MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 58906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_002607	GGCG	2	8	528704	528711	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15002	NC_002607	TGA	2	6	528768	528773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789882
15003	NC_002607	G	6	6	528800	528805	0 %	0 %	100 %	0 %	15789882
15004	NC_002607	GC	3	6	528849	528854	0 %	0 %	50 %	50 %	15789882
15005	NC_002607	CGC	2	6	528895	528900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789882
15006	NC_002607	CCG	3	9	528921	528929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789882
15007	NC_002607	GGCG	2	8	528934	528941	0 %	0 %	75 %	25 %	15789882
15008	NC_002607	GC	3	6	529026	529031	0 %	0 %	50 %	50 %	15789882
15009	NC_002607	CGA	2	6	529096	529101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15010	NC_002607	ACGT	2	8	529112	529119	25 %	25 %	25 %	25 %	15789882
15011	NC_002607	CGC	2	6	529150	529155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789882
15012	NC_002607	CCG	3	9	529218	529226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789882
15013	NC_002607	GCG	2	6	529246	529251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789882
15014	NC_002607	TCG	2	6	529308	529313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15015	NC_002607	GGC	2	6	529364	529369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789882
15016	NC_002607	CGT	2	6	529420	529425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15017	NC_002607	GCG	2	6	529457	529462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789882
15018	NC_002607	CGA	2	6	529512	529517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15019	NC_002607	CTCG	2	8	529531	529538	0 %	25 %	25 %	50 %	15789882
15020	NC_002607	GCT	2	6	529543	529548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15021	NC_002607	CGG	3	9	529561	529569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789882
15022	NC_002607	CGG	2	6	529584	529589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789882
15023	NC_002607	TCA	2	6	529605	529610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789882
15024	NC_002607	AGCCA	2	10	529643	529652	40 %	0 %	20 %	40 %	15789882
15025	NC_002607	CG	3	6	529693	529698	0 %	0 %	50 %	50 %	15789882
15026	NC_002607	TCG	2	6	529701	529706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15027	NC_002607	CGA	2	6	529738	529743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15028	NC_002607	CCGA	2	8	529790	529797	25 %	0 %	25 %	50 %	15789882
15029	NC_002607	CGT	2	6	529801	529806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15030	NC_002607	CGA	2	6	529828	529833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15031	NC_002607	CGA	2	6	529879	529884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15032	NC_002607	TCG	2	6	529920	529925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15033	NC_002607	CAG	2	6	529961	529966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15034	NC_002607	CAC	2	6	529972	529977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789882
15035	NC_002607	TCT	2	6	530070	530075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15789882
15036	NC_002607	G	6	6	530076	530081	0 %	0 %	100 %	0 %	15789882
15037	NC_002607	TGG	2	6	530087	530092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789882
15038	NC_002607	GCT	2	6	530104	530109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15039	NC_002607	GTG	2	6	530117	530122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789882
15040	NC_002607	GCG	2	6	530151	530156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789882
15041	NC_002607	CGG	2	6	530160	530165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789882
15042	NC_002607	CGT	3	9	530188	530196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15043	NC_002607	GCCG	2	8	530248	530255	0 %	0 %	50 %	50 %	15789882
15044	NC_002607	CGA	2	6	530256	530261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15045	NC_002607	GCG	2	6	530307	530312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789882
15046	NC_002607	GAC	2	6	530371	530376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
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15048	NC_002607	CGG	2	6	530425	530430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789882
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15050	NC_002607	CGA	2	6	530458	530463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15051	NC_002607	GCC	4	12	530483	530494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789882
15052	NC_002607	TCG	2	6	530529	530534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15053	NC_002607	TCG	2	6	530604	530609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15054	NC_002607	CGC	2	6	530624	530629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789882
15055	NC_002607	CG	3	6	530645	530650	0 %	0 %	50 %	50 %	15789882
15056	NC_002607	CTC	2	6	530651	530656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789882
15057	NC_002607	CGC	2	6	530683	530688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789882
15058	NC_002607	CGA	2	6	530743	530748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15059	NC_002607	GTC	2	6	530762	530767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789882
15060	NC_002607	GCC	2	6	530798	530803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789882
15061	NC_002607	AACG	2	8	530858	530865	50 %	0 %	25 %	25 %	15789882
15062	NC_002607	CG	5	10	530869	530878	0 %	0 %	50 %	50 %	15789882
15063	NC_002607	CGC	2	6	530881	530886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789882
15064	NC_002607	CGGG	2	8	530915	530922	0 %	0 %	75 %	25 %	15789882
15065	NC_002607	GGCG	2	8	530965	530972	0 %	0 %	75 %	25 %	15789882
15066	NC_002607	ATG	2	6	530984	530989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789882
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15070	NC_002607	GACGT	2	10	531083	531092	20 %	20 %	40 %	20 %	15789882
15071	NC_002607	CGA	2	6	531100	531105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789882
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15083	NC_002607	GAC	3	9	531549	531557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789883
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15086	NC_002607	GCC	2	6	531632	531637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15087	NC_002607	TCG	2	6	531642	531647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15088	NC_002607	C	6	6	531660	531665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15089	NC_002607	GCC	2	6	531782	531787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789884
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15094	NC_002607	CCG	2	6	531988	531993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789884
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15104	NC_002607	GTC	2	6	532209	532214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789885
15105	NC_002607	CCT	3	9	532253	532261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789885
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15110	NC_002607	TGTCA	2	10	532404	532413	20 %	40 %	20 %	20 %	15789885
15111	NC_002607	CAC	2	6	532447	532452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15112	NC_002607	GCG	2	6	532484	532489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_002607	GC	3	6	532535	532540	0 %	0 %	50 %	50 %	15789886
15114	NC_002607	CGC	2	6	532549	532554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789886
15115	NC_002607	GT	3	6	532633	532638	0 %	50 %	50 %	0 %	15789886
15116	NC_002607	CG	3	6	532675	532680	0 %	0 %	50 %	50 %	15789886
15117	NC_002607	GGTC	2	8	532725	532732	0 %	25 %	50 %	25 %	15789886
15118	NC_002607	CGA	2	6	532753	532758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789886
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15120	NC_002607	ACC	2	6	532823	532828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789886
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15122	NC_002607	GC	4	8	532882	532889	0 %	0 %	50 %	50 %	15789886
15123	NC_002607	TGG	2	6	532934	532939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789886
15124	NC_002607	GTCG	2	8	532990	532997	0 %	25 %	50 %	25 %	15789886
15125	NC_002607	GCG	2	6	533016	533021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789886
15126	NC_002607	TGG	2	6	533072	533077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789886
15127	NC_002607	GTC	2	6	533152	533157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789886
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15130	NC_002607	GGA	2	6	533205	533210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789886
15131	NC_002607	CCG	2	6	533223	533228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789886
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15148	NC_002607	GCCG	2	8	533723	533730	0 %	0 %	50 %	50 %	15789886
15149	NC_002607	GTC	2	6	533743	533748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789886
15150	NC_002607	GC	3	6	533798	533803	0 %	0 %	50 %	50 %	15789886
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15154	NC_002607	CGG	2	6	533897	533902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789886
15155	NC_002607	CG	3	6	533903	533908	0 %	0 %	50 %	50 %	15789886
15156	NC_002607	GTC	2	6	533944	533949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789886
15157	NC_002607	GGC	2	6	534020	534025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15158	NC_002607	GCCG	3	12	534116	534127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15159	NC_002607	TCGT	2	8	534198	534205	0 %	50 %	25 %	25 %	15789887
15160	NC_002607	ACC	2	6	534250	534255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789887
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15165	NC_002607	GAC	2	6	534363	534368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789887
15166	NC_002607	CGC	2	6	534370	534375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789887
15167	NC_002607	CGA	2	6	534380	534385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789887
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15170	NC_002607	GCCG	2	8	534443	534450	0 %	0 %	50 %	50 %	15789887
15171	NC_002607	TCC	3	9	534508	534516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789887
15172	NC_002607	GC	3	6	534527	534532	0 %	0 %	50 %	50 %	15789887
15173	NC_002607	CACG	2	8	534536	534543	25 %	0 %	25 %	50 %	15789887
15174	NC_002607	CGCCA	2	10	534594	534603	20 %	0 %	20 %	60 %	15789887
15175	NC_002607	GGCT	2	8	534621	534628	0 %	25 %	50 %	25 %	15789887
15176	NC_002607	GTC	2	6	534630	534635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789887
15177	NC_002607	GCC	2	6	534663	534668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789887
15178	NC_002607	TGCG	2	8	534694	534701	0 %	25 %	50 %	25 %	15789887
15179	NC_002607	TCG	2	6	534748	534753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789887
15180	NC_002607	GCA	2	6	534796	534801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15181	NC_002607	CCCG	2	8	534802	534809	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15182	NC_002607	ACCG	2	8	534903	534910	25 %	0 %	25 %	50 %	15789888
15183	NC_002607	GAT	2	6	534938	534943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789888
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15185	NC_002607	CTG	2	6	534963	534968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789888
15186	NC_002607	CGC	2	6	534974	534979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789888
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15199	NC_002607	GC	3	6	535456	535461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15200	NC_002607	GCAC	2	8	535526	535533	25 %	0 %	25 %	50 %	15789889
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15207	NC_002607	CGT	2	6	535709	535714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789889
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15210	NC_002607	CAC	2	6	535750	535755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789889
15211	NC_002607	TGG	2	6	535832	535837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789889
15212	NC_002607	GACGCC	2	12	535843	535854	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15789889
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15222	NC_002607	TCG	2	6	536105	536110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789889
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15226	NC_002607	CGG	2	6	536264	536269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789889
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15229	NC_002607	CGA	2	6	536298	536303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789889
15230	NC_002607	TCC	2	6	536402	536407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789889
15231	NC_002607	CGA	2	6	536436	536441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789889
15232	NC_002607	TCG	2	6	536462	536467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789889
15233	NC_002607	CGC	2	6	536493	536498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789889
15234	NC_002607	C	6	6	536544	536549	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15235	NC_002607	GC	3	6	536563	536568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15236	NC_002607	AC	3	6	536665	536670	50 %	0 %	0 %	50 %	15789890
15237	NC_002607	CGT	2	6	536678	536683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789890
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15239	NC_002607	CGT	2	6	536706	536711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789890
15240	NC_002607	CGC	2	6	536769	536774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789890
15241	NC_002607	GTC	2	6	536794	536799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789890
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15243	NC_002607	CGA	2	6	536820	536825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789890
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15487	NC_002607	GCA	2	6	545319	545324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789898
15488	NC_002607	AGC	2	6	545360	545365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789898
15489	NC_002607	CGG	2	6	545388	545393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789898
15490	NC_002607	GC	3	6	545399	545404	0 %	0 %	50 %	50 %	15789898
15491	NC_002607	ACC	2	6	545405	545410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789898
15492	NC_002607	CGA	2	6	545496	545501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789898
15493	NC_002607	CAG	2	6	545536	545541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789898
15494	NC_002607	TCG	2	6	545558	545563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789898
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15498	NC_002607	GTC	2	6	545682	545687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15499	NC_002607	GCCC	2	8	545690	545697	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15500	NC_002607	GCG	2	6	545713	545718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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