MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 58906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_002607	GAA	2	6	561898	561903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15789917
16003	NC_002607	CGTG	2	8	561921	561928	0 %	25 %	50 %	25 %	15789917
16004	NC_002607	GTC	2	6	561985	561990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789917
16005	NC_002607	GTT	2	6	561991	561996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15789917
16006	NC_002607	CCG	2	6	562016	562021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789917
16007	NC_002607	GTT	2	6	562041	562046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15789917
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16009	NC_002607	CGT	2	6	562149	562154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789917
16010	NC_002607	TCG	2	6	562205	562210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789917
16011	NC_002607	GCC	2	6	562220	562225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789917
16012	NC_002607	CGT	2	6	562313	562318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789918
16013	NC_002607	CGTG	2	8	562366	562373	0 %	25 %	50 %	25 %	15789918
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16015	NC_002607	GTC	2	6	562466	562471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789918
16016	NC_002607	GCCG	2	8	562490	562497	0 %	0 %	50 %	50 %	15789918
16017	NC_002607	TCG	2	6	562533	562538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789918
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16021	NC_002607	CGA	2	6	562714	562719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789918
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16024	NC_002607	CGA	2	6	562795	562800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789918
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16054	NC_002607	TCG	3	9	563819	563827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789919
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16114	NC_002607	CGCC	2	8	565807	565814	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16115	NC_002607	CGA	2	6	565910	565915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789920
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16120	NC_002607	TCC	2	6	565999	566004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789920
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16125	NC_002607	GTC	2	6	566112	566117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789920
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16133	NC_002607	GATC	2	8	566382	566389	25 %	25 %	25 %	25 %	15789920
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16209	NC_002607	CGC	2	6	569262	569267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789922
16210	NC_002607	CGA	2	6	569300	569305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789922
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16212	NC_002607	ACGCT	2	10	569373	569382	20 %	20 %	20 %	40 %	15789923
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16231	NC_002607	CGT	2	6	570137	570142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789923
16232	NC_002607	CA	3	6	570149	570154	50 %	0 %	0 %	50 %	15789923
16233	NC_002607	GTC	2	6	570213	570218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789923
16234	NC_002607	CGT	2	6	570230	570235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789923
16235	NC_002607	GC	3	6	570248	570253	0 %	0 %	50 %	50 %	15789923
16236	NC_002607	ACG	2	6	570292	570297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789923
16237	NC_002607	GC	3	6	570385	570390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16238	NC_002607	GGA	2	6	570419	570424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789924
16239	NC_002607	CAA	2	6	570455	570460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789924
16240	NC_002607	GTC	2	6	570496	570501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789924
16241	NC_002607	TCG	2	6	570571	570576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789924
16242	NC_002607	GTC	2	6	570579	570584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789924
16243	NC_002607	GGC	2	6	570585	570590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789924
16244	NC_002607	GACA	2	8	570600	570607	50 %	0 %	25 %	25 %	15789924
16245	NC_002607	CGGG	2	8	570651	570658	0 %	0 %	75 %	25 %	15789924
16246	NC_002607	CGA	2	6	570680	570685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789924
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16249	NC_002607	GC	3	6	570831	570836	0 %	0 %	50 %	50 %	15789924
16250	NC_002607	GCCGAC	2	12	570849	570860	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15789924
16251	NC_002607	AGG	2	6	570874	570879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789924
16252	NC_002607	CAC	2	6	570897	570902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789924
16253	NC_002607	GGA	2	6	570951	570956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789924
16254	NC_002607	TGA	2	6	570980	570985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789924
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16271	NC_002607	GTC	2	6	571507	571512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789924
16272	NC_002607	CGA	2	6	571532	571537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789924
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16275	NC_002607	ACCCC	2	10	571553	571562	20 %	0 %	0 %	80 %	15789924
16276	NC_002607	AGC	2	6	571564	571569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789924
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16278	NC_002607	GCC	2	6	571582	571587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16279	NC_002607	GT	3	6	571592	571597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16280	NC_002607	TCG	3	9	571633	571641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789925
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16321	NC_002607	GTC	2	6	573067	573072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16323	NC_002607	CCG	2	6	573236	573241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789927
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16347	NC_002607	GAC	3	9	574030	574038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789928
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16355	NC_002607	GCT	2	6	574335	574340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789928
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