MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 58906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_002607	GT	3	6	511472	511477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_002607	GAT	2	6	511520	511525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_002607	TGAG	2	8	511536	511543	25 %	25 %	50 %	0 %	15789862
14504	NC_002607	CGA	2	6	511678	511683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789862
14505	NC_002607	GCC	2	6	511694	511699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789862
14506	NC_002607	AGG	2	6	511704	511709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789862
14507	NC_002607	ACA	2	6	511749	511754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789862
14508	NC_002607	ATC	2	6	511769	511774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789862
14509	NC_002607	ACG	2	6	511791	511796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789862
14510	NC_002607	CCG	2	6	511797	511802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789862
14511	NC_002607	TCG	2	6	511818	511823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789862
14512	NC_002607	CAT	2	6	511828	511833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789862
14513	NC_002607	CGA	2	6	511837	511842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789862
14514	NC_002607	CG	3	6	511847	511852	0 %	0 %	50 %	50 %	15789862
14515	NC_002607	ACG	2	6	512044	512049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789863
14516	NC_002607	CA	3	6	512080	512085	50 %	0 %	0 %	50 %	15789863
14517	NC_002607	GCCA	2	8	512157	512164	25 %	0 %	25 %	50 %	15789863
14518	NC_002607	CGG	2	6	512225	512230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789863
14519	NC_002607	CCGCAT	2	12	512246	512257	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15789863
14520	NC_002607	TTC	2	6	512286	512291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15789863
14521	NC_002607	CCGC	2	8	512302	512309	0 %	0 %	25 %	75 %	15789863
14522	NC_002607	G	6	6	512319	512324	0 %	0 %	100 %	0 %	15789863
14523	NC_002607	TCA	2	6	512383	512388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789863
14524	NC_002607	CCG	2	6	512434	512439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789863
14525	NC_002607	GCC	2	6	512459	512464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789863
14526	NC_002607	CGA	2	6	512474	512479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789863
14527	NC_002607	TCG	2	6	512524	512529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789863
14528	NC_002607	CGA	3	9	512603	512611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789863
14529	NC_002607	CAC	2	6	512696	512701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789863
14530	NC_002607	CTGG	2	8	512702	512709	0 %	25 %	50 %	25 %	15789863
14531	NC_002607	GCC	2	6	512719	512724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789863
14532	NC_002607	GAG	2	6	512754	512759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789863
14533	NC_002607	GCT	2	6	512768	512773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789863
14534	NC_002607	GCGG	2	8	512774	512781	0 %	0 %	75 %	25 %	15789863
14535	NC_002607	CGA	2	6	512828	512833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789863
14536	NC_002607	CG	3	6	512840	512845	0 %	0 %	50 %	50 %	15789863
14537	NC_002607	GCG	2	6	512854	512859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789863
14538	NC_002607	CGC	2	6	512879	512884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789863
14539	NC_002607	CGGCG	2	10	512936	512945	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14540	NC_002607	CTG	2	6	513000	513005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789864
14541	NC_002607	CCG	2	6	513025	513030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789864
14542	NC_002607	GC	3	6	513056	513061	0 %	0 %	50 %	50 %	15789864
14543	NC_002607	CGA	2	6	513062	513067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789864
14544	NC_002607	C	6	6	513072	513077	0 %	0 %	0 %	100 %	15789864
14545	NC_002607	GAC	2	6	513098	513103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789864
14546	NC_002607	CGGC	2	8	513139	513146	0 %	0 %	50 %	50 %	15789864
14547	NC_002607	CGA	2	6	513152	513157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789864
14548	NC_002607	CGG	2	6	513190	513195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789864
14549	NC_002607	CG	3	6	513204	513209	0 %	0 %	50 %	50 %	15789864
14550	NC_002607	GTC	2	6	513219	513224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789864
14551	NC_002607	GGA	2	6	513236	513241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789864
14552	NC_002607	ACCG	2	8	513282	513289	25 %	0 %	25 %	50 %	15789864
14553	NC_002607	GC	3	6	513310	513315	0 %	0 %	50 %	50 %	15789864
14554	NC_002607	TCG	2	6	513328	513333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789864
14555	NC_002607	CGT	2	6	513334	513339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789864
14556	NC_002607	CGA	2	6	513356	513361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789864
14557	NC_002607	GGC	2	6	513407	513412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789864
14558	NC_002607	CGCGCT	2	12	513431	513442	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15789864
14559	NC_002607	GT	3	6	513444	513449	0 %	50 %	50 %	0 %	15789864
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14570	NC_002607	CG	3	6	513786	513791	0 %	0 %	50 %	50 %	15789864
14571	NC_002607	CGC	2	6	513800	513805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789864
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14575	NC_002607	GTC	2	6	513928	513933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789865
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14578	NC_002607	CCGC	2	8	513989	513996	0 %	0 %	25 %	75 %	15789865
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14583	NC_002607	CGT	3	9	514241	514249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789865
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14596	NC_002607	CGGC	2	8	514684	514691	0 %	0 %	50 %	50 %	15789866
14597	NC_002607	GCCGGT	2	12	514742	514753	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15789866
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14608	NC_002607	CGTC	2	8	515089	515096	0 %	25 %	25 %	50 %	15789866
14609	NC_002607	CGG	2	6	515101	515106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789866
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14863	NC_002607	CGC	2	6	524135	524140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789876
14864	NC_002607	CGA	2	6	524165	524170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789876
14865	NC_002607	CGACGT	2	12	524201	524212	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15789876
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14983	NC_002607	CGT	2	6	527912	527917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789881
14984	NC_002607	GCTG	2	8	527948	527955	0 %	25 %	50 %	25 %	15789881
14985	NC_002607	GTG	2	6	527959	527964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789881
14986	NC_002607	GTC	2	6	527973	527978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789881
14987	NC_002607	CAGC	2	8	528009	528016	25 %	0 %	25 %	50 %	15789881
14988	NC_002607	CTGG	2	8	528030	528037	0 %	25 %	50 %	25 %	15789881
14989	NC_002607	CGG	2	6	528131	528136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789881
14990	NC_002607	CGG	2	6	528140	528145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789881
14991	NC_002607	CGC	2	6	528284	528289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789881
14992	NC_002607	GTC	2	6	528303	528308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789881
14993	NC_002607	CGC	2	6	528368	528373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789881
14994	NC_002607	GC	3	6	528372	528377	0 %	0 %	50 %	50 %	15789881
14995	NC_002607	GCGTGC	2	12	528395	528406	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15789881
14996	NC_002607	GTTC	2	8	528435	528442	0 %	50 %	25 %	25 %	15789881
14997	NC_002607	CGT	2	6	528443	528448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789881
14998	NC_002607	CT	3	6	528537	528542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14999	NC_002607	CCAGC	2	10	528576	528585	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15000	NC_002607	AGCC	2	8	528638	528645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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