_002607	CGCC	2	8	71760	71767	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1613	NC_002607	GAC	2	6	71788	71793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_002607	CGG	2	6	71846	71851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789412
1615	NC_002607	CGCC	2	8	71894	71901	0 %	0 %	25 %	75 %	15789412
1616	NC_002607	ACGC	2	8	71903	71910	25 %	0 %	25 %	50 %	15789412
1617	NC_002607	CT	3	6	71920	71925	0 %	50 %	0 %	50 %	15789412
1618	NC_002607	GTC	2	6	71928	71933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789412
1619	NC_002607	GCC	3	9	71958	71966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789412
1620	NC_002607	CGC	2	6	71972	71977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789412
1621	NC_002607	GAC	2	6	72018	72023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789412
1622	NC_002607	CAC	2	6	72029	72034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789412
1623	NC_002607	CG	3	6	72047	72052	0 %	0 %	50 %	50 %	15789412
1624	NC_002607	GCG	2	6	72091	72096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789412
1625	NC_002607	CGA	2	6	72110	72115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789412
1626	NC_002607	CGC	2	6	72173	72178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789412
1627	NC_002607	ACG	2	6	72205	72210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789412
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1629	NC_002607	GTTG	2	8	72311	72318	0 %	50 %	50 %	0 %	15789412
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